Heatmap: Cluster_63 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_286 (286)	0.26	0.17	0.06	0.09	0.11	0.03	0.08	0.2	0.13	1.0	0.71
Transcript_contig_2917 (2917)	0.16	0.0	0.0	0.14	0.1	0.0	0.37	0.18	0.0	1.0	0.96
Transcript_contig_3610 (3610)	0.39	0.0	0.05	0.07	0.0	0.03	0.03	0.0	0.07	1.0	0.98
Transcript_contig_39092 (39092)	0.23	0.1	0.0	0.0	0.0	0.6	0.16	0.02	0.27	1.0	0.68
Transcript_contig_441 (441)	0.02	0.01	0.41	0.75	1.0	0.57	0.1	0.15	0.0	0.78	0.63
Transcript_contig_4462 (4462)	0.15	0.07	0.35	0.78	1.0	0.7	0.49	0.02	0.03	0.83	0.51
Transcript_contig_458 (458)	0.03	0.02	0.29	0.62	0.75	0.4	0.13	0.01	0.01	1.0	0.55
Transcript_contig_4945 (4945)	0.07	0.0	0.2	1.0	0.91	0.6	0.87	0.0	0.0	0.93	0.55
Transcript_contig_54017 (54017)	0.13	0.06	0.33	0.75	0.83	0.57	0.45	0.04	0.19	1.0	0.63
Transcript_contig_54086 (54086)	0.15	0.0	0.09	0.14	0.21	0.11	0.1	0.0	0.0	1.0	0.6
Transcript_contig_54114 (54114)	0.39	0.25	0.43	0.58	0.66	0.44	0.3	0.11	0.57	1.0	0.73
Transcript_contig_54483 (54483)	0.41	0.33	0.34	0.79	0.9	0.55	0.52	0.34	0.74	1.0	0.71
Transcript_contig_54597 (54597)	0.26	0.15	0.54	0.73	1.0	0.45	0.32	0.09	0.46	0.87	0.69
Transcript_contig_55051 (55051)	0.33	0.17	0.12	0.48	0.58	0.44	0.34	0.16	0.53	1.0	0.72
Transcript_contig_55061 (55061)	0.13	0.06	0.24	0.53	0.77	0.48	0.42	0.04	0.19	1.0	0.55
Transcript_contig_55369 (55369)	0.41	0.15	0.4	0.44	0.64	0.24	0.58	0.1	0.2	1.0	0.66
Transcript_contig_55779 (55779)	0.25	0.3	0.07	0.64	1.0	0.42	0.19	0.18	0.16	0.94	0.62
Transcript_contig_56305 (56305)	0.3	0.25	0.09	0.68	1.0	0.33	0.13	0.24	0.17	0.9	0.7
Transcript_contig_56588 (56588)	0.39	0.34	0.18	0.66	0.9	0.4	0.6	0.35	0.16	1.0	0.73
Transcript_contig_56665 (56665)	0.34	0.1	0.16	0.25	0.31	0.27	0.28	0.07	0.06	1.0	0.59
Transcript_contig_57309 (57309)	0.25	0.29	0.23	0.71	1.0	0.64	0.38	0.31	0.19	0.76	0.56
Transcript_contig_57464 (57464)	0.14	0.17	0.3	0.67	1.0	0.53	0.6	0.11	0.01	0.92	0.48
Transcript_contig_57569 (57569)	0.17	0.13	0.32	0.7	1.0	0.64	0.43	0.05	0.03	0.82	0.46
Transcript_contig_57861 (57861)	0.07	0.04	0.08	0.63	0.84	0.63	0.1	0.03	0.17	1.0	0.65
Transcript_contig_57872 (57872)	0.27	0.24	0.2	0.23	0.35	0.47	0.16	0.24	0.21	1.0	0.65
Transcript_contig_57958 (57958)	0.03	0.03	0.08	0.46	1.0	0.81	0.09	0.01	0.05	0.67	0.48
Transcript_contig_57987 (57987)	0.15	0.01	0.08	0.26	0.48	0.21	0.1	0.01	0.02	1.0	0.6
Transcript_contig_58718 (58718)	0.38	0.18	0.24	0.21	0.19	0.31	0.34	0.11	0.22	1.0	0.65
Transcript_contig_59170 (59170)	0.29	0.15	0.04	0.03	0.0	0.04	0.04	0.1	0.08	1.0	0.57
Transcript_contig_59979 (59979)	0.62	0.26	0.11	0.43	0.13	0.13	0.3	0.0	1.0	0.98	0.88
Transcript_contig_60355 (60355)	0.25	0.13	0.43	0.54	0.68	0.48	0.31	0.12	1.0	0.66	0.49
Transcript_contig_60374 (60374)	0.37	0.15	0.41	0.26	0.29	0.63	0.38	0.04	0.11	1.0	0.58
Transcript_contig_61251 (61251)	0.19	0.0	0.58	0.53	0.54	0.3	0.48	0.0	0.21	1.0	0.67
Transcript_contig_61507 (61507)	0.19	0.02	0.18	0.35	0.4	0.23	0.11	0.02	0.34	1.0	0.76
Transcript_contig_61536 (61536)	0.1	0.06	0.05	0.56	1.0	0.82	0.17	0.05	0.03	0.76	0.5
Transcript_contig_62647 (62647)	0.3	0.09	0.45	1.0	0.84	0.77	0.61	0.11	0.02	0.84	0.83
Transcript_contig_62785 (62785)	0.17	0.0	0.12	0.17	0.2	0.37	0.2	0.0	0.46	1.0	0.48
Transcript_contig_63219 (63219)	0.17	0.09	0.12	0.48	0.71	0.36	0.24	0.06	0.26	1.0	0.61
Transcript_contig_6393 (6393)	0.14	0.1	0.14	0.75	1.0	0.54	0.37	0.0	0.01	0.92	0.43
Transcript_contig_66171 (66171)	0.28	0.17	0.0	0.06	0.05	0.27	0.03	0.09	0.12	1.0	0.38
Transcript_contig_67526 (67526)	0.16	0.1	0.13	0.65	1.0	0.63	0.27	0.06	0.14	0.87	0.57
Transcript_contig_67527 (67527)	0.32	0.24	0.33	0.62	0.93	0.45	0.32	0.2	0.27	1.0	0.67
Transcript_contig_67536 (67536)	0.31	0.24	0.39	0.87	1.0	0.66	0.72	0.21	0.05	0.95	0.63
Transcript_contig_68231 (68231)	0.07	0.04	0.0	0.0	0.16	0.14	0.04	0.0	0.08	1.0	0.63
Transcript_contig_68358 (68358)	0.12	0.01	0.0	0.06	0.0	0.23	0.01	0.03	0.6	1.0	0.43
Transcript_contig_69517 (69517)	0.24	0.02	0.11	0.14	0.03	0.19	0.12	0.0	0.0	1.0	0.83
Transcript_contig_70184 (70184)	0.23	0.24	0.09	0.15	0.09	0.21	0.29	0.05	0.0	1.0	0.4
Transcript_contig_70588 (70588)	0.04	0.02	0.23	0.62	0.73	0.52	0.18	0.0	0.0	1.0	0.67
Transcript_contig_757 (757)	0.24	0.13	0.32	0.52	0.68	0.54	0.56	0.07	0.56	1.0	0.68
Transcript_contig_78577 (78577)	0.2	0.12	0.28	0.55	1.0	0.41	0.33	0.11	0.58	0.89	0.64
Transcript_contig_78595 (78595)	0.39	0.49	0.15	0.87	1.0	0.64	0.37	0.53	0.68	0.9	0.71
Transcript_contig_78747 (78747)	0.27	0.26	0.36	0.74	1.0	0.61	0.45	0.08	0.01	0.92	0.5
Transcript_contig_78793 (78793)	0.36	0.24	0.32	0.58	0.97	0.38	0.27	0.2	0.32	1.0	0.76
Transcript_contig_79038 (79038)	0.37	0.2	0.19	0.27	0.43	0.54	0.26	0.1	0.3	1.0	0.73
Transcript_contig_79130 (79130)	0.23	0.07	0.19	0.14	0.0	0.1	0.1	0.15	0.06	1.0	0.87
Transcript_contig_79384 (79384)	0.12	0.0	0.17	0.13	0.12	0.2	0.14	0.0	0.13	1.0	0.57
Transcript_contig_79790 (79790)	0.24	0.08	0.04	0.07	0.04	0.09	0.02	0.04	0.04	1.0	0.69
Transcript_contig_79868 (79868)	0.2	0.17	0.05	0.15	0.12	0.24	0.2	0.11	0.27	1.0	0.61
Transcript_contig_79869 (79869)	0.21	0.11	0.18	0.25	0.36	0.45	0.27	0.17	0.17	1.0	0.61
Transcript_contig_80377 (80377)	0.26	0.01	0.3	0.35	0.36	0.08	0.29	0.01	0.08	1.0	0.73
Transcript_contig_82317 (82317)	0.23	0.08	0.08	0.2	0.25	0.31	0.17	0.03	0.07	1.0	0.57
Transcript_contig_82372 (82372)	0.26	0.04	0.22	0.3	0.36	0.26	0.15	0.03	0.36	1.0	0.72
Transcript_contig_82504 (82504)	0.21	0.09	0.24	0.48	0.77	0.41	0.18	0.08	1.0	0.99	0.67
Transcript_contig_82974 (82974)	0.26	0.22	0.52	0.87	0.86	0.69	0.57	0.16	0.07	1.0	0.65
Transcript_contig_83617 (83617)	0.07	0.02	0.0	0.0	0.0	0.29	0.11	0.02	0.4	1.0	0.43
Transcript_contig_84532 (84532)	0.11	0.04	0.0	0.03	0.09	0.06	0.05	0.0	0.04	1.0	0.75
Transcript_contig_8698 (8698)	0.19	0.02	0.16	0.43	0.56	0.46	0.25	0.01	0.33	1.0	0.56
Transcript_contig_89434 (89434)	0.25	0.08	0.51	0.54	0.7	0.4	0.3	0.06	0.42	1.0	0.78
Transcript_contig_89618 (89618)	0.18	0.18	0.1	0.47	0.68	0.42	0.25	0.15	0.17	1.0	0.64
Transcript_contig_89781 (89781)	0.25	0.12	0.28	0.61	0.69	0.31	0.14	0.05	0.17	1.0	0.85
Transcript_contig_89902 (89902)	0.19	0.11	0.45	0.58	1.0	0.28	0.23	0.1	0.22	0.89	0.63
Transcript_contig_90285 (90285)	0.26	0.18	0.4	0.67	0.86	0.6	0.4	0.17	0.03	1.0	0.49
Transcript_contig_90307 (90307)	0.48	0.18	0.49	0.35	0.23	0.73	0.44	0.1	0.18	1.0	0.8
Transcript_contig_91402 (91402)	0.28	0.27	0.06	0.07	0.08	0.08	0.05	0.35	0.45	1.0	0.64
Transcript_contig_9745 (9745)	0.19	0.05	0.22	0.17	0.04	0.06	0.22	0.0	0.0	1.0	0.66
Transcript_contig_980 (980)	0.58	0.34	0.46	0.87	0.63	0.38	0.45	0.21	1.0	0.93	0.97

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)