Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
-N
2.5M NaCl,0.5h
2.5M NaCl,1h
2.5M NaCl,2h
CCAP 19/18,4.5M NaCl
CCAP 19/18,5M Glycerol
CCAP 19/3
CCAP 19/3,Log
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,1h
CCAP 19/3,Log,3M NaCl,6h
Log
Mid-log,Low light
Mid-log,Medium light
Mid-log,High light
Mid-log,White light
Mid-log,Red light
Mid-log,Blue light
Strain 435
Strain 435,H2O2
Strain 435,NaCl
Strain 435,Sorbitol
Dusal.0003s00047.1 (33187484)
0.37 0.02 0.03 0.01 2.1 1.6 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.41 0.17 0.57 0.51 0.47 0.02 0.09 0.02 0.03
Dusal.0003s00048.1 (33187546)
0.82 0.03 0.07 0.02 4.92 3.92 1.4 0.02 0.05 0.0 0.0 0.07 0.25 0.11 2.24 0.58 0.54 0.06 0.15 0.02 0.08
Dusal.0004s00015.1 (33201073)
3.51 1.58 1.1 0.22 8.13 5.77 2.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 1.78 0.49 1.96 3.75 5.14 1.08 0.96 0.37 0.41
Dusal.0005s00047.1 (33196959)
0.94 0.09 0.08 0.05 2.69 2.1 1.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.21 0.08 1.16 0.29 0.64 0.43 0.64 0.14 0.25
Dusal.0020s00026.1 (33193720)
1.5 0.1 0.1 0.0 3.1 2.61 0.86 0.0 0.0 0.06 0.18 0.47 0.95 0.27 1.16 1.28 1.41 0.07 0.02 0.07 0.08
Dusal.0024s00001.1 (33202201)
2.16 0.0 0.0 0.0 6.38 4.93 1.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.88 0.0 2.71 0.8 0.5 0.0 0.0 0.09 0.0
Dusal.0025s00026.1 (33200692)
13.44 0.99 0.64 0.73 14.3 13.11 3.57 0.06 0.3 0.29 0.59 0.54 2.56 1.06 1.28 1.6 2.09 1.38 1.06 0.27 1.2
Dusal.0025s00040.1 (33200699)
0.43 0.01 0.17 0.0 16.91 11.67 2.97 0.03 0.0 0.39 0.0 1.45 2.66 0.31 1.91 3.03 3.46 0.0 0.0 0.15 0.0
Dusal.0033s00033.1 (33202502)
1.45 0.56 0.55 0.37 3.98 2.89 1.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.9 0.52 0.15 0.16 0.77 0.57 0.6 0.19 0.05
Dusal.0034s00006.1 (33197165)
0.57 0.0 0.0 0.0 4.45 3.42 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.2 0.2 0.75 0.22 0.0 0.05 0.0 0.0
Dusal.0036s00025.1 (33190406)
5.3 0.25 0.29 0.14 9.04 7.86 2.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.66 0.92 3.01 1.04 1.41 1.37 1.85 1.6 1.39
Dusal.0037s00036.1 (33185951)
1.78 0.53 0.54 0.41 7.2 6.66 2.42 0.17 0.13 0.13 0.09 0.85 1.03 0.24 1.42 1.97 1.84 0.67 0.82 0.68 0.96
Dusal.0044s00018.1 (33194924)
1.03 0.68 0.78 0.52 3.04 2.47 1.12 0.03 0.04 0.08 0.08 0.55 0.78 0.25 0.46 0.57 0.54 0.73 0.54 0.59 0.79
Dusal.0045s00003.1 (33191628)
0.1 0.15 0.14 0.17 2.04 1.71 0.83 0.06 0.07 0.1 0.06 0.12 0.25 0.13 0.38 0.34 0.41 0.12 0.15 0.04 0.07
Dusal.0048s00048.1 (33189481)
0.68 0.03 0.01 0.02 3.68 3.0 0.76 0.12 0.05 0.06 0.13 0.04 0.13 0.18 0.07 0.34 0.25 0.07 0.07 0.03 0.09
Dusal.0050s00015.1 (33193822)
1.07 0.0 0.0 0.0 2.47 2.23 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.13 0.1 0.28 0.15 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0068s00015.1 (33187214)
3.31 2.21 2.05 1.09 29.35 23.31 11.63 0.0 0.04 0.0 0.0 2.27 3.97 2.25 8.63 4.23 6.71 2.37 2.46 0.49 2.13
Dusal.0077s00023.1 (33192479)
10.25 1.17 0.66 0.53 8.74 6.62 4.68 0.12 0.0 0.0 0.0 0.49 1.75 0.43 2.04 3.68 4.14 2.89 3.86 1.45 2.58
Dusal.0080s00016.1 (33203968)
0.55 1.04 1.3 0.46 6.15 5.14 1.57 0.0 0.0 0.0 0.0 1.05 1.52 1.14 2.18 1.25 0.85 0.8 1.59 0.67 0.56
Dusal.0088s00008.1 (33203547)
1.01 0.0 0.0 0.0 2.11 1.63 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.59 0.11 0.26 0.43 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0096s00024.1 (33195829)
1.02 0.63 0.49 0.08 8.58 7.03 3.75 0.0 0.0 0.06 0.21 0.54 0.83 0.49 1.0 1.32 1.14 1.22 1.99 0.42 0.78
Dusal.0107s00016.1 (33192127)
0.29 0.0 0.0 0.0 17.02 14.51 6.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.91 0.59 11.7 2.07 1.23 0.0 0.0 0.0 0.05
Dusal.0113s00021.1 (33191899)
2.94 0.72 0.72 0.46 5.16 3.87 2.62 0.0 0.22 0.0 0.0 0.64 0.86 0.37 1.32 1.09 1.68 1.11 1.42 1.01 1.53
Dusal.0113s00022.1 (33191901)
7.73 1.82 1.72 0.63 18.27 13.9 5.18 0.0 0.0 0.0 0.0 1.56 3.19 1.41 2.21 3.51 4.34 2.95 2.48 0.75 2.59
Dusal.0122s00002.1 (33203034)
0.23 0.1 0.26 0.14 2.73 2.25 0.55 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.25 0.09 0.39 0.25 0.51 0.15 0.15 0.06 0.33
Dusal.0128s00019.1 (33185276)
3.7 1.95 1.36 0.81 9.96 11.1 4.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.39 0.75 2.7 0.36 0.43 0.87 1.63 0.24 0.25
Dusal.0140s00012.1 (33196370)
1.58 0.42 0.4 0.31 3.1 2.92 1.17 0.09 0.24 0.25 0.25 0.23 0.67 0.2 0.68 0.25 0.35 0.55 0.42 0.49 0.36
Dusal.0155s00007.1 (33194771)
2.65 3.02 2.98 2.25 25.46 22.44 10.49 1.25 1.59 0.5 0.9 1.26 1.38 0.52 4.96 2.38 3.41 3.96 4.65 0.77 1.89
Dusal.0165s00012.1 (33193362)
1.01 1.04 1.2 0.87 3.51 2.98 1.8 0.8 0.9 0.28 0.63 1.01 1.45 0.63 1.62 1.55 1.9 1.39 1.53 1.28 1.58
Dusal.0165s00026.1 (33193364)
2.15 0.81 0.96 0.75 5.93 4.89 1.62 1.01 0.99 0.98 0.45 1.74 1.9 1.02 2.25 2.12 2.14 1.47 1.9 1.05 1.56
Dusal.0168s00005.1 (33200862)
0.37 0.22 0.26 0.13 4.73 3.46 0.76 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.18 0.02 0.53 0.14 0.07 0.12 0.16 0.06 0.11
Dusal.0168s00019.1 (33200864)
1.06 0.61 0.78 0.26 3.22 2.33 1.29 0.23 0.34 0.2 0.06 0.75 0.84 0.36 0.57 1.09 1.41 0.23 0.35 0.18 0.34
Dusal.0205s00002.1 (33197312)
0.24 0.11 0.13 0.05 3.32 2.77 1.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.18 0.05 1.03 0.18 0.47 0.49 0.64 0.18 0.28
Dusal.0222s00010.1 (33201849)
0.2 0.06 0.06 0.16 5.11 3.86 1.14 0.25 0.28 0.17 0.35 0.2 0.4 0.15 0.57 0.46 0.69 0.12 0.12 0.12 0.18
Dusal.0244s00017.1 (33186502)
1.1 0.72 0.74 0.45 3.45 3.2 1.59 0.29 0.25 0.27 0.17 0.53 0.56 0.18 0.84 0.57 1.26 1.51 1.65 0.83 1.77
Dusal.0261s00001.1 (33200537)
0.73 0.34 0.33 0.39 4.68 4.17 1.97 0.0 0.07 0.0 0.0 1.27 1.42 0.54 2.01 1.59 1.57 0.32 0.55 0.45 0.39
Dusal.0296s00009.1 (33186013)
4.67 1.06 1.67 1.37 5.31 4.41 3.39 0.0 0.0 0.0 0.0 2.07 2.19 0.95 2.21 1.55 2.67 2.16 2.37 0.3 0.79
Dusal.0348s00001.1 (33203504)
0.0 0.0 0.0 0.0 3.37 3.06 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0358s00005.1 (33203379)
0.22 0.29 0.38 0.25 2.57 2.09 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.58 0.33 1.09 0.94 1.1 0.35 0.21 0.24 0.27
Dusal.0416s00009.1 (33198865)
2.01 0.0 0.02 0.0 10.91 9.13 3.76 0.0 0.0 0.0 0.0 1.01 1.96 0.61 4.36 2.99 3.81 0.0 0.0 0.0 0.0
Dusal.0426s00009.1 (33189088)
0.17 0.03 0.04 0.03 1.68 1.28 0.27 0.36 0.29 0.18 0.15 0.05 0.07 0.03 0.42 0.22 0.18 0.05 0.06 0.15 0.09
Dusal.0457s00012.1 (33193808)
5.27 4.4 3.04 2.26 20.33 22.96 6.67 0.0 0.0 0.0 0.0 3.76 3.33 4.15 4.58 3.59 4.56 5.5 5.99 4.55 6.09
Dusal.0513s00002.1 (33186365)
1.51 0.27 0.23 0.3 6.2 5.15 2.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.14 0.04 0.88 0.16 0.15 0.52 0.75 0.26 0.25
Dusal.0534s00004.1 (33197449)
1.18 0.15 0.21 0.15 5.31 4.71 3.69 0.0 0.0 0.0 0.0 1.18 1.33 0.6 3.68 1.82 2.54 0.33 0.4 0.5 0.37
Dusal.0563s00006.1 (33202351)
0.42 0.07 0.07 0.02 2.08 1.57 0.62 0.48 0.17 0.42 0.21 0.21 0.4 0.14 1.3 0.69 0.8 0.22 0.16 0.21 0.27
Dusal.0620s00006.1 (33193413)
0.41 0.08 0.08 0.2 3.14 2.52 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.48 0.34 0.38 0.41 0.66 0.14 0.26 0.03 0.21
Dusal.0622s00009.1 (33200105)
2.12 0.58 0.35 0.18 6.69 5.53 3.08 0.02 0.03 0.0 0.09 0.92 0.88 0.61 2.36 1.39 1.29 1.3 1.72 0.32 0.84
Dusal.0658s00004.1 (33202428)
3.02 0.11 0.3 0.04 13.43 12.35 5.22 0.0 0.0 0.0 0.0 1.35 1.36 1.98 2.6 0.88 1.01 0.78 1.19 0.21 0.88
Dusal.0695s00005.1 (33201554)
3.59 1.39 1.58 0.64 9.6 7.35 4.62 0.0 0.0 0.0 0.0 1.4 2.43 1.25 3.78 2.32 4.38 1.34 1.5 0.42 0.65
Dusal.0760s00002.1 (33190089)
2.63 0.46 0.34 0.48 9.68 6.38 3.02 0.07 0.73 0.07 0.85 0.35 1.54 0.27 0.5 1.64 1.33 0.48 0.64 0.38 0.55
Dusal.0765s00003.1 (33197861)
0.09 0.1 0.08 0.18 1.29 0.9 0.42 0.16 0.14 0.07 0.21 0.08 0.15 0.05 0.25 0.23 0.22 0.17 0.27 0.41 0.24
Dusal.0798s00002.1 (33197432)
0.47 0.51 0.48 0.22 2.05 1.36 1.01 0.06 0.03 0.05 0.07 0.33 0.39 0.13 0.45 0.76 0.89 0.52 0.71 0.33 0.39
Dusal.0832s00006.1 (33198636)
2.74 0.65 0.66 1.0 5.07 4.62 1.6 0.0 0.0 0.04 0.0 0.92 1.47 0.67 0.92 1.51 1.65 0.65 0.86 0.25 0.4
Dusal.0868s00004.1 (33198175)
2.26 0.35 0.39 0.45 27.0 22.04 6.46 1.41 0.83 1.12 3.5 1.74 1.97 1.18 0.98 1.81 1.19 0.04 0.11 0.31 0.26
Dusal.0934s00004.1 (33191139)
7.27 8.62 7.3 5.63 55.97 61.0 23.2 0.0 0.0 0.0 0.0 10.51 9.57 6.32 22.56 14.37 8.83 15.48 15.67 7.46 9.04
Dusal.0962s00003.1 (33190325)
1.49 0.34 0.23 0.27 1.55 1.36 1.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 1.14 0.3 0.19 0.56 0.59 0.08 0.11 0.16 0.28
Dusal.0975s00002.1 (33188983)
1.93 0.15 0.08 0.05 3.98 3.38 0.73 0.31 0.69 0.36 0.56 0.43 0.27 0.06 0.5 0.49 0.4 0.48 0.82 0.19 0.5
Dusal.1127s00002.1 (33192975)
0.3 0.05 0.05 0.06 2.49 2.55 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.4 0.04 1.64 0.29 0.28 0.73 0.83 0.13 0.3
Dusal.1142s00002.1 (33193684)
0.42 0.1 0.08 0.1 1.96 1.55 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.36 0.11 0.16 0.33 0.46 0.21 0.22 0.16 0.19
Dusal.1181s00004.1 (33196592)
4.5 0.86 0.98 0.22 9.11 6.76 2.12 0.0 0.0 0.0 0.0 1.78 2.9 0.29 0.94 2.17 1.23 0.49 1.04 0.09 0.51
Dusal.1193s00002.1 (33189972)
0.36 0.02 0.0 0.04 4.97 4.95 1.1 0.0 0.04 0.0 0.26 0.34 0.73 0.37 4.62 1.01 0.51 0.01 0.02 0.01 0.02
Dusal.3767s00001.1 (33202258)
0.0 0.0 0.0 0.0 6.7 4.68 1.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.84 0.16 0.0 1.67 1.48 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)