Heatmap: Cluster_48 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10133 (10133)	1.0	0.85	0.58	0.54	0.56	0.42	0.83	0.24	0.64	0.62	0.34
Transcript_contig_11448 (11448)	1.0	1.0	0.17	0.34	0.4	0.41	0.32	0.23	0.0	0.78	0.31
Transcript_contig_11584 (11584)	0.92	1.0	0.26	0.54	0.52	0.65	0.24	0.67	0.13	0.48	0.35
Transcript_contig_1389 (1389)	0.94	1.0	0.38	0.67	0.7	0.4	0.62	0.43	0.03	0.67	0.53
Transcript_contig_1392 (1392)	1.0	1.0	0.13	0.16	0.2	0.12	0.16	0.35	0.0	0.64	0.32
Transcript_contig_1402 (1402)	0.98	1.0	0.37	0.41	0.55	0.14	0.38	0.24	0.22	0.13	0.05
Transcript_contig_14836 (14836)	0.79	1.0	0.0	0.02	0.0	0.01	0.0	0.16	0.0	0.31	0.34
Transcript_contig_1543 (1543)	1.0	0.91	0.5	0.66	0.42	0.42	0.43	0.39	0.92	0.54	0.46
Transcript_contig_17389 (17389)	0.72	1.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.05	0.54	0.0	0.66	0.54
Transcript_contig_1858 (1858)	1.0	0.91	0.4	0.68	0.45	0.35	0.58	0.19	0.17	0.35	0.28
Transcript_contig_1974 (1974)	0.87	1.0	0.45	0.53	0.48	0.52	0.49	0.8	0.95	0.48	0.36
Transcript_contig_2103 (2103)	0.82	1.0	0.02	0.11	0.08	0.26	0.06	0.31	0.0	0.55	0.32
Transcript_contig_2113 (2113)	1.0	0.98	0.63	0.5	0.45	0.18	0.42	0.55	0.0	0.36	0.17
Transcript_contig_21677 (21677)	0.94	0.96	0.11	0.26	1.0	0.31	0.07	0.23	0.0	0.24	0.36
Transcript_contig_2416 (2416)	0.95	1.0	0.25	0.35	0.36	0.17	0.36	0.43	0.11	0.7	0.37
Transcript_contig_2467 (2467)	0.69	1.0	0.42	0.22	0.21	0.31	0.28	0.38	0.0	0.05	0.07
Transcript_contig_2488 (2488)	1.0	0.89	0.73	0.64	0.97	0.18	0.5	0.29	0.14	0.53	0.31
Transcript_contig_2595 (2595)	1.0	0.87	0.4	0.61	0.9	0.54	0.57	0.21	0.26	0.86	0.63
Transcript_contig_3106 (3106)	0.84	1.0	0.38	0.27	0.13	0.28	0.27	0.42	0.37	0.0	0.02
Transcript_contig_3211 (3211)	0.88	1.0	0.03	0.01	0.02	0.18	0.08	0.65	0.02	0.16	0.11
Transcript_contig_3609 (3609)	0.62	1.0	0.13	0.3	0.27	0.18	0.28	0.69	0.0	0.47	0.41
Transcript_contig_3665 (3665)	0.73	1.0	0.45	0.03	0.0	0.27	0.0	0.36	0.0	0.3	0.08
Transcript_contig_4688 (4688)	0.95	1.0	0.23	0.26	0.21	0.44	0.3	0.19	0.17	0.63	0.27
Transcript_contig_4796 (4796)	0.86	1.0	0.08	0.32	0.54	0.34	0.19	0.4	0.07	0.86	0.53
Transcript_contig_5071 (5071)	1.0	0.96	0.39	0.68	0.65	0.25	0.44	0.54	0.08	0.13	0.12
Transcript_contig_5073 (5073)	0.74	1.0	0.68	0.53	0.26	0.42	0.49	0.16	0.02	0.58	0.45
Transcript_contig_53796 (53796)	0.96	1.0	0.36	0.39	0.49	0.27	0.43	0.69	0.26	0.53	0.36
Transcript_contig_53802 (53802)	1.0	0.96	0.48	0.45	0.66	0.45	0.72	0.52	0.34	0.58	0.4
Transcript_contig_54138 (54138)	0.9	1.0	0.03	0.27	0.36	0.13	0.25	0.04	0.0	0.2	0.13
Transcript_contig_54212 (54212)	0.76	1.0	0.07	0.1	0.11	0.17	0.14	0.57	0.02	0.52	0.23
Transcript_contig_54758 (54758)	1.0	0.93	0.3	0.41	0.44	0.44	0.33	0.38	0.38	0.6	0.42
Transcript_contig_54764 (54764)	1.0	0.91	0.72	0.66	0.57	0.37	0.71	0.3	0.13	0.37	0.25
Transcript_contig_54814 (54814)	0.94	1.0	0.36	0.38	0.47	0.22	0.33	0.47	0.23	0.54	0.36
Transcript_contig_54836 (54836)	0.85	1.0	0.24	0.48	0.71	0.23	0.38	0.68	0.21	0.4	0.33
Transcript_contig_54866 (54866)	1.0	0.92	0.31	0.16	0.03	0.17	0.18	0.06	0.03	0.88	0.51
Transcript_contig_55013 (55013)	1.0	0.99	0.25	0.21	0.27	0.48	0.31	0.45	0.16	0.56	0.42
Transcript_contig_55056 (55056)	1.0	0.96	0.47	0.43	0.49	0.27	0.35	0.37	0.59	0.74	0.51
Transcript_contig_55067 (55067)	0.92	1.0	0.39	0.53	0.61	0.42	0.67	0.39	0.29	0.56	0.36
Transcript_contig_55142 (55142)	1.0	0.91	0.53	0.87	0.78	0.57	0.8	0.35	0.36	0.62	0.4
Transcript_contig_55148 (55148)	1.0	0.94	0.53	0.65	0.74	0.4	0.65	0.64	0.39	0.7	0.48
Transcript_contig_55195 (55195)	0.84	1.0	0.47	0.46	0.3	0.32	0.27	0.47	0.11	0.34	0.21
Transcript_contig_55246 (55246)	0.95	1.0	0.34	0.63	0.86	0.47	0.5	0.54	0.1	0.62	0.45
Transcript_contig_55262 (55262)	1.0	0.99	0.55	0.68	0.7	0.39	0.62	0.57	0.21	0.69	0.47
Transcript_contig_553 (553)	0.94	1.0	0.28	0.47	0.52	0.17	0.32	0.51	0.11	0.34	0.23
Transcript_contig_55346 (55346)	1.0	1.0	0.26	0.57	0.58	0.27	0.51	0.32	0.12	0.72	0.42
Transcript_contig_55682 (55682)	0.97	1.0	0.4	0.73	0.84	0.47	0.34	0.48	0.68	0.84	0.6
Transcript_contig_55729 (55729)	0.97	1.0	0.26	0.72	0.46	0.43	0.37	0.39	0.19	0.6	0.41
Transcript_contig_55746 (55746)	0.89	1.0	0.22	0.59	0.82	0.55	0.29	0.73	0.45	0.32	0.21
Transcript_contig_55767 (55767)	0.99	1.0	0.26	0.52	0.75	0.24	0.35	0.55	0.39	0.46	0.29
Transcript_contig_55783 (55783)	1.0	0.86	0.12	0.23	0.29	0.21	0.5	0.28	0.1	0.35	0.23
Transcript_contig_55904 (55904)	1.0	0.98	0.09	0.14	0.35	0.36	0.16	0.19	0.15	0.87	0.53
Transcript_contig_56108 (56108)	1.0	0.84	0.31	0.37	0.42	0.47	0.31	0.35	0.4	0.71	0.55
Transcript_contig_56131 (56131)	0.77	1.0	0.05	0.22	0.28	0.17	0.2	0.61	0.04	0.55	0.28
Transcript_contig_56282 (56282)	0.91	1.0	0.31	0.57	0.54	0.37	0.7	0.45	0.06	0.89	0.38
Transcript_contig_56330 (56330)	0.85	1.0	0.44	0.64	0.93	0.37	0.48	0.76	0.11	0.56	0.45
Transcript_contig_56399 (56399)	1.0	0.98	0.26	0.49	0.73	0.14	0.2	0.15	0.05	0.31	0.18
Transcript_contig_56405 (56405)	0.98	1.0	0.14	0.17	0.14	0.42	0.27	0.43	0.25	0.69	0.33
Transcript_contig_56428 (56428)	1.0	0.87	0.39	0.47	0.51	0.37	0.45	0.12	0.15	0.72	0.34
Transcript_contig_5667 (5667)	0.65	1.0	0.17	0.13	0.15	0.31	0.42	0.17	0.22	0.44	0.3
Transcript_contig_56728 (56728)	0.89	1.0	0.3	0.53	0.73	0.42	0.47	0.58	0.41	0.47	0.34
Transcript_contig_56917 (56917)	1.0	0.92	0.42	0.61	0.76	0.45	0.77	0.37	0.56	0.51	0.36
Transcript_contig_56932 (56932)	0.89	1.0	0.22	0.52	0.71	0.41	0.52	0.66	0.17	0.4	0.27
Transcript_contig_56943 (56943)	1.0	0.98	0.45	0.43	0.41	0.28	0.4	0.29	0.51	0.37	0.25
Transcript_contig_56996 (56996)	1.0	0.94	0.19	0.37	0.47	0.26	0.35	0.49	0.26	0.95	0.41
Transcript_contig_57000 (57000)	0.91	1.0	0.11	0.12	0.12	0.26	0.21	0.58	0.11	0.8	0.44
Transcript_contig_57019 (57019)	0.97	1.0	0.28	0.64	0.72	0.27	0.57	0.82	0.14	0.46	0.42
Transcript_contig_57137 (57137)	1.0	0.96	0.28	0.51	0.8	0.71	0.42	0.28	0.2	0.44	0.22
Transcript_contig_57187 (57187)	1.0	0.96	0.64	0.25	0.23	0.29	0.31	0.21	0.34	0.16	0.16
Transcript_contig_57310 (57310)	0.94	1.0	0.31	0.7	0.95	0.39	0.32	0.72	0.33	0.48	0.38
Transcript_contig_57356 (57356)	0.98	1.0	0.58	0.58	0.88	0.58	0.84	0.55	0.03	0.48	0.19
Transcript_contig_57377 (57377)	0.89	1.0	0.51	0.37	0.34	0.26	0.24	0.66	0.28	0.64	0.42
Transcript_contig_57436 (57436)	0.89	1.0	0.61	0.6	0.76	0.39	0.43	0.65	0.62	0.57	0.39
Transcript_contig_57503 (57503)	0.91	1.0	0.13	0.38	0.41	0.29	0.36	0.31	0.01	0.73	0.4
Transcript_contig_57536 (57536)	0.93	0.99	0.52	0.57	1.0	0.31	0.51	0.53	0.4	0.48	0.41
Transcript_contig_57538 (57538)	1.0	0.97	0.46	0.2	0.0	0.09	0.15	0.06	0.02	0.41	0.28
Transcript_contig_57638 (57638)	0.96	1.0	0.66	0.51	0.53	0.2	0.32	0.63	0.54	0.41	0.23
Transcript_contig_57799 (57799)	0.88	1.0	0.25	0.53	0.6	0.37	0.45	0.56	0.37	0.8	0.45
Transcript_contig_57870 (57870)	0.94	1.0	0.13	0.24	0.29	0.16	0.16	0.38	0.28	0.4	0.32
Transcript_contig_57893 (57893)	0.84	1.0	0.1	0.16	0.19	0.52	0.29	0.32	0.09	0.67	0.3
Transcript_contig_58050 (58050)	1.0	0.97	0.44	0.34	0.31	0.22	0.45	0.3	0.24	0.16	0.16
Transcript_contig_58070 (58070)	1.0	0.87	0.35	0.52	0.94	0.29	0.32	0.31	0.18	0.52	0.39
Transcript_contig_58543 (58543)	1.0	0.87	0.44	0.38	0.42	0.36	0.49	0.3	0.19	0.79	0.55
Transcript_contig_58595 (58595)	0.9	1.0	0.04	0.08	0.28	0.16	0.1	0.54	0.19	0.84	0.47
Transcript_contig_58615 (58615)	0.98	1.0	0.6	0.58	0.71	0.42	0.64	0.39	0.09	0.36	0.3
Transcript_contig_58745 (58745)	0.86	1.0	0.06	0.24	0.23	0.42	0.36	0.47	0.33	0.07	0.1
Transcript_contig_58752 (58752)	0.76	1.0	0.29	0.49	0.36	0.21	0.37	0.41	0.04	0.63	0.32
Transcript_contig_58778 (58778)	1.0	0.94	0.15	0.3	0.27	0.45	0.29	0.16	0.09	0.51	0.27
Transcript_contig_59055 (59055)	0.93	0.81	0.5	0.7	1.0	0.3	0.46	0.34	0.44	0.75	0.48
Transcript_contig_59106 (59106)	0.87	1.0	0.42	0.59	0.47	0.22	0.19	0.26	0.09	0.45	0.23
Transcript_contig_59227 (59227)	0.97	1.0	0.35	0.62	0.87	0.39	0.58	0.58	0.4	0.65	0.42
Transcript_contig_59678 (59678)	0.78	1.0	0.19	0.34	0.39	0.23	0.17	0.74	0.11	0.4	0.24
Transcript_contig_59753 (59753)	0.93	1.0	0.2	0.44	0.61	0.25	0.41	0.4	0.05	0.25	0.14
Transcript_contig_59793 (59793)	0.91	1.0	0.15	0.51	0.53	0.06	0.19	0.45	0.06	0.17	0.06
Transcript_contig_60233 (60233)	1.0	0.84	0.31	0.38	0.27	0.32	0.39	0.21	0.63	0.48	0.32
Transcript_contig_60507 (60507)	0.93	1.0	0.32	0.35	0.35	0.19	0.4	0.49	0.14	0.64	0.31
Transcript_contig_60635 (60635)	1.0	0.96	0.17	0.36	0.73	0.14	0.19	0.03	0.0	0.24	0.06
Transcript_contig_60712 (60712)	1.0	0.92	0.56	0.52	0.43	0.28	0.49	0.42	0.79	0.6	0.46
Transcript_contig_60778 (60778)	0.94	1.0	0.11	0.39	0.43	0.09	0.23	0.6	0.83	0.56	0.38
Transcript_contig_61635 (61635)	0.93	1.0	0.13	0.36	0.27	0.5	0.39	0.29	0.04	0.73	0.21
Transcript_contig_61787 (61787)	1.0	0.95	0.77	0.58	0.46	0.48	0.65	0.27	0.06	0.33	0.38
Transcript_contig_61914 (61914)	0.95	1.0	0.2	0.35	0.65	0.31	0.28	0.25	0.06	0.48	0.34
Transcript_contig_63477 (63477)	0.97	1.0	0.53	0.43	0.49	0.29	0.38	0.58	0.73	0.44	0.21
Transcript_contig_651 (651)	0.89	1.0	0.32	0.37	0.3	0.37	0.36	0.33	0.07	0.25	0.13
Transcript_contig_66199 (66199)	0.92	0.74	0.84	0.73	1.0	0.19	0.49	0.43	0.48	0.49	0.26
Transcript_contig_67514 (67514)	0.89	1.0	0.34	0.46	0.68	0.35	0.49	0.8	0.42	0.42	0.29
Transcript_contig_67593 (67593)	0.96	1.0	0.13	0.23	0.1	0.22	0.42	0.43	0.28	0.03	0.08
Transcript_contig_67676 (67676)	0.94	0.84	0.6	0.59	0.41	0.4	0.4	0.32	1.0	0.47	0.36
Transcript_contig_6789 (6789)	0.96	1.0	0.13	0.03	0.17	0.19	0.19	0.66	0.14	0.33	0.23
Transcript_contig_68207 (68207)	0.99	1.0	0.41	0.54	0.71	0.15	0.43	0.72	0.0	0.06	0.03
Transcript_contig_6850 (6850)	0.88	1.0	0.31	0.45	0.75	0.38	0.42	0.55	0.32	0.43	0.27
Transcript_contig_69017 (69017)	0.89	1.0	0.2	0.63	0.7	0.54	0.45	0.62	0.25	0.41	0.31
Transcript_contig_69458 (69458)	1.0	0.98	0.36	0.54	0.73	0.57	0.43	0.46	0.02	0.61	0.39
Transcript_contig_69808 (69808)	1.0	0.83	0.53	0.38	0.3	0.57	0.39	0.17	0.12	0.81	0.67
Transcript_contig_69984 (69984)	0.75	0.88	0.0	0.0	0.0	0.41	0.19	0.92	0.1	1.0	0.53
Transcript_contig_70320 (70320)	1.0	0.84	0.11	0.3	0.49	0.26	0.34	0.15	0.08	0.58	0.33
Transcript_contig_70342 (70342)	0.95	1.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.3	0.84	0.06	0.13	0.03
Transcript_contig_70842 (70842)	0.94	1.0	0.12	0.25	0.41	0.53	0.36	0.47	0.01	0.43	0.23
Transcript_contig_71570 (71570)	1.0	0.99	0.31	0.68	0.76	0.49	0.49	0.36	0.25	0.45	0.32
Transcript_contig_731 (731)	0.94	1.0	0.24	0.33	0.21	0.35	0.32	0.32	0.06	0.19	0.14
Transcript_contig_78069 (78069)	1.0	0.92	0.64	0.52	0.43	0.45	0.6	0.48	0.55	0.49	0.37
Transcript_contig_78176 (78176)	1.0	0.9	0.57	0.42	0.37	0.24	0.52	0.35	0.25	0.16	0.18
Transcript_contig_78450 (78450)	0.91	1.0	0.17	0.18	0.17	0.28	0.14	0.56	0.31	0.43	0.25
Transcript_contig_78459 (78459)	0.95	1.0	0.46	0.5	0.61	0.34	0.4	0.63	0.31	0.45	0.33
Transcript_contig_78591 (78591)	0.85	1.0	0.25	0.5	0.58	0.5	0.53	0.6	0.63	0.48	0.23
Transcript_contig_7860 (7860)	0.83	1.0	0.11	0.31	0.39	0.08	0.17	0.41	0.0	0.04	0.06
Transcript_contig_78777 (78777)	1.0	0.91	0.54	0.83	0.77	0.55	0.87	0.57	0.2	0.26	0.19
Transcript_contig_78817 (78817)	0.95	1.0	0.03	0.24	0.41	0.25	0.46	0.31	0.02	0.16	0.1
Transcript_contig_78877 (78877)	0.91	1.0	0.27	0.49	0.4	0.26	0.3	0.57	0.3	0.41	0.26
Transcript_contig_78897 (78897)	0.91	1.0	0.02	0.01	0.0	0.05	0.02	0.15	0.02	0.45	0.35
Transcript_contig_78959 (78959)	0.83	1.0	0.54	0.69	0.68	0.42	0.56	0.41	0.33	0.53	0.34
Transcript_contig_79523 (79523)	1.0	0.87	0.54	0.7	0.67	0.62	0.89	0.52	0.26	0.31	0.24
Transcript_contig_79837 (79837)	0.81	1.0	0.47	0.56	0.62	0.59	0.39	0.49	0.1	0.66	0.56
Transcript_contig_80072 (80072)	1.0	1.0	0.48	0.71	0.82	0.62	0.82	0.67	0.46	0.95	0.48
Transcript_contig_80405 (80405)	1.0	1.0	0.82	0.34	0.14	0.32	0.37	0.45	0.37	0.01	0.07
Transcript_contig_8076 (8076)	0.96	1.0	0.1	0.13	0.16	0.09	0.17	0.44	0.03	0.67	0.35
Transcript_contig_81089 (81089)	0.87	1.0	0.09	0.12	0.22	0.2	0.14	0.71	0.03	0.37	0.17
Transcript_contig_81915 (81915)	0.95	1.0	0.19	0.17	0.21	0.47	0.33	0.44	0.55	0.38	0.19
Transcript_contig_82003 (82003)	0.95	1.0	0.21	0.2	0.1	0.2	0.15	0.29	0.07	0.62	0.55
Transcript_contig_82749 (82749)	0.9	1.0	0.26	0.42	0.44	0.24	0.36	0.39	0.06	0.14	0.15
Transcript_contig_82917 (82917)	0.84	1.0	0.26	0.39	0.61	0.19	0.49	0.33	0.0	0.12	0.08
Transcript_contig_83274 (83274)	0.87	1.0	0.36	0.43	0.46	0.4	0.44	0.67	0.08	0.68	0.53
Transcript_contig_83596 (83596)	1.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.04	0.2	0.11	0.6	0.43
Transcript_contig_8551 (8551)	0.46	1.0	0.21	0.21	0.03	0.45	0.16	0.19	0.16	0.35	0.15
Transcript_contig_8823 (8823)	0.88	1.0	0.13	0.34	0.41	0.34	0.25	0.31	0.01	0.48	0.29
Transcript_contig_89258 (89258)	0.92	1.0	0.12	0.55	0.56	0.38	0.42	0.71	0.14	0.94	0.54
Transcript_contig_89309 (89309)	0.98	1.0	0.43	0.58	0.67	0.23	0.58	0.32	0.08	0.22	0.16
Transcript_contig_89479 (89479)	0.95	1.0	0.08	0.09	0.1	0.32	0.12	0.49	0.03	0.87	0.45
Transcript_contig_89764 (89764)	0.95	1.0	0.33	0.76	0.97	0.33	0.54	0.42	0.15	0.45	0.26
Transcript_contig_9007 (9007)	0.86	1.0	0.26	0.54	0.83	0.23	0.24	0.61	0.19	0.52	0.31
Transcript_contig_90572 (90572)	1.0	0.91	0.27	0.32	0.4	0.18	0.37	0.33	0.31	0.31	0.22
Transcript_contig_91044 (91044)	0.97	1.0	0.53	0.34	0.29	0.33	0.36	0.36	0.41	0.31	0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)