Heatmap: Cluster_132 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000042.112 (tig00000042_g15508.t1)	0.37	0.35	0.33	0.33	0.35	0.36	0.38	0.35	0.3	0.31	0.32	0.36	0.33	0.32	0.36	0.35	0.28	0.38	0.38	0.36	0.14	0.45	0.44	1.0	0.71	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000076.135 (tig00000076_g2429.t1)	0.56	0.3	0.22	0.21	0.27	0.29	0.51	0.39	0.32	0.49	0.52	0.48	0.43	0.61	0.14	0.26	0.51	0.44	0.41	0.43	0.42	0.19	0.76	1.0	0.46	0.89
Cpa\|evm.model.tig00000076.136 (tig00000076_g2429.t1)	0.5	0.28	0.19	0.21	0.28	0.3	0.43	0.35	0.29	0.43	0.43	0.47	0.39	0.53	0.12	0.19	0.38	0.47	0.38	0.33	0.58	0.23	0.86	0.96	0.59	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000076.137 (tig00000076_g2429.t1)	0.69	0.37	0.25	0.29	0.41	0.55	0.53	0.46	0.46	0.58	0.61	0.61	0.58	0.47	0.11	0.2	0.37	0.31	0.34	0.31	0.47	0.22	0.89	1.0	0.62	0.89
Cpa\|evm.model.tig00000128.1 (tig00000128_g7201.t1)	0.09	0.12	0.19	0.32	0.34	0.35	0.48	0.38	0.48	0.5	0.4	0.45	0.11	0.29	0.27	0.22	0.32	0.35	0.32	0.24	0.27	0.36	0.59	1.0	0.46	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000147.18 (tig00000147_g9455.t1)	0.06	0.02	0.05	0.1	0.22	0.77	1.0	0.49	0.5	0.55	0.37	0.12	0.03	0.08	0.06	0.01	0.01	0.04	0.06	0.06	0.11	0.11	0.63	0.26	0.35	0.78
Cpa\|evm.model.tig00000147.33 (tig00000147_g9472.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.14	1.0	0.27	0.23	0.67
Cpa\|evm.model.tig00000157.12 (tig00000605_g2483.t1)	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.29	0.22	0.16	0.24	0.21	0.23	0.27	0.15	0.03	0.6	1.0	0.33	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000158.103 (tig00000158_g10207.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.17	0.08	0.09	0.06	0.0	0.0	0.57	0.14	0.8	0.36	0.34	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000178.70 (tig00000178_g12785.t1)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.01	0.18	0.0	0.29	0.05	0.06	0.01	0.3	0.35	0.71	1.0	0.23	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000190.19 (tig00000190_g13840.t1)	0.33	0.12	0.0	0.06	0.03	0.03	0.03	0.1	0.45	0.2	0.41	0.8	0.15	0.03	0.03	0.03	0.09	0.15	0.26	0.18	0.09	0.06	1.0	0.7	0.48	0.64
Cpa\|evm.model.tig00000215.91 (tig00000215_g18622.t1)	0.11	0.19	0.05	0.22	0.19	0.13	0.28	0.24	0.05	0.07	0.14	0.17	0.13	0.06	0.04	0.06	0.17	0.05	0.12	0.13	0.12	0.13	1.0	0.06	0.77	0.84
Cpa\|evm.model.tig00000215.92 (tig00000215_g18629.t1)	0.24	0.14	0.08	0.34	0.16	0.18	0.17	0.14	0.27	0.17	0.17	0.22	0.21	0.03	0.06	0.14	0.07	0.16	0.07	0.09	0.42	0.11	0.9	0.29	0.53	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000241.166 (tig00000241_g21032.t1)	0.17	0.15	0.2	0.41	0.45	0.36	0.4	0.37	0.38	0.39	0.5	0.36	0.1	0.35	0.19	0.47	0.17	0.29	0.23	0.11	0.08	0.2	1.0	0.96	0.56	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000248.22 (tig00000248_g21788.t1)	0.17	0.12	0.13	0.24	0.31	0.19	0.14	0.17	0.17	0.22	0.29	0.21	0.09	0.07	0.11	0.06	0.1	0.1	0.17	0.23	0.56	0.4	1.0	0.89	0.55	0.83
Cpa\|evm.model.tig00000391.39 (tig00000391_g24869.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.15	0.3	0.0	0.0	0.07	0.07	0.16	0.0	0.28	0.18	0.53	0.0	0.0	1.0	0.33	0.2	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000411.11 (tig00000411_g513.t1)	0.41	0.3	0.49	0.41	0.4	0.0	0.14	0.23	0.33	0.15	0.2	0.09	0.2	0.0	0.07	0.0	0.09	0.15	0.03	0.06	0.05	0.62	0.85	0.93	1.0	0.82
Cpa\|evm.model.tig00000411.45 (tig00000178_g12755.t1)	0.31	0.29	0.27	0.39	0.39	0.31	0.3	0.35	0.3	0.39	0.44	0.4	0.39	0.19	0.12	0.16	0.35	0.37	0.18	0.15	0.21	0.66	0.88	0.73	0.91	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000430.22 (tig00000430_g606.t1)	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.07	0.98	0.1	0.05	0.21	0.9	0.75	1.0	0.69	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000430.23 (tig00020902_g15005.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.09	1.0	0.11	0.05	0.01	0.31	0.16	0.37	0.41	0.57
Cpa\|evm.model.tig00000459.92 (tig00000459_g1157.t1)	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.02	0.0	0.01	0.38	0.1	0.36	0.02	0.22	0.46	0.41	0.75	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000581.16 (tig00000581_g2222.t1)	0.03	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.1	0.09	0.06	0.2	0.84	0.36	0.38	0.39	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000615.3 (tig00000615_g2529.t1)	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.01	0.06	0.03	0.02	0.17	0.31	0.43	0.57	0.53	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000663.3 (tig00000663_g2934.t1)	0.17	0.0	0.03	0.34	0.31	0.07	0.12	0.21	0.31	0.29	0.44	0.18	0.09	0.05	0.03	0.05	0.02	0.12	0.07	0.04	0.15	0.12	0.53	1.0	0.54	0.31
Cpa\|evm.model.tig00000802.9 (tig00000802_g4261.t1)	0.1	0.18	0.23	0.26	0.43	0.25	0.39	0.33	0.32	0.44	0.39	0.3	0.03	0.23	0.2	0.28	0.18	0.35	0.34	0.35	0.3	0.81	1.0	0.88	0.82	0.87
Cpa\|evm.model.tig00000940.23 (tig00000940_g5557.t1)	0.05	0.03	0.03	0.22	0.05	0.0	0.15	0.2	0.08	0.2	0.16	0.09	0.14	0.02	0.0	0.0	0.03	0.09	0.07	0.08	0.2	0.14	0.53	1.0	0.24	0.52
Cpa\|evm.model.tig00001021.7 (tig00001021_g6304.t1)	0.15	0.22	0.19	0.41	0.3	0.3	0.39	0.43	0.45	0.45	0.48	0.51	0.11	0.4	0.3	0.38	0.22	0.37	0.26	0.28	0.2	0.33	0.95	1.0	0.77	0.51
Cpa\|evm.model.tig00001065.8 (tig00001065_g6710.t1)	0.09	0.0	0.03	0.21	0.05	0.0	0.11	0.0	0.19	0.25	0.08	0.06	0.04	0.0	0.0	0.03	0.0	0.21	0.05	0.02	0.17	1.0	0.43	0.85	0.74	0.83
Cpa\|evm.model.tig00001073.1 (tig00001073_g6810.t1)	0.01	0.0	0.03	0.17	0.17	0.23	0.22	0.21	0.38	0.29	0.28	0.22	0.01	0.35	0.19	0.15	0.19	0.29	0.16	0.1	0.18	0.28	0.69	1.0	0.57	0.43
Cpa\|evm.model.tig00001181.18 (tig00001181_g7432.t1)	0.39	0.22	0.19	0.25	0.18	0.22	0.29	0.14	0.18	0.19	0.44	0.48	0.38	0.14	0.13	0.16	0.05	0.17	0.2	0.19	0.29	0.07	1.0	0.96	0.58	0.69
Cpa\|evm.model.tig00001636.13 (tig00001636_g9537.t1)	0.39	0.09	0.07	0.49	0.23	0.12	0.1	0.51	0.21	0.35	0.63	0.25	0.15	0.04	0.01	0.0	0.03	0.11	0.07	0.02	0.08	0.17	0.6	1.0	0.4	0.72
Cpa\|evm.model.tig00020510.147 (tig00020510_g9932.t1)	0.2	0.11	0.14	0.24	0.18	0.21	0.2	0.17	0.18	0.15	0.27	0.11	0.15	0.26	0.18	0.34	0.27	0.38	0.43	0.17	0.16	0.36	0.45	1.0	0.6	0.71
Cpa\|evm.model.tig00020510.88	0.21	0.31	0.19	0.08	0.02	0.08	0.25	0.25	0.22	0.53	0.2	0.4	0.05	0.32	0.13	0.25	0.36	0.21	0.38	0.16	0.13	0.28	1.0	0.19	0.67	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020516.15 (tig00020516_g9964.t1)	0.51	0.32	0.36	0.4	0.22	0.23	0.47	0.34	0.29	0.28	0.29	0.34	0.2	0.18	0.14	0.06	0.13	0.29	0.19	0.3	0.08	0.49	0.8	1.0	0.62	0.84
Cpa\|evm.model.tig00020616.14 (tig00001343_g8330.t1)	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.29	0.29	0.25	0.15	0.06	0.08	0.15	0.2	0.07	0.74	1.0	0.31	0.76
Cpa\|evm.model.tig00020660.53 (tig00020660_g12562.t1)	0.0	0.01	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.04	0.0	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.06	0.13	0.18	0.14	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020660.54 (tig00020660_g12562.t1)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.17	0.11	0.32	0.16	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020710.54 (tig00020710_g13297.t1)	0.26	0.12	0.12	0.23	0.06	0.04	0.12	0.11	0.11	0.42	0.4	0.4	0.05	0.02	0.03	0.0	0.04	0.13	0.17	0.11	0.15	0.03	0.84	0.5	0.77	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020710.66 (tig00020710_g13317.t1)	0.1	0.11	0.13	0.24	0.31	0.33	0.35	0.35	0.55	0.45	0.49	0.48	0.12	0.41	0.26	0.42	0.36	0.4	0.37	0.3	0.14	0.37	0.7	1.0	0.42	0.49
Cpa\|evm.model.tig00020710.74 (tig00020710_g13326.t1)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.08	0.02	0.01	0.0	0.1	0.33	0.41	1.0	0.4	0.52
Cpa\|evm.model.tig00020780.11 (tig00020780_g13763.t1)	0.41	0.48	0.5	0.47	0.45	0.33	0.4	0.4	0.39	0.37	0.47	0.5	0.37	0.49	0.39	0.44	0.31	0.71	0.52	0.35	0.75	0.15	0.71	1.0	0.89	0.97
Cpa\|evm.model.tig00020941.31 (tig00020941_g16222.t1)	0.45	0.0	0.0	0.07	0.32	0.15	0.31	0.31	0.51	0.54	1.0	0.35	0.4	0.1	0.0	0.07	0.0	0.09	0.09	0.03	0.19	0.34	0.9	0.8	0.95	0.4
Cpa\|evm.model.tig00020943.71 (tig00020943_g16311.t1)	0.05	0.15	0.36	0.0	0.07	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.09	0.0	0.06	0.2	0.04	0.22	0.04	0.32	0.09	1.0	0.64	0.25	0.64
Cpa\|evm.model.tig00020951.35 (tig00020951_g16435.t1)	0.03	0.0	0.0	0.09	0.21	0.04	0.19	0.04	0.09	0.16	0.29	0.32	0.1	0.0	0.04	0.0	0.1	0.03	0.16	0.03	0.04	0.06	0.7	0.38	0.22	1.0
Cpa\|evm.model.tig00020964.30 (tig00020964_g16806.t1)	0.23	0.03	0.03	0.09	0.03	0.03	0.11	0.23	0.07	0.47	0.51	0.32	0.19	0.25	0.29	0.26	0.2	0.09	0.09	0.05	0.06	0.26	1.0	0.43	0.32	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020964.32 (tig00020964_g16807.t1)	0.23	0.02	0.04	0.05	0.05	0.05	0.12	0.21	0.07	0.31	0.51	0.38	0.19	0.34	0.29	0.16	0.22	0.08	0.11	0.07	0.08	0.16	1.0	0.55	0.4	0.55
Cpa\|evm.model.tig00021037.46 (tig00021037_g17454.t1)	0.27	0.17	0.24	0.3	0.26	0.17	0.26	0.26	0.22	0.36	0.32	0.33	0.29	0.45	0.22	0.33	0.23	0.27	0.29	0.29	0.59	0.27	0.84	0.75	0.56	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021037.59 (tig00021037_g17467.t1)	0.31	0.31	0.42	0.48	0.67	0.58	0.72	0.55	0.61	0.82	0.75	0.63	0.33	0.53	0.34	0.3	0.49	0.71	0.52	0.72	0.42	0.43	1.0	1.0	0.51	0.99
Cpa\|evm.model.tig00021127.78 (tig00021127_g18755.t1)	0.26	0.14	0.26	0.74	0.59	0.22	0.26	0.38	0.36	0.35	0.58	0.46	0.16	0.36	0.18	0.33	0.14	0.37	0.18	0.19	0.35	0.62	0.99	1.0	0.94	0.65
Cpa\|evm.model.tig00021168.9 (tig00021168_g19074.t1)	0.45	0.44	0.42	0.4	0.49	0.47	0.53	0.58	0.64	0.6	0.56	0.5	0.35	0.59	0.35	0.63	0.23	0.35	0.3	0.33	0.24	0.72	1.0	0.95	0.91	0.59
Cpa\|evm.model.tig00021222.9 (tig00021222_g19366.t1)	0.08	0.01	0.06	0.11	0.04	0.03	0.0	0.02	0.05	0.03	0.07	0.09	0.03	0.03	0.03	0.0	0.0	0.02	0.01	0.17	0.21	0.23	0.9	0.88	0.23	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021254.46 (tig00021254_g19726.t1)	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.06	0.02	0.0	0.15	0.04	0.15	0.0	0.03	0.26	0.26	0.16	0.19	0.14	0.34	0.84	0.11	0.23	0.92	0.33	0.45	1.0
Cpa\|evm.model.tig00021434.47 (tig00021434_g21351.t1)	0.17	0.28	0.12	0.22	0.0	0.0	0.03	0.17	0.06	0.17	0.2	0.13	0.44	0.15	0.0	0.03	0.0	0.09	0.06	0.02	0.1	0.28	0.56	1.0	0.69	0.38
Cpa\|evm.model.tig00021603.6 (tig00021521_g22080.t1)	0.25	0.15	0.2	0.32	0.19	0.12	0.17	0.34	0.14	0.21	0.07	0.35	0.02	0.09	0.06	0.09	0.15	0.36	0.18	0.26	0.12	0.12	0.99	1.0	0.5	0.57

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)