1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_132 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
Light - ZT1
Light - ZT3
Light - ZT5
Light - ZT7
Light - ZT9
Light - ZT11
Light - ZT13
Light - ZT15
Dark - ZT17
Dark - ZT19
Dark - ZT21
Dark - ZT23
Light - ZT25
Nutrient stress - Low nitrogen - 10%
Nutrient stress - Low phosphate - 0%
Nutrient stress - Low sulfate - 2%
Nutrient stress - Low micronutrients - 0%
Nutrient stress - NaCl - 75 mM
Nutrient stress - Mannitol - 100 mM
Nutrient stress - Control
Environmental stress - Prolonged darkness - 72h
Environmental stress - Cold - 4C
Environmental stress - Heat - 37C
Environmental stress - Control
Environmental stress - High light - 150 uE
Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa|evm.model.tig00000042.112 (tig00000042_g15508.t1)
 12.44 11.74 11.05 11.15 11.84 12.14 12.91 11.89 9.98 10.43 10.73 12.09 11.17 10.77 12.23 11.8 9.57 12.92 12.73 12.26 4.76 15.12 14.71 33.76 24.02 20.87
Cpa|evm.model.tig00000076.135 (tig00000076_g2429.t1)
 112.52 59.78 44.1 42.58 55.1 57.76 103.17 79.11 65.56 99.07 104.21 97.29 86.96 123.23 28.34 52.05 103.44 89.36 82.19 86.81 85.27 37.67 153.49 202.08 93.03 180.21
Cpa|evm.model.tig00000076.136 (tig00000076_g2429.t1)
 79.9 44.42 30.22 33.97 43.92 47.66 68.09 56.32 46.7 67.7 68.03 74.49 62.16 84.32 19.5 30.52 60.52 74.18 60.79 52.3 92.31 37.13 137.06 153.23 94.18 159.23
Cpa|evm.model.tig00000076.137 (tig00000076_g2429.t1)
 124.15 65.98 45.88 51.62 74.0 99.65 96.49 82.16 82.4 103.87 109.57 110.24 104.81 84.78 20.68 36.41 67.06 55.52 62.21 56.16 84.33 40.41 160.59 180.5 111.83 160.5
Cpa|evm.model.tig00000128.1 (tig00000128_g7201.t1)
 1.0 1.31 2.04 3.47 3.62 3.75 5.1 4.08 5.1 5.33 4.28 4.83 1.14 3.14 2.91 2.4 3.43 3.74 3.45 2.54 2.9 3.84 6.31 10.72 4.93 4.78
Cpa|evm.model.tig00000147.18 (tig00000147_g9455.t1)
 0.34 0.12 0.3 0.59 1.34 4.61 5.99 2.93 3.02 3.32 2.22 0.7 0.21 0.47 0.38 0.07 0.08 0.26 0.38 0.36 0.65 0.67 3.79 1.58 2.08 4.69
Cpa|evm.model.tig00000147.33 (tig00000147_g9472.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.24 0.07 0.06 0.16
Cpa|evm.model.tig00000157.12 (tig00000605_g2483.t1)
 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.06 1.22 0.92 0.67 1.02 0.9 0.97 1.13 0.64 0.12 2.54 4.23 1.41 2.68
Cpa|evm.model.tig00000158.103 (tig00000158_g10207.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.02 0.02 0.02 0.0 0.0 0.14 0.03 0.19 0.09 0.08 0.24
Cpa|evm.model.tig00000178.70 (tig00000178_g12785.t1)
 1.89 0.48 0.26 0.41 0.31 0.33 0.98 0.66 1.29 3.06 4.13 4.68 1.65 0.73 22.21 0.25 36.75 6.47 6.99 1.17 38.16 44.07 89.41 126.39 28.48 52.53
Cpa|evm.model.tig00000190.19 (tig00000190_g13840.t1)
 0.49 0.18 0.0 0.09 0.05 0.04 0.05 0.15 0.67 0.29 0.6 1.17 0.22 0.04 0.04 0.05 0.13 0.21 0.39 0.27 0.13 0.08 1.47 1.03 0.71 0.95
Cpa|evm.model.tig00000215.91 (tig00000215_g18622.t1)
 0.32 0.58 0.16 0.65 0.57 0.39 0.83 0.73 0.15 0.22 0.41 0.51 0.38 0.19 0.12 0.17 0.52 0.15 0.36 0.4 0.35 0.4 3.01 0.19 2.32 2.54
Cpa|evm.model.tig00000215.92 (tig00000215_g18629.t1)
 0.44 0.25 0.15 0.61 0.28 0.32 0.3 0.25 0.49 0.31 0.3 0.4 0.39 0.06 0.11 0.25 0.12 0.28 0.12 0.16 0.76 0.21 1.62 0.52 0.96 1.81
Cpa|evm.model.tig00000241.166 (tig00000241_g21032.t1)
 1.05 0.97 1.27 2.56 2.85 2.3 2.5 2.3 2.38 2.49 3.17 2.29 0.61 2.18 1.21 2.98 1.06 1.8 1.44 0.7 0.51 1.27 6.3 6.07 3.51 3.12
Cpa|evm.model.tig00000248.22 (tig00000248_g21788.t1)
 1.67 1.18 1.29 2.44 3.1 1.91 1.42 1.67 1.69 2.18 2.89 2.12 0.91 0.75 1.09 0.57 0.98 0.99 1.77 2.33 5.68 3.99 10.1 9.02 5.55 8.35
Cpa|evm.model.tig00000391.39 (tig00000391_g24869.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.17 0.0 0.0 0.04 0.04 0.09 0.0 0.16 0.1 0.3 0.0 0.0 0.56 0.19 0.11 0.15
Cpa|evm.model.tig00000411.11 (tig00000411_g513.t1)
 0.22 0.16 0.27 0.22 0.22 0.0 0.08 0.13 0.18 0.08 0.11 0.05 0.11 0.0 0.04 0.0 0.05 0.08 0.02 0.03 0.03 0.34 0.46 0.51 0.54 0.44
Cpa|evm.model.tig00000411.45 (tig00000178_g12755.t1)
 2.36 2.14 2.01 2.92 2.89 2.29 2.26 2.62 2.24 2.96 3.27 2.97 2.92 1.43 0.9 1.2 2.64 2.79 1.35 1.1 1.54 4.98 6.6 5.47 6.8 7.51
Cpa|evm.model.tig00000430.22 (tig00000430_g606.t1)
 2.63 1.6 0.98 1.08 1.75 0.98 0.86 0.95 1.4 1.86 1.75 2.24 1.47 0.73 4.12 2.2 20.18 286.69 30.01 13.37 60.12 262.47 220.76 292.61 201.5 154.67
Cpa|evm.model.tig00000430.23 (tig00020902_g15005.t1)
 0.26 0.14 0.14 0.04 0.09 0.04 0.03 0.13 0.07 0.44 0.47 0.37 0.12 0.21 1.79 0.49 7.98 87.68 9.58 4.13 0.82 26.86 13.83 32.6 36.17 49.81
Cpa|evm.model.tig00000459.92 (tig00000459_g1157.t1)
 0.04 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.04 0.08 0.0 0.05 1.64 0.43 1.57 0.08 0.96 2.01 1.78 3.26 4.33
Cpa|evm.model.tig00000581.16 (tig00000581_g2222.t1)
 0.38 0.03 0.13 0.02 0.07 0.0 0.11 0.04 0.04 0.15 0.17 0.07 0.13 0.41 0.83 0.09 0.49 1.12 1.06 0.62 2.21 9.45 4.11 4.32 4.38 11.31
Cpa|evm.model.tig00000615.3 (tig00000615_g2529.t1)
 2.21 2.23 1.68 1.0 1.09 0.96 1.09 0.63 1.99 0.59 0.93 1.33 1.32 0.75 1.1 0.68 1.81 14.08 7.51 4.26 37.49 67.19 93.58 123.29 115.3 217.31
Cpa|evm.model.tig00000663.3 (tig00000663_g2934.t1)
 0.21 0.0 0.04 0.43 0.4 0.09 0.15 0.27 0.4 0.37 0.56 0.23 0.12 0.07 0.04 0.07 0.03 0.15 0.09 0.05 0.2 0.16 0.68 1.28 0.69 0.39
Cpa|evm.model.tig00000802.9 (tig00000802_g4261.t1)
 0.6 1.07 1.38 1.58 2.58 1.52 2.3 1.95 1.89 2.61 2.31 1.82 0.16 1.37 1.17 1.66 1.06 2.09 2.05 2.11 1.8 4.87 5.98 5.23 4.88 5.2
Cpa|evm.model.tig00000940.23 (tig00000940_g5557.t1)
 0.04 0.02 0.03 0.18 0.04 0.0 0.12 0.17 0.06 0.17 0.13 0.07 0.12 0.01 0.0 0.0 0.02 0.08 0.06 0.07 0.17 0.12 0.44 0.82 0.2 0.43
Cpa|evm.model.tig00001021.7 (tig00001021_g6304.t1)
 1.16 1.63 1.4 3.09 2.25 2.22 2.93 3.25 3.35 3.35 3.61 3.85 0.83 3.02 2.21 2.88 1.63 2.77 1.97 2.08 1.49 2.5 7.09 7.5 5.75 3.79
Cpa|evm.model.tig00001065.8 (tig00001065_g6710.t1)
 0.07 0.0 0.02 0.18 0.05 0.0 0.09 0.0 0.16 0.21 0.06 0.05 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.17 0.04 0.02 0.14 0.82 0.35 0.7 0.61 0.69
Cpa|evm.model.tig00001073.1 (tig00001073_g6810.t1)
 0.08 0.0 0.24 1.44 1.45 1.95 1.84 1.75 3.15 2.4 2.31 1.85 0.11 2.96 1.63 1.25 1.56 2.44 1.32 0.86 1.46 2.33 5.74 8.36 4.76 3.57
Cpa|evm.model.tig00001181.18 (tig00001181_g7432.t1)
 0.37 0.21 0.18 0.24 0.18 0.21 0.28 0.14 0.18 0.19 0.42 0.47 0.37 0.14 0.12 0.15 0.05 0.16 0.19 0.19 0.28 0.07 0.97 0.93 0.56 0.67
Cpa|evm.model.tig00001636.13 (tig00001636_g9537.t1)
 1.65 0.39 0.28 2.1 0.98 0.5 0.43 2.16 0.92 1.51 2.68 1.05 0.64 0.17 0.04 0.0 0.11 0.49 0.29 0.07 0.32 0.71 2.55 4.28 1.72 3.07
Cpa|evm.model.tig00020510.147 (tig00020510_g9932.t1)
 3.34 1.87 2.28 3.94 2.95 3.51 3.25 2.84 3.02 2.46 4.39 1.75 2.5 4.25 2.89 5.62 4.48 6.19 7.03 2.85 2.56 5.93 7.38 16.42 9.88 11.73
0.6 0.87 0.55 0.22 0.06 0.23 0.7 0.7 0.61 1.49 0.58 1.15 0.15 0.91 0.37 0.71 1.01 0.58 1.07 0.46 0.38 0.8 2.84 0.54 1.91 1.74
Cpa|evm.model.tig00020516.15 (tig00020516_g9964.t1)
 4.46 2.8 3.1 3.47 1.95 1.97 4.09 2.96 2.52 2.47 2.52 2.92 1.71 1.61 1.24 0.52 1.12 2.52 1.61 2.61 0.73 4.3 6.94 8.69 5.41 7.31
Cpa|evm.model.tig00020616.14 (tig00001343_g8330.t1)
 0.04 0.11 0.04 0.07 0.12 0.0 0.0 0.0 0.09 0.02 0.02 0.0 0.06 2.45 2.46 2.12 1.28 0.5 0.66 1.27 1.67 0.58 6.24 8.45 2.6 6.39
Cpa|evm.model.tig00020660.53 (tig00020660_g12562.t1)
 0.0 0.03 0.0 0.04 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.21 0.0 0.09 0.19 0.03 0.13 0.09 0.35 0.75 1.04 0.8 5.7
Cpa|evm.model.tig00020660.54 (tig00020660_g12562.t1)
 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.14 0.06 0.08 0.08 0.0 0.1 0.03 0.07 0.07 0.15 0.9 0.56 1.66 0.83 5.2
Cpa|evm.model.tig00020710.54 (tig00020710_g13297.t1)
 0.15 0.07 0.07 0.14 0.04 0.02 0.07 0.06 0.07 0.25 0.23 0.23 0.03 0.01 0.02 0.0 0.03 0.08 0.1 0.07 0.09 0.02 0.49 0.29 0.46 0.59
Cpa|evm.model.tig00020710.66 (tig00020710_g13317.t1)
 1.03 1.1 1.35 2.4 3.06 3.32 3.48 3.55 5.54 4.49 4.91 4.77 1.21 4.12 2.58 4.25 3.57 3.99 3.67 3.04 1.38 3.69 6.97 10.0 4.24 4.87
Cpa|evm.model.tig00020710.74 (tig00020710_g13326.t1)
 1.67 0.3 0.28 0.5 0.0 0.43 0.38 0.61 0.45 1.52 2.06 2.53 1.67 2.25 8.45 0.79 70.43 16.52 11.35 3.06 80.31 279.7 344.52 839.67 339.57 437.68
Cpa|evm.model.tig00020780.11 (tig00020780_g13763.t1)
 13.66 15.88 16.46 15.53 14.87 11.06 13.33 13.18 12.84 12.08 15.63 16.52 12.35 16.18 12.96 14.51 10.19 23.56 17.1 11.5 24.63 4.94 23.6 33.02 29.52 32.03
Cpa|evm.model.tig00020941.31 (tig00020941_g16222.t1)
 0.27 0.0 0.0 0.04 0.19 0.09 0.19 0.19 0.31 0.33 0.61 0.21 0.24 0.06 0.0 0.04 0.0 0.06 0.05 0.02 0.11 0.21 0.55 0.49 0.58 0.24
Cpa|evm.model.tig00020943.71 (tig00020943_g16311.t1)
 0.02 0.06 0.14 0.0 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.02 0.08 0.01 0.08 0.02 0.12 0.03 0.38 0.24 0.1 0.24
Cpa|evm.model.tig00020951.35 (tig00020951_g16435.t1)
 0.02 0.0 0.0 0.05 0.11 0.02 0.1 0.02 0.05 0.08 0.15 0.16 0.05 0.0 0.02 0.0 0.05 0.01 0.08 0.02 0.02 0.03 0.36 0.2 0.11 0.51
Cpa|evm.model.tig00020964.30 (tig00020964_g16806.t1)
 0.36 0.05 0.05 0.14 0.05 0.04 0.16 0.36 0.11 0.73 0.79 0.49 0.29 0.39 0.45 0.4 0.31 0.13 0.14 0.07 0.09 0.4 1.54 0.66 0.49 0.94
Cpa|evm.model.tig00020964.32 (tig00020964_g16807.t1)
 0.48 0.05 0.09 0.11 0.12 0.11 0.24 0.44 0.15 0.67 1.09 0.8 0.41 0.72 0.62 0.33 0.47 0.17 0.23 0.15 0.17 0.33 2.12 1.17 0.85 1.17
Cpa|evm.model.tig00021037.46 (tig00021037_g17454.t1)
 8.0 5.15 7.29 9.07 7.69 5.11 7.95 7.74 6.46 10.78 9.53 9.79 8.81 13.49 6.49 10.06 7.04 8.09 8.64 8.83 17.64 8.06 25.25 22.49 16.88 30.03
Cpa|evm.model.tig00021037.59 (tig00021037_g17467.t1)
 6.49 6.66 8.93 10.27 14.14 12.29 15.29 11.7 12.88 17.45 15.85 13.44 7.01 11.14 7.14 6.26 10.38 15.03 11.12 15.37 8.85 9.12 21.21 21.15 10.92 21.03
Cpa|evm.model.tig00021127.78 (tig00021127_g18755.t1)
 0.36 0.19 0.36 1.01 0.81 0.3 0.36 0.52 0.5 0.48 0.79 0.63 0.21 0.49 0.25 0.46 0.19 0.51 0.24 0.26 0.48 0.85 1.36 1.37 1.29 0.89
Cpa|evm.model.tig00021168.9 (tig00021168_g19074.t1)
 4.92 4.91 4.6 4.48 5.41 5.25 5.82 6.37 7.08 6.6 6.21 5.58 3.9 6.54 3.86 6.92 2.6 3.89 3.3 3.66 2.66 7.97 11.06 10.54 10.12 6.51
Cpa|evm.model.tig00021222.9 (tig00021222_g19366.t1)
 0.11 0.02 0.07 0.14 0.05 0.04 0.0 0.02 0.07 0.04 0.09 0.12 0.04 0.04 0.04 0.0 0.0 0.03 0.02 0.22 0.27 0.3 1.16 1.13 0.29 1.29
Cpa|evm.model.tig00021254.46 (tig00021254_g19726.t1)
 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.13 0.05 0.0 0.32 0.08 0.33 0.0 0.06 0.56 0.55 0.33 0.41 0.3 0.72 1.78 0.22 0.49 1.94 0.7 0.95 2.12
Cpa|evm.model.tig00021434.47 (tig00021434_g21351.t1)
 0.12 0.2 0.09 0.16 0.0 0.0 0.03 0.13 0.04 0.12 0.15 0.09 0.32 0.11 0.0 0.02 0.0 0.07 0.04 0.02 0.07 0.2 0.41 0.73 0.5 0.28
Cpa|evm.model.tig00021603.6 (tig00021521_g22080.t1)
 0.91 0.53 0.71 1.14 0.68 0.44 0.62 1.24 0.5 0.75 0.25 1.26 0.09 0.32 0.23 0.33 0.55 1.28 0.65 0.92 0.43 0.42 3.55 3.59 1.79 2.06

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)