1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.50 (tig00000042_g15441.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000042.95 (tig00000042_g15494.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000137.9 (tig00000227_g19858.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000140.22 (tig00000057_g148.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000157.1 (tig00000157_g9590.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.04 0.0
Cpa|evm.model.tig00000157.128 (tig00020510_g9798.t1)
 0.49 0.03 0.02 0.22 0.39 0.1 0.23 0.09 0.23 0.19 0.58 0.3 0.02 0.15 0.43 0.1 0.07 0.19 0.4 0.02 0.18 0.16 0.92 0.37 0.53 0.43
Cpa|evm.model.tig00000190.20 (tig00000190_g13841.t1)
 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.14 0.04 0.09 0.12 0.15 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 1.4 0.13 0.03 0.06
Cpa|evm.model.tig00000202.7 (tig00000202_g16615.t1)
 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000254.2 (tig00000254_g22447.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.08 0.0 0.06 0.08 0.0 1.22 0.09 0.13 0.0
Cpa|evm.model.tig00000263.10 (tig00000882_g5276.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.89 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000382.26 (tig00000382_g24560.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000383.11 (tig00021357_g20800.t1)
 0.0 0.0 0.13 0.02 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.06 0.18 0.0 0.03 0.0 0.18 0.22 0.0 2.93 0.0 0.03 0.03
Cpa|evm.model.tig00000396.6 (tig00000396_g24877.t1)
 0.12 0.03 0.08 0.07 0.19 0.02 0.07 0.08 0.11 0.02 0.08 0.05 0.13 0.07 0.1 0.0 0.07 0.17 0.03 0.0 0.12 0.14 0.97 0.33 0.36 0.14
Cpa|evm.model.tig00000404.50 (tig00000404_g411.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.26 0.0 0.01 0.02
Cpa|evm.model.tig00000444.5 (tig00000444_g795.t1)
 0.38 0.29 0.23 0.68 0.48 0.2 0.57 0.5 0.53 0.21 0.34 0.26 0.37 0.46 0.37 0.2 0.18 0.53 0.32 0.17 0.45 0.58 1.66 0.43 1.08 0.27
Cpa|evm.model.tig00000449.6 (tig00020904_g15227.t1)
 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.08 0.06 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.14 0.04 0.03 0.0 0.03 0.06 0.0 3.06 1.19 0.75 0.03
Cpa|evm.model.tig00000492.113 (tig00000492_g1506.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.2 0.0 0.0 0.03
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.57 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000492.62 (tig00000492_g1451.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00000663.4 (tig00000663_g2935.t1)
 0.9 0.22 0.22 0.5 0.33 0.0 0.57 0.58 0.56 0.23 0.54 0.42 0.34 0.39 0.3 0.0 0.29 0.67 0.18 0.08 0.19 0.15 2.8 0.55 1.67 1.19
0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.04 0.0 0.04 0.03 0.0 0.04 0.33 0.27 0.03 0.04 0.2 0.0 1.55 0.13 0.1 0.07
Cpa|evm.model.tig00000828.21 (tig00000828_g4622.t1)
 0.14 0.11 0.07 0.05 0.02 0.02 0.03 0.08 0.05 0.1 0.04 0.05 0.02 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.08 0.05 0.92 0.32 0.13 0.14
Cpa|evm.model.tig00001333.5 (tig00001333_g8182.t1)
 0.08 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.19 0.03 0.19 0.0 0.02 0.07 1.82 0.0 0.03 0.03
Cpa|evm.model.tig00001479.2 (tig00001479_g8903.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.27 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00001487.11 (tig00001487_g8940.t1)
 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.02 0.09 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020510.105 (tig00020510_g9890.t1)
 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.01
Cpa|evm.model.tig00020553.224 (tig00020553_g10714.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.24 0.11 0.0 0.13 0.06 0.04 0.11 0.02 1.02 0.03 0.01 0.15
Cpa|evm.model.tig00020564.36 (tig00020564_g11436.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.03 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020572.30 (tig00020572_g11548.t1)
 0.0 0.03 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.89 0.02 0.01 0.03
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.32 0.02 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020592.32 (tig00000158_g10201.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.31
Cpa|evm.model.tig00020629.112 (tig00020629_g12437.t1)
 0.04 0.05 0.1 0.14 0.02 0.28 0.05 0.16 0.09 0.2 0.21 0.19 0.0 0.05 0.06 0.02 0.0 0.21 0.1 0.0 0.11 0.25 1.5 0.08 0.04 0.15
Cpa|evm.model.tig00020629.7 (tig00020629_g12324.t1)
 3.31 3.06 2.4 3.2 3.52 1.82 3.45 4.06 4.44 4.2 4.39 3.09 4.55 2.62 1.84 1.42 2.1 3.03 1.52 2.06 0.85 3.58 10.09 2.81 8.37 5.43
Cpa|evm.model.tig00020675.117 (tig00000411_g549.t1)
 0.54 0.63 0.89 0.55 0.63 0.29 0.2 0.28 0.27 0.31 0.38 0.4 0.39 0.65 0.46 0.68 1.18 0.4 0.69 0.41 0.4 0.11 4.85 0.61 0.83 0.99
Cpa|evm.model.tig00020725.15 (tig00020725_g13542.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020800.12 (tig00020800_g13730.t1)
 2.44 1.64 1.21 1.45 0.98 0.75 1.11 1.16 1.1 1.45 1.92 2.61 2.67 1.39 1.23 1.8 1.22 1.48 1.57 0.76 0.65 0.9 3.19 1.93 2.09 2.36
Cpa|evm.model.tig00020801.38 (tig00020801_g13920.t1)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.1 0.0 0.44 0.03 0.01 0.03
Cpa|evm.model.tig00020801.66 (tig00020801_g13951.t1)
 0.19 0.14 0.09 0.25 0.18 0.32 0.24 0.13 0.04 0.04 0.08 0.33 0.02 0.0 0.08 0.02 0.02 0.05 0.08 0.0 0.01 0.03 1.19 0.0 0.01 0.09
Cpa|evm.model.tig00020806.21 (tig00020941_g16235.t1)
 0.05 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.04 0.11 0.15 0.0 0.0 0.05 0.04 0.06 0.13 0.04 0.0 0.07 0.19 0.07 0.03 0.08 2.27 0.31 0.2 0.0
Cpa|evm.model.tig00020902.28 (tig00020902_g14979.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020941.27 (tig00020941_g16220.t1)
 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.14 0.1 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020943.77 (tig00020943_g16317.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.09 0.08 0.15 0.21 0.05 0.05 0.4 0.21 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.22 0.07 0.03 0.11 0.0 0.92 0.19 0.11 0.29
Cpa|evm.model.tig00020951.19 (tig00020951_g16417.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.04 0.05 0.08 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.11 0.04 0.08 0.0 0.61 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00020995.20 (tig00020682_g12843.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.0 0.02
Cpa|evm.model.tig00021045.11 (tig00021045_g17656.t1)
 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.05 0.05 0.1 0.09 0.02 0.09 0.02 0.0 0.06 0.03 0.03 0.0 0.02 0.03 0.03 1.03 0.03 0.11 0.23
Cpa|evm.model.tig00021045.12 (tig00021045_g17657.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021168.34 (tig00021168_g19110.t1)
 0.05 0.0 0.09 0.04 0.02 0.15 0.09 0.08 0.12 0.04 0.09 0.02 0.0 0.0 0.04 0.04 0.0 0.07 0.02 0.02 0.0 0.2 0.45 0.0 0.24 0.09
Cpa|evm.model.tig00021168.65 (tig00021168_g19130.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021222.13 (tig00021222_g19371.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021254.12 (tig00021254_g19689.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.22 0.04 0.0 0.0 0.05 0.05 1.71 0.0 0.0 0.0
0.07 0.03 0.0 0.05 0.1 0.05 0.0 0.04 0.09 0.08 0.17 0.05 0.08 0.0 0.04 0.04 0.05 0.08 0.03 0.0 0.05 0.63 1.56 0.27 0.41 0.22
Cpa|evm.model.tig00021348.101 (tig00021348_g20608.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.04 0.82 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021358.3 (tig00021358_g20809.t1)
 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.4 0.07 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00021432.2 (tig00021432_g21192.t1)
 10.91 5.49 3.46 4.14 3.35 3.01 4.49 6.13 5.6 5.83 7.69 7.86 8.76 3.61 3.91 4.48 3.28 5.36 4.7 3.1 1.75 4.54 7.67 4.89 7.27 5.84
Cpa|evm.model.tig00021518.33 (tig00021518_g22049.t1)
 0.32 0.14 0.09 0.25 0.25 0.07 0.02 0.17 0.18 0.21 0.39 0.26 0.21 0.01 0.08 0.09 0.0 0.09 0.02 0.09 0.06 0.46 1.19 0.72 0.75 0.66
Cpa|evm.model.tig00021536.5 (tig00021535_g22231.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.3 0.03 0.04 0.05
Cpa|evm.model.tig00021687.19 (tig00021137_g18972.t1)
 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.05 0.07 0.29 0.0 0.0 0.0
Cpa|evm.model.tig00022075.96 (tig00022075_g23654.t1)
 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.05 0.53 0.0 0.07 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)