Heatmap: Cluster_112 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.212 (tig00000042_g15604.t1)	0.21	0.26	0.19	0.2	0.27	0.25	0.19	0.2	0.24	0.22	0.22	0.24	0.17	0.12	0.14	0.14	0.21	0.22	0.19	0.19	0.21	0.21	1.0	0.44	0.35	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000057.129 (tig00000382_g24590.t1)	0.11	0.08	0.1	0.09	0.07	0.1	0.07	0.09	0.13	0.16	0.19	0.19	0.1	0.16	0.09	0.17	0.1	0.12	0.12	0.13	0.3	0.21	1.0	0.34	0.28	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000101.7 (tig00000101_g4445.t1)	0.16	0.17	0.21	0.2	0.12	0.07	0.1	0.14	0.09	0.08	0.09	0.09	0.12	0.11	0.12	0.12	0.12	0.13	0.11	0.15	0.19	0.18	1.0	0.23	0.31	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000128.20 (tig00000128_g7219.t1)	0.09	0.12	0.15	0.1	0.18	0.19	0.17	0.15	0.22	0.17	0.21	0.16	0.08	0.23	0.21	0.23	0.15	0.23	0.34	0.17	0.13	0.09	1.0	0.32	0.15	0.24
Cpa\|evm.model.tig00000144.160 (tig00000144_g9153.t1)	0.25	0.18	0.19	0.23	0.28	0.18	0.17	0.19	0.2	0.22	0.29	0.35	0.35	0.2	0.11	0.11	0.1	0.12	0.14	0.08	0.28	0.53	1.0	0.47	0.22	0.26
Cpa\|evm.model.tig00000144.63 (tig00000144_g9054.t1)	0.1	0.17	0.17	0.1	0.1	0.12	0.11	0.14	0.11	0.09	0.13	0.11	0.09	0.23	0.2	0.16	0.15	0.26	0.25	0.16	0.11	0.14	1.0	0.13	0.38	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000157.113 (tig00000157_g9712.t1)	0.34	0.33	0.33	0.45	0.45	0.39	0.4	0.44	0.42	0.38	0.37	0.34	0.34	0.29	0.3	0.29	0.29	0.38	0.37	0.3	0.26	0.39	1.0	0.53	0.38	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000215.100 (tig00000215_g18638.t1)	0.0	0.09	0.09	0.15	0.17	0.13	0.07	0.14	0.12	0.1	0.2	0.22	0.05	0.07	0.09	0.12	0.03	0.14	0.09	0.08	0.04	0.11	1.0	0.12	0.34	0.12
Cpa\|evm.model.tig00000246.1 (tig00000246_g21494.t1)	0.13	0.06	0.04	0.06	0.06	0.06	0.08	0.08	0.07	0.08	0.09	0.07	0.07	0.07	0.08	0.06	0.07	0.13	0.17	0.06	0.09	0.1	1.0	0.3	0.2	0.18
Cpa\|evm.model.tig00000254.50 (tig00000254_g22502.t1)	0.05	0.08	0.06	0.11	0.16	0.15	0.15	0.13	0.19	0.14	0.17	0.13	0.06	0.13	0.1	0.13	0.1	0.27	0.15	0.12	0.06	0.33	1.0	0.38	0.52	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000269.64 (tig00000269_g23726.t1)	0.12	0.17	0.13	0.15	0.34	0.2	0.21	0.21	0.34	0.35	0.33	0.35	0.21	0.14	0.15	0.1	0.14	0.16	0.13	0.2	0.1	0.25	1.0	0.32	0.39	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000361.59 (tig00000361_g24407.t1)	0.03	0.01	0.04	0.12	0.14	0.08	0.14	0.15	0.26	0.22	0.24	0.17	0.02	0.11	0.05	0.1	0.04	0.13	0.08	0.05	0.17	0.47	1.0	0.45	0.38	0.19
Cpa\|evm.model.tig00000459.33 (tig00000459_g1100.t1)	0.13	0.13	0.16	0.26	0.23	0.19	0.19	0.17	0.21	0.14	0.14	0.12	0.09	0.15	0.1	0.13	0.15	0.19	0.12	0.15	0.09	0.29	1.0	0.2	0.29	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000545.47 (tig00000545_g2022.t1)	0.27	0.25	0.25	0.3	0.32	0.24	0.29	0.29	0.29	0.24	0.35	0.37	0.26	0.27	0.16	0.21	0.37	0.25	0.26	0.19	0.2	0.35	1.0	0.48	0.5	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000551.13 (tig00000551_g2035.t1)	0.04	0.17	0.2	0.26	0.29	0.29	0.22	0.2	0.29	0.25	0.22	0.27	0.06	0.19	0.18	0.23	0.18	0.28	0.28	0.16	0.19	0.23	1.0	0.37	0.38	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000711.62 (tig00000711_g3424.t1)	0.16	0.18	0.16	0.17	0.24	0.17	0.25	0.22	0.16	0.22	0.18	0.23	0.14	0.31	0.36	0.3	0.18	0.3	0.48	0.21	0.18	0.3	1.0	0.58	0.39	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000718.57 (tig00000718_g3729.t1)	0.31	0.33	0.25	0.25	0.26	0.32	0.31	0.32	0.27	0.24	0.27	0.29	0.21	0.28	0.23	0.2	0.3	0.35	0.27	0.22	0.44	0.29	1.0	0.52	0.43	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000737.21 (tig00000737_g3800.t1)	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.16	0.17	0.11	0.21	0.2	0.15	0.18	0.08	0.23	1.0	0.48	0.64	0.38
Cpa\|evm.model.tig00000792.22 (tig00000792_g4172.t1)	0.05	0.13	0.14	0.19	0.21	0.18	0.17	0.18	0.23	0.26	0.26	0.24	0.05	0.22	0.19	0.17	0.17	0.21	0.24	0.23	0.18	0.52	1.0	0.39	0.39	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000970.3 (tig00000970_g5825.t1)	0.31	0.29	0.28	0.37	0.36	0.31	0.4	0.42	0.36	0.33	0.3	0.26	0.28	0.18	0.21	0.22	0.27	0.41	0.29	0.3	0.26	0.38	1.0	0.34	0.45	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001030.40 (tig00001030_g6479.t1)	0.02	0.05	0.15	0.23	0.27	0.19	0.23	0.17	0.29	0.25	0.29	0.28	0.01	0.15	0.12	0.18	0.15	0.19	0.14	0.11	0.24	0.44	1.0	0.23	0.48	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001127.2 (tig00001127_g7135.t1)	0.17	0.18	0.13	0.26	0.29	0.19	0.24	0.32	0.26	0.3	0.22	0.22	0.07	0.28	0.17	0.27	0.25	0.32	0.2	0.21	0.12	0.16	1.0	0.32	0.44	0.28
Cpa\|evm.model.tig00001154.5 (tig00001154_g7269.t1)	0.01	0.02	0.06	0.1	0.14	0.15	0.15	0.11	0.23	0.13	0.12	0.05	0.01	0.09	0.08	0.07	0.09	0.11	0.1	0.06	0.15	0.34	1.0	0.27	0.39	0.23
Cpa\|evm.model.tig00001155.2 (tig00001155_g7310.t1)	0.12	0.16	0.16	0.17	0.18	0.16	0.21	0.2	0.21	0.22	0.24	0.2	0.1	0.15	0.14	0.14	0.13	0.17	0.16	0.14	0.09	0.21	1.0	0.46	0.4	0.37
Cpa\|evm.model.tig00001215.14 (tig00001215_g7579.t1)	0.2	0.11	0.04	0.05	0.09	0.15	0.3	0.25	0.2	0.19	0.14	0.12	0.17	0.18	0.12	0.12	0.2	0.22	0.19	0.15	0.08	0.14	1.0	0.24	0.24	0.14
Cpa\|evm.model.tig00001254.9 (tig00001254_g7814.t1)	0.18	0.24	0.28	0.39	0.47	0.5	0.47	0.44	0.39	0.38	0.35	0.33	0.21	0.19	0.17	0.14	0.2	0.22	0.22	0.21	0.35	0.26	1.0	0.33	0.28	0.32
Cpa\|evm.model.tig00001264.19 (tig00001264_g7875.t1)	0.11	0.26	0.19	0.2	0.27	0.27	0.26	0.24	0.28	0.33	0.29	0.23	0.14	0.18	0.24	0.17	0.24	0.31	0.34	0.34	0.22	0.04	1.0	0.6	0.4	0.35
Cpa\|evm.model.tig00001265.9 (tig00001265_g7896.t1)	0.18	0.23	0.22	0.23	0.29	0.3	0.35	0.27	0.32	0.37	0.36	0.34	0.17	0.33	0.34	0.28	0.33	0.39	0.42	0.27	0.12	0.17	1.0	0.67	0.55	0.48
Cpa\|evm.model.tig00001302.10 (tig00001302_g8095.t1)	0.27	0.2	0.2	0.22	0.18	0.19	0.21	0.3	0.25	0.2	0.26	0.24	0.19	0.07	0.1	0.08	0.1	0.17	0.14	0.12	0.29	0.17	1.0	0.33	0.38	0.24
Cpa\|evm.model.tig00001368.16 (tig00001368_g8415.t1)	0.08	0.14	0.2	0.18	0.19	0.15	0.16	0.21	0.24	0.2	0.21	0.26	0.06	0.18	0.13	0.2	0.16	0.27	0.22	0.13	0.1	0.47	1.0	0.27	0.32	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001527.8 (tig00001527_g9258.t1)	0.12	0.09	0.04	0.11	0.12	0.09	0.16	0.15	0.25	0.2	0.27	0.17	0.08	0.05	0.04	0.09	0.05	0.11	0.07	0.05	0.05	0.28	1.0	0.3	0.37	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001669.4 (tig00001669_g9558.t1)	0.29	0.26	0.19	0.2	0.15	0.12	0.17	0.23	0.25	0.23	0.23	0.21	0.25	0.2	0.2	0.2	0.21	0.38	0.41	0.16	0.17	0.26	1.0	0.36	0.34	0.25
Cpa\|evm.model.tig00020553.151 (tig00020553_g10642.t1)	0.21	0.11	0.1	0.15	0.15	0.07	0.1	0.14	0.12	0.1	0.11	0.08	0.14	0.09	0.13	0.05	0.05	0.16	0.13	0.04	0.17	0.13	1.0	0.1	0.2	0.13
Cpa\|evm.model.tig00020572.33 (tig00020572_g11552.t1)	0.03	0.04	0.05	0.08	0.05	0.05	0.07	0.09	0.09	0.09	0.12	0.1	0.03	0.03	0.04	0.05	0.05	0.09	0.05	0.04	0.34	0.1	1.0	0.43	0.25	0.23
Cpa\|evm.model.tig00020601.17 (tig00020601_g11727.t1)	0.35	0.27	0.23	0.33	0.46	0.39	0.39	0.34	0.39	0.34	0.36	0.33	0.27	0.2	0.3	0.19	0.17	0.21	0.2	0.16	0.24	0.12	1.0	0.4	0.3	0.25
Cpa\|evm.model.tig00020629.69 (tig00020629_g12396.t1)	0.17	0.11	0.1	0.13	0.12	0.1	0.14	0.14	0.21	0.22	0.27	0.25	0.15	0.08	0.15	0.07	0.09	0.17	0.15	0.13	0.26	0.37	1.0	0.39	0.36	0.34
Cpa\|evm.model.tig00020710.127 (tig00020710_g13391.t1)	0.38	0.3	0.25	0.3	0.21	0.21	0.21	0.28	0.3	0.29	0.42	0.42	0.35	0.24	0.26	0.2	0.29	0.25	0.39	0.39	0.03	0.29	1.0	0.49	0.49	0.58
Cpa\|evm.model.tig00020710.129 (tig00020710_g13393.t1)	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.07	0.08	0.09	0.16	0.18	0.19	0.13	0.01	0.06	0.07	0.05	0.1	0.16	0.14	0.1	0.09	0.14	1.0	0.45	0.34	0.24
Cpa\|evm.model.tig00020710.23 (tig00020710_g13255.t1)	0.41	0.5	0.48	0.55	0.55	0.51	0.37	0.46	0.44	0.34	0.42	0.4	0.34	0.29	0.3	0.26	0.22	0.32	0.28	0.23	0.24	0.22	1.0	0.44	0.45	0.35
Cpa\|evm.model.tig00020801.49 (tig00020801_g13933.t1)	0.21	0.12	0.11	0.13	0.13	0.09	0.13	0.13	0.15	0.13	0.19	0.13	0.13	0.06	0.08	0.06	0.09	0.12	0.19	0.08	0.24	0.08	1.0	0.29	0.36	0.27
Cpa\|evm.model.tig00020830.29 (tig00020830_g14410.t1)	0.04	0.17	0.18	0.21	0.28	0.28	0.27	0.28	0.3	0.28	0.33	0.36	0.05	0.2	0.14	0.15	0.15	0.23	0.28	0.15	0.19	0.37	1.0	0.48	0.32	0.29
Cpa\|evm.model.tig00020902.8 (tig00020902_g14950.t1)	0.01	0.0	0.01	0.04	0.05	0.04	0.05	0.05	0.08	0.1	0.14	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.05	0.02	0.04	0.26	0.54	1.0	0.4	0.16	0.19
Cpa\|evm.model.tig00020944.22 (tig00020944_g16368.t1)	0.08	0.06	0.11	0.14	0.12	0.09	0.12	0.17	0.12	0.19	0.16	0.11	0.09	0.11	0.12	0.09	0.15	0.2	0.17	0.25	0.05	0.26	1.0	0.39	0.55	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020944.23 (tig00020944_g16369.t1)	0.2	0.16	0.24	0.31	0.26	0.2	0.26	0.33	0.3	0.31	0.33	0.27	0.24	0.17	0.2	0.12	0.14	0.19	0.24	0.3	0.05	0.22	1.0	0.59	0.5	0.56
Cpa\|evm.model.tig00020960.34 (tig00020960_g16557.t1)	0.17	0.09	0.1	0.1	0.15	0.13	0.11	0.13	0.16	0.15	0.2	0.19	0.15	0.09	0.09	0.08	0.04	0.12	0.08	0.06	0.15	0.45	1.0	0.49	0.23	0.16
Cpa\|evm.model.tig00020961.26 (tig00020961_g16646.t1)	0.19	0.25	0.25	0.2	0.1	0.06	0.09	0.16	0.19	0.23	0.23	0.23	0.19	0.28	0.22	0.32	0.21	0.26	0.31	0.25	0.16	0.18	1.0	0.31	0.44	0.39
Cpa\|evm.model.tig00020996.22 (tig00020996_g16936.t1)	0.04	0.11	0.23	0.21	0.17	0.12	0.17	0.25	0.23	0.21	0.24	0.2	0.03	0.24	0.23	0.2	0.18	0.34	0.34	0.19	0.09	0.15	1.0	0.25	0.34	0.3
Cpa\|evm.model.tig00021122.18 (tig00021122_g18449.t1)	0.26	0.12	0.09	0.09	0.15	0.2	0.23	0.25	0.28	0.29	0.28	0.26	0.26	0.21	0.16	0.17	0.17	0.26	0.24	0.19	0.23	0.32	1.0	0.4	0.44	0.22
Cpa\|evm.model.tig00021127.169 (tig00021127_g18853.t1)	0.24	0.24	0.18	0.25	0.26	0.22	0.39	0.37	0.34	0.36	0.45	0.39	0.18	0.21	0.25	0.27	0.25	0.38	0.39	0.28	0.06	0.17	1.0	0.61	0.5	0.37
Cpa\|evm.model.tig00021168.7 (tig00021168_g19072.t1)	0.16	0.13	0.14	0.46	0.47	0.19	0.26	0.33	0.19	0.26	0.32	0.2	0.12	0.08	0.15	0.05	0.06	0.08	0.07	0.05	0.27	0.35	1.0	0.45	0.32	0.22
Cpa\|evm.model.tig00021179.7 (tig00021179_g19221.t1)	0.05	0.19	0.26	0.23	0.25	0.25	0.22	0.27	0.29	0.22	0.26	0.27	0.02	0.28	0.21	0.27	0.19	0.29	0.2	0.15	0.08	0.17	1.0	0.27	0.45	0.23
Cpa\|evm.model.tig00021257.18 (tig00021257_g19756.t1)	0.14	0.16	0.13	0.42	0.35	0.16	0.27	0.32	0.33	0.34	0.4	0.32	0.25	0.14	0.24	0.18	0.16	0.26	0.19	0.11	0.37	0.67	1.0	0.5	0.36	0.22
Cpa\|evm.model.tig00021433.36	0.14	0.1	0.11	0.11	0.13	0.12	0.14	0.12	0.14	0.14	0.15	0.16	0.11	0.09	0.07	0.09	0.09	0.19	0.2	0.15	0.25	0.24	1.0	0.36	0.3	0.29
Cpa\|evm.model.tig00021493.52 (tig00021493_g21891.t1)	0.17	0.24	0.28	0.3	0.27	0.2	0.24	0.25	0.26	0.26	0.31	0.29	0.18	0.23	0.2	0.21	0.24	0.22	0.23	0.17	0.16	0.38	1.0	0.42	0.59	0.35
Cpa\|evm.model.tig00021525.18 (tig00021525_g22134.t1)	0.17	0.27	0.27	0.23	0.2	0.22	0.27	0.27	0.3	0.33	0.34	0.36	0.17	0.28	0.34	0.31	0.33	0.32	0.37	0.36	0.13	0.23	1.0	0.46	0.28	0.39
Cpa\|evm.model.tig00021535.3 (tig00021535_g22209.t1)	0.1	0.05	0.03	0.09	0.11	0.06	0.07	0.09	0.1	0.1	0.12	0.08	0.1	0.12	0.29	0.23	0.13	0.39	0.45	0.18	0.12	0.26	1.0	0.56	0.28	0.32
Cpa\|evm.model.tig00021583.9 (tig00021583_g22650.t2)	0.25	0.27	0.27	0.24	0.23	0.24	0.37	0.34	0.33	0.32	0.27	0.29	0.21	0.32	0.37	0.39	0.38	0.36	0.39	0.36	0.19	0.18	1.0	0.37	0.37	0.31
Cpa\|evm.model.tig00021591.2 (tig00021532_g22205.t1)	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.05	0.05	0.04	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.13	0.14	0.01	0.25	0.21	1.0	0.33	0.19	0.19
Cpa\|evm.model.tig00021603.5 (tig00021603_g22814.t1)	0.09	0.15	0.14	0.09	0.12	0.08	0.13	0.14	0.14	0.13	0.13	0.15	0.07	0.04	0.02	0.02	0.07	0.14	0.1	0.08	0.06	0.05	1.0	0.29	0.3	0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)