Heatmap: Cluster_64 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
CCAP211/11P,High light
CCAP211/11P,Low light
CPCC90,BBM,72h,Autotrophy
CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy
CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy
CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy
CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy
NJ-7,20C
NJ-7,4C
UTEX259,20C
UTEX259,4C
1.0 0.78 0.09 0.32 0.57 0.1 0.53 0.55 0.0 0.03 0.13
0.75 0.96 0.13 0.46 0.79 0.18 1.0 0.64 0.0 0.03 0.04
0.69 1.0 0.62 0.62 0.53 0.12 0.38 0.41 0.0 0.08 0.09
0.83 1.0 0.96 0.21 0.29 0.09 0.29 0.89 0.0 0.04 0.0
0.62 0.91 0.56 0.62 0.48 0.24 0.96 1.0 0.06 0.0 0.03
0.92 0.93 0.69 0.55 0.54 0.52 1.0 0.98 0.07 0.26 0.17
0.72 0.82 0.54 0.42 0.12 0.4 1.0 0.81 0.05 0.08 0.08
0.82 0.99 0.73 0.65 0.47 0.3 0.82 1.0 0.01 0.01 0.02
1.0 0.9 0.98 0.37 0.23 0.1 0.49 0.31 0.02 0.0 0.0
0.61 0.85 0.89 0.63 0.56 0.49 1.0 0.8 0.07 0.06 0.16
0.8 0.69 0.81 0.15 0.15 0.04 0.35 1.0 0.0 0.03 0.07
0.88 0.84 0.62 0.34 0.96 0.34 1.0 0.77 0.0 0.02 0.1
0.75 1.0 0.66 0.33 0.31 0.59 0.72 0.95 0.18 0.22 0.19
0.28 0.37 1.0 0.6 0.18 0.35 0.8 0.46 0.02 0.01 0.01
0.74 1.0 0.42 0.59 0.85 0.4 0.93 0.9 0.0 0.01 0.08
0.61 0.81 0.88 0.87 0.4 0.35 0.89 1.0 0.02 0.0 0.05
0.79 1.0 0.73 0.62 0.17 0.37 0.79 0.76 0.13 0.12 0.15
0.69 0.83 0.52 0.49 0.77 0.31 0.9 1.0 0.52 0.0 0.06
0.85 1.0 0.56 0.68 0.46 0.31 0.68 0.83 0.05 0.24 0.2
0.78 0.9 0.78 0.59 0.42 0.39 0.76 1.0 0.0 0.17 0.18
0.88 1.0 0.86 0.7 0.42 0.41 0.87 0.67 0.23 0.0 0.09
0.83 0.98 0.75 0.57 0.48 0.33 1.0 0.85 0.12 0.12 0.14
0.54 0.55 1.0 0.55 0.66 0.32 0.99 0.58 0.15 0.11 0.1
0.72 1.0 0.45 0.3 0.17 0.62 0.76 0.98 0.13 0.26 0.19
0.63 0.76 0.8 0.55 0.59 0.31 1.0 0.8 0.02 0.02 0.04
0.73 0.89 0.61 0.54 0.31 0.35 1.0 0.7 0.0 0.0 0.08
0.99 0.75 1.0 0.32 0.21 0.11 0.57 0.92 0.0 0.2 0.23
0.85 1.0 0.15 0.11 0.8 0.13 0.33 0.8 0.0 0.0 0.0
0.56 0.63 1.0 0.57 0.43 0.34 0.97 0.83 0.0 0.0 0.04
0.81 0.67 1.0 0.21 0.0 0.06 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.76 0.29 0.48 0.35 0.0 0.31 0.59 0.1 0.0 0.0
0.79 0.65 0.27 0.23 1.0 0.16 0.72 0.82 0.0 0.0 0.0
0.82 0.79 0.82 0.51 0.54 0.49 1.0 0.91 0.0 0.03 0.0
1.0 0.97 0.78 0.37 0.11 0.17 0.61 0.24 0.16 0.0 0.02
0.75 0.8 1.0 0.18 0.39 0.49 0.84 0.77 0.0 0.0 0.0
0.78 0.99 1.0 0.6 0.39 0.26 0.94 0.82 0.11 0.11 0.03
0.85 0.71 0.92 0.4 0.74 0.29 1.0 0.71 0.0 0.11 0.24
0.49 0.79 0.57 0.3 0.15 0.09 0.68 1.0 0.0 0.0 0.01
0.6 0.7 0.1 0.4 0.41 0.18 0.73 1.0 0.0 0.03 0.01
0.6 0.85 0.85 0.62 0.46 0.43 1.0 0.7 0.0 0.0 0.1
0.72 1.0 0.33 0.89 0.73 0.22 0.7 0.92 0.28 0.05 0.09
0.64 0.77 0.76 0.49 0.24 0.37 1.0 0.83 0.02 0.04 0.06
0.78 1.0 0.68 0.34 0.28 0.57 0.84 0.98 0.32 0.18 0.22
0.8 0.93 1.0 0.86 0.71 0.33 1.0 0.81 0.0 0.14 0.04
0.72 0.81 0.61 0.83 0.7 0.18 1.0 0.62 0.0 0.0 0.06
0.96 0.57 1.0 0.21 0.21 0.31 0.96 0.27 0.0 0.0 0.0
0.77 0.7 0.55 0.64 0.28 0.46 0.83 1.0 0.06 0.07 0.14
0.88 0.94 0.47 0.56 0.76 0.19 0.93 1.0 0.0 0.19 0.17
0.65 0.63 0.94 0.37 0.73 0.48 1.0 0.15 0.0 0.04 0.05
0.38 0.6 0.93 0.41 0.54 0.42 1.0 0.6 0.29 0.13 0.15
0.58 1.0 0.33 0.53 0.71 0.05 0.66 0.5 0.0 0.0 0.0
0.77 0.85 0.7 0.51 0.45 0.33 0.95 1.0 0.0 0.0 0.05
0.53 0.51 0.93 0.27 0.45 0.36 1.0 0.67 0.0 0.0 0.0
0.76 0.87 0.51 0.41 0.3 0.4 1.0 0.71 0.09 0.23 0.18
0.87 0.95 0.48 0.74 0.27 0.43 1.0 0.9 0.39 0.22 0.24
0.77 0.85 0.41 0.5 0.64 0.5 1.0 0.84 0.21 0.03 0.06
0.89 0.98 0.81 0.63 0.32 0.48 1.0 0.57 0.14 0.44 0.31
0.79 1.0 0.85 0.62 0.43 0.29 0.76 0.74 0.01 0.04 0.04
0.68 0.91 0.91 0.67 0.63 0.4 1.0 0.53 0.07 0.0 0.04
0.8 0.92 0.63 0.63 0.4 0.36 0.86 1.0 0.0 0.0 0.08
0.57 0.78 1.0 0.54 0.21 0.4 0.84 0.81 0.05 0.01 0.02
0.95 1.0 0.74 0.7 0.55 0.42 0.88 0.48 0.14 0.0 0.04
0.81 0.88 0.75 0.76 0.49 0.44 1.0 0.57 0.07 0.12 0.2
0.69 0.85 0.59 0.45 0.37 0.3 0.68 1.0 0.0 0.0 0.1
0.59 0.81 0.7 0.55 0.37 0.45 0.86 1.0 0.0 0.0 0.17
0.84 0.95 1.0 0.31 0.35 0.38 0.7 0.48 0.0 0.0 0.0
0.67 0.61 0.39 0.37 0.56 0.29 0.51 1.0 0.0 0.21 0.09
1.0 0.99 0.66 0.5 0.31 0.35 0.96 0.52 0.05 0.23 0.14
0.87 1.0 0.75 0.71 0.42 0.42 0.93 0.93 0.14 0.19 0.19
0.59 1.0 0.41 0.78 0.58 0.22 0.41 0.59 0.0 0.0 0.08
0.83 0.93 0.94 0.6 0.25 0.46 0.92 1.0 0.0 0.0 0.06
0.79 1.0 0.83 0.31 0.34 0.48 0.91 1.0 0.32 0.25 0.23
0.71 0.93 0.97 0.6 0.35 0.41 0.99 1.0 0.01 0.03 0.11
0.72 0.85 0.8 0.59 0.3 0.29 0.82 1.0 0.0 0.01 0.03
0.47 0.47 1.0 0.51 0.68 0.25 0.76 0.29 0.0 0.01 0.03
0.69 0.82 0.79 0.72 0.49 0.53 1.0 0.57 0.1 0.14 0.24
0.82 0.89 0.75 0.58 0.75 0.36 1.0 0.79 0.14 0.13 0.12
0.85 1.0 0.68 0.81 0.63 0.34 0.69 0.81 0.36 0.28 0.22
0.61 0.78 1.0 0.49 0.47 0.44 0.88 0.73 0.02 0.07 0.06
0.97 0.88 1.0 0.52 0.05 0.53 0.99 0.66 0.03 0.09 0.06
0.71 0.62 0.74 0.44 0.15 0.64 1.0 0.24 0.0 0.0 0.08
0.64 0.76 1.0 0.31 0.43 0.42 0.69 0.87 0.0 0.11 0.15
1.0 0.87 0.86 0.59 0.44 0.1 0.62 0.7 0.0 0.0 0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)