Heatmap: Cluster_31 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10291 (10291)	0.13	0.19	0.06	0.45	0.26	1.0	0.6	0.35	0.0	0.62	0.37
Transcript_contig_10332 (10332)	0.13	0.28	0.0	0.55	0.13	0.92	0.35	0.68	0.0	1.0	0.55
Transcript_contig_13514 (13514)	0.41	0.32	0.47	0.76	1.0	0.78	0.8	0.32	0.12	0.65	0.49
Transcript_contig_1939 (1939)	0.49	0.46	0.56	0.69	0.72	1.0	0.93	0.48	0.43	0.7	0.48
Transcript_contig_2874 (2874)	0.32	0.33	0.54	0.76	0.46	0.67	1.0	0.15	0.16	0.45	0.32
Transcript_contig_2939 (2939)	0.38	0.33	0.59	0.79	0.71	0.69	1.0	0.28	0.28	0.44	0.24
Transcript_contig_3453 (3453)	0.33	0.07	0.44	0.76	0.93	0.97	1.0	0.11	0.55	0.44	0.35
Transcript_contig_3692 (3692)	0.34	0.3	0.48	0.85	0.85	1.0	0.75	0.04	0.07	0.86	0.54
Transcript_contig_426 (426)	0.25	0.0	0.7	0.72	0.72	0.81	1.0	0.0	0.29	0.22	0.22
Transcript_contig_4270 (4270)	0.36	0.34	0.2	0.49	0.37	1.0	0.78	0.2	0.43	0.71	0.47
Transcript_contig_4347 (4347)	0.13	0.0	0.52	1.0	0.75	0.41	0.76	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_53820 (53820)	0.5	0.27	0.21	0.71	0.57	0.94	0.87	0.25	0.31	1.0	0.49
Transcript_contig_54763 (54763)	0.22	0.12	0.9	1.0	0.75	0.79	0.76	0.09	0.05	0.0	0.05
Transcript_contig_55261 (55261)	0.62	0.71	0.8	0.8	0.93	1.0	0.78	0.74	0.5	0.8	0.55
Transcript_contig_56016 (56016)	0.4	0.39	0.43	0.92	1.0	0.82	0.85	0.4	0.54	0.3	0.21
Transcript_contig_57017 (57017)	0.39	0.27	0.63	0.74	0.68	0.79	1.0	0.16	0.37	0.34	0.25
Transcript_contig_57112 (57112)	0.25	0.14	0.35	0.72	0.9	1.0	0.62	0.07	0.47	0.55	0.52
Transcript_contig_57190 (57190)	0.47	0.39	0.91	0.71	0.79	0.77	1.0	0.16	0.4	0.35	0.34
Transcript_contig_57470 (57470)	0.59	0.51	0.76	0.9	1.0	0.82	0.94	0.47	0.45	0.51	0.44
Transcript_contig_57499 (57499)	0.57	0.65	0.88	0.66	0.82	0.74	1.0	0.44	0.69	0.4	0.38
Transcript_contig_57519 (57519)	0.43	0.3	0.38	0.74	0.71	1.0	0.98	0.15	0.0	0.14	0.22
Transcript_contig_58536 (58536)	0.45	0.46	0.75	0.74	0.72	0.49	1.0	0.28	0.14	0.53	0.4
Transcript_contig_58946 (58946)	0.23	0.0	0.23	0.75	0.8	0.95	1.0	0.0	0.17	0.64	0.22
Transcript_contig_58977 (58977)	0.18	0.0	1.0	0.83	0.49	0.56	0.85	0.0	0.3	0.08	0.14
Transcript_contig_59274 (59274)	0.32	0.25	0.87	0.79	1.0	0.67	0.47	0.17	0.57	0.41	0.28
Transcript_contig_5947 (5947)	0.39	0.34	0.24	0.81	0.87	1.0	0.77	0.39	0.02	0.7	0.43
Transcript_contig_59711 (59711)	0.54	0.43	0.41	0.92	1.0	0.99	0.78	0.22	0.31	0.64	0.37
Transcript_contig_59787 (59787)	0.65	0.39	0.69	0.85	0.72	1.0	0.89	0.31	0.37	0.15	0.07
Transcript_contig_59888 (59888)	0.37	0.42	0.47	0.76	0.62	1.0	0.69	0.72	0.12	0.56	0.34
Transcript_contig_60049 (60049)	0.47	0.24	0.66	1.0	0.9	0.65	0.65	0.11	0.02	0.26	0.22
Transcript_contig_60184 (60184)	0.33	0.32	0.31	0.62	0.64	1.0	0.56	0.16	0.01	0.64	0.41
Transcript_contig_60436 (60436)	0.25	0.0	0.73	0.59	0.58	1.0	0.9	0.0	0.05	0.1	0.17
Transcript_contig_61020 (61020)	0.46	0.33	0.41	0.69	0.58	0.71	1.0	0.27	0.01	0.28	0.17
Transcript_contig_61080 (61080)	0.35	0.0	0.32	0.89	0.44	1.0	0.93	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61390 (61390)	0.46	0.37	1.0	0.77	0.99	0.61	0.71	0.11	0.57	0.64	0.35
Transcript_contig_61551 (61551)	0.33	0.39	0.33	0.95	0.65	1.0	0.75	0.25	0.04	0.75	0.42
Transcript_contig_61941 (61941)	0.37	0.5	0.44	0.39	0.51	1.0	0.96	0.61	0.08	0.48	0.36
Transcript_contig_63672 (63672)	0.16	0.0	0.09	0.5	0.72	1.0	0.53	0.0	0.5	0.0	0.19
Transcript_contig_6665 (6665)	0.2	0.03	0.58	1.0	0.66	0.8	0.66	0.03	0.0	0.43	0.32
Transcript_contig_67590 (67590)	0.45	0.2	0.46	0.87	0.7	0.64	1.0	0.51	0.32	0.18	0.23
Transcript_contig_67892 (67892)	0.2	0.32	0.29	0.73	1.0	0.65	0.45	0.66	0.52	0.3	0.22
Transcript_contig_69519 (69519)	0.4	0.1	0.58	0.87	0.51	1.0	0.99	0.08	0.43	0.38	0.32
Transcript_contig_69964 (69964)	0.26	0.23	0.31	0.76	0.77	1.0	0.51	0.12	0.13	0.5	0.37
Transcript_contig_70417 (70417)	0.1	0.0	1.0	0.7	0.49	0.81	0.59	0.0	0.0	0.29	0.17
Transcript_contig_7388 (7388)	0.44	0.69	0.58	0.7	1.0	0.81	0.62	0.83	0.05	0.62	0.41
Transcript_contig_78508 (78508)	0.29	0.25	0.3	0.51	0.64	0.95	0.8	0.17	0.22	1.0	0.3
Transcript_contig_78594 (78594)	0.52	0.39	1.0	0.87	1.0	0.75	0.97	0.23	0.58	0.73	0.29
Transcript_contig_78973 (78973)	0.42	0.31	0.84	0.7	0.63	0.97	1.0	0.24	0.13	0.22	0.26
Transcript_contig_79298 (79298)	0.57	0.33	0.62	0.83	0.86	0.81	1.0	0.18	0.43	0.4	0.17
Transcript_contig_79349 (79349)	0.31	0.18	0.5	0.65	0.57	1.0	0.87	0.2	0.1	0.81	0.58
Transcript_contig_79569 (79569)	0.41	0.37	0.64	0.79	0.86	0.85	1.0	0.44	0.15	0.37	0.23
Transcript_contig_80053 (80053)	0.21	0.08	0.42	0.81	0.95	1.0	0.9	0.16	0.69	0.35	0.19
Transcript_contig_80491 (80491)	0.22	0.0	0.73	1.0	0.87	0.89	0.89	0.0	0.22	0.19	0.22
Transcript_contig_80559 (80559)	0.27	0.08	0.55	0.56	0.81	1.0	0.41	0.2	0.1	0.37	0.24
Transcript_contig_80663 (80663)	0.2	0.0	0.68	1.0	0.86	0.88	0.99	0.0	0.91	0.0	0.01
Transcript_contig_81067 (81067)	0.11	0.0	1.0	0.59	0.67	0.59	0.86	0.0	0.31	0.0	0.11
Transcript_contig_81167 (81167)	0.21	0.04	0.74	0.98	0.73	0.55	1.0	0.0	0.91	0.34	0.09
Transcript_contig_81899 (81899)	0.19	0.03	0.52	0.51	0.97	0.91	1.0	0.08	0.02	0.18	0.18
Transcript_contig_82526 (82526)	0.41	0.46	0.73	0.71	1.0	0.9	0.68	0.35	0.11	0.46	0.3
Transcript_contig_8261 (8261)	0.3	0.16	0.26	0.59	1.0	0.66	0.75	0.14	0.07	0.39	0.25
Transcript_contig_82809 (82809)	0.53	0.46	0.65	1.0	0.99	0.85	0.99	0.33	0.82	0.66	0.47
Transcript_contig_8285 (8285)	0.31	0.34	0.51	0.7	1.0	0.89	0.62	0.45	0.07	0.8	0.38
Transcript_contig_83282 (83282)	0.2	0.0	0.4	0.77	0.63	0.62	1.0	0.0	0.09	0.0	0.04
Transcript_contig_89189 (89189)	0.21	0.27	0.27	0.61	0.51	1.0	0.71	0.25	0.09	0.42	0.33
Transcript_contig_89535 (89535)	0.33	0.33	0.37	0.66	0.48	1.0	0.95	0.26	0.61	0.51	0.39
Transcript_contig_89793 (89793)	0.41	0.45	0.59	0.67	1.0	0.96	0.52	0.55	0.21	0.52	0.27
Transcript_contig_89820 (89820)	0.12	0.04	0.24	0.63	1.0	0.94	0.28	0.01	0.24	0.28	0.21
Transcript_contig_90504 (90504)	0.23	0.09	0.6	0.64	1.0	0.82	0.64	0.04	0.7	0.31	0.17
Transcript_contig_9327 (9327)	0.36	0.29	0.53	0.69	1.0	0.92	0.66	0.13	0.25	0.52	0.33

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)