Heatmap: Cluster_196 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.267 (tig00000042_g15669.t1)	0.98	0.6	0.61	0.67	0.68	0.64	0.94	1.0	0.84	0.71	0.65	0.59	0.88	0.49	0.83	0.63	0.79	0.98	0.8	0.94	0.07	0.34	0.76	0.69	0.64	0.66
Cpa\|evm.model.tig00000042.94 (tig00000042_g15493.t1)	0.64	0.77	0.72	0.75	0.78	0.59	0.71	0.77	0.41	0.52	0.46	0.54	0.6	0.69	0.46	0.77	0.48	0.79	0.77	0.52	0.11	0.27	1.0	0.21	0.83	0.58
Cpa\|evm.model.tig00000057.116 (tig00000057_g140.t1)	0.81	0.71	0.61	0.55	0.61	0.52	0.65	0.65	0.55	0.65	0.63	0.66	0.7	0.41	0.74	0.71	0.66	0.97	0.99	0.64	0.07	0.23	1.0	0.6	0.62	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000093.198 (tig00000093_g3622.t1)	0.04	0.05	0.12	0.27	0.24	0.24	0.12	0.12	0.26	0.3	0.31	0.24	0.08	0.47	0.34	0.56	0.23	0.25	0.28	0.15	0.07	0.12	1.0	0.36	0.34	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000093.253 (tig00000093_g3674.t1)	0.28	0.52	0.49	0.64	0.79	0.78	0.77	0.7	0.74	0.71	0.76	0.75	0.24	0.53	0.49	0.55	0.63	0.82	0.66	0.47	0.39	0.22	1.0	0.73	0.69	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000144.82 (tig00000144_g9073.t1)	0.65	0.67	0.52	0.36	0.31	0.24	0.41	0.44	0.34	0.31	0.3	0.26	0.41	0.53	0.59	0.5	0.47	0.94	0.78	0.63	0.11	0.16	1.0	0.35	0.44	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000145.38 (tig00000145_g8839.t1)	0.7	0.56	0.48	0.55	0.54	0.37	0.55	0.56	0.39	0.42	0.46	0.53	0.84	0.77	0.3	0.63	0.38	0.49	0.4	0.34	0.17	0.32	1.0	0.39	0.54	0.39
Cpa\|evm.model.tig00000157.59 (tig00000157_g9646.t1)	0.31	0.34	0.3	0.39	0.55	0.77	0.88	0.91	0.86	0.73	0.66	0.53	0.31	0.6	0.33	0.41	0.66	0.82	0.64	0.54	0.07	0.4	1.0	0.47	0.78	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000204.76 (tig00000204_g17742.t1)	0.32	0.3	0.39	0.38	0.51	0.54	0.53	0.45	0.49	0.55	0.45	0.4	0.32	0.57	0.54	0.61	0.48	0.48	0.49	0.46	0.19	0.29	1.0	0.55	0.61	0.65
Cpa\|evm.model.tig00000227.39 (tig00000227_g19830.t1)	0.26	1.0	0.98	0.8	0.7	0.54	0.42	0.4	0.31	0.34	0.26	0.29	0.31	0.51	0.43	0.4	0.66	0.59	0.49	0.46	0.03	0.29	0.97	0.2	0.78	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000227.47 (tig00000227_g19839.t1)	0.48	0.54	0.56	0.71	0.91	0.8	0.87	0.77	0.67	0.82	0.73	0.75	0.54	0.76	0.65	0.79	0.78	0.91	0.75	0.79	0.22	0.69	1.0	0.84	0.66	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000382.11 (tig00000382_g24551.t1)	0.21	0.42	0.5	0.56	0.51	0.42	0.5	0.58	0.59	0.63	0.5	0.38	0.23	0.44	0.26	0.28	0.22	0.65	0.52	0.3	0.09	0.27	1.0	0.46	0.58	0.54
Cpa\|evm.model.tig00000383.48 (tig00000383_g24662.t1)	0.71	0.68	0.74	0.83	0.95	1.0	0.99	0.96	0.85	0.77	0.74	0.7	0.77	0.74	0.71	0.83	0.76	0.85	0.82	0.74	0.19	0.87	0.78	0.53	0.67	0.67
Cpa\|evm.model.tig00000480.55 (tig00000480_g1323.t1)	0.14	0.06	0.07	0.04	0.03	0.06	0.18	0.26	0.32	0.27	0.29	0.2	0.25	0.35	0.36	0.25	0.5	0.78	0.37	0.17	0.42	0.16	1.0	0.91	0.98	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000507.26 (tig00000507_g1780.t1)	0.39	0.58	0.67	0.67	0.73	0.57	0.52	0.68	0.62	0.69	0.65	0.59	0.28	0.73	0.48	0.62	0.42	0.84	0.6	0.5	0.28	0.18	1.0	0.38	0.64	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000607.9 (tig00000607_g2520.t1)	0.29	0.35	0.31	0.29	0.28	0.31	0.45	0.32	0.62	0.51	0.56	0.66	0.31	0.64	0.59	0.6	0.42	0.61	0.48	0.32	0.05	0.38	1.0	0.45	0.49	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000630.44 (tig00000630_g2728.t1)	0.35	0.53	0.64	0.81	0.73	0.53	0.7	0.76	0.71	0.63	0.68	0.52	0.25	0.72	0.86	0.8	0.6	0.92	0.7	0.51	0.26	0.33	1.0	0.54	0.68	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000692.70 (tig00000692_g3269.t1)	0.38	0.34	0.3	0.29	0.38	0.51	0.47	0.49	0.45	0.54	0.44	0.52	0.35	0.54	0.52	0.66	0.54	0.6	0.58	0.48	0.21	0.59	1.0	0.53	0.64	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000711.26 (tig00000711_g3386.t2)	0.56	0.69	0.63	0.85	0.84	0.86	0.93	0.94	0.85	0.69	0.61	0.55	0.5	0.57	0.53	0.61	0.61	1.0	0.73	0.7	0.05	0.59	0.91	0.45	0.66	0.55
Cpa\|evm.model.tig00000769.23 (tig00000769_g4017.t1)	0.52	0.41	0.24	0.2	0.15	0.25	0.34	0.42	0.14	0.27	0.21	0.18	0.19	0.23	0.11	0.54	0.35	0.45	0.48	0.41	0.01	0.09	1.0	0.18	0.28	0.14
Cpa\|evm.model.tig00000808.44 (tig00000808_g4430.t1)	0.49	0.57	0.63	0.66	0.62	0.58	0.72	0.77	0.78	0.66	0.6	0.59	0.57	0.69	0.75	0.76	0.72	0.83	0.72	0.67	0.17	0.22	1.0	0.6	0.74	0.61
Cpa\|evm.model.tig00000823.22 (tig00000823_g4549.t1)	0.72	0.59	0.53	0.54	0.62	0.6	0.59	0.6	0.48	0.6	0.52	0.53	0.66	0.57	0.52	0.71	0.56	0.93	0.64	0.44	0.2	0.32	1.0	0.58	0.96	0.47
Cpa\|evm.model.tig00000828.16 (tig00000828_g4616.t1)	0.86	0.61	0.63	0.57	0.53	0.56	0.71	0.67	0.62	0.62	0.63	0.53	0.87	0.75	0.8	0.86	1.0	0.8	0.65	0.58	0.1	0.22	0.68	0.81	0.96	0.75
Cpa\|evm.model.tig00001181.10 (tig00001181_g7426.t1)	0.62	0.63	0.55	0.48	0.52	0.52	0.54	0.46	0.37	0.45	0.39	0.39	0.55	0.59	0.82	0.68	0.36	0.93	0.7	0.49	0.15	0.1	0.74	0.51	1.0	0.67
Cpa\|evm.model.tig00001224.1 (tig00001224_g7624.t1)	0.61	0.49	0.48	0.51	0.57	0.45	0.68	0.56	0.57	0.67	0.57	0.54	0.55	0.72	0.69	0.77	0.59	0.76	0.66	0.55	0.11	0.5	1.0	0.5	0.75	0.75
Cpa\|evm.model.tig00001310.3 (tig00001310_g8152.t1)	0.26	0.43	0.58	0.65	0.62	0.6	0.74	0.82	0.71	0.78	0.69	0.6	0.21	0.91	0.62	1.0	0.6	0.98	0.74	0.7	0.16	0.28	0.72	0.31	0.78	0.64
Cpa\|evm.model.tig00001365.9 (tig00001365_g8361.t1)	0.55	0.6	0.69	0.81	0.88	0.83	1.0	0.89	0.77	0.74	0.68	0.61	0.59	0.67	0.57	0.73	0.98	0.79	0.74	0.68	0.07	0.62	0.7	0.46	0.57	0.58
Cpa\|evm.model.tig00001376.24 (tig00001376_g8545.t1)	0.06	0.27	0.34	0.42	0.34	0.25	0.43	0.42	0.46	0.51	0.44	0.43	0.05	0.49	0.51	0.6	0.51	0.54	0.51	0.4	0.07	0.39	1.0	0.47	0.6	0.51
Cpa\|evm.model.tig00001376.25 (tig00001376_g8546.t1)	0.79	0.67	0.7	0.65	0.67	0.59	0.57	0.55	0.47	0.58	0.6	0.66	0.84	1.0	0.66	0.88	0.67	0.58	0.68	0.61	0.06	0.4	0.85	0.69	0.42	0.74
Cpa\|evm.model.tig00001376.26 (tig00001376_g8546.t1)	1.0	0.78	0.76	0.68	0.89	0.77	0.66	0.69	0.65	0.66	0.79	0.78	0.92	0.88	0.57	0.73	0.5	0.41	0.46	0.44	0.07	0.35	0.93	0.48	0.55	0.73
Cpa\|evm.model.tig00001493.7 (tig00001493_g8982.t1)	0.85	0.83	0.6	0.55	0.46	0.43	0.63	0.61	0.76	0.63	0.74	0.55	0.6	0.89	0.69	0.88	0.7	0.86	0.78	0.57	0.22	0.54	1.0	0.75	0.92	0.74
Cpa\|evm.model.tig00020538.52 (tig00020538_g10360.t1)	0.2	0.23	0.15	0.03	0.16	0.0	0.07	0.17	0.13	0.09	0.0	0.07	0.32	0.07	0.03	0.13	0.11	0.58	0.13	0.06	0.14	0.28	0.81	0.56	1.0	0.21
Cpa\|evm.model.tig00020556.42 (tig00020556_g11011.t1)	0.88	0.6	0.36	0.32	0.4	0.43	0.66	0.59	0.5	0.49	0.5	0.52	0.82	0.57	0.63	0.63	0.63	1.0	0.81	0.41	0.12	0.55	0.82	0.57	0.57	0.57
Cpa\|evm.model.tig00020685.28 (tig00020685_g12944.t1)	0.59	0.91	0.8	0.49	0.45	0.42	0.42	0.51	0.42	0.36	0.29	0.3	0.44	0.65	0.77	0.83	0.7	0.86	0.96	0.68	0.14	0.22	0.76	0.28	1.0	0.46
Cpa\|evm.model.tig00020723.16 (tig00020723_g13434.t1)	0.08	0.13	0.14	0.24	0.28	0.26	0.34	0.41	0.39	0.37	0.45	0.34	0.13	0.53	0.13	0.33	0.1	0.34	0.28	0.25	0.07	0.11	1.0	0.41	0.59	0.41
Cpa\|evm.model.tig00020878.27 (tig00020878_g14875.t1)	0.76	0.48	0.44	0.55	0.64	0.56	0.77	0.68	0.54	0.42	0.4	0.35	0.89	0.38	0.57	0.73	0.6	0.78	0.62	0.56	0.15	0.15	0.78	0.57	1.0	0.55
Cpa\|evm.model.tig00020956.11 (tig00020956_g16520.t1)	0.63	0.55	0.49	0.59	0.48	0.36	0.63	0.63	0.59	0.54	0.58	0.61	0.56	0.73	0.53	0.56	0.58	0.91	0.51	0.5	0.11	0.29	0.83	1.0	0.8	0.77
Cpa\|evm.model.tig00020961.52 (tig00020961_g16674.t1)	0.24	0.42	0.5	0.58	0.51	0.37	0.59	0.58	0.53	0.58	0.59	0.48	0.22	0.6	0.67	0.53	0.61	0.82	0.68	0.54	0.07	0.31	0.94	0.49	1.0	0.79
Cpa\|evm.model.tig00020961.81 (tig00020961_g16701.t1)	0.52	0.6	0.58	0.67	0.69	0.72	0.84	0.83	0.78	0.66	0.65	0.53	0.45	0.45	0.51	0.69	0.52	0.77	0.66	0.55	0.3	0.24	1.0	0.52	0.73	0.45
Cpa\|evm.model.tig00020965.26 (tig00020965_g16842.t1)	0.47	0.51	0.52	0.59	0.71	0.69	0.73	0.66	0.77	0.63	0.6	0.49	0.39	0.73	0.68	0.75	0.71	0.81	0.76	0.65	0.19	0.52	1.0	0.63	0.78	0.69
Cpa\|evm.model.tig00021012.6 (tig00021012_g16985.t1)	0.09	0.31	0.31	0.42	0.45	0.4	0.45	0.43	0.58	0.53	0.59	0.54	0.1	0.46	0.46	0.5	0.37	0.61	0.44	0.38	0.06	0.25	1.0	0.53	0.54	0.6
Cpa\|evm.model.tig00021105.47 (tig00021105_g18259.t1)	0.38	0.41	0.32	0.33	0.3	0.28	0.43	0.34	0.39	0.41	0.38	0.45	0.46	0.56	0.44	0.5	0.5	1.0	0.62	0.41	0.15	0.48	0.59	0.38	0.81	0.59
Cpa\|evm.model.tig00021127.111 (tig00021127_g18792.t1)	0.72	0.55	0.64	0.58	0.42	0.42	0.49	0.55	0.47	0.42	0.51	0.51	0.63	0.7	0.67	0.98	0.41	0.53	0.54	0.39	0.1	0.15	1.0	0.35	0.5	0.57
Cpa\|evm.model.tig00021127.112 (tig00021127_g18793.t1)	0.15	0.29	0.25	0.3	0.29	0.36	0.37	0.35	0.39	0.39	0.32	0.25	0.16	0.56	0.42	0.57	0.48	0.44	0.43	0.49	0.1	0.33	1.0	0.57	0.42	0.59
Cpa\|evm.model.tig00021179.17 (tig00021179_g19232.t1)	0.84	0.43	0.43	0.44	0.4	0.37	0.37	0.47	0.46	0.54	0.63	0.71	0.87	1.0	0.57	0.76	0.28	0.37	0.36	0.27	0.14	0.04	0.65	0.85	0.75	0.91
Cpa\|evm.model.tig00021257.7 (tig00021257_g19743.t1)	0.27	0.34	0.33	0.33	0.16	0.27	0.41	0.5	0.54	0.57	0.59	0.5	0.33	0.46	0.43	0.43	0.34	0.43	0.34	0.49	0.08	0.41	1.0	0.44	0.4	0.66
Cpa\|evm.model.tig00021314.1 (tig00021314_g20109.t1)	0.68	0.44	0.6	0.65	0.55	0.41	0.52	0.44	0.31	0.51	0.46	0.71	0.81	0.77	0.49	1.0	0.49	0.52	0.45	0.51	0.07	0.45	0.49	0.55	0.49	0.63
Cpa\|evm.model.tig00021348.82 (tig00021348_g20591.t1)	0.18	0.36	0.43	0.48	0.69	0.6	0.82	0.6	0.56	0.51	0.43	0.46	0.18	0.52	0.28	0.5	0.36	0.77	0.39	0.36	0.14	0.18	1.0	0.45	0.54	0.5
Cpa\|evm.model.tig00021434.56 (tig00021434_g21359.t1)	0.87	0.67	0.64	0.4	0.38	0.29	0.4	0.47	0.51	0.5	0.56	0.74	1.0	0.74	0.64	0.66	0.47	0.57	0.48	0.44	0.09	0.28	0.64	0.39	0.57	0.73
Cpa\|evm.model.tig00021522.13 (tig00021522_g22107.t1)	0.1	0.31	0.19	0.3	0.55	0.87	0.92	0.86	0.73	0.55	0.54	0.36	0.06	0.59	0.48	0.54	0.64	0.64	0.54	0.45	0.08	0.12	1.0	0.66	0.85	0.59
Cpa\|evm.model.tig00021525.26 (tig00021525_g22142.t1)	0.81	1.0	0.97	0.78	0.6	0.41	0.47	0.61	0.64	0.6	0.64	0.64	0.75	0.49	0.55	0.58	0.6	0.57	0.58	0.61	0.08	0.38	0.71	0.43	0.83	0.38
Cpa\|evm.model.tig00021532.9 (tig00021532_g22189.t1)	0.37	0.55	0.54	0.52	0.37	0.27	0.38	0.44	0.37	0.44	0.51	0.48	0.44	0.64	0.47	0.68	0.51	1.0	0.77	0.27	0.09	0.2	0.87	0.28	0.84	0.45

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)