Heatmap: Cluster_112 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.212 (tig00000042_g15604.t1)
7.47 9.31 6.92 7.42 9.66 9.04 6.91 7.21 8.61 7.86 8.11 8.6 6.15 4.44 5.15 5.09 7.65 8.0 7.0 7.03 7.66 7.49 36.36 16.02 12.57 9.37
Cpa|evm.model.tig00000057.129 (tig00000382_g24590.t1)
2.13 1.65 1.93 1.88 1.33 1.99 1.37 1.74 2.62 3.15 3.72 3.71 2.09 3.1 1.87 3.31 1.96 2.33 2.43 2.57 5.9 4.21 19.97 6.7 5.66 6.08
Cpa|evm.model.tig00000101.7 (tig00000101_g4445.t1)
8.77 9.37 11.56 10.56 6.28 3.97 5.56 7.63 5.06 4.35 4.76 4.95 6.52 6.16 6.31 6.26 6.72 6.97 6.06 7.93 10.49 9.94 53.89 12.59 16.71 16.23
Cpa|evm.model.tig00000128.20 (tig00000128_g7219.t1)
0.66 0.8 1.01 0.7 1.26 1.33 1.2 1.01 1.54 1.16 1.48 1.12 0.58 1.58 1.47 1.62 1.07 1.59 2.36 1.17 0.93 0.59 6.94 2.22 1.08 1.7
Cpa|evm.model.tig00000144.160 (tig00000144_g9153.t1)
10.69 7.48 8.17 9.57 11.81 7.5 7.11 7.94 8.37 9.19 12.38 14.69 14.84 8.29 4.79 4.71 4.04 5.26 5.72 3.4 12.01 22.57 42.33 20.01 9.32 11.16
Cpa|evm.model.tig00000144.63 (tig00000144_g9054.t1)
3.22 5.45 5.5 3.31 3.37 3.98 3.73 4.66 3.48 2.82 4.3 3.74 2.84 7.62 6.53 5.28 4.94 8.37 8.12 5.29 3.48 4.59 32.49 4.26 12.26 9.87
Cpa|evm.model.tig00000157.113 (tig00000157_g9712.t1)
4.47 4.28 4.3 5.79 5.82 5.11 5.24 5.7 5.44 4.99 4.77 4.42 4.36 3.78 3.96 3.78 3.73 4.93 4.86 3.89 3.35 5.12 12.98 6.84 4.9 5.25
Cpa|evm.model.tig00000215.100 (tig00000215_g18638.t1)
0.0 0.2 0.18 0.31 0.35 0.27 0.16 0.3 0.25 0.2 0.43 0.47 0.1 0.15 0.19 0.25 0.07 0.3 0.18 0.16 0.08 0.23 2.1 0.25 0.72 0.25
Cpa|evm.model.tig00000246.1 (tig00000246_g21494.t1)
1.86 0.86 0.53 0.87 0.89 0.88 1.12 1.18 1.01 1.22 1.24 0.96 1.02 1.02 1.14 0.86 1.08 1.85 2.47 0.89 1.33 1.44 14.57 4.39 2.9 2.64
Cpa|evm.model.tig00000254.50 (tig00000254_g22502.t1)
1.49 2.27 1.82 3.2 4.43 4.28 4.24 3.77 5.51 4.02 4.83 3.71 1.84 3.75 2.97 3.63 2.98 7.68 4.27 3.54 1.8 9.55 28.53 10.85 14.79 9.81
Cpa|evm.model.tig00000269.64 (tig00000269_g23726.t1)
1.48 2.03 1.55 1.78 4.14 2.39 2.48 2.56 4.08 4.26 4.02 4.25 2.55 1.68 1.85 1.22 1.64 1.91 1.54 2.4 1.18 3.03 12.03 3.84 4.64 6.78
Cpa|evm.model.tig00000361.59 (tig00000361_g24407.t1)
0.26 0.05 0.35 0.96 1.13 0.66 1.1 1.16 2.07 1.68 1.88 1.35 0.13 0.85 0.38 0.78 0.34 1.02 0.63 0.38 1.33 3.65 7.83 3.52 2.99 1.5
Cpa|evm.model.tig00000459.33 (tig00000459_g1100.t1)
0.92 0.89 1.1 1.82 1.62 1.32 1.36 1.23 1.48 1.01 0.98 0.82 0.66 1.04 0.7 0.91 1.04 1.34 0.84 1.09 0.65 2.03 7.08 1.4 2.05 2.2
Cpa|evm.model.tig00000545.47 (tig00000545_g2022.t1)
6.88 6.43 6.21 7.68 8.02 5.99 7.29 7.24 7.23 6.03 8.76 9.37 6.69 6.74 3.94 5.35 9.43 6.22 6.69 4.93 5.15 8.9 25.33 12.17 12.72 11.15
Cpa|evm.model.tig00000551.13 (tig00000551_g2035.t1)
1.03 4.27 4.78 6.43 7.13 6.98 5.43 4.9 7.05 6.11 5.5 6.7 1.52 4.72 4.51 5.64 4.32 6.75 6.8 3.87 4.58 5.57 24.48 9.16 9.33 7.45
Cpa|evm.model.tig00000711.62 (tig00000711_g3424.t1)
2.27 2.56 2.29 2.36 3.49 2.38 3.56 3.19 2.26 3.1 2.61 3.32 2.01 4.41 5.08 4.33 2.56 4.27 6.79 3.01 2.59 4.22 14.27 8.24 5.51 4.57
Cpa|evm.model.tig00000718.57 (tig00000718_g3729.t1)
36.54 39.06 29.21 29.25 30.44 37.57 35.78 36.97 30.96 27.42 31.24 34.28 23.97 32.41 26.29 23.1 34.94 40.46 32.07 25.65 51.72 34.04 116.66 61.24 50.19 50.14
Cpa|evm.model.tig00000737.21 (tig00000737_g3800.t1)
0.17 0.07 0.11 0.04 0.1 0.05 0.05 0.09 0.13 0.19 0.15 0.19 0.13 0.92 0.96 0.65 1.21 1.15 0.88 1.03 0.44 1.3 5.7 2.73 3.65 2.17
Cpa|evm.model.tig00000792.22 (tig00000792_g4172.t1)
1.14 3.05 3.39 4.55 5.01 4.32 3.88 4.18 5.49 6.19 5.99 5.7 1.23 5.12 4.52 3.87 4.04 4.98 5.64 5.36 4.18 12.2 23.42 9.08 9.02 11.12
Cpa|evm.model.tig00000970.3 (tig00000970_g5825.t1)
18.34 17.11 16.46 21.88 21.24 17.92 23.15 24.26 20.93 19.03 17.66 15.42 16.57 10.69 12.18 12.92 15.69 23.9 17.05 17.53 14.95 22.43 58.38 19.93 26.0 17.35
Cpa|evm.model.tig00001030.40 (tig00001030_g6479.t1)
0.49 1.3 3.9 5.93 6.94 4.94 5.8 4.32 7.38 6.33 7.34 7.08 0.27 3.9 3.2 4.58 3.84 4.82 3.67 2.74 6.07 11.27 25.61 5.88 12.22 7.59
Cpa|evm.model.tig00001127.2 (tig00001127_g7135.t1)
2.1 2.19 1.61 3.19 3.48 2.31 2.98 3.84 3.13 3.65 2.66 2.73 0.9 3.43 2.07 3.26 3.02 3.94 2.48 2.61 1.46 1.96 12.18 3.95 5.33 3.45
Cpa|evm.model.tig00001154.5 (tig00001154_g7269.t1)
0.92 1.87 4.38 7.48 10.91 11.64 11.64 8.07 17.28 10.08 8.89 3.67 0.97 6.62 6.17 5.24 6.65 8.16 7.59 4.39 11.51 25.93 76.01 20.22 29.44 17.34
Cpa|evm.model.tig00001155.2 (tig00001155_g7310.t1)
3.82 5.37 5.12 5.43 6.04 5.25 6.98 6.66 6.92 7.19 7.83 6.68 3.18 5.05 4.73 4.49 4.37 5.6 5.4 4.6 3.05 6.76 32.81 15.07 13.12 12.27
Cpa|evm.model.tig00001215.14 (tig00001215_g7579.t1)
21.52 11.37 4.7 5.03 9.95 16.41 31.86 27.31 21.01 20.51 15.4 12.85 18.07 18.91 13.44 12.48 21.73 24.08 20.7 15.98 8.29 14.79 107.74 25.59 26.14 15.51
Cpa|evm.model.tig00001254.9 (tig00001254_g7814.t1)
9.11 12.21 14.36 20.28 24.18 25.93 24.41 22.55 20.19 19.77 18.23 17.05 10.98 9.97 8.87 7.45 10.18 11.35 11.53 11.09 18.01 13.41 51.76 17.09 14.3 16.74
Cpa|evm.model.tig00001264.19 (tig00001264_g7875.t1)
2.43 5.53 4.05 4.23 5.77 5.77 5.61 5.04 6.07 6.97 6.15 4.88 2.98 3.85 5.13 3.68 5.09 6.68 7.23 7.32 4.68 0.94 21.36 12.88 8.6 7.48
Cpa|evm.model.tig00001265.9 (tig00001265_g7896.t1)
3.24 4.19 3.96 4.09 5.21 5.48 6.28 4.92 5.8 6.62 6.55 6.16 2.97 5.95 6.2 5.11 6.01 6.96 7.48 4.77 2.08 3.08 17.98 11.96 9.82 8.57
Cpa|evm.model.tig00001302.10 (tig00001302_g8095.t1)
8.98 6.67 6.55 7.25 5.83 6.33 7.0 9.93 8.33 6.51 8.68 7.98 6.32 2.43 3.45 2.76 3.39 5.59 4.54 3.83 9.42 5.55 32.85 10.72 12.6 8.02
Cpa|evm.model.tig00001368.16 (tig00001368_g8415.t1)
1.18 2.19 3.08 2.77 2.88 2.3 2.51 3.29 3.75 3.18 3.21 3.97 0.96 2.85 1.97 3.1 2.46 4.22 3.4 2.08 1.62 7.36 15.55 4.25 4.98 4.65
Cpa|evm.model.tig00001527.8 (tig00001527_g9258.t1)
2.06 1.51 0.72 1.77 1.95 1.46 2.67 2.5 4.1 3.32 4.53 2.82 1.34 0.88 0.59 1.42 0.76 1.85 1.11 0.82 0.77 4.58 16.55 4.92 6.07 4.91
Cpa|evm.model.tig00001669.4 (tig00001669_g9558.t1)
8.12 7.48 5.4 5.72 4.12 3.48 4.74 6.5 7.04 6.42 6.64 5.82 7.04 5.77 5.66 5.63 5.87 10.76 11.62 4.44 4.79 7.48 28.26 10.08 9.49 7.18
Cpa|evm.model.tig00020553.151 (tig00020553_g10642.t1)
1.72 0.95 0.87 1.21 1.29 0.61 0.8 1.14 1.01 0.83 0.89 0.63 1.14 0.75 1.06 0.45 0.45 1.37 1.05 0.37 1.4 1.12 8.35 0.84 1.7 1.06
Cpa|evm.model.tig00020572.33 (tig00020572_g11552.t1)
0.48 0.6 0.75 1.39 0.87 0.81 1.09 1.47 1.42 1.43 2.0 1.61 0.44 0.49 0.71 0.79 0.75 1.47 0.84 0.63 5.65 1.62 16.65 7.11 4.19 3.78
Cpa|evm.model.tig00020601.17 (tig00020601_g11727.t1)
5.37 4.24 3.5 5.08 7.19 6.06 6.06 5.35 6.0 5.3 5.58 5.16 4.23 3.17 4.63 3.02 2.7 3.21 3.09 2.51 3.77 1.84 15.56 6.29 4.61 3.91
Cpa|evm.model.tig00020629.69 (tig00020629_g12396.t1)
2.5 1.61 1.55 1.91 1.85 1.49 2.14 2.17 3.15 3.36 4.03 3.74 2.21 1.24 2.28 1.11 1.31 2.61 2.21 2.01 3.92 5.5 15.01 5.9 5.44 5.06
Cpa|evm.model.tig00020710.127 (tig00020710_g13391.t1)
8.59 6.79 5.69 6.92 4.71 4.7 4.77 6.37 6.75 6.59 9.52 9.51 8.01 5.47 5.84 4.58 6.49 5.79 8.86 8.98 0.67 6.49 22.73 11.18 11.1 13.15
Cpa|evm.model.tig00020710.129 (tig00020710_g13393.t1)
0.32 1.02 0.54 0.8 1.27 1.56 1.86 2.19 3.73 4.07 4.3 2.99 0.32 1.39 1.56 1.22 2.21 3.82 3.17 2.3 2.17 3.32 23.17 10.41 7.85 5.62
Cpa|evm.model.tig00020710.23 (tig00020710_g13255.t1)
7.98 9.6 9.32 10.57 10.69 9.81 7.14 8.8 8.57 6.64 8.04 7.82 6.5 5.68 5.79 5.0 4.25 6.24 5.38 4.54 4.74 4.21 19.33 8.43 8.76 6.85
Cpa|evm.model.tig00020801.49 (tig00020801_g13933.t1)
2.61 1.46 1.3 1.56 1.55 1.15 1.55 1.58 1.81 1.56 2.31 1.63 1.57 0.71 1.03 0.71 1.08 1.42 2.29 0.98 2.93 0.96 12.15 3.51 4.34 3.32
Cpa|evm.model.tig00020830.29 (tig00020830_g14410.t1)
0.81 3.82 4.03 4.79 6.4 6.31 6.12 6.5 6.89 6.34 7.47 8.27 1.16 4.46 3.26 3.38 3.39 5.23 6.48 3.53 4.4 8.42 22.81 10.93 7.24 6.5
Cpa|evm.model.tig00020902.8 (tig00020902_g14950.t1)
0.31 0.1 0.7 2.27 2.78 2.14 2.66 2.68 4.92 6.16 8.45 6.4 0.45 1.09 0.5 0.49 1.88 2.96 1.36 2.46 15.43 31.91 59.04 23.57 9.18 11.18
Cpa|evm.model.tig00020944.22 (tig00020944_g16368.t1)
2.03 1.52 2.75 3.63 3.0 2.31 2.94 4.15 3.1 4.73 3.89 2.76 2.15 2.86 2.97 2.3 3.66 5.12 4.18 6.21 1.37 6.45 25.06 9.87 13.78 11.31
Cpa|evm.model.tig00020944.23 (tig00020944_g16369.t1)
6.75 5.58 8.2 10.64 9.04 6.99 8.84 11.3 10.47 10.56 11.45 9.18 8.12 5.88 6.98 4.08 4.97 6.55 8.36 10.47 1.58 7.65 34.38 20.18 17.18 19.34
Cpa|evm.model.tig00020960.34 (tig00020960_g16557.t1)
2.49 1.27 1.43 1.5 2.28 1.91 1.69 1.93 2.3 2.14 2.97 2.78 2.14 1.37 1.37 1.16 0.61 1.71 1.24 0.81 2.15 6.63 14.74 7.25 3.35 2.37
Cpa|evm.model.tig00020961.26 (tig00020961_g16646.t1)
15.26 20.23 19.68 15.75 7.64 5.06 7.57 13.11 15.04 18.08 18.48 18.76 15.65 22.84 17.89 25.68 16.76 20.8 25.19 20.14 12.45 14.77 80.27 24.71 34.96 31.1
Cpa|evm.model.tig00020996.22 (tig00020996_g16936.t1)
1.03 2.75 5.88 5.37 4.26 2.95 4.33 6.53 5.91 5.39 6.04 5.02 0.83 6.28 6.02 5.05 4.66 8.78 8.61 4.79 2.19 3.96 25.65 6.47 8.78 7.63
Cpa|evm.model.tig00021122.18 (tig00021122_g18449.t1)
9.97 4.54 3.46 3.27 5.54 7.49 8.89 9.51 10.67 10.94 10.58 9.86 10.1 8.11 6.16 6.58 6.41 9.97 9.05 7.21 8.86 12.1 38.19 15.39 16.88 8.4
Cpa|evm.model.tig00021127.169 (tig00021127_g18853.t1)
2.36 2.45 1.82 2.51 2.56 2.24 3.87 3.7 3.38 3.65 4.51 3.94 1.78 2.08 2.47 2.69 2.51 3.8 3.9 2.76 0.55 1.66 10.02 6.15 5.03 3.75
Cpa|evm.model.tig00021168.7 (tig00021168_g19072.t1)
0.26 0.22 0.23 0.76 0.78 0.32 0.43 0.55 0.31 0.43 0.54 0.33 0.21 0.14 0.25 0.09 0.09 0.13 0.12 0.09 0.46 0.59 1.66 0.75 0.53 0.36
Cpa|evm.model.tig00021179.7 (tig00021179_g19221.t1)
1.2 4.95 6.93 6.14 6.59 6.69 5.82 7.25 7.59 5.86 6.81 7.08 0.59 7.31 5.68 7.27 5.13 7.65 5.34 3.98 2.18 4.42 26.55 7.13 12.08 6.17
Cpa|evm.model.tig00021257.18 (tig00021257_g19756.t1)
3.9 4.66 3.77 11.89 10.01 4.69 7.76 9.26 9.32 9.56 11.46 9.19 7.13 3.88 6.85 5.16 4.61 7.39 5.47 3.15 10.67 19.17 28.53 14.31 10.26 6.14
19.94 13.94 15.62 16.0 17.44 17.08 19.23 17.12 19.7 19.22 21.15 22.28 15.16 13.05 10.26 12.36 12.21 26.4 27.33 20.62 35.1 33.25 139.36 49.7 42.29 41.02
Cpa|evm.model.tig00021493.52 (tig00021493_g21891.t1)
8.1 11.62 13.56 14.5 13.12 9.66 11.85 12.43 12.69 12.91 15.27 14.08 8.84 11.24 9.73 10.29 11.6 10.98 11.34 8.52 7.63 18.68 48.85 20.4 28.74 17.02
Cpa|evm.model.tig00021525.18 (tig00021525_g22134.t1)
5.63 8.58 8.78 7.51 6.4 7.07 8.76 8.85 9.87 10.69 10.89 11.68 5.64 9.1 11.16 9.96 10.67 10.3 11.88 11.55 4.09 7.56 32.37 14.93 9.04 12.48
Cpa|evm.model.tig00021535.3 (tig00021535_g22209.t1)
0.42 0.21 0.12 0.38 0.46 0.27 0.29 0.38 0.45 0.43 0.51 0.33 0.43 0.54 1.26 1.0 0.58 1.67 1.95 0.77 0.5 1.11 4.34 2.43 1.2 1.41
Cpa|evm.model.tig00021583.9 (tig00021583_g22650.t2)
15.45 16.97 16.65 14.74 14.44 15.28 22.8 21.16 20.48 19.92 16.6 17.96 13.17 20.21 23.24 24.11 23.59 22.57 24.35 22.19 12.03 11.25 62.4 22.78 22.78 19.48
Cpa|evm.model.tig00021591.2 (tig00021532_g22205.t1)
0.3 0.31 0.11 0.22 0.09 0.08 0.13 0.39 0.33 0.32 0.21 0.12 0.04 0.14 0.26 0.22 0.11 0.94 1.01 0.07 1.87 1.52 7.4 2.41 1.44 1.41
Cpa|evm.model.tig00021603.5 (tig00021603_g22814.t1)
0.47 0.81 0.76 0.46 0.61 0.43 0.66 0.72 0.75 0.7 0.69 0.79 0.39 0.21 0.12 0.13 0.38 0.73 0.53 0.42 0.31 0.26 5.29 1.53 1.59 1.01

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)