Heatmap: Cluster_31 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10291 (10291)	-1.45	-0.92	-2.65	0.29	-0.48	1.45	0.7	-0.05	-	0.76	-0.0
Transcript_contig_10332 (10332)	-1.73	-0.58	-	0.4	-1.66	1.14	-0.24	0.71	-	1.26	0.4
Transcript_contig_13514 (13514)	-0.45	-0.79	-0.23	0.45	0.85	0.49	0.53	-0.81	-2.19	0.22	-0.19
Transcript_contig_1939 (1939)	-0.36	-0.45	-0.17	0.12	0.19	0.67	0.56	-0.38	-0.55	0.14	-0.4
Transcript_contig_2874 (2874)	-0.53	-0.51	0.19	0.7	-0.02	0.5	1.09	-1.63	-1.53	-0.06	-0.57
Transcript_contig_2939 (2939)	-0.45	-0.68	0.18	0.61	0.45	0.41	0.94	-0.9	-0.89	-0.24	-1.14
Transcript_contig_3453 (3453)	-0.73	-3.0	-0.3	0.5	0.79	0.85	0.89	-2.31	0.03	-0.3	-0.64
Transcript_contig_3692 (3692)	-0.69	-0.87	-0.22	0.63	0.62	0.86	0.44	-3.82	-3.07	0.64	-0.03
Transcript_contig_426 (426)	-0.85	-	0.65	0.69	0.69	0.86	1.16	-	-0.64	-1.04	-1.02
Transcript_contig_4270 (4270)	-0.45	-0.53	-1.27	0.0	-0.4	1.04	0.67	-1.25	-0.16	0.55	-0.05
Transcript_contig_4347 (4347)	-1.39	-	0.66	1.6	1.18	0.31	1.19	-	-	-	-2.14
Transcript_contig_53820 (53820)	-0.16	-1.06	-1.42	0.36	0.04	0.76	0.64	-1.14	-0.84	0.85	-0.19
Transcript_contig_54763 (54763)	-0.95	-1.81	1.07	1.21	0.81	0.88	0.81	-2.32	-3.12	-	-3.08
Transcript_contig_55261 (55261)	-0.28	-0.08	0.1	0.09	0.31	0.42	0.07	-0.01	-0.57	0.09	-0.45
Transcript_contig_56016 (56016)	-0.5	-0.54	-0.39	0.69	0.81	0.52	0.57	-0.5	-0.07	-0.92	-1.45
Transcript_contig_57017 (57017)	-0.39	-0.92	0.3	0.53	0.41	0.63	0.97	-1.64	-0.48	-0.59	-1.05
Transcript_contig_57112 (57112)	-1.01	-1.91	-0.53	0.5	0.82	0.98	0.28	-2.84	-0.11	0.12	0.04
Transcript_contig_57190 (57190)	-0.27	-0.55	0.67	0.31	0.47	0.43	0.81	-1.83	-0.52	-0.73	-0.73
Transcript_contig_57470 (57470)	-0.2	-0.39	0.19	0.42	0.57	0.3	0.48	-0.5	-0.59	-0.39	-0.62
Transcript_contig_57499 (57499)	-0.21	-0.01	0.43	0.01	0.31	0.18	0.61	-0.58	0.06	-0.73	-0.8
Transcript_contig_57519 (57519)	-0.09	-0.62	-0.28	0.69	0.63	1.13	1.1	-1.64	-	-1.73	-1.04
Transcript_contig_58536 (58536)	-0.26	-0.23	0.47	0.45	0.41	-0.16	0.88	-0.96	-1.97	-0.03	-0.42
Transcript_contig_58946 (58946)	-0.97	-	-0.96	0.72	0.81	1.07	1.14	-	-1.38	0.5	-1.07
Transcript_contig_58977 (58977)	-1.2	-	1.31	1.05	0.27	0.48	1.08	-	-0.42	-2.29	-1.48
Transcript_contig_59274 (59274)	-0.7	-1.06	0.73	0.59	0.92	0.34	-0.18	-1.64	0.11	-0.37	-0.93
Transcript_contig_5947 (5947)	-0.46	-0.68	-1.19	0.58	0.69	0.89	0.51	-0.49	-5.0	0.38	-0.34
Transcript_contig_59711 (59711)	-0.14	-0.49	-0.55	0.61	0.73	0.72	0.37	-1.43	-0.94	0.09	-0.7
Transcript_contig_59787 (59787)	0.22	-0.52	0.31	0.61	0.37	0.85	0.69	-0.83	-0.57	-1.84	-2.93
Transcript_contig_59888 (59888)	-0.56	-0.38	-0.23	0.46	0.18	0.85	0.32	0.37	-2.19	0.02	-0.69
Transcript_contig_60049 (60049)	0.01	-0.95	0.48	1.08	0.93	0.47	0.47	-2.13	-4.87	-0.85	-1.12
Transcript_contig_60184 (60184)	-0.47	-0.5	-0.56	0.45	0.49	1.14	0.3	-1.5	-5.98	0.49	-0.14
Transcript_contig_60436 (60436)	-0.66	-	0.87	0.58	0.54	1.33	1.17	-	-2.96	-1.98	-1.18
Transcript_contig_61020 (61020)	0.05	-0.44	-0.13	0.63	0.37	0.67	1.16	-0.72	-5.13	-0.67	-1.4
Transcript_contig_61080 (61080)	-0.02	-	-0.14	1.31	0.3	1.48	1.38	-	-	-	-
Transcript_contig_61390 (61390)	-0.39	-0.68	0.74	0.36	0.72	0.02	0.25	-2.39	-0.06	0.1	-0.76
Transcript_contig_61551 (61551)	-0.69	-0.46	-0.67	0.84	0.28	0.91	0.49	-1.1	-3.9	0.5	-0.35
Transcript_contig_61941 (61941)	-0.49	-0.05	-0.23	-0.4	-0.03	0.94	0.89	0.24	-2.74	-0.11	-0.51
Transcript_contig_63672 (63672)	-1.07	-	-1.86	0.56	1.1	1.58	0.67	-	0.58	-	-0.84
Transcript_contig_6665 (6665)	-1.07	-3.98	0.44	1.22	0.63	0.9	0.63	-3.93	-	0.02	-0.42
Transcript_contig_67590 (67590)	-0.16	-1.35	-0.15	0.79	0.48	0.35	0.98	0.0	-0.67	-1.48	-1.16
Transcript_contig_67892 (67892)	-1.29	-0.59	-0.73	0.58	1.04	0.42	-0.13	0.44	0.11	-0.7	-1.11
Transcript_contig_69519 (69519)	-0.38	-2.35	0.18	0.76	-0.01	0.96	0.94	-2.75	-0.27	-0.43	-0.67
Transcript_contig_69964 (69964)	-0.81	-0.97	-0.54	0.75	0.77	1.15	0.19	-1.89	-1.81	0.15	-0.29
Transcript_contig_70417 (70417)	-1.87	-	1.41	0.89	0.37	1.1	0.66	-	-	-0.38	-1.15
Transcript_contig_7388 (7388)	-0.49	0.17	-0.08	0.19	0.7	0.4	0.0	0.44	-3.55	0.02	-0.59
Transcript_contig_78508 (78508)	-0.75	-1.0	-0.73	0.06	0.38	0.94	0.69	-1.51	-1.15	1.02	-0.74
Transcript_contig_78594 (78594)	-0.36	-0.78	0.59	0.39	0.59	0.17	0.54	-1.54	-0.2	0.14	-1.19
Transcript_contig_78973 (78973)	-0.32	-0.75	0.69	0.44	0.28	0.91	0.95	-1.14	-2.02	-1.27	-0.99
Transcript_contig_79298 (79298)	0.01	-0.75	0.13	0.56	0.6	0.53	0.83	-1.66	-0.38	-0.51	-1.71
Transcript_contig_79349 (79349)	-0.76	-1.51	-0.06	0.32	0.12	0.93	0.74	-1.42	-2.45	0.62	0.13
Transcript_contig_79569 (79569)	-0.43	-0.58	0.21	0.5	0.63	0.6	0.85	-0.33	-1.86	-0.59	-1.25
Transcript_contig_80053 (80053)	-1.29	-2.79	-0.31	0.62	0.86	0.93	0.77	-1.74	0.41	-0.57	-1.43
Transcript_contig_80491 (80491)	-1.11	-	0.62	1.08	0.88	0.9	0.9	-	-1.11	-1.34	-1.12
Transcript_contig_80559 (80559)	-0.63	-2.39	0.39	0.43	0.95	1.26	-0.02	-1.04	-2.1	-0.18	-0.8
Transcript_contig_80663 (80663)	-1.33	-	0.43	0.99	0.77	0.81	0.98	-	0.86	-	-5.33
Transcript_contig_81067 (81067)	-1.83	-	1.37	0.62	0.8	0.62	1.16	-	-0.34	-	-1.77
Transcript_contig_81167 (81167)	-1.26	-3.52	0.55	0.94	0.52	0.12	0.98	-	0.84	-0.59	-2.54
Transcript_contig_81899 (81899)	-1.16	-3.76	0.32	0.29	1.21	1.13	1.26	-2.44	-4.6	-1.19	-1.21
Transcript_contig_82526 (82526)	-0.43	-0.28	0.4	0.35	0.85	0.7	0.29	-0.68	-2.35	-0.26	-0.88
Transcript_contig_8261 (8261)	-0.49	-1.37	-0.66	0.5	1.27	0.66	0.86	-1.53	-2.62	-0.09	-0.73
Transcript_contig_82809 (82809)	-0.42	-0.63	-0.12	0.5	0.5	0.28	0.49	-1.09	0.22	-0.09	-0.59
Transcript_contig_8285 (8285)	-0.82	-0.71	-0.11	0.33	0.86	0.68	0.17	-0.3	-2.91	0.54	-0.53
Transcript_contig_83282 (83282)	-0.75	-	0.23	1.17	0.87	0.87	1.55	-	-1.91	-	-2.98
Transcript_contig_89189 (89189)	-1.03	-0.65	-0.64	0.52	0.27	1.24	0.74	-0.77	-2.21	-0.02	-0.38
Transcript_contig_89535 (89535)	-0.71	-0.7	-0.55	0.3	-0.15	0.9	0.83	-1.04	0.2	-0.08	-0.45
Transcript_contig_89793 (89793)	-0.45	-0.3	0.07	0.25	0.84	0.79	-0.09	-0.03	-1.44	-0.11	-1.05
Transcript_contig_89820 (89820)	-1.57	-3.05	-0.62	0.8	1.46	1.37	-0.39	-4.89	-0.61	-0.36	-0.82
Transcript_contig_90504 (90504)	-1.06	-2.34	0.33	0.43	1.07	0.78	0.43	-3.76	0.55	-0.6	-1.47
Transcript_contig_9327 (9327)	-0.51	-0.82	0.05	0.43	0.95	0.83	0.34	-2.02	-1.08	0.02	-0.65

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.