1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.50 (tig00000042_g15441.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000042.95 (tig00000042_g15494.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000137.9 (tig00000227_g19858.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000140.22 (tig00000057_g148.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000157.1 (tig00000157_g9590.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.48 0.0
Cpa|evm.model.tig00000157.128 (tig00020510_g9798.t1)
 0.53 0.04 0.02 0.24 0.42 0.1 0.25 0.1 0.25 0.21 0.63 0.33 0.02 0.17 0.46 0.11 0.08 0.2 0.43 0.02 0.2 0.18 1.0 0.4 0.57 0.47
Cpa|evm.model.tig00000190.20 (tig00000190_g13841.t1)
 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.07 0.09 0.1 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 1.0 0.09 0.02 0.04
Cpa|evm.model.tig00000202.7 (tig00000202_g16615.t1)
 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000254.2 (tig00000254_g22447.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.06 0.0 0.05 0.07 0.0 1.0 0.07 0.1 0.0
Cpa|evm.model.tig00000263.10 (tig00000882_g5276.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000382.26 (tig00000382_g24560.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000383.11 (tig00021357_g20800.t1)
 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.06 0.0 0.01 0.0 0.06 0.08 0.0 1.0 0.0 0.01 0.01
Cpa|evm.model.tig00000396.6 (tig00000396_g24877.t1)
 0.12 0.03 0.08 0.07 0.2 0.02 0.07 0.09 0.12 0.02 0.09 0.05 0.13 0.07 0.1 0.0 0.07 0.18 0.04 0.0 0.13 0.15 1.0 0.34 0.37 0.14
Cpa|evm.model.tig00000404.50 (tig00000404_g411.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 1.0 0.0 0.05 0.06
Cpa|evm.model.tig00000444.5 (tig00000444_g795.t1)
 0.23 0.18 0.14 0.41 0.29 0.12 0.34 0.3 0.32 0.12 0.2 0.15 0.22 0.27 0.23 0.12 0.11 0.32 0.19 0.1 0.27 0.35 1.0 0.26 0.65 0.17
Cpa|evm.model.tig00000449.6 (tig00020904_g15227.t1)
 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.01 0.01 0.0 0.01 0.02 0.0 1.0 0.39 0.25 0.01
Cpa|evm.model.tig00000492.113 (tig00000492_g1506.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.26 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.09 0.08 0.0 1.0 0.0 0.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000492.62 (tig00000492_g1451.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000663.4 (tig00000663_g2935.t1)
 0.32 0.08 0.08 0.18 0.12 0.0 0.2 0.21 0.2 0.08 0.19 0.15 0.12 0.14 0.11 0.0 0.1 0.24 0.06 0.03 0.07 0.05 1.0 0.19 0.59 0.42
0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.03 0.0 0.03 0.02 0.0 0.03 0.21 0.18 0.02 0.03 0.13 0.0 1.0 0.09 0.06 0.04
Cpa|evm.model.tig00000828.21 (tig00000828_g4622.t1)
 0.15 0.12 0.08 0.05 0.03 0.02 0.03 0.09 0.05 0.11 0.05 0.05 0.02 0.03 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.06 0.09 0.06 1.0 0.35 0.14 0.15
Cpa|evm.model.tig00001333.5 (tig00001333_g8182.t1)
 0.04 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.11 0.01 0.1 0.0 0.01 0.04 1.0 0.0 0.02 0.02
Cpa|evm.model.tig00001479.2 (tig00001479_g8903.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00001487.11 (tig00001487_g8940.t1)
 0.05 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.06 0.25 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020510.105 (tig00020510_g9890.t1)
 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.06
Cpa|evm.model.tig00020553.224 (tig00020553_g10714.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.23 0.11 0.0 0.13 0.05 0.04 0.11 0.02 1.0 0.03 0.01 0.15
Cpa|evm.model.tig00020564.36 (tig00020564_g11436.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.07 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020572.30 (tig00020572_g11548.t1)
 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 1.0 0.02 0.02 0.04
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.06 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020592.32 (tig00000158_g10201.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.44
Cpa|evm.model.tig00020629.112 (tig00020629_g12437.t1)
 0.02 0.03 0.07 0.09 0.01 0.19 0.03 0.11 0.06 0.13 0.14 0.12 0.0 0.03 0.04 0.01 0.0 0.14 0.07 0.0 0.07 0.16 1.0 0.06 0.03 0.1
Cpa|evm.model.tig00020629.7 (tig00020629_g12324.t1)
 0.33 0.3 0.24 0.32 0.35 0.18 0.34 0.4 0.44 0.42 0.43 0.31 0.45 0.26 0.18 0.14 0.21 0.3 0.15 0.2 0.08 0.36 1.0 0.28 0.83 0.54
Cpa|evm.model.tig00020675.117 (tig00000411_g549.t1)
 0.11 0.13 0.18 0.11 0.13 0.06 0.04 0.06 0.06 0.06 0.08 0.08 0.08 0.13 0.09 0.14 0.24 0.08 0.14 0.09 0.08 0.02 1.0 0.13 0.17 0.2
Cpa|evm.model.tig00020725.15 (tig00020725_g13542.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020800.12 (tig00020800_g13730.t1)
 0.76 0.51 0.38 0.45 0.31 0.23 0.35 0.36 0.34 0.45 0.6 0.82 0.83 0.44 0.39 0.56 0.38 0.46 0.49 0.24 0.2 0.28 1.0 0.6 0.65 0.74
Cpa|evm.model.tig00020801.38 (tig00020801_g13920.t1)
 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.24 0.0 1.0 0.08 0.03 0.07
Cpa|evm.model.tig00020801.66 (tig00020801_g13951.t1)
 0.16 0.12 0.07 0.21 0.15 0.27 0.2 0.11 0.04 0.04 0.07 0.28 0.02 0.0 0.07 0.02 0.02 0.04 0.07 0.0 0.01 0.02 1.0 0.0 0.01 0.08
Cpa|evm.model.tig00020806.21 (tig00020941_g16235.t1)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.05 0.07 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.06 0.02 0.0 0.03 0.09 0.03 0.01 0.04 1.0 0.14 0.09 0.0
Cpa|evm.model.tig00020902.28 (tig00020902_g14979.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020941.27 (tig00020941_g16220.t1)
 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.09 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020943.77 (tig00020943_g16317.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.1 0.08 0.16 0.23 0.06 0.05 0.43 0.23 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.24 0.07 0.04 0.12 0.0 1.0 0.21 0.12 0.32
Cpa|evm.model.tig00020951.19 (tig00020951_g16417.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.07 0.07 0.13 0.07 0.0 0.0 0.06 0.0 0.15 0.0 0.0 0.18 0.07 0.13 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020995.20 (tig00020682_g12843.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 1.0 0.0 0.0 0.17
Cpa|evm.model.tig00021045.11 (tig00021045_g17656.t1)
 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.04 0.1 0.09 0.02 0.08 0.02 0.0 0.06 0.02 0.03 0.0 0.02 0.03 0.03 1.0 0.03 0.11 0.22
Cpa|evm.model.tig00021045.12 (tig00021045_g17657.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021168.34 (tig00021168_g19110.t1)
 0.1 0.0 0.2 0.09 0.04 0.33 0.21 0.19 0.25 0.09 0.19 0.05 0.0 0.0 0.08 0.09 0.0 0.16 0.05 0.04 0.0 0.45 1.0 0.0 0.53 0.2
Cpa|evm.model.tig00021168.65 (tig00021168_g19130.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021222.13 (tig00021222_g19371.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021254.12 (tig00021254_g19689.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.13 0.03 0.0 0.0 0.03 0.03 1.0 0.0 0.0 0.0
0.05 0.02 0.0 0.03 0.06 0.03 0.0 0.03 0.06 0.05 0.11 0.03 0.05 0.0 0.03 0.03 0.03 0.05 0.02 0.0 0.03 0.4 1.0 0.17 0.26 0.14
Cpa|evm.model.tig00021348.101 (tig00021348_g20608.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.05 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021358.3 (tig00021358_g20809.t1)
 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 1.0 0.17 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021432.2 (tig00021432_g21192.t1)
 1.0 0.5 0.32 0.38 0.31 0.28 0.41 0.56 0.51 0.53 0.7 0.72 0.8 0.33 0.36 0.41 0.3 0.49 0.43 0.28 0.16 0.42 0.7 0.45 0.67 0.54
Cpa|evm.model.tig00021518.33 (tig00021518_g22049.t1)
 0.27 0.12 0.07 0.21 0.21 0.06 0.02 0.14 0.15 0.17 0.33 0.22 0.18 0.01 0.06 0.08 0.0 0.08 0.01 0.07 0.05 0.39 1.0 0.61 0.64 0.56
Cpa|evm.model.tig00021536.5 (tig00021535_g22231.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 1.0 0.11 0.14 0.15
Cpa|evm.model.tig00021687.19 (tig00021137_g18972.t1)
 0.07 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.07 0.09 0.0 0.0 0.16 0.24 1.0 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00022075.96 (tig00022075_g23654.t1)
 0.1 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.09 1.0 0.0 0.13 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)