Heatmap: Cluster_196 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.267 (tig00000042_g15669.t1)
0.46 -0.23 -0.22 -0.07 -0.07 -0.15 0.41 0.5 0.25 0.01 -0.13 -0.26 0.31 -0.53 0.24 -0.17 0.15 0.46 0.18 0.41 -3.33 -1.05 0.1 -0.04 -0.15 -0.09
Cpa|evm.model.tig00000042.94 (tig00000042_g15493.t1)
0.08 0.34 0.25 0.31 0.37 -0.04 0.23 0.34 -0.55 -0.22 -0.4 -0.17 -0.01 0.18 -0.4 0.35 -0.33 0.39 0.35 -0.22 -2.4 -1.17 0.72 -1.52 0.45 -0.06
Cpa|evm.model.tig00000057.116 (tig00000057_g140.t1)
0.35 0.15 -0.06 -0.22 -0.06 -0.3 0.04 0.02 -0.2 0.02 -0.02 0.06 0.14 -0.64 0.22 0.17 0.04 0.61 0.64 0.02 -3.23 -1.47 0.65 -0.09 -0.03 -0.07
Cpa|evm.model.tig00000093.198 (tig00000093_g3622.t1)
-2.78 -2.32 -1.18 0.04 -0.16 -0.17 -1.12 -1.16 -0.05 0.17 0.23 -0.15 -1.8 0.84 0.36 1.07 -0.18 -0.09 0.08 -0.83 -2.02 -1.1 1.91 0.42 0.36 0.41
Cpa|evm.model.tig00000093.253 (tig00000093_g3674.t1)
-1.12 -0.22 -0.31 0.07 0.38 0.36 0.34 0.21 0.28 0.23 0.33 0.3 -1.34 -0.21 -0.3 -0.15 0.06 0.44 0.12 -0.38 -0.64 -1.45 0.72 0.27 0.18 -0.48
Cpa|evm.model.tig00000144.82 (tig00000144_g9073.t1)
0.49 0.51 0.15 -0.36 -0.57 -0.97 -0.17 -0.08 -0.45 -0.61 -0.62 -0.87 -0.18 0.17 0.33 0.1 0.02 1.01 0.75 0.44 -2.1 -1.53 1.1 -0.39 -0.09 -0.23
Cpa|evm.model.tig00000145.38 (tig00000145_g8839.t1)
0.47 0.16 -0.07 0.14 0.11 -0.45 0.13 0.15 -0.37 -0.24 -0.13 0.07 0.74 0.61 -0.74 0.33 -0.4 -0.05 -0.33 -0.56 -1.58 -0.66 0.99 -0.35 0.11 -0.37
Cpa|evm.model.tig00000157.59 (tig00000157_g9646.t1)
-0.86 -0.72 -0.9 -0.55 -0.05 0.45 0.63 0.67 0.61 0.36 0.21 -0.09 -0.88 0.08 -0.78 -0.48 0.21 0.54 0.17 -0.08 -3.12 -0.51 0.82 -0.26 0.46 -0.19
Cpa|evm.model.tig00000204.76 (tig00000204_g17742.t1)
-0.59 -0.69 -0.32 -0.33 0.08 0.15 0.14 -0.09 0.02 0.18 -0.1 -0.26 -0.57 0.23 0.17 0.34 0.0 -0.02 0.03 -0.07 -1.34 -0.74 1.05 0.19 0.33 0.42
Cpa|evm.model.tig00000227.39 (tig00000227_g19830.t1)
-0.93 1.02 1.0 0.7 0.5 0.13 -0.23 -0.3 -0.66 -0.55 -0.94 -0.76 -0.65 0.04 -0.19 -0.29 0.42 0.25 0.0 -0.1 -4.01 -0.77 0.97 -1.32 0.66 -0.3
Cpa|evm.model.tig00000227.47 (tig00000227_g19839.t1)
-0.57 -0.4 -0.34 -0.0 0.34 0.16 0.27 0.1 -0.09 0.19 0.03 0.06 -0.39 0.09 -0.14 0.14 0.12 0.34 0.07 0.15 -1.67 -0.05 0.48 0.22 -0.11 -0.2
Cpa|evm.model.tig00000382.11 (tig00000382_g24551.t1)
-1.09 -0.09 0.15 0.33 0.19 -0.09 0.16 0.38 0.4 0.5 0.15 -0.22 -0.99 -0.03 -0.8 -0.67 -1.03 0.55 0.21 -0.58 -2.37 -0.72 1.16 0.03 0.37 0.28
Cpa|evm.model.tig00000383.48 (tig00000383_g24662.t1)
-0.11 -0.18 -0.04 0.12 0.32 0.39 0.38 0.34 0.15 0.01 -0.05 -0.13 0.02 -0.04 -0.1 0.13 -0.0 0.16 0.1 -0.05 -1.98 0.19 0.02 -0.52 -0.2 -0.2
Cpa|evm.model.tig00000480.55 (tig00000480_g1323.t1)
-1.27 -2.53 -2.33 -3.19 -3.32 -2.5 -0.93 -0.38 -0.08 -0.31 -0.19 -0.77 -0.42 0.08 0.08 -0.43 0.56 1.22 0.15 -1.02 0.32 -1.1 1.57 1.44 1.54 0.02
Cpa|evm.model.tig00000507.26 (tig00000507_g1780.t1)
-0.55 0.01 0.22 0.22 0.34 -0.02 -0.13 0.24 0.11 0.26 0.19 0.03 -1.03 0.35 -0.26 0.11 -0.46 0.55 0.07 -0.21 -1.06 -1.65 0.8 -0.59 0.17 0.12
Cpa|evm.model.tig00000607.9 (tig00000607_g2520.t1)
-0.63 -0.36 -0.51 -0.62 -0.67 -0.55 0.01 -0.5 0.47 0.2 0.32 0.56 -0.54 0.52 0.4 0.43 -0.1 0.46 0.1 -0.49 -3.14 -0.24 1.16 0.0 0.14 -0.39
Cpa|evm.model.tig00000630.44 (tig00000630_g2728.t1)
-0.85 -0.24 0.02 0.37 0.22 -0.26 0.15 0.28 0.17 0.0 0.11 -0.27 -1.34 0.2 0.44 0.35 -0.07 0.54 0.16 -0.3 -1.27 -0.94 0.67 -0.22 0.11 -0.05
Cpa|evm.model.tig00000692.70 (tig00000692_g3269.t1)
-0.36 -0.53 -0.71 -0.74 -0.39 0.06 -0.08 0.01 -0.14 0.13 -0.15 0.07 -0.5 0.14 0.08 0.43 0.13 0.28 0.23 -0.02 -1.25 0.25 1.02 0.11 0.37 -0.15
Cpa|evm.model.tig00000711.26 (tig00000711_g3386.t2)
-0.26 0.05 -0.09 0.34 0.33 0.36 0.47 0.49 0.34 0.04 -0.15 -0.29 -0.43 -0.23 -0.34 -0.15 -0.13 0.57 0.13 0.05 -3.72 -0.2 0.44 -0.59 -0.02 -0.3
Cpa|evm.model.tig00000769.23 (tig00000769_g4017.t1)
0.8 0.43 -0.35 -0.56 -0.96 -0.24 0.19 0.49 -1.14 -0.13 -0.5 -0.74 -0.63 -0.39 -1.41 0.85 0.22 0.58 0.68 0.45 -5.49 -1.77 1.74 -0.71 -0.12 -1.06
Cpa|evm.model.tig00000808.44 (tig00000808_g4430.t1)
-0.39 -0.16 -0.03 0.03 -0.05 -0.15 0.16 0.25 0.27 0.03 -0.09 -0.12 -0.18 0.1 0.23 0.23 0.16 0.37 0.16 0.05 -1.94 -1.52 0.64 -0.1 0.2 -0.08
Cpa|evm.model.tig00000823.22 (tig00000823_g4549.t1)
0.27 -0.03 -0.18 -0.14 0.05 0.02 -0.0 0.02 -0.31 0.01 -0.19 -0.18 0.15 -0.07 -0.2 0.25 -0.08 0.65 0.11 -0.43 -1.55 -0.9 0.75 -0.03 0.68 -0.34
Cpa|evm.model.tig00000828.16 (tig00000828_g4616.t1)
0.36 -0.12 -0.08 -0.24 -0.33 -0.25 0.08 0.0 -0.12 -0.1 -0.09 -0.34 0.38 0.17 0.26 0.37 0.58 0.26 -0.05 -0.21 -2.7 -1.62 0.03 0.28 0.52 0.18
Cpa|evm.model.tig00001181.10 (tig00001181_g7426.t1)
0.18 0.21 0.0 -0.19 -0.09 -0.08 -0.02 -0.24 -0.55 -0.29 -0.48 -0.49 0.01 0.12 0.58 0.32 -0.61 0.77 0.36 -0.16 -1.85 -2.4 0.44 -0.09 0.87 0.3
Cpa|evm.model.tig00001224.1 (tig00001224_g7624.t1)
0.02 -0.29 -0.33 -0.23 -0.08 -0.4 0.19 -0.1 -0.07 0.16 -0.07 -0.16 -0.12 0.26 0.19 0.35 -0.02 0.35 0.14 -0.11 -2.49 -0.26 0.74 -0.28 0.33 0.32
Cpa|evm.model.tig00001310.3 (tig00001310_g8152.t1)
-1.24 -0.52 -0.11 0.07 -0.01 -0.04 0.25 0.4 0.2 0.34 0.16 -0.05 -1.55 0.55 -0.01 0.69 -0.04 0.66 0.26 0.17 -1.98 -1.16 0.21 -1.0 0.33 0.04
Cpa|evm.model.tig00001365.9 (tig00001365_g8361.t1)
-0.31 -0.2 0.0 0.24 0.36 0.28 0.55 0.38 0.16 0.12 -0.01 -0.16 -0.21 -0.03 -0.26 0.09 0.52 0.2 0.12 -0.02 -3.2 -0.13 0.04 -0.59 -0.26 -0.24
Cpa|evm.model.tig00001376.24 (tig00001376_g8545.t1)
-2.77 -0.67 -0.31 -0.0 -0.33 -0.78 0.03 -0.03 0.12 0.26 0.04 0.01 -2.97 0.21 0.26 0.5 0.27 0.35 0.27 -0.07 -2.53 -0.11 1.23 0.16 0.5 0.26
Cpa|evm.model.tig00001376.25 (tig00001376_g8546.t1)
0.31 0.07 0.13 0.04 0.07 -0.11 -0.16 -0.22 -0.45 -0.15 -0.1 0.04 0.4 0.65 0.05 0.47 0.06 -0.14 0.1 -0.05 -3.37 -0.66 0.42 0.11 -0.59 0.21
Cpa|evm.model.tig00001376.26 (tig00001376_g8546.t1)
0.6 0.25 0.2 0.05 0.43 0.23 -0.0 0.07 -0.02 0.0 0.25 0.25 0.49 0.41 -0.22 0.14 -0.39 -0.69 -0.53 -0.59 -3.14 -0.92 0.5 -0.45 -0.27 0.15
Cpa|evm.model.tig00001493.7 (tig00001493_g8982.t1)
0.31 0.28 -0.2 -0.31 -0.57 -0.68 -0.12 -0.17 0.16 -0.11 0.12 -0.3 -0.18 0.37 0.01 0.36 0.03 0.33 0.19 -0.26 -1.63 -0.34 0.55 0.14 0.42 0.11
Cpa|evm.model.tig00020538.52 (tig00020538_g10360.t1)
-0.14 0.06 -0.6 -2.69 -0.46 - -1.66 -0.41 -0.74 -1.23 - -1.68 0.55 -1.62 -2.86 -0.79 -1.06 1.41 -0.73 -1.86 -0.62 0.32 1.87 1.34 2.18 -0.09
Cpa|evm.model.tig00020556.42 (tig00020556_g11011.t1)
0.61 0.06 -0.67 -0.84 -0.53 -0.43 0.2 0.03 -0.2 -0.24 -0.2 -0.14 0.51 -0.0 0.12 0.13 0.13 0.8 0.5 -0.48 -2.29 -0.06 0.52 -0.02 -0.0 -0.01
Cpa|evm.model.tig00020685.28 (tig00020685_g12944.t1)
0.06 0.69 0.49 -0.2 -0.34 -0.43 -0.43 -0.15 -0.45 -0.65 -0.98 -0.92 -0.35 0.21 0.44 0.55 0.31 0.6 0.77 0.26 -1.98 -1.38 0.42 -1.0 0.82 -0.31
Cpa|evm.model.tig00020723.16 (tig00020723_g13434.t1)
-1.93 -1.31 -1.17 -0.4 -0.13 -0.26 0.13 0.39 0.34 0.24 0.52 0.13 -1.24 0.76 -1.25 0.09 -1.62 0.13 -0.18 -0.34 -2.22 -1.53 1.68 0.41 0.93 0.38
Cpa|evm.model.tig00020878.27 (tig00020878_g14875.t1)
0.4 -0.25 -0.39 -0.07 0.17 -0.03 0.42 0.24 -0.1 -0.45 -0.52 -0.69 0.64 -0.58 -0.02 0.35 0.05 0.44 0.11 -0.04 -1.92 -1.93 0.45 -0.01 0.8 -0.05
Cpa|evm.model.tig00020956.11 (tig00020956_g16520.t1)
0.1 -0.1 -0.28 -0.0 -0.31 -0.71 0.09 0.09 0.0 -0.13 -0.02 0.05 -0.08 0.31 -0.17 -0.07 -0.04 0.62 -0.2 -0.23 -2.38 -1.05 0.5 0.76 0.43 0.39
Cpa|evm.model.tig00020961.52 (tig00020961_g16674.t1)
-1.18 -0.39 -0.12 0.07 -0.09 -0.58 0.12 0.08 -0.06 0.09 0.11 -0.18 -1.33 0.14 0.28 -0.05 0.15 0.58 0.31 -0.02 -2.95 -0.81 0.78 -0.15 0.87 0.52
Cpa|evm.model.tig00020961.81 (tig00020961_g16701.t1)
-0.23 -0.04 -0.07 0.13 0.18 0.24 0.45 0.44 0.35 0.11 0.08 -0.2 -0.45 -0.46 -0.26 0.17 -0.23 0.34 0.12 -0.17 -1.04 -1.34 0.71 -0.24 0.25 -0.44
Cpa|evm.model.tig00020965.26 (tig00020965_g16842.t1)
-0.45 -0.33 -0.3 -0.11 0.15 0.11 0.19 0.04 0.26 -0.04 -0.09 -0.39 -0.71 0.19 0.09 0.23 0.15 0.33 0.24 0.02 -1.74 -0.3 0.64 -0.02 0.29 0.11
Cpa|evm.model.tig00021012.6 (tig00021012_g16985.t1)
-2.21 -0.51 -0.5 -0.07 0.03 -0.11 0.05 -0.02 0.41 0.28 0.44 0.3 -2.09 0.08 0.06 0.18 -0.26 0.47 0.01 -0.22 -2.98 -0.8 1.19 0.28 0.3 0.44
Cpa|evm.model.tig00021105.47 (tig00021105_g18259.t1)
-0.28 -0.16 -0.52 -0.48 -0.6 -0.69 -0.1 -0.42 -0.25 -0.15 -0.26 -0.04 0.01 0.29 -0.05 0.14 0.12 1.13 0.45 -0.15 -1.64 0.07 0.35 -0.27 0.82 0.36
Cpa|evm.model.tig00021127.111 (tig00021127_g18792.t1)
0.44 0.06 0.26 0.12 -0.33 -0.34 -0.11 0.06 -0.18 -0.35 -0.07 -0.06 0.26 0.41 0.33 0.88 -0.39 -0.0 0.02 -0.45 -2.43 -1.78 0.91 -0.6 -0.09 0.11
Cpa|evm.model.tig00021127.112 (tig00021127_g18793.t1)
-1.39 -0.45 -0.66 -0.39 -0.44 -0.13 -0.08 -0.18 -0.01 -0.03 -0.28 -0.63 -1.34 0.5 0.1 0.52 0.27 0.14 0.14 0.31 -2.04 -0.28 1.34 0.53 0.09 0.57
Cpa|evm.model.tig00021179.17 (tig00021179_g19232.t1)
0.65 -0.33 -0.33 -0.28 -0.42 -0.51 -0.54 -0.2 -0.23 0.01 0.25 0.41 0.7 0.9 0.1 0.5 -0.91 -0.51 -0.58 -1.0 -1.94 -3.63 0.28 0.67 0.5 0.76
Cpa|evm.model.tig00021257.7 (tig00021257_g19743.t1)
-0.66 -0.33 -0.37 -0.38 -1.39 -0.64 -0.05 0.23 0.35 0.43 0.47 0.24 -0.37 0.1 0.03 0.01 -0.34 0.01 -0.32 0.2 -2.44 -0.06 1.24 0.05 -0.07 0.63
Cpa|evm.model.tig00021314.1 (tig00021314_g20109.t1)
0.34 -0.29 0.15 0.27 0.04 -0.39 -0.05 -0.29 -0.79 -0.07 -0.22 0.4 0.58 0.51 -0.14 0.89 -0.13 -0.05 -0.26 -0.07 -2.9 -0.26 -0.13 0.03 -0.14 0.21
Cpa|evm.model.tig00021348.82 (tig00021348_g20591.t1)
-1.42 -0.4 -0.15 0.03 0.55 0.35 0.8 0.34 0.25 0.11 -0.13 -0.03 -1.38 0.13 -0.76 0.08 -0.39 0.71 -0.28 -0.38 -1.72 -1.44 1.08 -0.08 0.19 0.09
Cpa|evm.model.tig00021434.56 (tig00021434_g21359.t1)
0.67 0.31 0.23 -0.43 -0.52 -0.91 -0.44 -0.21 -0.09 -0.13 0.03 0.44 0.88 0.45 0.25 0.29 -0.22 0.08 -0.19 -0.3 -2.63 -0.95 0.23 -0.48 0.07 0.42
Cpa|evm.model.tig00021522.13 (tig00021522_g22107.t1)
-2.35 -0.75 -1.43 -0.77 0.08 0.75 0.83 0.72 0.48 0.09 0.04 -0.53 -3.2 0.17 -0.12 0.06 0.3 0.3 0.04 -0.2 -2.75 -2.1 0.95 0.34 0.71 0.17
Cpa|evm.model.tig00021525.26 (tig00021525_g22142.t1)
0.42 0.72 0.68 0.37 -0.02 -0.57 -0.35 0.02 0.08 -0.0 0.07 0.08 0.31 -0.29 -0.13 -0.05 -0.02 -0.08 -0.05 0.01 -2.86 -0.66 0.22 -0.49 0.46 -0.66
Cpa|evm.model.tig00021532.9 (tig00021532_g22189.t1)
-0.39 0.15 0.14 0.08 -0.42 -0.87 -0.36 -0.16 -0.42 -0.16 0.05 -0.02 -0.15 0.38 -0.07 0.48 0.07 1.03 0.65 -0.85 -2.47 -1.29 0.83 -0.79 0.78 -0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.