Heatmap: Cluster_131 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_2200 (2200)	0.83	1.0	0.27	0.23	0.26	0.2	0.26	0.97	0.08	0.75	0.43
Transcript_contig_53731 (53731)	0.84	0.95	0.25	0.5	0.5	0.29	0.75	1.0	0.76	0.5	0.41
Transcript_contig_53770 (53770)	0.98	0.96	0.39	0.47	0.66	0.42	0.55	0.97	1.0	0.84	0.7
Transcript_contig_53784 (53784)	0.87	0.98	0.44	0.49	0.71	0.37	0.69	1.0	0.58	0.56	0.36
Transcript_contig_53833 (53833)	0.59	0.87	0.23	0.28	0.35	0.29	0.4	1.0	0.16	0.3	0.17
Transcript_contig_53842 (53842)	0.84	0.98	0.5	0.71	0.83	0.43	0.71	1.0	0.17	0.49	0.37
Transcript_contig_53937 (53937)	0.8	0.96	0.28	0.71	0.97	0.68	0.52	0.69	0.15	1.0	0.63
Transcript_contig_53955 (53955)	0.7	0.93	0.28	0.54	0.82	0.31	0.38	1.0	0.31	0.69	0.42
Transcript_contig_54213 (54213)	1.0	0.98	0.34	0.54	0.93	0.16	0.25	0.83	0.87	0.43	0.48
Transcript_contig_54234 (54234)	0.74	1.0	0.41	0.72	1.0	0.3	0.57	0.99	0.28	0.42	0.33
Transcript_contig_54237 (54237)	0.74	1.0	0.21	0.13	0.06	0.1	0.14	0.79	0.12	0.36	0.17
Transcript_contig_54253 (54253)	0.73	0.82	0.58	0.83	1.0	0.28	0.53	0.9	0.32	0.45	0.33
Transcript_contig_54277 (54277)	0.8	0.86	0.43	0.56	1.0	0.29	0.62	0.91	0.95	0.5	0.39
Transcript_contig_54317 (54317)	0.49	0.71	0.33	0.41	0.73	0.34	0.41	1.0	0.32	0.65	0.41
Transcript_contig_54694 (54694)	1.0	0.94	0.43	0.53	0.75	0.38	0.68	0.64	0.39	0.52	0.39
Transcript_contig_54865 (54865)	0.78	0.75	0.44	0.74	1.0	0.46	0.35	0.45	0.1	0.57	0.42
Transcript_contig_55031 (55031)	0.62	0.54	0.33	0.74	1.0	0.4	0.61	0.48	0.86	0.55	0.47
Transcript_contig_55302 (55302)	0.9	1.0	0.31	0.56	0.88	0.65	0.59	0.84	0.25	0.87	0.63
Transcript_contig_55349 (55349)	0.27	0.32	0.07	0.5	1.0	0.11	0.13	0.26	0.05	0.17	0.09
Transcript_contig_55374 (55374)	0.51	0.51	0.16	0.48	1.0	0.37	0.25	0.31	0.11	0.57	0.38
Transcript_contig_55631 (55631)	0.52	0.49	0.09	0.45	1.0	0.23	0.23	0.16	0.05	0.31	0.18
Transcript_contig_55781 (55781)	0.99	1.0	0.27	0.36	0.46	0.3	0.55	0.81	0.56	0.68	0.56
Transcript_contig_55808 (55808)	0.68	0.84	0.4	0.69	1.0	0.36	0.66	0.81	0.11	0.32	0.26
Transcript_contig_55954 (55954)	0.53	0.57	0.12	0.6	1.0	0.14	0.19	0.34	0.52	0.31	0.22
Transcript_contig_56060 (56060)	0.56	0.65	0.26	0.54	1.0	0.58	0.46	0.65	0.22	0.88	0.59
Transcript_contig_56202 (56202)	0.77	0.95	0.4	0.72	1.0	0.35	0.55	0.81	0.49	0.7	0.52
Transcript_contig_56315 (56315)	0.33	0.46	0.16	0.49	1.0	0.26	0.26	0.36	0.1	0.27	0.2
Transcript_contig_56507 (56507)	0.84	1.0	0.27	0.52	0.41	0.4	0.63	0.86	0.55	0.88	0.55
Transcript_contig_56893 (56893)	0.88	0.94	0.32	0.32	0.45	0.24	0.37	1.0	0.78	0.63	0.51
Transcript_contig_57439 (57439)	0.81	1.0	0.38	0.37	0.36	0.49	0.43	0.9	0.29	0.58	0.42
Transcript_contig_57443 (57443)	0.93	1.0	0.66	0.52	0.63	0.41	0.6	0.64	0.35	0.76	0.51
Transcript_contig_57456 (57456)	0.82	0.7	0.39	0.62	1.0	0.63	0.48	0.18	0.2	0.75	0.53
Transcript_contig_57486 (57486)	0.62	0.64	0.13	0.5	1.0	0.14	0.28	0.24	0.04	0.27	0.18
Transcript_contig_57612 (57612)	0.68	1.0	0.74	0.47	0.43	0.44	0.47	0.84	0.11	0.67	0.38
Transcript_contig_58132 (58132)	0.71	1.0	0.18	0.11	0.14	0.09	0.14	0.86	0.12	0.24	0.13
Transcript_contig_58134 (58134)	0.65	0.95	0.25	0.37	0.51	0.33	0.43	1.0	0.42	0.51	0.31
Transcript_contig_58277 (58277)	0.61	0.69	0.3	0.46	1.0	0.41	0.26	0.54	0.34	0.93	0.66
Transcript_contig_58305 (58305)	0.85	1.0	0.36	0.51	0.4	0.36	0.54	0.84	0.16	0.47	0.29
Transcript_contig_58529 (58529)	0.85	1.0	0.24	0.45	0.59	0.25	0.38	0.92	0.39	0.85	0.58
Transcript_contig_58817 (58817)	0.72	0.83	0.28	0.37	0.45	0.21	0.24	1.0	0.96	0.48	0.44
Transcript_contig_58923 (58923)	0.81	0.94	0.48	0.65	0.81	0.54	0.69	1.0	0.12	0.76	0.4
Transcript_contig_59107 (59107)	0.48	0.56	0.14	0.49	1.0	0.16	0.16	0.49	0.06	0.33	0.27
Transcript_contig_59891 (59891)	0.7	1.0	0.29	0.48	0.6	0.55	0.37	0.98	0.53	0.93	0.61
Transcript_contig_59986 (59986)	0.33	0.27	0.17	0.34	1.0	0.04	0.07	0.16	0.03	0.19	0.11
Transcript_contig_61240 (61240)	0.71	0.88	0.65	0.6	0.59	0.55	0.6	1.0	0.73	0.59	0.45
Transcript_contig_61407 (61407)	0.43	0.43	0.06	0.48	1.0	0.27	0.26	0.1	0.01	0.73	0.47
Transcript_contig_63406 (63406)	0.67	0.81	0.3	0.81	1.0	0.85	0.45	0.69	0.42	0.93	0.57
Transcript_contig_63850 (63850)	0.75	1.0	0.41	0.54	0.77	0.36	0.35	0.92	0.13	0.36	0.25
Transcript_contig_717 (717)	0.75	1.0	0.14	0.44	0.75	0.37	0.37	0.95	0.25	0.68	0.45
Transcript_contig_78032 (78032)	0.52	0.64	0.23	0.59	1.0	0.3	0.26	0.44	0.09	0.47	0.34
Transcript_contig_78347 (78347)	0.82	0.94	0.37	0.47	0.6	0.43	0.64	1.0	0.63	0.51	0.39
Transcript_contig_78370 (78370)	0.82	1.0	0.37	0.65	0.85	0.52	0.54	0.76	0.05	0.89	0.55
Transcript_contig_78466 (78466)	0.62	1.0	0.12	0.1	0.06	0.15	0.23	0.93	0.1	0.37	0.24
Transcript_contig_78467 (78467)	0.62	0.61	0.34	0.74	0.89	0.64	0.45	0.45	0.65	1.0	0.61
Transcript_contig_78957 (78957)	0.72	0.79	0.19	0.49	1.0	0.19	0.26	0.79	0.62	0.52	0.37
Transcript_contig_79515 (79515)	0.22	0.24	0.1	0.32	1.0	0.18	0.08	0.08	0.0	0.21	0.18
Transcript_contig_80038 (80038)	0.49	0.81	0.31	0.38	0.76	0.21	0.33	1.0	0.07	0.52	0.28
Transcript_contig_80536 (80536)	0.61	0.71	0.25	0.65	1.0	0.39	0.55	0.72	0.05	0.46	0.31
Transcript_contig_8648 (8648)	0.87	0.68	0.43	0.78	1.0	0.55	0.57	0.26	0.09	0.94	0.4
Transcript_contig_89140 (89140)	0.8	1.0	0.21	0.32	0.33	0.27	0.26	0.91	0.31	0.57	0.33
Transcript_contig_89178 (89178)	0.9	1.0	0.38	0.72	0.93	0.48	0.55	0.67	0.19	0.76	0.48
Transcript_contig_89244 (89244)	0.62	0.63	0.34	0.73	1.0	0.29	0.52	0.64	0.61	0.44	0.38
Transcript_contig_89263 (89263)	1.0	0.89	0.52	0.83	0.87	0.28	0.74	0.69	0.26	0.57	0.39
Transcript_contig_89280 (89280)	0.53	0.56	0.37	1.0	0.96	0.94	0.65	0.53	0.47	0.73	0.41
Transcript_contig_89328 (89328)	0.71	0.82	0.07	0.81	1.0	0.38	0.43	0.46	0.03	0.85	0.63
Transcript_contig_89667 (89667)	0.73	0.88	0.27	0.48	0.69	0.55	0.46	0.62	0.15	1.0	0.52
Transcript_contig_89852 (89852)	0.68	0.74	0.46	1.0	0.99	0.65	0.54	0.35	0.16	0.66	0.43
Transcript_contig_90004 (90004)	0.46	0.4	0.23	0.9	1.0	0.43	0.49	0.48	0.38	0.5	0.44

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)