Heatmap: Cluster_180 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10085 (10085)	0.25	0.71	0.04	0.03	0.0	0.02	0.12	1.0	0.0	0.19	0.19
Transcript_contig_10139 (10139)	0.59	1.0	0.0	0.2	0.14	0.13	0.07	0.47	0.08	0.47	0.33
Transcript_contig_1336 (1336)	0.69	1.0	0.08	0.34	0.25	0.24	0.3	0.8	0.0	0.41	0.16
Transcript_contig_1721 (1721)	0.89	1.0	0.34	0.39	0.29	0.47	0.49	0.69	0.37	0.38	0.49
Transcript_contig_2152 (2152)	0.55	1.0	0.05	0.02	0.02	0.03	0.2	0.64	0.0	0.06	0.02
Transcript_contig_4812 (4812)	0.71	0.86	0.34	0.22	0.11	0.58	0.34	0.31	0.14	1.0	0.43
Transcript_contig_54121 (54121)	0.79	1.0	0.39	0.4	0.25	0.21	0.47	0.89	0.39	0.32	0.28
Transcript_contig_54526 (54526)	0.81	1.0	0.43	0.4	0.49	0.37	0.63	0.73	0.14	0.27	0.24
Transcript_contig_54580 (54580)	0.31	0.78	0.23	0.24	0.12	0.17	0.11	1.0	0.09	0.08	0.04
Transcript_contig_54988 (54988)	0.71	1.0	0.22	0.25	0.32	0.19	0.34	0.88	0.21	0.11	0.12
Transcript_contig_55700 (55700)	0.6	1.0	0.07	0.15	0.17	0.23	0.18	0.51	0.29	0.66	0.31
Transcript_contig_56025 (56025)	0.58	0.85	0.24	0.22	0.12	0.27	0.3	0.46	0.21	1.0	0.43
Transcript_contig_57461 (57461)	0.77	1.0	0.61	0.26	0.08	0.23	0.41	0.94	0.2	0.27	0.26
Transcript_contig_57528 (57528)	0.59	1.0	0.1	0.05	0.01	0.16	0.14	0.64	0.03	0.17	0.2
Transcript_contig_57639 (57639)	0.58	0.79	0.32	0.32	0.31	0.39	0.43	0.55	0.01	1.0	0.49
Transcript_contig_57976 (57976)	0.57	0.87	0.12	0.15	0.17	0.38	0.49	0.32	0.99	1.0	0.43
Transcript_contig_58225 (58225)	0.38	0.64	0.22	0.28	0.23	0.28	0.25	1.0	0.06	0.18	0.18
Transcript_contig_58257 (58257)	0.43	1.0	0.12	0.09	0.02	0.31	0.25	0.81	0.03	0.21	0.14
Transcript_contig_58882 (58882)	0.57	1.0	0.05	0.04	0.01	0.14	0.33	0.89	0.07	0.4	0.18
Transcript_contig_58896 (58896)	0.69	1.0	0.15	0.16	0.16	0.23	0.28	0.79	0.03	0.18	0.3
Transcript_contig_58941 (58941)	0.49	1.0	0.21	0.07	0.03	0.26	0.27	0.47	0.0	0.38	0.2
Transcript_contig_59208 (59208)	0.58	0.72	0.2	0.18	0.16	0.19	0.23	1.0	0.21	0.21	0.18
Transcript_contig_59809 (59809)	0.49	0.83	0.21	0.19	0.26	0.39	0.37	1.0	0.36	0.43	0.21
Transcript_contig_60388 (60388)	0.23	0.68	0.0	0.0	0.0	0.13	0.04	1.0	0.0	0.41	0.12
Transcript_contig_61236 (61236)	0.75	1.0	0.16	0.13	0.2	0.19	0.26	0.98	0.06	0.23	0.21
Transcript_contig_61908 (61908)	0.82	1.0	0.16	0.18	0.3	0.26	0.22	0.94	0.06	0.13	0.08
Transcript_contig_67508 (67508)	0.79	1.0	0.32	0.22	0.07	0.25	0.43	0.94	0.09	0.31	0.34
Transcript_contig_68135 (68135)	0.52	0.92	0.05	0.09	0.14	0.02	0.17	1.0	0.0	0.58	0.33
Transcript_contig_68392 (68392)	0.46	1.0	0.17	0.27	0.22	0.38	0.3	0.5	0.0	0.14	0.14
Transcript_contig_68583 (68583)	0.67	0.87	0.56	0.33	0.26	0.17	0.35	1.0	0.12	0.16	0.15
Transcript_contig_68759 (68759)	0.29	0.7	0.04	0.07	0.07	0.19	0.27	1.0	0.2	0.5	0.21
Transcript_contig_69024 (69024)	0.39	0.51	0.01	0.01	0.0	0.18	0.38	1.0	0.02	0.14	0.19
Transcript_contig_70497 (70497)	0.18	0.52	0.01	0.01	0.01	0.14	0.06	1.0	0.0	0.17	0.04
Transcript_contig_70553 (70553)	0.78	1.0	0.5	0.45	0.57	0.62	0.55	0.93	0.26	0.45	0.69
Transcript_contig_70573 (70573)	0.8	1.0	0.11	0.18	0.37	0.36	0.41	0.98	0.0	0.13	0.2
Transcript_contig_70648 (70648)	0.6	0.84	0.14	0.43	0.58	0.34	0.32	0.35	0.18	1.0	0.44
Transcript_contig_78293 (78293)	0.71	0.89	0.39	0.36	0.25	0.37	0.46	0.36	0.52	1.0	0.48
Transcript_contig_79056 (79056)	0.55	0.96	0.36	0.31	0.19	0.29	0.34	1.0	0.83	0.6	0.44
Transcript_contig_79294 (79294)	0.71	1.0	0.19	0.41	0.34	0.26	0.26	0.85	0.22	0.22	0.32
Transcript_contig_79775 (79775)	0.66	1.0	0.12	0.08	0.05	0.06	0.1	0.98	0.47	0.16	0.07
Transcript_contig_79951 (79951)	0.7	0.95	0.23	0.3	0.37	0.19	0.34	1.0	0.0	0.16	0.13
Transcript_contig_79984 (79984)	0.53	0.81	0.15	0.1	0.02	0.12	0.08	1.0	0.0	0.13	0.08
Transcript_contig_80025 (80025)	0.37	0.61	0.15	0.42	0.61	0.43	0.21	1.0	0.04	0.2	0.21
Transcript_contig_80205 (80205)	0.25	0.66	0.02	0.03	0.03	0.35	0.15	1.0	0.16	0.5	0.15
Transcript_contig_80338 (80338)	0.52	0.92	0.05	0.16	0.2	0.47	0.38	1.0	0.01	0.26	0.09
Transcript_contig_80464 (80464)	0.46	0.78	0.42	0.33	0.23	0.21	0.39	0.15	0.16	1.0	0.22
Transcript_contig_80495 (80495)	0.52	0.77	0.06	0.09	0.01	0.07	0.09	1.0	0.01	0.51	0.27
Transcript_contig_819 (819)	0.87	1.0	0.3	0.31	0.58	0.28	0.38	0.98	0.01	0.33	0.23
Transcript_contig_82341 (82341)	0.69	1.0	0.27	0.25	0.18	0.31	0.45	0.84	0.1	0.3	0.26
Transcript_contig_83980 (83980)	0.84	0.95	0.28	0.25	0.54	0.12	0.55	1.0	0.22	0.2	0.11
Transcript_contig_89274 (89274)	0.64	1.0	0.37	0.24	0.06	0.14	0.26	0.71	0.13	0.11	0.19
Transcript_contig_89920 (89920)	0.69	1.0	0.21	0.45	0.64	0.25	0.41	0.92	0.03	0.16	0.11
Transcript_contig_90343 (90343)	0.55	0.86	0.08	0.08	0.07	0.16	0.27	1.0	0.0	0.09	0.09
Transcript_contig_931 (931)	0.64	1.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.13	0.55	0.08	0.12	0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)