Heatmap: Cluster_81 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11795 (11795)	0.27	0.13	1.0	0.76	0.9	0.3	0.96	0.04	0.0	0.13	0.09
Transcript_contig_133 (133)	0.28	0.2	0.63	0.87	1.0	0.31	0.76	0.18	0.02	0.15	0.07
Transcript_contig_2066 (2066)	0.25	0.19	0.86	0.76	1.0	0.45	0.66	0.03	0.56	0.34	0.27
Transcript_contig_2239 (2239)	0.37	0.36	0.87	1.0	0.68	0.61	0.73	0.21	0.09	0.26	0.21
Transcript_contig_2503 (2503)	0.3	0.06	0.48	1.0	0.99	0.21	0.72	0.01	0.02	0.08	0.1
Transcript_contig_2740 (2740)	0.24	0.0	0.69	0.61	1.0	0.26	0.82	0.0	0.04	0.64	0.37
Transcript_contig_403 (403)	0.39	0.27	0.71	0.79	0.66	0.32	1.0	0.21	0.29	0.05	0.04
Transcript_contig_4577 (4577)	0.29	0.14	0.82	1.0	0.64	0.49	1.0	0.09	0.26	0.07	0.23
Transcript_contig_54022 (54022)	0.13	0.08	0.52	0.97	1.0	0.71	0.43	0.04	0.1	0.67	0.43
Transcript_contig_54679 (54679)	0.5	0.38	0.53	0.9	0.76	0.52	1.0	0.37	0.36	0.24	0.26
Transcript_contig_54995 (54995)	0.24	0.13	0.86	1.0	0.64	0.43	0.87	0.06	0.04	0.2	0.21
Transcript_contig_55139 (55139)	0.42	0.28	0.5	0.92	1.0	0.5	0.97	0.11	0.24	0.38	0.25
Transcript_contig_55311 (55311)	0.28	0.15	0.52	1.0	0.95	0.41	0.87	0.15	0.02	0.12	0.12
Transcript_contig_56094 (56094)	0.36	0.2	0.86	0.64	0.68	0.33	1.0	0.11	0.0	0.34	0.29
Transcript_contig_56135 (56135)	0.36	0.19	0.91	0.98	0.87	0.36	1.0	0.21	0.37	0.1	0.09
Transcript_contig_56167 (56167)	0.23	0.09	0.5	1.0	0.87	0.33	0.79	0.11	0.0	0.04	0.04
Transcript_contig_56277 (56277)	0.24	0.15	0.6	0.94	0.85	0.32	1.0	0.05	0.23	0.25	0.14
Transcript_contig_56378 (56378)	0.25	0.26	0.64	0.78	1.0	0.3	0.9	0.15	0.09	0.04	0.06
Transcript_contig_56488 (56488)	0.3	0.24	0.83	1.0	0.83	0.45	0.79	0.15	0.22	0.18	0.27
Transcript_contig_57446 (57446)	0.24	0.11	0.42	1.0	0.49	0.28	0.87	0.08	0.05	0.13	0.18
Transcript_contig_57787 (57787)	0.46	0.4	0.55	0.8	1.0	0.32	0.66	0.28	0.13	0.37	0.29
Transcript_contig_57855 (57855)	0.2	0.0	0.65	0.78	1.0	0.33	0.72	0.0	0.0	0.23	0.25
Transcript_contig_57985 (57985)	0.21	0.24	0.57	0.94	1.0	0.43	0.56	0.1	0.17	0.45	0.32
Transcript_contig_58003 (58003)	0.25	0.18	0.65	1.0	0.76	0.38	0.71	0.07	0.03	0.23	0.18
Transcript_contig_58200 (58200)	0.19	0.0	0.42	0.53	0.82	0.37	1.0	0.0	0.0	0.58	0.32
Transcript_contig_58311 (58311)	0.58	0.5	0.6	0.83	1.0	0.42	0.92	0.38	0.59	0.64	0.51
Transcript_contig_58401 (58401)	0.28	0.18	0.79	0.7	0.66	0.38	1.0	0.2	0.06	0.18	0.14
Transcript_contig_59233 (59233)	0.16	0.0	0.45	0.48	0.95	0.37	1.0	0.0	0.0	0.31	0.24
Transcript_contig_59255 (59255)	0.5	0.48	0.52	0.51	1.0	0.31	0.81	0.45	0.13	0.46	0.39
Transcript_contig_59636 (59636)	0.21	0.1	0.45	0.91	1.0	0.4	0.79	0.08	0.37	0.25	0.22
Transcript_contig_60045 (60045)	0.21	0.07	0.46	0.78	0.58	0.3	1.0	0.07	0.0	0.05	0.02
Transcript_contig_60108 (60108)	0.4	0.42	0.95	0.75	1.0	0.51	0.67	0.55	0.49	0.51	0.43
Transcript_contig_60377 (60377)	0.31	0.0	0.84	1.0	0.75	0.35	0.7	0.03	0.18	0.25	0.34
Transcript_contig_61263 (61263)	0.29	0.05	1.0	0.74	0.48	0.32	0.92	0.07	0.0	0.03	0.05
Transcript_contig_61290 (61290)	0.21	0.25	0.9	0.83	1.0	0.6	0.91	0.22	0.04	0.38	0.47
Transcript_contig_61732 (61732)	0.54	0.54	0.87	1.0	0.93	0.48	0.79	0.35	0.69	0.37	0.44
Transcript_contig_63071 (63071)	0.21	0.04	0.53	1.0	0.79	0.3	0.79	0.03	0.04	0.14	0.14
Transcript_contig_63425 (63425)	0.17	0.06	0.76	0.67	1.0	0.1	0.38	0.0	0.26	0.32	0.16
Transcript_contig_64471 (64471)	0.37	0.17	0.82	1.0	0.84	0.5	0.62	0.03	0.02	0.21	0.21
Transcript_contig_67560 (67560)	0.11	0.0	0.26	0.42	0.09	1.0	0.71	0.0	0.0	0.16	0.18
Transcript_contig_67670 (67670)	0.2	0.09	0.68	0.72	1.0	0.22	0.68	0.08	0.03	0.1	0.12
Transcript_contig_67948 (67948)	0.2	0.21	1.0	0.88	0.59	0.35	0.91	0.2	0.0	0.25	0.19
Transcript_contig_68177 (68177)	0.19	0.0	0.84	1.0	0.95	0.21	0.68	0.0	0.0	0.69	0.37
Transcript_contig_68621 (68621)	0.12	0.0	0.22	0.6	0.34	0.27	0.34	0.0	0.0	1.0	0.34
Transcript_contig_68779 (68779)	0.22	0.05	0.78	1.0	0.65	0.54	0.95	0.04	0.1	0.25	0.28
Transcript_contig_69888 (69888)	0.16	0.0	0.73	0.81	1.0	0.27	0.72	0.0	0.0	0.03	0.14
Transcript_contig_70852 (70852)	0.24	0.0	0.43	0.48	0.8	0.35	0.87	0.0	0.0	1.0	0.72
Transcript_contig_71030 (71030)	0.33	0.24	0.45	1.0	0.45	0.42	0.95	0.14	0.01	0.25	0.13
Transcript_contig_71557 (71557)	0.21	0.07	0.93	0.93	0.66	0.52	1.0	0.04	0.18	0.16	0.28
Transcript_contig_7204 (7204)	0.23	0.21	0.47	0.7	0.84	0.49	0.39	0.0	0.41	1.0	0.27
Transcript_contig_751 (751)	0.26	0.0	0.62	0.82	1.0	0.37	0.98	0.0	0.0	0.96	0.59
Transcript_contig_78112 (78112)	0.4	0.35	0.48	1.0	0.61	0.48	0.92	0.2	0.18	0.33	0.23
Transcript_contig_78204 (78204)	0.27	0.31	0.81	1.0	0.75	0.46	0.56	0.28	0.21	0.34	0.27
Transcript_contig_78303 (78303)	0.35	0.28	0.73	0.88	0.79	0.38	1.0	0.34	0.0	0.26	0.19
Transcript_contig_78365 (78365)	0.23	0.07	0.58	1.0	0.43	0.32	0.83	0.0	0.01	0.27	0.23
Transcript_contig_78477 (78477)	0.35	0.47	0.51	0.74	0.68	0.57	1.0	0.67	0.17	0.24	0.29
Transcript_contig_78648 (78648)	0.4	0.36	0.47	0.86	0.8	1.0	0.57	0.12	0.79	0.83	0.68
Transcript_contig_78761 (78761)	0.23	0.1	0.83	0.78	0.64	0.45	1.0	0.02	0.0	0.08	0.04
Transcript_contig_78990 (78990)	0.27	0.09	0.86	0.87	0.86	0.45	1.0	0.11	0.0	0.25	0.26
Transcript_contig_79048 (79048)	0.28	0.09	0.61	0.74	0.63	0.33	1.0	0.07	0.03	0.16	0.11
Transcript_contig_79100 (79100)	0.22	0.22	0.48	0.72	1.0	0.46	0.86	0.26	0.02	0.17	0.18
Transcript_contig_79243 (79243)	0.35	0.33	0.48	1.0	0.4	0.35	0.7	0.12	0.19	0.38	0.25
Transcript_contig_79861 (79861)	0.39	0.37	0.85	1.0	0.74	0.4	0.76	0.25	0.0	0.24	0.33
Transcript_contig_79870 (79870)	0.33	0.22	0.59	0.88	1.0	0.46	0.92	0.17	0.01	0.45	0.27
Transcript_contig_79955 (79955)	0.47	0.41	0.92	1.0	0.91	0.43	0.89	0.22	0.14	0.18	0.21
Transcript_contig_80014 (80014)	0.31	0.2	0.89	0.84	0.95	0.53	1.0	0.14	0.27	0.11	0.22
Transcript_contig_80139 (80139)	0.25	0.07	0.63	0.78	0.84	0.49	1.0	0.03	0.17	0.21	0.23
Transcript_contig_80282 (80282)	0.37	0.25	0.99	1.0	0.87	0.34	0.9	0.23	0.47	0.31	0.24
Transcript_contig_80303 (80303)	0.17	0.05	0.58	0.95	1.0	0.37	0.73	0.04	0.01	0.45	0.39
Transcript_contig_80367 (80367)	0.36	0.23	0.72	0.8	0.77	0.43	1.0	0.27	0.13	0.42	0.33
Transcript_contig_80431 (80431)	0.26	0.11	0.71	0.82	0.58	0.39	1.0	0.08	0.0	0.04	0.04
Transcript_contig_80789 (80789)	0.32	0.31	0.58	0.69	0.9	0.52	1.0	0.2	0.03	0.4	0.18
Transcript_contig_81551 (81551)	0.35	0.13	0.53	0.57	0.64	0.45	0.91	0.09	0.04	1.0	0.7
Transcript_contig_81689 (81689)	0.43	0.39	0.53	0.7	0.7	0.47	1.0	0.39	0.02	0.16	0.15
Transcript_contig_81944 (81944)	0.21	0.0	0.73	0.84	1.0	0.58	0.98	0.0	0.12	0.95	0.59
Transcript_contig_82001 (82001)	0.12	0.0	0.58	0.62	0.73	0.43	1.0	0.0	0.28	0.11	0.2
Transcript_contig_82930 (82930)	0.23	0.22	0.74	0.69	1.0	0.29	0.7	0.16	0.02	0.24	0.17
Transcript_contig_83482 (83482)	0.23	0.15	0.47	1.0	0.83	0.48	0.78	0.08	0.05	0.19	0.25
Transcript_contig_89783 (89783)	0.16	0.13	0.64	0.99	1.0	0.35	0.6	0.14	0.05	0.21	0.26
Transcript_contig_90041 (90041)	0.2	0.08	0.78	1.0	0.66	0.41	0.82	0.04	0.03	0.11	0.14
Transcript_contig_90105 (90105)	0.23	0.0	0.64	0.79	1.0	0.38	0.89	0.0	0.48	0.07	0.15
Transcript_contig_90401 (90401)	0.23	0.01	0.55	0.63	0.85	0.47	1.0	0.0	0.05	0.1	0.11
Transcript_contig_90591 (90591)	0.36	0.33	0.92	0.82	0.79	0.49	1.0	0.33	0.0	0.17	0.16
Transcript_contig_90678 (90678)	0.24	0.08	0.74	1.0	0.84	0.5	0.92	0.08	0.01	0.31	0.21
Transcript_contig_90706 (90706)	0.21	0.21	0.83	1.0	0.91	0.49	0.6	0.14	0.21	0.32	0.26
Transcript_contig_91427 (91427)	0.18	0.02	0.39	0.97	0.89	0.41	1.0	0.0	0.0	0.06	0.06
Transcript_contig_91440 (91440)	0.31	0.07	0.84	1.0	0.85	0.91	0.38	0.24	0.16	0.4	0.75
Transcript_contig_983 (983)	0.29	0.08	0.85	0.81	0.73	0.29	1.0	0.06	0.2	0.27	0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)