Heatmap: Cluster_204 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11031 (11031)	0.27	0.39	0.45	0.24	0.22	0.41	1.0	0.39	0.04	0.05	0.12
Transcript_contig_11851 (11851)	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_11986 (11986)	0.36	0.03	0.17	0.4	0.45	0.25	1.0	0.0	0.0	0.01	0.03
Transcript_contig_11995 (11995)	0.4	0.0	0.35	0.25	0.27	0.27	1.0	0.23	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_1265 (1265)	0.64	0.0	0.01	0.0	0.0	0.07	1.0	0.0	0.0	0.07	0.02
Transcript_contig_13845 (13845)	0.42	0.08	0.09	0.15	0.08	0.4	1.0	0.19	0.0	0.0	0.2
Transcript_contig_14105 (14105)	0.31	0.0	0.0	0.18	0.17	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_18803 (18803)	0.48	0.17	0.28	0.31	0.17	0.78	1.0	0.13	0.0	0.13	0.03
Transcript_contig_1978 (1978)	0.34	0.09	0.03	0.04	0.0	0.02	1.0	0.05	0.07	0.01	0.05
Transcript_contig_2051 (2051)	0.32	0.14	0.11	0.17	0.07	0.21	1.0	0.08	0.0	0.0	0.11
Transcript_contig_2307 (2307)	0.41	0.0	0.12	0.13	0.14	0.19	1.0	0.0	0.07	0.0	0.01
Transcript_contig_23318 (23318)	0.45	0.29	0.71	0.3	1.0	0.19	0.87	0.36	0.0	0.05	0.23
Transcript_contig_25583 (25583)	0.56	0.0	0.7	1.0	0.53	0.25	0.98	0.0	0.05	0.0	0.03
Transcript_contig_27061 (27061)	0.52	0.0	0.0	0.01	0.01	0.19	1.0	0.01	0.0	0.32	0.19
Transcript_contig_27632 (27632)	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14
Transcript_contig_27869 (27869)	0.16	0.0	0.72	0.29	0.24	0.21	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_3102 (3102)	0.21	0.0	0.4	0.55	0.82	0.5	1.0	0.0	0.02	0.26	0.37
Transcript_contig_31793 (31793)	0.55	0.41	0.43	0.27	0.19	0.19	1.0	0.32	0.0	0.03	0.03
Transcript_contig_320 (320)	0.26	0.0	0.19	0.23	0.17	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_35239 (35239)	0.42	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	1.0	0.01	0.0	0.0	0.07
Transcript_contig_3552 (3552)	0.53	0.2	0.65	0.38	0.43	0.35	1.0	0.29	0.49	0.01	0.02
Transcript_contig_53875 (53875)	0.49	0.19	0.0	0.0	0.01	0.26	1.0	0.17	0.0	0.03	0.0
Transcript_contig_54356 (54356)	0.32	0.04	0.05	0.1	0.08	0.34	1.0	0.03	0.19	0.06	0.07
Transcript_contig_54696 (54696)	0.57	0.15	0.09	0.1	0.11	0.46	1.0	0.15	0.08	0.45	0.25
Transcript_contig_54744 (54744)	0.52	0.21	0.07	0.06	0.06	0.62	1.0	0.14	0.11	0.67	0.36
Transcript_contig_54848 (54848)	0.48	0.19	0.06	0.08	0.08	0.17	1.0	0.21	0.01	0.06	0.03
Transcript_contig_55951 (55951)	0.47	0.22	0.35	0.41	0.35	0.24	1.0	0.16	0.0	0.03	0.01
Transcript_contig_56117 (56117)	0.47	0.31	0.12	0.23	0.23	0.31	1.0	0.23	0.1	0.14	0.09
Transcript_contig_56799 (56799)	0.52	0.0	0.01	0.01	0.01	0.24	1.0	0.0	0.09	0.41	0.28
Transcript_contig_5759 (5759)	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5762 (5762)	0.42	0.19	0.4	0.35	0.2	0.23	1.0	0.24	0.16	0.0	0.0
Transcript_contig_57682 (57682)	0.41	0.0	0.01	0.01	0.03	0.03	1.0	0.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_57901 (57901)	0.43	0.05	0.0	0.01	0.01	0.77	1.0	0.1	0.07	0.53	0.31
Transcript_contig_58972 (58972)	0.47	0.23	0.2	0.42	0.44	0.57	1.0	0.32	0.08	0.42	0.17
Transcript_contig_59403 (59403)	0.45	0.19	0.11	0.18	0.3	0.29	1.0	0.14	0.06	0.07	0.09
Transcript_contig_60277 (60277)	0.33	0.0	0.45	0.4	1.0	0.79	1.0	0.0	0.21	0.0	0.0
Transcript_contig_60308 (60308)	0.44	0.05	0.31	0.3	1.0	0.4	0.91	0.0	0.0	0.09	0.0
Transcript_contig_60969 (60969)	0.29	0.03	0.35	0.34	0.35	0.14	1.0	0.0	0.0	0.0	0.06
Transcript_contig_61014 (61014)	0.46	0.02	0.35	0.24	0.1	0.35	1.0	0.08	0.1	0.02	0.0
Transcript_contig_61033 (61033)	0.43	0.0	0.0	0.47	0.89	0.0	1.0	0.0	0.0	0.18	0.0
Transcript_contig_61042 (61042)	0.22	0.08	0.26	0.0	0.15	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61062 (61062)	0.44	0.5	0.65	0.54	1.0	0.2	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61473 (61473)	0.55	0.15	1.0	0.81	0.84	0.19	0.98	0.11	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61535 (61535)	0.35	0.14	0.44	0.62	0.75	0.63	1.0	0.07	0.27	0.31	0.57
Transcript_contig_61685 (61685)	0.23	0.0	0.27	0.13	0.1	0.1	1.0	0.0	0.0	0.0	0.06
Transcript_contig_61710 (61710)	0.3	0.0	0.35	0.25	0.2	0.2	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_62355 (62355)	0.38	0.17	0.3	0.41	1.0	0.17	0.62	0.2	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_67054 (67054)	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67721 (67721)	0.72	0.15	0.0	0.24	0.2	0.11	1.0	0.17	0.0	0.28	0.11
Transcript_contig_68259 (68259)	0.66	0.32	0.42	0.45	0.45	0.24	1.0	0.15	0.0	0.65	0.08
Transcript_contig_68475 (68475)	0.42	0.0	0.0	0.0	0.45	0.11	1.0	0.0	0.0	0.11	0.0
Transcript_contig_72564 (72564)	0.34	0.03	0.06	0.15	0.05	0.19	1.0	0.0	0.0	0.01	0.0
Transcript_contig_75348 (75348)	0.52	0.0	0.23	0.09	0.08	0.03	1.0	0.0	0.0	0.28	0.15
Transcript_contig_76469 (76469)	0.52	0.0	0.4	0.5	0.16	0.15	1.0	0.0	0.0	0.22	0.15
Transcript_contig_78045 (78045)	0.41	0.01	0.24	0.28	0.25	0.51	1.0	0.0	0.03	0.03	0.07
Transcript_contig_79045 (79045)	0.58	0.03	0.03	0.03	0.03	0.27	1.0	0.04	0.34	0.45	0.34
Transcript_contig_79526 (79526)	0.41	0.0	0.09	0.1	0.16	0.32	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_79879 (79879)	0.56	0.05	0.03	0.05	0.04	0.08	1.0	0.06	0.0	0.12	0.05
Transcript_contig_80955 (80955)	0.2	0.1	0.34	0.38	0.3	0.38	1.0	0.08	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_8110 (8110)	0.44	0.0	0.11	0.15	0.25	0.22	1.0	0.0	0.0	0.03	0.0
Transcript_contig_82724 (82724)	0.38	0.19	0.24	0.35	0.28	0.23	1.0	0.17	0.22	0.0	0.03
Transcript_contig_89629 (89629)	0.34	0.11	0.11	0.28	0.24	0.28	1.0	0.05	0.0	0.06	0.05
Transcript_contig_90193 (90193)	0.19	0.0	0.69	0.06	1.0	0.63	0.72	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_90452 (90452)	0.26	0.09	0.19	0.23	0.58	0.29	1.0	0.0	0.0	0.17	0.07
Transcript_contig_90465 (90465)	0.52	0.0	0.4	0.23	0.09	0.21	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_90565 (90565)	0.51	0.0	0.42	0.66	0.38	0.16	1.0	0.28	0.0	0.15	0.0
Transcript_contig_91414 (91414)	0.23	0.0	0.5	0.56	0.75	0.58	1.0	0.0	0.0	0.16	0.28
Transcript_contig_9879 (9879)	0.23	0.0	0.13	0.22	0.44	0.31	1.0	0.0	0.0	0.11	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)