Heatmap: Cluster_46 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1009 (1009)	0.62	1.0	0.12	0.05	0.05	0.39	0.09	0.5	0.0	0.47	0.46
Transcript_contig_10489 (10489)	0.63	0.93	0.14	0.46	0.28	0.31	0.15	1.0	0.0	1.0	0.46
Transcript_contig_1299 (1299)	0.5	0.76	0.22	0.25	0.18	0.41	0.28	0.44	0.2	1.0	0.56
Transcript_contig_14265 (14265)	0.68	1.0	0.16	0.2	0.32	0.63	0.19	0.78	0.25	0.71	0.42
Transcript_contig_1536 (1536)	0.5	0.62	0.16	0.2	0.3	0.32	0.31	0.6	0.06	1.0	0.49
Transcript_contig_1646 (1646)	0.7	0.77	0.42	0.38	0.56	0.44	0.38	0.68	0.39	1.0	0.67
Transcript_contig_16703 (16703)	0.44	0.46	0.17	0.12	0.25	0.35	0.21	0.39	0.03	1.0	0.68
Transcript_contig_1684 (1684)	0.84	0.97	0.49	0.62	0.71	0.69	0.54	1.0	0.57	0.91	0.57
Transcript_contig_1690 (1690)	0.34	0.51	0.04	0.11	0.18	0.45	0.1	0.6	0.16	1.0	0.41
Transcript_contig_1817 (1817)	0.56	1.0	0.13	0.17	0.25	0.49	0.18	0.97	0.01	0.57	0.31
Transcript_contig_1877 (1877)	0.53	1.0	0.01	0.03	0.05	0.38	0.05	1.0	0.03	0.91	0.23
Transcript_contig_1972 (1972)	0.28	0.44	0.16	0.18	0.2	0.46	0.13	0.33	0.01	1.0	0.61
Transcript_contig_19806 (19806)	0.59	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.73
Transcript_contig_21307 (21307)	0.26	0.3	0.3	0.39	0.43	0.31	0.44	0.18	0.26	1.0	0.4
Transcript_contig_2183 (2183)	0.59	0.85	0.21	0.29	0.45	0.6	0.26	1.0	0.14	0.52	0.33
Transcript_contig_22439 (22439)	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.46	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_2331 (2331)	0.76	1.0	0.1	0.27	0.44	0.37	0.26	0.96	0.14	0.72	0.51
Transcript_contig_2479 (2479)	0.67	1.0	0.17	0.27	0.5	0.39	0.35	0.46	0.47	0.94	0.51
Transcript_contig_2674 (2674)	0.74	0.95	0.06	0.35	0.32	0.45	0.21	0.8	0.0	1.0	0.6
Transcript_contig_2820 (2820)	0.36	0.52	0.18	0.14	0.33	0.11	0.47	0.62	0.04	1.0	0.48
Transcript_contig_2923 (2923)	0.6	1.0	0.26	0.12	0.15	0.42	0.31	0.35	0.03	0.63	0.33
Transcript_contig_3058 (3058)	0.79	1.0	0.28	0.38	0.31	0.48	0.32	0.53	0.23	0.89	0.44
Transcript_contig_3383 (3383)	0.42	0.51	0.12	0.11	0.08	0.79	0.13	0.15	0.15	1.0	0.61
Transcript_contig_3528 (3528)	0.91	0.81	0.19	0.11	0.78	0.65	0.15	0.71	0.65	1.0	0.36
Transcript_contig_3935 (3935)	0.74	1.0	0.0	0.01	0.05	0.42	0.02	0.48	0.0	0.78	0.49
Transcript_contig_4774 (4774)	0.38	0.69	0.03	0.02	0.04	0.71	0.06	1.0	0.45	0.65	0.56
Transcript_contig_5274 (5274)	0.59	1.0	0.11	0.15	0.17	0.5	0.23	0.42	0.06	1.0	0.51
Transcript_contig_54106 (54106)	0.75	1.0	0.07	0.16	0.18	0.65	0.56	0.58	0.05	0.97	0.41
Transcript_contig_54490 (54490)	0.7	1.0	0.36	0.51	0.49	0.71	0.46	0.63	0.12	0.79	0.36
Transcript_contig_5488 (5488)	0.54	1.0	0.1	0.23	0.12	0.41	0.12	0.82	0.03	0.62	0.31
Transcript_contig_54889 (54889)	0.66	0.72	0.26	0.3	0.35	0.51	0.36	0.3	0.06	1.0	0.5
Transcript_contig_54896 (54896)	0.57	0.62	0.1	0.34	0.28	0.6	0.29	0.24	0.15	1.0	0.56
Transcript_contig_54930 (54930)	0.74	0.75	0.05	0.04	0.1	0.14	0.06	0.11	0.01	1.0	0.57
Transcript_contig_56000 (56000)	0.54	0.68	0.22	0.23	0.25	0.42	0.18	0.52	0.22	1.0	0.66
Transcript_contig_56165 (56165)	0.4	0.46	0.05	0.07	0.08	0.57	0.06	0.29	0.16	1.0	0.51
Transcript_contig_56628 (56628)	0.44	0.68	0.19	0.17	0.28	0.28	0.11	0.57	0.24	1.0	0.65
Transcript_contig_56678 (56678)	0.65	0.85	0.19	0.27	0.5	0.58	0.36	0.73	0.03	1.0	0.29
Transcript_contig_57149 (57149)	0.74	0.74	0.13	0.35	0.52	0.52	0.38	0.37	0.25	1.0	0.64
Transcript_contig_57672 (57672)	0.6	0.88	0.13	0.29	0.29	0.38	0.15	0.95	0.14	1.0	0.5
Transcript_contig_57740 (57740)	0.64	0.84	0.36	0.23	0.37	0.3	0.32	0.38	0.05	1.0	0.7
Transcript_contig_5835 (5835)	0.55	0.78	0.12	0.14	0.19	0.39	0.19	1.0	0.06	0.72	0.47
Transcript_contig_58485 (58485)	0.82	1.0	0.28	0.17	0.14	0.59	0.33	0.42	0.09	0.98	0.67
Transcript_contig_58638 (58638)	0.37	0.24	0.21	0.2	0.0	0.2	0.17	0.21	0.0	1.0	0.84
Transcript_contig_59043 (59043)	0.23	0.44	0.02	0.1	0.14	0.52	0.12	0.18	0.02	1.0	0.45
Transcript_contig_59306 (59306)	0.49	0.81	0.16	0.26	0.37	0.52	0.17	1.0	0.09	0.96	0.6
Transcript_contig_59845 (59845)	0.72	0.93	0.06	0.32	0.41	0.49	0.11	0.39	0.06	1.0	0.6
Transcript_contig_60136 (60136)	0.65	1.0	0.09	0.3	0.25	0.71	0.32	0.99	0.14	0.69	0.41
Transcript_contig_60326 (60326)	0.39	0.62	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	1.0	0.02	0.64	0.11
Transcript_contig_61592 (61592)	0.3	0.39	0.08	0.19	0.29	0.42	0.09	0.6	0.34	1.0	0.67
Transcript_contig_61895 (61895)	0.54	0.77	0.17	0.3	0.4	0.37	0.18	0.69	0.48	1.0	0.56
Transcript_contig_61909 (61909)	0.72	1.0	0.32	0.52	0.7	0.42	0.31	0.75	0.45	0.95	0.58
Transcript_contig_62142 (62142)	0.57	0.87	0.12	0.21	0.27	0.51	0.22	1.0	0.02	0.69	0.41
Transcript_contig_62961 (62961)	0.46	0.72	0.2	0.16	0.3	0.42	0.37	0.96	0.06	1.0	0.61
Transcript_contig_63046 (63046)	0.53	0.49	0.1	0.01	0.04	0.1	0.06	0.26	0.04	1.0	0.28
Transcript_contig_64036 (64036)	0.76	0.69	0.0	0.26	0.0	0.2	0.27	0.74	0.99	1.0	0.0
Transcript_contig_64149 (64149)	0.42	0.81	0.19	0.36	0.21	0.26	0.17	0.19	0.21	1.0	0.43
Transcript_contig_65926 (65926)	0.25	0.55	0.02	0.01	0.01	0.16	0.05	0.56	0.04	1.0	0.26
Transcript_contig_66204 (66204)	0.46	0.65	0.24	0.26	0.45	0.52	0.36	0.82	0.21	1.0	0.53
Transcript_contig_6759 (6759)	0.43	0.65	0.26	0.24	0.44	0.3	0.24	0.48	0.07	1.0	0.7
Transcript_contig_67971 (67971)	0.59	0.86	0.21	0.18	0.23	0.41	0.24	0.96	0.12	1.0	0.43
Transcript_contig_68023 (68023)	0.28	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.85
Transcript_contig_68179 (68179)	0.56	0.54	0.22	0.13	0.07	0.07	0.08	0.28	0.04	1.0	0.5
Transcript_contig_68317 (68317)	0.42	0.49	0.09	0.16	0.17	0.52	0.18	0.1	0.06	1.0	0.62
Transcript_contig_68642 (68642)	0.55	0.63	0.01	0.09	0.06	0.28	0.03	0.18	0.0	1.0	0.79
Transcript_contig_6901 (6901)	0.75	1.0	0.39	0.56	0.51	0.68	0.43	0.26	0.23	0.71	0.45
Transcript_contig_69042 (69042)	0.6	0.68	0.31	0.13	0.1	0.98	0.5	0.36	0.0	1.0	0.67
Transcript_contig_69287 (69287)	0.53	0.84	0.06	0.15	0.35	0.31	0.11	0.71	0.39	1.0	0.52
Transcript_contig_69726 (69726)	0.48	0.56	0.0	0.0	0.0	0.46	0.01	0.68	0.07	1.0	0.39
Transcript_contig_69871 (69871)	0.57	0.69	0.12	0.41	0.52	0.53	0.29	0.71	0.31	1.0	0.59
Transcript_contig_70151 (70151)	0.21	0.36	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.21	0.68	1.0	0.55
Transcript_contig_7019 (7019)	0.65	0.46	0.15	0.21	0.49	0.67	0.29	0.53	0.16	1.0	0.5
Transcript_contig_70450 (70450)	0.4	0.78	0.0	0.0	0.0	0.74	0.0	0.83	0.0	1.0	0.6
Transcript_contig_71961 (71961)	0.85	1.0	0.2	0.47	0.65	0.49	0.36	0.61	0.28	0.79	0.6
Transcript_contig_72 (72)	0.51	0.84	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.97	0.45
Transcript_contig_72140 (72140)	0.55	1.0	0.02	0.17	0.3	0.58	0.2	0.57	0.06	0.65	0.28
Transcript_contig_73089 (73089)	0.99	0.6	0.49	0.12	0.0	0.0	0.0	0.66	0.22	1.0	0.09
Transcript_contig_74467 (74467)	0.25	0.34	0.12	0.33	0.23	0.14	0.26	0.55	0.05	1.0	0.37
Transcript_contig_7466 (7466)	0.24	0.33	0.09	0.13	0.23	0.27	0.11	0.3	0.49	1.0	0.7
Transcript_contig_78067 (78067)	0.14	0.41	0.02	0.05	0.2	0.18	0.03	0.59	0.08	1.0	0.36
Transcript_contig_78351 (78351)	0.67	1.0	0.13	0.2	0.41	0.22	0.18	0.98	0.06	0.97	0.64
Transcript_contig_78447 (78447)	0.42	0.71	0.07	0.13	0.04	0.43	0.11	0.36	0.07	1.0	0.55
Transcript_contig_78563 (78563)	0.61	0.67	0.24	0.29	0.3	0.35	0.25	0.22	0.14	1.0	0.48
Transcript_contig_7862 (7862)	0.64	0.77	0.17	0.23	0.44	0.63	0.31	0.48	0.23	1.0	0.42
Transcript_contig_79169 (79169)	0.37	0.28	0.0	0.03	0.08	0.57	0.12	0.18	0.0	1.0	0.28
Transcript_contig_79209 (79209)	0.4	0.65	0.05	0.01	0.15	0.16	0.06	0.29	0.0	1.0	0.61
Transcript_contig_79594 (79594)	0.47	0.6	0.1	0.16	0.17	0.62	0.38	0.55	0.24	1.0	0.49
Transcript_contig_80346 (80346)	0.56	0.64	0.22	0.32	0.46	0.56	0.39	0.14	0.02	1.0	0.84
Transcript_contig_810 (810)	0.35	0.39	0.15	0.13	0.06	0.08	0.09	0.24	0.04	1.0	0.2
Transcript_contig_8117 (8117)	0.61	0.83	0.13	0.25	0.39	0.44	0.38	1.0	0.02	0.93	0.47
Transcript_contig_81931 (81931)	0.58	0.65	0.08	0.07	0.09	0.71	0.16	0.31	0.34	1.0	0.46
Transcript_contig_82235 (82235)	0.54	0.68	0.43	0.33	0.07	0.34	0.36	0.27	0.02	1.0	0.38
Transcript_contig_82236 (82236)	0.38	0.57	0.1	0.22	0.3	0.43	0.24	0.66	0.05	1.0	0.44
Transcript_contig_82455 (82455)	0.35	0.44	0.02	0.01	0.13	0.52	0.06	0.19	0.06	1.0	0.41
Transcript_contig_82838 (82838)	0.64	0.67	0.03	0.28	0.16	0.17	0.43	1.0	0.0	1.0	0.37
Transcript_contig_82972 (82972)	0.64	1.0	0.0	0.08	0.35	0.4	0.11	0.31	0.02	0.97	0.61
Transcript_contig_83431 (83431)	0.39	0.66	0.08	0.1	0.09	0.17	0.11	1.0	0.08	0.7	0.26
Transcript_contig_83650 (83650)	0.48	1.0	0.34	0.35	0.55	0.18	0.5	0.77	0.0	0.99	0.45
Transcript_contig_83973 (83973)	0.75	0.72	0.11	0.27	0.11	0.35	0.15	0.03	0.13	1.0	0.36
Transcript_contig_84938 (84938)	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.24
Transcript_contig_85224 (85224)	1.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.43	0.0
Transcript_contig_8524 (8524)	0.64	1.0	0.12	0.27	0.7	0.49	0.09	0.61	0.01	0.69	0.48
Transcript_contig_8564 (8564)	0.52	0.62	0.16	0.17	0.27	0.73	0.2	1.0	0.0	0.81	0.37
Transcript_contig_89512 (89512)	0.7	1.0	0.42	0.43	0.29	0.47	0.39	0.87	0.17	0.94	0.59
Transcript_contig_90043 (90043)	0.69	1.0	0.23	0.36	0.49	0.7	0.47	0.98	0.03	0.83	0.63
Transcript_contig_90312 (90312)	0.44	0.73	0.36	0.72	0.63	0.26	0.42	0.89	0.0	1.0	0.41
Transcript_contig_904 (904)	0.77	1.0	0.05	0.09	0.1	0.39	0.21	0.46	0.09	0.96	0.36
Transcript_contig_90514 (90514)	0.73	1.0	0.24	0.39	0.5	0.81	0.47	0.26	0.25	0.84	0.35
Transcript_contig_907 (907)	0.62	0.73	0.46	0.43	0.43	0.7	0.37	0.95	0.31	1.0	0.56
Transcript_contig_90830 (90830)	0.31	0.5	0.06	0.04	0.06	0.1	0.01	0.41	0.16	1.0	0.4
Transcript_contig_90974 (90974)	0.68	0.99	0.39	0.22	0.51	0.51	0.32	1.0	0.35	0.38	0.48

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)