Heatmap: Cluster_93 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_2244 (2244)	0.14	0.0	1.0	0.45	0.1	0.13	0.23	0.0	0.0	0.33	0.14
Transcript_contig_2671 (2671)	0.57	0.69	0.85	0.76	0.76	0.59	1.0	0.19	0.53	0.63	0.48
Transcript_contig_3086 (3086)	0.66	1.0	0.67	0.63	0.36	0.21	0.32	0.8	0.28	0.45	0.32
Transcript_contig_4039 (4039)	0.3	0.25	1.0	0.6	0.16	0.32	0.58	0.23	0.52	0.38	0.27
Transcript_contig_4286 (4286)	0.16	0.13	1.0	0.43	0.02	0.22	0.43	0.04	0.02	0.06	0.22
Transcript_contig_4425 (4425)	0.06	0.0	1.0	0.5	0.01	0.2	0.32	0.0	0.12	0.14	0.16
Transcript_contig_53811 (53811)	0.79	0.9	1.0	0.64	0.2	0.31	0.38	0.47	0.06	0.44	0.31
Transcript_contig_54171 (54171)	0.72	0.67	1.0	0.47	0.12	0.21	0.64	0.44	0.05	0.26	0.18
Transcript_contig_54198 (54198)	0.34	0.21	1.0	0.65	0.27	0.26	0.52	0.11	0.32	0.26	0.25
Transcript_contig_54295 (54295)	0.5	0.51	1.0	0.48	0.15	0.17	0.31	0.44	0.17	0.16	0.2
Transcript_contig_54591 (54591)	0.47	0.75	1.0	0.43	0.03	0.19	0.55	0.68	0.26	0.32	0.15
Transcript_contig_54947 (54947)	0.18	0.17	1.0	0.4	0.02	0.08	0.26	0.16	0.13	0.06	0.05
Transcript_contig_55134 (55134)	0.28	0.42	1.0	0.67	0.16	0.16	0.19	0.55	0.11	0.16	0.14
Transcript_contig_55217 (55217)	0.38	0.28	1.0	0.85	0.05	0.54	0.65	0.0	0.23	0.38	0.5
Transcript_contig_55412 (55412)	0.16	0.21	1.0	0.44	0.02	0.13	0.11	0.17	0.1	0.13	0.15
Transcript_contig_55470 (55470)	0.29	0.21	1.0	0.53	0.04	0.21	0.37	0.19	0.7	0.21	0.21
Transcript_contig_55681 (55681)	0.78	1.0	0.99	0.53	0.16	0.4	0.67	1.0	0.02	0.32	0.18
Transcript_contig_55974 (55974)	0.59	0.77	0.84	0.87	0.68	0.58	1.0	0.45	0.33	0.68	0.44
Transcript_contig_56161 (56161)	0.33	0.44	1.0	0.6	0.21	0.13	0.3	0.41	0.42	0.24	0.16
Transcript_contig_56220 (56220)	0.38	0.4	1.0	0.52	0.63	0.24	0.58	0.41	0.34	0.28	0.19
Transcript_contig_56559 (56559)	0.27	0.19	1.0	0.57	0.18	0.4	0.75	0.16	0.57	0.35	0.25
Transcript_contig_56725 (56725)	0.37	0.28	1.0	0.67	0.32	0.27	0.45	0.09	0.75	0.51	0.33
Transcript_contig_56838 (56838)	0.47	0.56	1.0	0.46	0.04	0.11	0.21	0.41	0.34	0.28	0.21
Transcript_contig_56988 (56988)	0.37	0.23	1.0	0.62	0.36	0.37	0.47	0.29	0.69	0.61	0.47
Transcript_contig_57002 (57002)	0.68	0.83	0.8	0.71	0.77	0.76	1.0	0.62	0.52	0.48	0.21
Transcript_contig_57011 (57011)	0.65	0.83	1.0	0.47	0.17	0.52	0.61	0.7	0.01	0.2	0.28
Transcript_contig_57108 (57108)	0.34	0.26	1.0	0.64	0.19	0.39	0.76	0.16	1.0	0.38	0.27
Transcript_contig_57195 (57195)	0.68	0.75	1.0	0.61	0.02	0.13	0.27	0.42	0.23	0.16	0.14
Transcript_contig_57228 (57228)	0.75	1.0	0.87	0.55	0.27	0.25	0.41	0.55	0.23	0.44	0.32
Transcript_contig_57298 (57298)	0.49	0.59	1.0	0.69	0.44	0.36	0.58	0.56	0.23	0.27	0.3
Transcript_contig_57380 (57380)	0.75	0.82	0.78	0.75	0.52	0.57	1.0	0.15	0.52	0.39	0.27
Transcript_contig_57388 (57388)	0.32	0.27	1.0	0.57	0.29	0.44	0.81	0.18	0.09	0.34	0.19
Transcript_contig_57428 (57428)	0.95	1.0	1.0	0.78	0.5	0.28	0.56	0.61	0.1	0.92	0.66
Transcript_contig_57531 (57531)	0.76	0.86	1.0	0.54	0.21	0.41	0.84	0.54	0.17	0.44	0.47
Transcript_contig_57593 (57593)	0.4	0.67	0.81	0.74	1.0	0.21	0.91	0.47	0.06	0.47	0.26
Transcript_contig_57671 (57671)	0.29	0.27	1.0	0.56	0.08	0.12	0.26	0.13	0.55	0.21	0.19
Transcript_contig_57810 (57810)	0.3	0.16	1.0	0.65	0.17	0.27	0.47	0.07	0.2	0.27	0.21
Transcript_contig_57966 (57966)	0.59	0.93	0.93	0.25	0.08	0.14	0.59	1.0	0.0	0.15	0.13
Transcript_contig_58095 (58095)	0.39	0.37	1.0	0.5	0.22	0.28	0.46	0.38	0.24	0.33	0.3
Transcript_contig_58253 (58253)	0.22	0.1	1.0	0.65	0.06	0.15	0.35	0.09	0.34	0.24	0.22
Transcript_contig_58264 (58264)	0.61	0.6	1.0	0.47	0.5	0.36	0.63	0.59	0.46	0.33	0.21
Transcript_contig_58448 (58448)	0.24	0.25	1.0	0.42	0.15	0.18	0.48	0.13	0.11	0.13	0.08
Transcript_contig_58877 (58877)	0.6	0.52	1.0	0.48	0.25	0.23	0.52	0.29	0.06	0.52	0.3
Transcript_contig_59602 (59602)	0.68	0.95	0.91	0.72	0.0	0.17	0.41	1.0	0.26	0.21	0.24
Transcript_contig_59686 (59686)	0.12	0.09	1.0	0.32	0.01	0.05	0.22	0.04	0.07	0.07	0.08
Transcript_contig_59995 (59995)	0.34	0.32	1.0	0.84	0.6	0.45	0.33	0.1	0.21	0.72	0.74
Transcript_contig_60356 (60356)	0.15	0.09	1.0	0.62	0.35	0.14	0.28	0.03	0.03	0.09	0.13
Transcript_contig_60403 (60403)	0.82	1.0	0.75	0.87	0.33	0.29	0.48	0.59	0.27	0.29	0.2
Transcript_contig_609 (609)	0.7	0.66	1.0	0.82	0.58	0.41	0.68	0.4	0.85	0.44	0.34
Transcript_contig_61488 (61488)	0.22	0.0	1.0	0.3	0.05	0.17	0.33	0.0	0.0	0.42	0.15
Transcript_contig_61984 (61984)	0.17	0.18	1.0	0.77	0.21	0.11	0.19	0.19	0.67	0.16	0.15
Transcript_contig_63064 (63064)	0.23	0.19	1.0	0.84	0.34	0.24	0.43	0.1	0.0	0.58	0.46
Transcript_contig_64884 (64884)	0.45	0.4	0.95	0.67	0.5	0.58	1.0	0.2	0.11	0.54	0.46
Transcript_contig_67685 (67685)	0.44	0.5	1.0	0.56	0.39	0.37	0.54	0.55	0.12	0.17	0.21
Transcript_contig_67799 (67799)	0.31	0.42	1.0	0.43	0.05	0.18	0.6	0.51	0.08	0.17	0.13
Transcript_contig_68213 (68213)	0.96	0.89	0.75	0.89	0.7	0.72	1.0	0.26	0.7	0.82	0.34
Transcript_contig_69428 (69428)	0.43	0.58	1.0	0.9	0.7	0.37	0.93	0.72	0.23	0.21	0.21
Transcript_contig_69591 (69591)	0.45	0.46	0.8	0.54	0.75	0.36	1.0	0.48	0.11	0.48	0.29
Transcript_contig_71801 (71801)	0.46	0.48	0.58	0.51	0.3	0.26	0.4	0.58	1.0	0.28	0.15
Transcript_contig_78192 (78192)	0.44	0.4	1.0	0.77	0.5	0.15	0.44	0.33	0.26	0.28	0.22
Transcript_contig_78425 (78425)	0.79	0.74	0.93	1.0	0.66	0.51	0.89	0.26	0.33	0.92	0.5
Transcript_contig_78520 (78520)	0.57	0.48	0.87	0.7	0.56	0.45	1.0	0.68	0.31	0.7	0.49
Transcript_contig_78564 (78564)	0.1	0.08	1.0	0.66	0.08	0.23	0.18	0.13	0.01	0.5	0.28
Transcript_contig_78758 (78758)	0.37	0.36	1.0	0.7	0.42	0.23	0.56	0.37	0.6	0.47	0.43
Transcript_contig_78771 (78771)	0.37	0.26	1.0	0.51	0.19	0.17	0.38	0.27	0.63	0.38	0.42
Transcript_contig_78937 (78937)	0.73	0.83	1.0	0.6	0.11	0.27	0.52	0.36	0.05	0.36	0.22
Transcript_contig_79106 (79106)	0.46	0.42	1.0	0.77	0.33	0.36	0.43	0.12	0.0	0.28	0.24
Transcript_contig_79244 (79244)	0.63	0.82	0.99	0.71	0.63	0.73	1.0	0.7	0.0	0.39	0.39
Transcript_contig_79589 (79589)	0.72	0.86	1.0	0.47	0.05	0.21	0.23	0.43	0.38	0.68	0.48
Transcript_contig_80617 (80617)	0.07	0.13	1.0	0.34	0.06	0.23	0.29	0.22	0.0	0.1	0.21
Transcript_contig_82125 (82125)	0.61	0.5	1.0	0.63	0.36	0.2	0.48	0.27	0.18	0.21	0.18
Transcript_contig_82650 (82650)	0.54	1.0	0.66	0.48	0.44	0.29	0.56	1.0	0.13	0.17	0.17
Transcript_contig_83237 (83237)	0.33	0.26	1.0	0.55	0.26	0.16	0.45	0.16	0.09	0.11	0.12
Transcript_contig_869 (869)	0.05	0.0	1.0	0.34	0.0	0.14	0.26	0.0	0.03	0.07	0.08
Transcript_contig_88 (88)	0.18	0.0	1.0	0.35	0.0	0.24	0.57	0.0	0.0	0.12	0.36
Transcript_contig_89123 (89123)	0.44	0.39	1.0	0.65	0.12	0.31	0.58	0.37	0.3	0.63	0.39
Transcript_contig_89127 (89127)	0.42	0.37	1.0	0.47	0.24	0.25	0.54	0.35	0.21	0.34	0.25
Transcript_contig_89290 (89290)	0.31	0.45	1.0	0.44	0.07	0.12	0.24	0.55	0.01	0.18	0.12
Transcript_contig_89443 (89443)	0.46	0.44	1.0	0.57	0.24	0.41	0.5	0.31	0.61	0.68	0.49
Transcript_contig_9250 (9250)	0.54	0.76	0.97	0.31	0.07	0.21	0.6	1.0	0.0	0.17	0.12
Transcript_contig_939 (939)	0.69	0.9	1.0	0.69	0.27	0.66	0.81	0.59	0.21	0.32	0.14

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)