Heatmap: Cluster_39 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11039 (11039)	0.27	0.0	0.0	0.09	0.0	0.53	1.0	0.0	0.33	0.26	0.22
Transcript_contig_12261 (12261)	0.36	0.0	1.0	0.17	0.11	0.39	0.98	0.0	0.77	0.13	0.15
Transcript_contig_1525 (1525)	0.39	0.22	0.46	0.27	0.15	0.55	1.0	0.08	0.98	0.4	0.35
Transcript_contig_1941 (1941)	0.29	0.27	0.45	0.29	0.07	0.19	0.27	0.15	1.0	0.39	0.31
Transcript_contig_2597 (2597)	0.5	0.53	0.54	0.57	0.48	0.53	1.0	0.58	0.85	0.41	0.38
Transcript_contig_2791 (2791)	0.2	0.01	0.89	0.43	0.05	0.35	0.17	0.0	1.0	0.1	0.31
Transcript_contig_2873 (2873)	0.6	0.5	0.97	1.0	0.33	0.39	0.87	0.46	0.45	0.52	0.56
Transcript_contig_2992 (2992)	0.33	0.56	1.0	0.31	0.0	0.1	0.27	0.74	0.0	0.39	0.3
Transcript_contig_3611 (3611)	0.38	0.26	1.0	0.5	0.06	0.09	0.26	0.21	0.23	0.41	0.35
Transcript_contig_4047 (4047)	0.44	0.43	0.95	0.45	0.03	0.21	0.35	0.22	1.0	0.5	0.49
Transcript_contig_4437 (4437)	0.36	0.14	1.0	0.56	0.51	0.48	0.59	0.22	0.15	0.5	0.47
Transcript_contig_4762 (4762)	0.27	0.07	0.86	0.36	0.05	0.12	0.53	0.03	1.0	0.25	0.19
Transcript_contig_4770 (4770)	0.36	0.0	0.7	1.0	0.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.93	0.19
Transcript_contig_4829 (4829)	0.94	0.71	0.9	0.54	0.34	0.3	0.8	0.54	1.0	0.97	0.85
Transcript_contig_53743 (53743)	0.56	0.49	0.52	0.42	0.71	0.48	1.0	0.63	0.77	0.6	0.51
Transcript_contig_53907 (53907)	0.67	0.62	0.69	0.5	0.26	0.49	0.68	0.51	0.42	1.0	0.58
Transcript_contig_53936 (53936)	0.55	0.43	0.46	0.37	0.44	0.56	1.0	0.41	0.88	0.45	0.39
Transcript_contig_54156 (54156)	0.36	0.26	0.38	0.44	0.39	0.61	1.0	0.14	0.56	0.36	0.4
Transcript_contig_54194 (54194)	0.54	0.43	0.31	0.23	0.47	0.43	0.88	0.6	1.0	0.71	0.51
Transcript_contig_54227 (54227)	0.42	0.32	0.43	0.34	0.29	0.53	1.0	0.19	0.85	0.41	0.32
Transcript_contig_54273 (54273)	0.65	0.57	0.25	0.55	0.68	0.44	1.0	0.61	0.87	0.64	0.45
Transcript_contig_54373 (54373)	0.13	0.0	0.81	0.61	0.01	0.18	0.05	0.01	1.0	0.34	0.23
Transcript_contig_54395 (54395)	0.34	0.3	1.0	0.74	0.1	0.21	0.45	0.57	0.74	0.39	0.34
Transcript_contig_54551 (54551)	0.61	0.43	1.0	0.7	0.52	0.33	0.55	0.4	0.95	0.5	0.48
Transcript_contig_54671 (54671)	0.51	0.35	0.69	0.37	0.12	0.21	0.36	0.21	1.0	0.41	0.48
Transcript_contig_54674 (54674)	0.63	0.41	1.0	0.56	0.23	0.35	0.62	0.17	0.57	0.81	0.62
Transcript_contig_54820 (54820)	0.41	0.34	0.46	0.49	0.59	0.47	1.0	0.36	0.52	0.24	0.23
Transcript_contig_54926 (54926)	0.42	0.32	0.33	0.2	0.33	0.48	0.91	0.4	1.0	0.43	0.42
Transcript_contig_55058 (55058)	0.34	0.31	0.21	0.16	0.2	0.6	1.0	0.43	0.77	0.54	0.46
Transcript_contig_55089 (55089)	0.44	0.38	1.0	0.78	0.45	0.27	0.6	0.29	0.58	0.19	0.21
Transcript_contig_55096 (55096)	0.88	0.9	0.45	0.66	0.87	0.67	0.97	0.98	1.0	0.74	0.69
Transcript_contig_55146 (55146)	0.41	0.31	0.47	0.36	0.32	0.48	0.52	0.24	1.0	0.37	0.3
Transcript_contig_55205 (55205)	0.45	0.33	0.44	0.25	0.17	0.42	0.74	0.22	1.0	0.45	0.4
Transcript_contig_55581 (55581)	0.62	0.47	0.8	0.38	0.16	0.44	0.83	0.41	1.0	0.55	0.51
Transcript_contig_55669 (55669)	0.65	0.55	0.91	0.52	0.41	0.57	0.94	0.4	1.0	0.55	0.56
Transcript_contig_55896 (55896)	0.26	0.24	0.34	0.18	0.07	0.1	0.2	0.15	1.0	0.09	0.11
Transcript_contig_56150 (56150)	0.41	0.37	0.34	0.29	0.38	0.45	0.85	0.34	1.0	0.65	0.53
Transcript_contig_56178 (56178)	0.64	0.51	0.37	0.19	0.1	0.46	0.91	0.32	1.0	0.35	0.38
Transcript_contig_56192 (56192)	0.61	0.34	1.0	0.62	0.69	0.38	0.81	0.38	0.86	0.62	0.53
Transcript_contig_56239 (56239)	0.61	0.45	1.0	0.83	0.66	0.43	0.88	0.34	0.67	0.84	0.59
Transcript_contig_56242 (56242)	0.22	0.23	0.25	0.17	0.31	0.57	1.0	0.4	0.76	0.47	0.43
Transcript_contig_56295 (56295)	0.86	0.79	1.0	0.62	0.58	0.43	0.89	0.94	0.92	0.76	0.69
Transcript_contig_56317 (56317)	0.22	0.08	1.0	0.42	0.01	0.1	0.21	0.07	0.53	0.25	0.27
Transcript_contig_56453 (56453)	0.86	0.78	0.89	0.64	0.52	0.5	1.0	0.35	0.34	0.9	0.53
Transcript_contig_56521 (56521)	0.11	0.0	0.42	0.23	0.01	0.05	0.04	0.0	1.0	0.24	0.16
Transcript_contig_56558 (56558)	0.43	0.37	1.0	0.79	0.69	0.27	0.66	0.36	0.72	0.39	0.32
Transcript_contig_57032 (57032)	0.44	0.29	0.85	0.66	0.48	0.3	0.67	0.2	1.0	0.37	0.35
Transcript_contig_57161 (57161)	0.4	0.25	0.29	0.19	0.16	0.26	0.74	0.21	1.0	0.24	0.24
Transcript_contig_57198 (57198)	0.44	0.45	1.0	0.65	0.66	0.35	0.5	0.58	0.34	0.46	0.45
Transcript_contig_57281 (57281)	0.66	0.48	1.0	0.85	0.41	0.37	0.77	0.24	0.76	0.55	0.46
Transcript_contig_57351 (57351)	0.65	0.43	0.42	0.35	0.54	0.58	1.0	0.33	0.94	0.51	0.44
Transcript_contig_58274 (58274)	0.45	0.31	0.93	0.52	0.24	0.22	0.34	0.17	1.0	0.55	0.46
Transcript_contig_58803 (58803)	0.3	0.18	0.44	0.26	0.11	0.18	0.34	0.13	1.0	0.26	0.28
Transcript_contig_58804 (58804)	0.32	0.12	1.0	0.45	0.01	0.14	0.37	0.11	0.97	0.25	0.27
Transcript_contig_58883 (58883)	0.59	0.18	0.97	0.78	0.65	0.63	1.0	0.14	0.25	0.51	0.75
Transcript_contig_59126 (59126)	0.42	0.26	0.31	0.31	0.38	0.36	1.0	0.28	0.11	0.37	0.25
Transcript_contig_59374 (59374)	0.75	0.55	1.0	0.61	0.42	0.23	0.61	0.47	0.63	0.42	0.36
Transcript_contig_59572 (59572)	0.74	0.71	0.55	0.66	0.56	0.4	1.0	0.37	0.23	0.56	0.47
Transcript_contig_59780 (59780)	0.17	0.05	1.0	0.34	0.29	0.18	0.64	0.07	0.65	0.17	0.13
Transcript_contig_59907 (59907)	0.52	0.26	1.0	0.47	0.03	0.11	0.25	0.16	0.35	0.76	0.64
Transcript_contig_60029 (60029)	0.26	0.3	0.52	0.21	0.02	0.06	0.08	0.31	1.0	0.29	0.29
Transcript_contig_60130 (60130)	0.62	0.76	0.3	0.42	0.35	0.28	0.78	0.47	1.0	0.42	0.31
Transcript_contig_60261 (60261)	0.18	0.21	0.43	0.12	0.0	0.1	0.08	0.14	1.0	0.2	0.21
Transcript_contig_60284 (60284)	0.28	0.21	1.0	0.56	0.11	0.19	0.47	0.21	0.57	0.25	0.3
Transcript_contig_60447 (60447)	0.41	0.13	1.0	0.46	0.01	0.16	0.27	0.15	0.79	0.45	0.47
Transcript_contig_60539 (60539)	0.55	0.31	1.0	0.57	0.46	0.35	0.88	0.27	0.44	0.53	0.56
Transcript_contig_60578 (60578)	0.75	0.63	0.35	0.34	0.45	0.47	1.0	0.72	0.22	0.52	0.57
Transcript_contig_60804 (60804)	0.13	0.0	0.18	0.12	0.02	0.06	0.14	0.0	1.0	0.42	0.23
Transcript_contig_61277 (61277)	0.41	0.27	1.0	0.52	0.21	0.21	0.56	0.27	0.0	0.32	0.32
Transcript_contig_61330 (61330)	0.7	0.45	0.86	0.55	0.51	0.5	1.0	0.3	0.09	0.53	0.56
Transcript_contig_61371 (61371)	0.65	0.37	1.0	0.47	0.24	0.26	0.5	0.19	0.37	0.63	0.49
Transcript_contig_61395 (61395)	0.41	0.32	0.9	0.6	0.16	0.29	0.56	0.04	1.0	0.4	0.26
Transcript_contig_61486 (61486)	0.29	0.05	0.69	0.26	0.15	0.29	0.45	0.0	1.0	0.24	0.27
Transcript_contig_61832 (61832)	0.45	0.54	1.0	0.62	0.07	0.17	0.43	0.92	0.37	0.29	0.23
Transcript_contig_62242 (62242)	0.69	0.49	1.0	0.52	0.04	0.26	0.54	0.55	0.85	0.99	0.81
Transcript_contig_62319 (62319)	0.61	0.7	0.64	0.37	0.09	0.15	0.21	0.81	0.26	1.0	0.63
Transcript_contig_62608 (62608)	0.77	0.69	0.9	0.75	1.0	0.42	0.85	0.84	0.94	0.71	0.76
Transcript_contig_6481 (6481)	0.44	0.46	0.5	0.46	0.6	0.58	1.0	0.34	0.71	0.5	0.29
Transcript_contig_6549 (6549)	0.41	0.22	0.68	0.55	0.58	0.27	0.56	0.22	1.0	0.45	0.33
Transcript_contig_66175 (66175)	0.13	0.0	1.0	0.26	0.0	0.05	0.07	0.0	0.0	0.14	0.13
Transcript_contig_66221 (66221)	0.99	0.57	1.0	0.56	0.5	0.19	0.6	0.25	0.52	0.8	0.71
Transcript_contig_67870 (67870)	0.33	0.16	0.81	0.59	0.25	0.28	0.73	0.04	1.0	0.54	0.42
Transcript_contig_69204 (69204)	0.43	0.36	1.0	0.72	0.45	0.3	0.6	0.29	0.41	0.24	0.23
Transcript_contig_69229 (69229)	0.29	0.08	1.0	0.48	0.24	0.23	0.8	0.08	0.41	0.22	0.29
Transcript_contig_70680 (70680)	0.19	0.11	0.2	0.25	0.14	0.15	0.28	0.08	1.0	0.36	0.29
Transcript_contig_78194 (78194)	0.61	0.51	1.0	0.61	0.17	0.32	0.5	0.32	0.72	0.47	0.4
Transcript_contig_78338 (78338)	0.45	0.34	0.93	0.82	0.66	0.27	0.65	0.39	1.0	0.44	0.3
Transcript_contig_78340 (78340)	0.45	0.23	1.0	0.78	0.5	0.29	0.76	0.15	0.9	0.41	0.35
Transcript_contig_78588 (78588)	0.39	0.27	1.0	0.58	0.15	0.19	0.39	0.4	0.31	0.39	0.35
Transcript_contig_78768 (78768)	0.85	0.51	0.99	0.54	0.34	0.55	1.0	0.43	0.58	0.85	0.73
Transcript_contig_78945 (78945)	0.77	0.68	1.0	0.89	0.55	0.24	0.64	0.7	0.3	0.6	0.46
Transcript_contig_79074 (79074)	0.45	0.33	0.38	0.31	0.18	0.62	0.95	0.33	1.0	0.49	0.57
Transcript_contig_79147 (79147)	0.38	0.27	0.28	0.22	0.31	0.64	1.0	0.23	0.76	0.4	0.45
Transcript_contig_79308 (79308)	0.31	0.01	1.0	0.34	0.08	0.26	0.66	0.0	0.54	0.26	0.18
Transcript_contig_79447 (79447)	0.39	0.36	1.0	0.51	0.48	0.44	0.47	0.14	0.88	0.54	0.55
Transcript_contig_7990 (7990)	0.14	0.12	0.2	0.1	0.02	0.08	0.1	0.02	1.0	0.07	0.06
Transcript_contig_80385 (80385)	0.25	0.0	0.64	0.36	0.16	0.55	1.0	0.0	0.0	0.6	0.38
Transcript_contig_804 (804)	0.4	0.06	0.42	0.46	0.52	0.48	1.0	0.05	0.0	0.47	0.63
Transcript_contig_81985 (81985)	0.65	0.54	0.51	0.34	0.31	0.6	1.0	0.54	0.78	0.72	0.68
Transcript_contig_82773 (82773)	0.43	0.0	1.0	0.93	0.0	0.0	0.31	0.0	0.52	0.45	0.32
Transcript_contig_8293 (8293)	0.47	0.4	0.51	0.27	0.51	0.49	1.0	0.34	0.41	0.37	0.34
Transcript_contig_83159 (83159)	0.3	0.4	1.0	0.37	0.03	0.23	0.39	0.22	0.85	0.06	0.13
Transcript_contig_89124 (89124)	0.62	0.59	0.55	0.43	0.48	0.36	1.0	0.56	0.52	0.4	0.32
Transcript_contig_89194 (89194)	0.72	0.73	0.59	0.66	0.86	0.48	1.0	0.91	0.69	0.54	0.41
Transcript_contig_89801 (89801)	0.4	0.43	0.53	0.49	0.6	0.47	1.0	0.31	0.18	0.18	0.2
Transcript_contig_89927 (89927)	0.14	0.01	0.64	0.39	0.03	0.08	0.2	0.01	1.0	0.19	0.18
Transcript_contig_89985 (89985)	0.25	0.21	0.63	0.33	0.09	0.17	0.34	0.13	1.0	0.14	0.18
Transcript_contig_90189 (90189)	0.43	0.38	0.97	0.52	0.11	0.3	0.5	0.53	1.0	0.3	0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)