Heatmap: Cluster_134 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1171 (1171)	0.22	0.69	0.07	0.04	0.14	0.06	0.16	1.0	0.0	0.13	0.05
Transcript_contig_14186 (14186)	0.0	0.32	0.0	0.09	0.0	0.09	0.0	1.0	0.0	0.37	0.18
Transcript_contig_14252 (14252)	0.1	0.1	0.0	0.23	0.29	0.27	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_14514 (14514)	0.27	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	1.0	0.0	0.09	0.04
Transcript_contig_151 (151)	0.37	0.56	0.17	0.0	0.0	0.1	0.49	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_1530 (1530)	0.12	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_19009 (19009)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_20254 (20254)	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_21268 (21268)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_23382 (23382)	0.16	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.69	0.27
Transcript_contig_345 (345)	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.28	0.27
Transcript_contig_34802 (34802)	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0	0.46	0.0
Transcript_contig_4583 (4583)	0.41	0.36	0.0	0.0	0.15	0.07	0.45	1.0	0.0	0.35	0.0
Transcript_contig_4830 (4830)	0.23	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5056 (5056)	0.25	0.39	0.0	0.15	0.0	0.16	0.06	1.0	0.0	0.44	0.11
Transcript_contig_5293 (5293)	0.33	0.3	0.0	0.09	0.06	0.15	0.07	1.0	0.0	0.06	0.04
Transcript_contig_54422 (54422)	0.26	0.78	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	1.0	0.01	0.11	0.06
Transcript_contig_5521 (5521)	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.28	0.0
Transcript_contig_55814 (55814)	0.15	0.45	0.0	0.03	0.04	0.07	0.12	1.0	0.01	0.05	0.03
Transcript_contig_56994 (56994)	0.21	0.52	0.01	0.01	0.01	0.12	0.14	1.0	0.21	0.02	0.03
Transcript_contig_58845 (58845)	0.15	0.46	0.1	0.11	0.15	0.07	0.19	1.0	0.05	0.06	0.04
Transcript_contig_59428 (59428)	0.04	0.23	0.1	0.11	0.12	0.0	0.06	1.0	0.0	0.22	0.1
Transcript_contig_59498 (59498)	0.14	0.26	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	1.0	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_60250 (60250)	0.13	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.34	0.0	0.08
Transcript_contig_60582 (60582)	0.2	0.3	0.2	0.08	0.19	0.03	0.16	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_60947 (60947)	0.13	0.12	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.07	0.0
Transcript_contig_61057 (61057)	0.09	0.41	0.14	0.08	0.03	0.22	0.38	0.88	0.0	1.0	0.51
Transcript_contig_61554 (61554)	0.16	0.15	0.0	0.46	0.0	0.0	0.18	1.0	0.0	0.14	0.13
Transcript_contig_61726 (61726)	0.27	0.61	0.0	0.0	0.0	0.32	0.1	1.0	0.0	0.0	0.48
Transcript_contig_61778 (61778)	0.12	0.41	0.1	0.11	0.11	0.06	0.22	1.0	0.02	0.03	0.02
Transcript_contig_61782 (61782)	0.04	0.52	0.0	0.0	0.0	0.02	0.0	1.0	0.0	0.01	0.01
Transcript_contig_61860 (61860)	0.12	0.41	0.0	0.01	0.01	0.03	0.04	1.0	0.03	0.07	0.04
Transcript_contig_62442 (62442)	0.21	0.39	0.05	0.22	0.0	0.22	0.11	1.0	0.0	0.13	0.09
Transcript_contig_62772 (62772)	0.2	0.27	0.06	0.11	0.07	0.18	0.06	1.0	0.0	0.16	0.01
Transcript_contig_63431 (63431)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.67	0.28	0.0
Transcript_contig_63791 (63791)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_63972 (63972)	0.18	0.32	0.0	0.0	0.0	0.12	0.23	1.0	0.0	0.07	0.0
Transcript_contig_642 (642)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	1.0	0.0	0.28	0.0
Transcript_contig_64217 (64217)	0.31	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	1.0	0.31	0.2
Transcript_contig_65633 (65633)	0.29	1.0	0.0	0.11	0.0	0.4	0.22	0.74	0.17	0.75	0.59
Transcript_contig_66838 (66838)	0.16	0.78	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.14	0.4
Transcript_contig_67774 (67774)	0.28	0.41	0.05	0.18	0.12	0.05	0.31	1.0	0.0	0.25	0.03
Transcript_contig_68106 (68106)	0.01	0.37	0.05	0.04	0.02	0.02	0.01	1.0	0.1	0.03	0.01
Transcript_contig_68258 (68258)	0.15	0.21	0.0	0.07	0.0	0.15	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68339 (68339)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68539 (68539)	0.25	0.5	0.35	0.0	0.0	0.0	0.28	1.0	0.0	0.19	0.0
Transcript_contig_68822 (68822)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_69036 (69036)	0.08	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.07	0.07
Transcript_contig_69732 (69732)	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_69834 (69834)	0.14	0.51	0.02	0.04	0.06	0.05	0.07	1.0	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_70138 (70138)	0.19	0.56	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	1.0	0.01	0.09	0.06
Transcript_contig_70771 (70771)	0.16	0.49	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	1.0	0.01	0.02	0.01
Transcript_contig_70956 (70956)	0.17	0.37	0.23	0.13	0.0	0.09	0.03	1.0	0.03	0.14	0.01
Transcript_contig_71573 (71573)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_71699 (71699)	0.16	0.49	0.0	0.04	0.0	0.04	0.05	1.0	0.0	0.04	0.0
Transcript_contig_72959 (72959)	0.19	0.53	0.07	0.02	0.0	0.1	0.02	1.0	0.0	0.0	0.09
Transcript_contig_73424 (73424)	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	1.0	0.0	0.51	0.0
Transcript_contig_75699 (75699)	0.0	0.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.28	0.27
Transcript_contig_765 (765)	0.27	0.69	0.09	0.01	0.09	0.08	0.03	1.0	0.09	0.23	0.11
Transcript_contig_79170 (79170)	0.2	0.5	0.15	0.11	0.1	0.29	0.24	1.0	0.25	0.12	0.11
Transcript_contig_79176 (79176)	0.03	0.42	0.02	0.0	0.0	0.14	0.01	1.0	0.0	0.01	0.02
Transcript_contig_7933 (7933)	0.45	0.55	0.0	0.2	0.47	0.29	0.06	1.0	0.13	0.06	0.19
Transcript_contig_79826 (79826)	0.04	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_79877 (79877)	0.24	0.57	0.02	0.02	0.0	0.05	0.15	1.0	0.01	0.01	0.01
Transcript_contig_79920 (79920)	0.05	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.01	0.0
Transcript_contig_79963 (79963)	0.1	0.57	0.0	0.0	0.0	0.21	0.25	1.0	0.0	0.16	0.18
Transcript_contig_79986 (79986)	0.09	0.41	0.0	0.0	0.0	0.11	0.07	1.0	0.02	0.12	0.11
Transcript_contig_80074 (80074)	0.06	0.52	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.02	0.01
Transcript_contig_80609 (80609)	0.17	0.45	0.11	0.06	0.19	0.15	0.06	1.0	0.04	0.0	0.01
Transcript_contig_80657 (80657)	0.19	0.66	0.0	0.0	0.0	0.12	0.2	1.0	0.0	0.52	0.48
Transcript_contig_81549 (81549)	0.02	0.63	0.0	0.0	0.0	0.04	0.08	1.0	0.0	0.02	0.01
Transcript_contig_82603 (82603)	0.11	0.19	0.0	0.02	0.0	0.04	0.06	1.0	0.39	0.0	0.0
Transcript_contig_83927 (83927)	0.24	0.86	0.0	0.0	0.0	0.13	0.04	1.0	0.08	0.07	0.07
Transcript_contig_85062 (85062)	0.14	0.27	0.0	0.07	0.0	0.07	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_85315 (85315)	0.34	0.35	0.05	0.0	0.0	0.08	0.24	0.42	1.0	0.08	0.11
Transcript_contig_90174 (90174)	0.11	0.37	0.06	0.05	0.04	0.04	0.15	1.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_90461 (90461)	0.2	0.54	0.0	0.0	0.07	0.57	0.08	1.0	0.0	0.34	0.32
Transcript_contig_90638 (90638)	0.01	0.37	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	1.0	0.01	0.03	0.02
Transcript_contig_90757 (90757)	0.1	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_91027 (91027)	0.26	0.7	0.0	0.0	0.08	0.05	0.17	1.0	0.0	0.25	0.13
Transcript_contig_9292 (9292)	0.0	0.09	0.12	0.09	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9422 (9422)	0.13	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.2	0.04
Transcript_contig_9922 (9922)	0.16	0.18	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)