Heatmap: Cluster_228 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1335 (1335)	0.81	1.0	0.14	0.19	0.25	0.13	0.27	0.67	0.09	0.42	0.25
Transcript_contig_1930 (1930)	0.62	1.0	0.13	0.19	0.18	0.16	0.19	0.97	0.04	0.15	0.1
Transcript_contig_2157 (2157)	0.81	1.0	0.09	0.1	0.05	0.12	0.32	0.77	0.54	0.18	0.17
Transcript_contig_5283 (5283)	0.71	1.0	0.08	0.04	0.05	0.11	0.24	1.0	0.63	0.08	0.03
Transcript_contig_53891 (53891)	0.76	1.0	0.19	0.21	0.23	0.14	0.3	0.79	0.05	0.23	0.13
Transcript_contig_54011 (54011)	0.8	1.0	0.2	0.19	0.27	0.2	0.27	0.82	0.34	0.3	0.22
Transcript_contig_54082 (54082)	0.86	1.0	0.19	0.22	0.18	0.23	0.3	0.67	0.53	0.45	0.28
Transcript_contig_54161 (54161)	0.74	1.0	0.13	0.1	0.06	0.19	0.16	0.7	0.23	0.31	0.15
Transcript_contig_54267 (54267)	0.8	1.0	0.11	0.2	0.23	0.22	0.23	0.71	0.09	0.36	0.26
Transcript_contig_54274 (54274)	0.81	1.0	0.06	0.19	0.19	0.19	0.3	0.68	0.05	0.21	0.1
Transcript_contig_54347 (54347)	0.8	1.0	0.2	0.2	0.2	0.21	0.38	0.69	0.11	0.26	0.19
Transcript_contig_54417 (54417)	0.89	1.0	0.12	0.24	0.31	0.22	0.37	0.74	0.34	0.39	0.29
Transcript_contig_54880 (54880)	0.7	0.99	0.15	0.15	0.12	0.12	0.22	1.0	0.07	0.12	0.09
Transcript_contig_54999 (54999)	0.77	1.0	0.19	0.14	0.11	0.17	0.15	0.77	0.24	0.35	0.23
Transcript_contig_55140 (55140)	0.87	1.0	0.07	0.15	0.18	0.2	0.23	0.49	0.49	0.22	0.16
Transcript_contig_55161 (55161)	0.84	1.0	0.1	0.18	0.26	0.18	0.2	0.7	0.14	0.36	0.22
Transcript_contig_55382 (55382)	0.81	1.0	0.18	0.16	0.17	0.11	0.3	0.76	0.35	0.11	0.09
Transcript_contig_55522 (55522)	0.82	1.0	0.12	0.18	0.18	0.17	0.26	0.66	0.24	0.33	0.18
Transcript_contig_55913 (55913)	0.77	1.0	0.22	0.24	0.32	0.22	0.34	0.92	0.13	0.28	0.18
Transcript_contig_56103 (56103)	0.82	1.0	0.25	0.16	0.13	0.12	0.2	0.77	0.22	0.31	0.21
Transcript_contig_56394 (56394)	0.81	1.0	0.31	0.32	0.4	0.18	0.4	0.64	0.25	0.26	0.22
Transcript_contig_56418 (56418)	0.77	1.0	0.13	0.14	0.14	0.09	0.18	0.77	0.09	0.1	0.07
Transcript_contig_56585 (56585)	0.81	1.0	0.24	0.25	0.27	0.2	0.45	0.78	0.12	0.17	0.13
Transcript_contig_56714 (56714)	0.9	1.0	0.26	0.25	0.16	0.19	0.26	0.53	0.63	0.41	0.31
Transcript_contig_57008 (57008)	0.83	1.0	0.25	0.28	0.36	0.18	0.35	0.85	0.49	0.29	0.19
Transcript_contig_57196 (57196)	0.77	1.0	0.27	0.24	0.25	0.12	0.32	0.83	0.24	0.13	0.13
Transcript_contig_57269 (57269)	0.84	1.0	0.23	0.19	0.23	0.08	0.22	0.59	0.14	0.34	0.22
Transcript_contig_57420 (57420)	0.76	1.0	0.33	0.22	0.16	0.15	0.21	0.6	0.53	0.38	0.24
Transcript_contig_57478 (57478)	0.73	1.0	0.23	0.27	0.34	0.13	0.16	0.76	0.07	0.34	0.17
Transcript_contig_57709 (57709)	0.73	1.0	0.09	0.03	0.01	0.04	0.09	0.55	0.06	0.23	0.18
Transcript_contig_57763 (57763)	0.69	1.0	0.25	0.17	0.14	0.17	0.27	0.63	0.37	0.17	0.12
Transcript_contig_5791 (5791)	0.81	1.0	0.33	0.15	0.13	0.2	0.28	0.74	0.35	0.28	0.2
Transcript_contig_58144 (58144)	0.7	1.0	0.12	0.18	0.19	0.13	0.2	0.89	0.05	0.13	0.08
Transcript_contig_58528 (58528)	0.66	1.0	0.16	0.1	0.16	0.12	0.27	0.63	0.1	0.11	0.12
Transcript_contig_58918 (58918)	0.79	1.0	0.15	0.16	0.19	0.13	0.17	0.75	0.34	0.21	0.12
Transcript_contig_58925 (58925)	0.86	1.0	0.25	0.34	0.22	0.27	0.39	0.6	0.24	0.45	0.27
Transcript_contig_5903 (5903)	0.97	1.0	0.1	0.07	0.02	0.12	0.07	0.84	0.32	0.29	0.29
Transcript_contig_59137 (59137)	0.8	1.0	0.09	0.1	0.11	0.06	0.12	0.64	0.04	0.14	0.1
Transcript_contig_59297 (59297)	0.77	1.0	0.19	0.19	0.28	0.19	0.21	1.0	0.71	0.3	0.2
Transcript_contig_59493 (59493)	0.66	0.93	0.24	0.19	0.24	0.08	0.21	1.0	0.07	0.15	0.1
Transcript_contig_59687 (59687)	0.65	1.0	0.19	0.24	0.3	0.19	0.25	0.71	0.0	0.22	0.21
Transcript_contig_59903 (59903)	0.85	1.0	0.35	0.27	0.37	0.19	0.37	0.91	0.27	0.18	0.17
Transcript_contig_59992 (59992)	0.82	1.0	0.4	0.18	0.02	0.17	0.24	0.72	0.47	0.32	0.22
Transcript_contig_60030 (60030)	0.79	1.0	0.12	0.12	0.12	0.06	0.15	0.58	0.42	0.1	0.07
Transcript_contig_60422 (60422)	0.81	1.0	0.15	0.12	0.14	0.13	0.12	0.63	0.01	0.22	0.16
Transcript_contig_6086 (6086)	0.79	1.0	0.12	0.14	0.1	0.24	0.3	0.62	0.11	0.21	0.23
Transcript_contig_61769 (61769)	0.82	0.99	0.3	0.24	0.21	0.2	0.26	1.0	0.33	0.22	0.17
Transcript_contig_62492 (62492)	0.68	1.0	0.22	0.14	0.1	0.14	0.19	1.0	0.74	0.0	0.01
Transcript_contig_62760 (62760)	0.82	1.0	0.19	0.19	0.15	0.2	0.16	0.64	0.43	0.3	0.25
Transcript_contig_6428 (6428)	0.79	0.97	0.07	0.12	0.23	0.12	0.04	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_6632 (6632)	0.82	1.0	0.31	0.19	0.02	0.12	0.22	0.56	0.11	0.05	0.09
Transcript_contig_66738 (66738)	0.83	1.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.97	0.44	0.0	0.0
Transcript_contig_67633 (67633)	0.72	1.0	0.14	0.13	0.05	0.11	0.08	0.79	0.31	0.18	0.08
Transcript_contig_72237 (72237)	0.65	1.0	0.25	0.23	0.15	0.19	0.25	0.77	0.16	0.17	0.13
Transcript_contig_72929 (72929)	0.61	1.0	0.19	0.16	0.17	0.16	0.15	0.97	0.07	0.03	0.06
Transcript_contig_7792 (7792)	0.95	1.0	0.27	0.19	0.24	0.2	0.41	0.72	0.18	0.38	0.29
Transcript_contig_783 (783)	0.78	1.0	0.23	0.19	0.25	0.22	0.32	0.78	0.2	0.42	0.2
Transcript_contig_78496 (78496)	0.77	1.0	0.17	0.18	0.21	0.12	0.23	0.82	0.13	0.15	0.09
Transcript_contig_78536 (78536)	0.81	1.0	0.12	0.3	0.43	0.16	0.22	0.72	0.05	0.29	0.22
Transcript_contig_78630 (78630)	0.72	1.0	0.14	0.16	0.15	0.18	0.36	0.69	0.02	0.12	0.15
Transcript_contig_78669 (78669)	0.76	1.0	0.23	0.16	0.03	0.18	0.29	0.78	0.62	0.13	0.12
Transcript_contig_79241 (79241)	0.82	1.0	0.23	0.2	0.18	0.19	0.34	0.92	0.1	0.43	0.32
Transcript_contig_79329 (79329)	0.74	1.0	0.23	0.22	0.21	0.13	0.26	0.49	0.27	0.11	0.12
Transcript_contig_79880 (79880)	0.97	1.0	0.07	0.13	0.1	0.18	0.12	0.56	0.42	0.42	0.2
Transcript_contig_81936 (81936)	0.72	1.0	0.14	0.18	0.22	0.17	0.21	0.81	0.13	0.24	0.16
Transcript_contig_82005 (82005)	0.87	1.0	0.16	0.15	0.24	0.16	0.16	0.94	0.78	0.26	0.22
Transcript_contig_82032 (82032)	0.7	1.0	0.24	0.27	0.32	0.19	0.34	0.68	0.11	0.31	0.15
Transcript_contig_89516 (89516)	0.75	1.0	0.11	0.19	0.19	0.09	0.23	0.98	0.12	0.16	0.1
Transcript_contig_89722 (89722)	0.74	1.0	0.08	0.19	0.13	0.23	0.29	0.63	0.16	0.3	0.24
Transcript_contig_89741 (89741)	0.77	1.0	0.21	0.12	0.14	0.14	0.2	0.85	0.16	0.21	0.13
Transcript_contig_89924 (89924)	0.79	1.0	0.16	0.22	0.3	0.17	0.34	0.75	0.44	0.23	0.16
Transcript_contig_90146 (90146)	0.82	1.0	0.13	0.19	0.18	0.19	0.15	0.98	0.28	0.25	0.27
Transcript_contig_90780 (90780)	0.84	1.0	0.08	0.22	0.17	0.19	0.19	0.9	0.6	0.18	0.14

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)