Heatmap: Cluster_125 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_119 (119)	0.68	1.0	0.24	0.18	0.13	0.81	0.89	0.86	0.06	0.11	0.73
Transcript_contig_12055 (12055)	0.3	0.13	0.37	0.38	0.08	0.54	0.15	0.12	0.97	0.32	1.0
Transcript_contig_16197 (16197)	0.33	0.95	0.99	0.19	0.0	0.38	0.83	1.0	0.0	0.44	0.82
Transcript_contig_17028 (17028)	0.74	1.0	0.25	0.0	0.29	0.27	0.0	0.51	0.34	0.0	0.49
Transcript_contig_17275 (17275)	0.32	0.19	0.38	0.46	1.0	0.49	0.72	0.76	0.0	0.29	0.8
Transcript_contig_17469 (17469)	0.63	0.78	0.25	0.0	0.19	0.74	0.37	1.0	0.56	0.22	0.78
Transcript_contig_17768 (17768)	0.7	1.0	0.25	0.13	0.09	0.34	0.42	0.82	0.0	0.32	0.6
Transcript_contig_18145 (18145)	1.0	0.7	0.0	0.5	0.0	0.0	0.26	0.0	0.0	0.0	0.56
Transcript_contig_20421 (20421)	0.91	1.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.14	0.61	0.0	0.0	0.51
Transcript_contig_21221 (21221)	0.46	0.36	0.08	0.12	0.1	0.19	0.0	1.0	0.0	0.0	0.27
Transcript_contig_24866 (24866)	0.2	0.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.64
Transcript_contig_2553 (2553)	0.43	0.45	0.49	0.75	1.0	0.9	0.51	0.59	0.02	0.2	0.54
Transcript_contig_3077 (3077)	0.26	0.39	0.18	0.42	0.3	0.38	0.32	1.0	0.0	0.0	0.38
Transcript_contig_3471 (3471)	0.6	0.91	0.16	0.47	1.0	1.0	0.45	0.7	0.0	0.1	0.4
Transcript_contig_4850 (4850)	0.73	0.97	0.0	0.0	0.0	0.28	0.31	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_55517 (55517)	0.63	0.66	0.39	0.2	0.07	1.0	0.92	0.54	0.13	0.5	0.91
Transcript_contig_55834 (55834)	0.7	0.55	0.94	0.74	0.39	0.81	0.47	0.46	0.53	0.29	1.0
Transcript_contig_59190 (59190)	0.68	0.97	0.39	0.25	0.14	0.56	0.6	1.0	0.25	0.08	0.46
Transcript_contig_59615 (59615)	0.28	0.35	0.28	0.31	0.43	0.23	0.17	0.48	1.0	0.16	0.23
Transcript_contig_60011 (60011)	0.74	1.0	0.25	0.17	0.12	0.19	0.17	0.81	0.0	0.42	0.75
Transcript_contig_60253 (60253)	0.55	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.69
Transcript_contig_60440 (60440)	0.65	1.0	0.1	0.12	0.0	0.55	0.12	0.62	0.0	0.0	0.92
Transcript_contig_61157 (61157)	0.71	1.0	0.06	0.04	0.06	0.81	0.27	0.49	0.25	0.58	0.77
Transcript_contig_6174 (6174)	0.36	0.63	0.2	0.06	0.21	0.3	0.54	1.0	0.11	0.09	0.5
Transcript_contig_61893 (61893)	0.65	0.62	0.35	0.67	0.84	0.91	0.92	0.65	0.0	0.19	1.0
Transcript_contig_62468 (62468)	0.52	0.88	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.67	0.08	0.32
Transcript_contig_6344 (6344)	0.39	0.54	0.67	0.48	0.31	1.0	0.82	0.92	0.0	0.17	0.81
Transcript_contig_635 (635)	0.7	0.78	0.16	0.59	1.0	0.84	0.45	0.78	0.02	0.31	0.8
Transcript_contig_64180 (64180)	0.54	0.7	0.66	0.57	1.0	0.59	0.48	0.77	0.07	0.0	0.85
Transcript_contig_6444 (6444)	0.31	0.32	0.0	0.29	0.74	0.68	0.18	1.0	0.0	0.18	0.82
Transcript_contig_6566 (6566)	0.26	0.5	0.12	0.0	0.0	0.13	0.09	1.0	0.0	0.1	0.43
Transcript_contig_66122 (66122)	0.56	0.84	0.65	0.85	0.88	0.83	0.63	1.0	0.02	0.1	0.88
Transcript_contig_6672 (6672)	0.19	0.3	0.1	0.15	0.36	0.21	0.1	0.3	1.0	0.05	0.18
Transcript_contig_67474 (67474)	0.8	1.0	0.49	0.2	0.01	0.4	0.34	0.8	0.11	0.16	0.27
Transcript_contig_68469 (68469)	0.72	0.54	0.0	0.12	0.0	0.29	0.11	1.0	0.0	0.08	0.0
Transcript_contig_70265 (70265)	0.37	0.38	0.07	0.12	0.17	0.44	0.26	0.45	1.0	0.04	0.39
Transcript_contig_70981 (70981)	0.78	0.52	0.35	0.9	0.54	1.0	0.68	0.54	0.06	0.02	0.81
Transcript_contig_71352 (71352)	1.0	0.44	0.87	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.84
Transcript_contig_73265 (73265)	0.34	0.52	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.44	1.0
Transcript_contig_74560 (74560)	0.55	0.6	0.38	0.39	0.58	0.7	1.0	0.32	0.0	0.35	0.75
Transcript_contig_75217 (75217)	0.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	1.0
Transcript_contig_7828 (7828)	0.43	0.55	0.31	0.25	0.15	0.53	0.25	0.3	1.0	0.18	0.69
Transcript_contig_79292 (79292)	0.69	1.0	0.36	0.19	0.06	0.44	0.59	0.87	0.01	0.11	0.2
Transcript_contig_79820 (79820)	0.28	0.58	0.26	0.45	1.0	0.93	0.41	0.79	0.03	0.57	0.66
Transcript_contig_81554 (81554)	0.5	0.75	0.6	0.55	0.35	0.79	0.43	1.0	0.49	0.31	0.77
Transcript_contig_8390 (8390)	0.45	0.38	0.0	0.38	0.71	1.0	0.67	0.92	0.0	0.76	0.93
Transcript_contig_84102 (84102)	0.56	1.0	0.17	0.15	0.05	0.35	0.59	0.47	0.11	0.08	0.16
Transcript_contig_84342 (84342)	0.31	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.51	0.64
Transcript_contig_90453 (90453)	0.34	0.63	0.2	0.07	0.12	0.0	0.48	1.0	0.54	0.46	0.85
Transcript_contig_90643 (90643)	0.28	0.58	0.36	0.2	0.0	0.4	0.12	1.0	0.03	0.01	0.68
Transcript_contig_933 (933)	1.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71
Transcript_contig_9510 (9510)	0.47	0.37	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.14	0.93
Transcript_contig_9824 (9824)	0.86	0.97	0.0	0.47	0.0	0.0	0.31	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_9991 (9991)	0.32	0.29	0.21	0.17	0.19	0.54	0.06	0.11	1.0	0.08	0.84

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)