Heatmap: Cluster_133 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_12823 (12823)	0.07	0.07	0.38	0.87	1.0	0.13	0.44	0.03	0.01	0.03	0.05
Transcript_contig_1480 (1480)	0.12	0.02	0.49	1.0	0.82	0.28	0.71	0.01	0.0	0.02	0.02
Transcript_contig_30374 (30374)	0.04	0.0	0.36	1.0	0.32	0.28	0.48	0.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_3709 (3709)	0.19	0.1	0.3	1.0	1.0	0.45	0.84	0.15	0.09	0.3	0.22
Transcript_contig_3747 (3747)	0.08	0.0	0.2	0.71	1.0	0.2	0.36	0.0	0.0	0.01	0.02
Transcript_contig_54546 (54546)	0.14	0.0	0.59	1.0	0.72	0.58	0.71	0.0	0.05	0.23	0.15
Transcript_contig_54652 (54652)	0.15	0.1	0.3	0.75	1.0	0.33	0.54	0.08	0.2	0.19	0.13
Transcript_contig_55504 (55504)	0.31	0.23	0.25	0.89	1.0	0.33	0.53	0.22	0.34	0.49	0.33
Transcript_contig_55534 (55534)	0.26	0.12	0.26	1.0	0.87	0.38	0.75	0.18	0.04	0.32	0.19
Transcript_contig_55943 (55943)	0.06	0.04	0.32	0.76	1.0	0.25	0.52	0.04	0.0	0.03	0.02
Transcript_contig_56716 (56716)	0.24	0.21	0.25	1.0	0.76	0.31	0.54	0.14	0.09	0.25	0.18
Transcript_contig_56955 (56955)	0.18	0.0	0.28	1.0	0.84	0.16	0.48	0.0	0.02	0.15	0.1
Transcript_contig_57038 (57038)	0.09	0.0	0.62	0.53	1.0	0.15	0.37	0.0	0.0	0.07	0.03
Transcript_contig_57714 (57714)	0.14	0.05	0.39	1.0	0.7	0.35	0.51	0.01	0.04	0.22	0.18
Transcript_contig_58875 (58875)	0.0	0.0	0.58	1.0	0.75	0.22	0.59	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_58902 (58902)	0.18	0.02	0.33	1.0	0.87	0.44	0.94	0.01	0.0	0.02	0.06
Transcript_contig_59030 (59030)	0.19	0.0	0.31	1.0	0.96	0.18	0.57	0.01	0.07	0.32	0.23
Transcript_contig_59367 (59367)	0.29	0.23	0.24	1.0	0.95	0.36	0.58	0.14	0.03	0.29	0.27
Transcript_contig_60304 (60304)	0.17	0.14	0.3	1.0	0.98	0.38	0.51	0.13	0.03	0.17	0.13
Transcript_contig_60656 (60656)	0.05	0.04	0.34	0.95	1.0	0.21	0.78	0.0	0.0	0.18	0.2
Transcript_contig_60805 (60805)	0.15	0.01	0.27	0.8	0.75	0.41	1.0	0.01	0.0	0.11	0.16
Transcript_contig_61527 (61527)	0.13	0.0	0.73	0.8	1.0	0.12	0.46	0.0	0.0	0.02	0.02
Transcript_contig_61946 (61946)	0.09	0.14	0.65	1.0	0.86	0.43	0.43	0.07	0.1	0.13	0.17
Transcript_contig_61948 (61948)	0.13	0.02	0.51	0.94	1.0	0.51	0.8	0.01	0.17	0.02	0.09
Transcript_contig_63481 (63481)	0.0	0.0	0.55	1.0	0.38	0.28	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_63545 (63545)	0.16	0.0	0.35	1.0	0.88	0.39	0.9	0.01	0.02	0.02	0.1
Transcript_contig_63612 (63612)	0.3	0.16	0.56	1.0	0.56	0.24	0.9	0.0	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_66410 (66410)	0.23	0.01	0.2	0.79	0.72	0.39	1.0	0.0	0.02	0.13	0.13
Transcript_contig_67524 (67524)	0.14	0.01	0.26	1.0	0.72	0.19	0.54	0.01	0.0	0.05	0.06
Transcript_contig_69120 (69120)	0.07	0.01	0.56	1.0	0.96	0.07	0.43	0.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_69592 (69592)	0.26	0.02	0.21	0.77	0.81	0.47	1.0	0.01	0.33	0.39	0.25
Transcript_contig_69598 (69598)	0.11	0.0	0.22	1.0	0.69	0.32	0.69	0.0	0.0	0.08	0.09
Transcript_contig_69697 (69697)	0.22	0.02	0.29	1.0	0.82	0.44	0.73	0.0	0.01	0.24	0.2
Transcript_contig_71607 (71607)	0.15	0.0	0.58	0.99	1.0	0.11	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_73317 (73317)	0.15	0.0	0.08	1.0	0.97	0.24	0.71	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_7411 (7411)	0.17	0.0	0.39	1.0	0.84	0.34	0.93	0.0	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_79451 (79451)	0.25	0.13	0.34	1.0	0.69	0.37	0.44	0.24	0.39	0.55	0.5
Transcript_contig_79552 (79552)	0.1	0.01	0.65	1.0	0.92	0.35	0.64	0.0	0.06	0.02	0.17
Transcript_contig_7981 (7981)	0.24	0.08	0.43	1.0	0.8	0.3	0.65	0.02	0.07	0.27	0.22
Transcript_contig_80163 (80163)	0.02	0.0	0.35	1.0	0.79	0.17	0.4	0.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_80347 (80347)	0.08	0.03	0.42	0.89	1.0	0.39	0.62	0.02	0.08	0.0	0.05
Transcript_contig_80437 (80437)	0.27	0.0	0.17	1.0	0.84	0.2	0.94	0.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_80615 (80615)	0.04	0.0	0.47	1.0	0.79	0.45	0.5	0.0	0.59	0.0	0.04
Transcript_contig_80684 (80684)	0.06	0.0	0.53	1.0	0.54	0.14	0.33	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_81039 (81039)	0.13	0.0	0.41	0.94	1.0	0.31	0.65	0.0	0.0	0.0	0.17
Transcript_contig_82512 (82512)	0.21	0.11	0.23	1.0	0.81	0.13	0.58	0.04	0.0	0.06	0.04
Transcript_contig_89141 (89141)	0.38	0.15	0.44	1.0	0.82	0.39	0.78	0.19	0.22	0.39	0.39
Transcript_contig_89957 (89957)	0.43	0.38	0.35	1.0	0.82	0.5	0.66	0.39	0.37	0.59	0.5
Transcript_contig_89992 (89992)	0.24	0.05	0.35	1.0	0.57	0.35	0.49	0.07	0.48	0.58	0.48
Transcript_contig_90044 (90044)	0.03	0.0	0.93	1.0	0.93	0.06	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_90404 (90404)	0.13	0.03	0.36	0.74	1.0	0.31	0.43	0.03	0.03	0.02	0.03
Transcript_contig_90854 (90854)	0.18	0.0	0.35	1.0	0.73	0.13	0.51	0.02	0.02	0.19	0.1
Transcript_contig_90905 (90905)	0.29	0.0	0.2	1.0	0.55	0.3	0.66	0.0	0.0	0.27	0.17
Transcript_contig_9655 (9655)	0.26	0.0	0.19	0.69	1.0	0.43	0.55	0.0	0.13	0.63	0.66

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)