Heatmap: Cluster_124 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10143 (10143)	0.0	0.0	0.2	0.74	0.4	1.0	0.15	0.0	0.42	0.51	0.06
Transcript_contig_10712 (10712)	0.23	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.08	0.82	0.46
Transcript_contig_1212 (1212)	0.34	0.41	0.03	0.03	0.07	0.82	0.14	0.43	1.0	0.41	0.2
Transcript_contig_1219 (1219)	0.59	0.71	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.47	0.77	0.43	0.25
Transcript_contig_1433 (1433)	0.4	0.34	0.07	0.05	0.06	1.0	0.1	0.52	0.54	0.76	0.66
Transcript_contig_15041 (15041)	0.26	0.38	0.0	0.0	0.0	0.53	0.05	0.3	1.0	0.0	0.36
Transcript_contig_1645 (1645)	0.59	0.54	0.3	0.15	0.02	0.18	0.17	0.16	1.0	0.15	0.09
Transcript_contig_17094 (17094)	0.17	0.12	0.12	0.31	0.12	1.0	0.32	0.2	0.26	0.07	0.11
Transcript_contig_1714 (1714)	0.19	0.23	0.0	0.0	0.0	0.31	0.0	0.12	1.0	0.05	0.06
Transcript_contig_17879 (17879)	0.35	0.53	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_17990 (17990)	0.66	0.79	0.0	0.0	0.0	0.18	0.17	0.07	1.0	0.0	0.14
Transcript_contig_22325 (22325)	0.49	0.51	0.0	0.11	0.0	0.28	0.08	0.26	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_2635 (2635)	0.05	0.01	0.0	0.0	0.0	0.48	0.0	0.0	1.0	0.34	0.17
Transcript_contig_2899 (2899)	0.13	0.0	0.0	0.01	0.11	0.49	0.01	0.0	0.94	1.0	0.73
Transcript_contig_3092 (3092)	0.11	0.04	0.17	0.08	0.04	0.19	0.06	0.0	1.0	0.14	0.1
Transcript_contig_3108 (3108)	0.19	0.35	0.32	0.28	0.41	0.92	0.22	0.21	1.0	0.41	0.11
Transcript_contig_3114 (3114)	0.4	0.56	0.15	0.44	0.76	1.0	0.23	0.51	0.42	0.39	0.3
Transcript_contig_3265 (3265)	0.79	0.26	0.0	0.0	0.0	1.0	0.17	0.0	0.36	0.58	0.14
Transcript_contig_3406 (3406)	0.1	0.06	0.04	0.08	0.11	0.66	0.07	0.04	1.0	0.7	0.51
Transcript_contig_36 (36)	0.11	0.02	0.0	0.0	0.0	0.92	0.0	0.01	1.0	0.69	0.4
Transcript_contig_3624 (3624)	0.49	0.75	0.49	0.45	1.0	0.95	0.5	0.8	0.02	0.41	0.29
Transcript_contig_3778 (3778)	0.07	0.05	0.0	0.06	0.0	0.18	0.04	0.14	1.0	0.1	0.06
Transcript_contig_3858 (3858)	0.11	0.09	0.02	0.19	0.29	0.26	0.15	0.04	1.0	0.45	0.28
Transcript_contig_42129 (42129)	0.79	1.0	0.14	0.05	0.08	0.52	0.17	0.14	0.68	0.0	0.19
Transcript_contig_4612 (4612)	0.28	0.38	0.07	0.16	0.0	0.43	0.23	0.21	1.0	0.14	0.13
Transcript_contig_470 (470)	0.12	0.08	0.16	0.43	0.72	0.45	0.22	0.08	1.0	0.42	0.26
Transcript_contig_53948 (53948)	0.08	0.03	0.03	0.04	0.02	0.13	0.04	0.02	1.0	0.23	0.14
Transcript_contig_54023 (54023)	0.2	0.23	0.07	0.05	0.05	1.0	0.14	0.13	0.11	0.14	0.05
Transcript_contig_55002 (55002)	0.31	0.26	0.01	0.04	0.02	0.63	0.08	0.16	0.48	1.0	0.44
Transcript_contig_55149 (55149)	0.2	0.15	0.05	0.08	0.03	0.25	0.08	0.1	1.0	0.33	0.19
Transcript_contig_55274 (55274)	0.16	0.26	0.02	0.0	0.05	1.0	0.12	0.09	0.1	0.06	0.01
Transcript_contig_55350 (55350)	0.59	1.0	0.4	0.94	0.64	0.97	0.58	0.72	0.44	0.64	0.46
Transcript_contig_55553 (55553)	0.55	0.44	0.17	0.23	0.23	1.0	0.23	0.29	0.57	0.7	0.53
Transcript_contig_56109 (56109)	0.18	0.12	0.14	0.35	0.42	0.77	0.34	0.1	0.95	1.0	0.5
Transcript_contig_56319 (56319)	0.79	0.78	0.3	0.16	0.1	0.1	0.17	0.15	1.0	0.08	0.08
Transcript_contig_56672 (56672)	0.07	0.0	0.16	0.09	0.41	0.61	0.16	0.0	1.0	0.19	0.16
Transcript_contig_57061 (57061)	0.29	0.23	0.05	0.12	0.17	0.53	0.12	0.21	0.46	1.0	0.54
Transcript_contig_57092 (57092)	0.15	0.19	0.03	0.07	0.09	0.4	0.05	0.22	1.0	0.37	0.18
Transcript_contig_5730 (5730)	0.27	0.26	0.01	0.07	0.04	0.76	0.11	0.15	1.0	0.36	0.23
Transcript_contig_57401 (57401)	0.1	0.09	0.04	0.17	0.31	0.37	0.09	0.08	1.0	0.36	0.19
Transcript_contig_57492 (57492)	0.11	0.23	0.11	0.06	0.08	0.29	0.11	0.36	1.0	0.02	0.07
Transcript_contig_57619 (57619)	0.5	0.52	0.25	0.24	0.12	0.1	0.19	0.19	1.0	0.24	0.15
Transcript_contig_57732 (57732)	0.12	0.0	0.11	0.14	0.09	1.0	0.08	0.0	0.6	0.35	0.47
Transcript_contig_57967 (57967)	0.73	0.71	0.66	0.29	0.01	0.07	0.22	0.43	1.0	0.04	0.03
Transcript_contig_57992 (57992)	0.01	0.02	0.0	0.0	0.0	1.0	0.01	0.0	0.46	0.07	0.05
Transcript_contig_58080 (58080)	0.17	0.23	0.01	0.01	0.01	0.28	0.04	0.21	1.0	0.18	0.11
Transcript_contig_58307 (58307)	0.04	0.03	0.52	0.62	1.0	0.76	0.07	0.02	0.7	0.11	0.14
Transcript_contig_58435 (58435)	0.41	0.53	0.06	0.14	0.16	0.71	0.15	0.34	1.0	0.35	0.22
Transcript_contig_58512 (58512)	0.21	0.21	0.09	0.22	0.26	0.67	0.23	0.22	0.38	1.0	0.48
Transcript_contig_58557 (58557)	0.18	0.17	0.26	0.45	0.48	1.0	0.31	0.24	0.35	0.4	0.37
Transcript_contig_58658 (58658)	0.09	0.06	0.01	0.04	0.02	0.28	0.02	0.09	1.0	0.51	0.3
Transcript_contig_59028 (59028)	0.39	0.36	0.07	0.06	0.05	0.61	0.09	0.19	1.0	0.5	0.31
Transcript_contig_59175 (59175)	0.63	0.68	0.52	0.38	0.34	0.17	0.31	0.24	1.0	0.12	0.12
Transcript_contig_59383 (59383)	0.16	0.17	0.01	0.01	0.01	0.42	0.02	0.16	1.0	0.24	0.13
Transcript_contig_59524 (59524)	0.37	0.35	0.24	0.33	0.42	1.0	0.28	0.34	0.87	0.61	0.47
Transcript_contig_5972 (5972)	0.68	0.68	0.41	0.19	0.0	0.04	0.15	0.51	1.0	0.08	0.02
Transcript_contig_59976 (59976)	0.23	0.27	0.0	0.01	0.01	1.0	0.07	0.2	0.22	0.22	0.12
Transcript_contig_60018 (60018)	0.53	0.66	0.33	0.6	0.94	1.0	0.52	0.8	0.29	0.43	0.26
Transcript_contig_60081 (60081)	0.17	0.24	0.07	0.03	0.0	0.39	0.02	0.14	0.13	1.0	0.33
Transcript_contig_60115 (60115)	0.34	0.35	0.02	0.04	0.05	0.45	0.04	0.04	1.0	0.06	0.06
Transcript_contig_60591 (60591)	0.12	0.12	0.05	0.02	0.01	0.33	0.02	0.09	1.0	0.24	0.16
Transcript_contig_61419 (61419)	0.09	0.18	0.0	0.01	0.02	1.0	0.05	0.11	0.33	0.04	0.05
Transcript_contig_61870 (61870)	0.43	0.72	0.23	0.61	0.8	1.0	0.4	0.89	0.46	0.47	0.23
Transcript_contig_62164 (62164)	0.17	0.18	0.23	0.44	0.23	0.83	0.25	0.01	1.0	0.41	0.2
Transcript_contig_62570 (62570)	0.05	0.11	0.0	0.0	0.01	1.0	0.04	0.09	0.26	0.06	0.05
Transcript_contig_62593 (62593)	0.37	0.34	0.21	0.21	0.17	0.6	0.29	0.25	1.0	0.01	0.04
Transcript_contig_62701 (62701)	0.12	0.04	0.09	0.05	0.01	0.2	0.03	0.01	1.0	0.15	0.1
Transcript_contig_63433 (63433)	0.15	0.42	0.0	0.0	0.0	0.4	0.27	0.0	1.0	0.19	0.0
Transcript_contig_64812 (64812)	0.78	1.0	0.19	0.0	0.0	0.76	0.14	0.38	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67743 (67743)	0.12	0.04	0.09	0.06	0.05	0.47	0.1	0.05	0.97	1.0	0.46
Transcript_contig_68070 (68070)	0.23	0.18	0.05	0.05	0.07	0.21	0.16	0.14	1.0	0.2	0.2
Transcript_contig_68234 (68234)	0.36	0.41	0.02	0.02	0.01	0.27	0.03	0.28	1.0	0.25	0.13
Transcript_contig_6836 (6836)	0.26	0.24	0.35	0.4	0.62	0.7	0.33	0.32	1.0	0.43	0.28
Transcript_contig_68788 (68788)	0.4	0.51	0.52	0.71	1.0	0.69	0.62	0.75	0.18	0.09	0.12
Transcript_contig_69585 (69585)	1.0	0.97	0.01	0.02	0.01	0.85	0.03	0.77	0.04	0.56	0.42
Transcript_contig_69616 (69616)	0.76	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_71331 (71331)	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.0	0.0	1.0	0.25	0.1
Transcript_contig_72740 (72740)	0.05	0.04	0.01	0.14	0.03	1.0	0.06	0.03	0.0	0.04	0.03
Transcript_contig_7284 (7284)	0.29	0.34	0.02	0.02	0.01	1.0	0.06	0.33	0.42	0.31	0.14
Transcript_contig_73156 (73156)	0.23	0.26	0.12	0.03	0.0	0.43	0.08	0.23	1.0	0.01	0.01
Transcript_contig_7675 (7675)	0.13	0.07	0.04	0.01	0.06	0.28	0.07	0.11	1.0	0.27	0.31
Transcript_contig_78113 (78113)	0.18	0.13	0.16	0.31	0.39	1.0	0.36	0.07	0.18	0.18	0.06
Transcript_contig_78455 (78455)	0.07	0.07	0.07	0.04	0.06	1.0	0.02	0.0	0.07	0.18	0.1
Transcript_contig_78715 (78715)	0.15	0.06	0.04	0.02	0.0	0.15	0.01	0.01	1.0	0.22	0.2
Transcript_contig_78811 (78811)	0.21	0.21	0.12	0.24	0.33	1.0	0.25	0.12	0.27	0.3	0.12
Transcript_contig_78874 (78874)	0.24	0.25	0.09	0.04	0.03	0.36	0.05	0.19	1.0	0.31	0.21
Transcript_contig_78942 (78942)	0.12	0.1	0.0	0.0	0.0	0.49	0.04	0.13	0.8	1.0	0.38
Transcript_contig_79389 (79389)	0.17	0.15	0.04	0.09	0.08	0.22	0.11	0.17	1.0	0.19	0.13
Transcript_contig_79562 (79562)	0.16	0.16	0.44	0.52	0.49	1.0	0.44	0.11	0.04	0.55	0.28
Transcript_contig_79593 (79593)	0.62	1.0	0.49	0.51	0.95	0.91	0.91	0.98	0.31	0.66	0.39
Transcript_contig_79891 (79891)	0.26	0.15	0.24	0.29	0.32	0.59	0.19	0.11	1.0	0.45	0.47
Transcript_contig_80098 (80098)	0.04	0.0	0.36	0.27	0.49	0.85	0.25	0.0	1.0	0.21	0.16
Transcript_contig_80154 (80154)	0.37	0.45	0.16	0.18	0.15	0.58	0.19	0.49	1.0	0.75	0.52
Transcript_contig_80613 (80613)	0.09	0.16	0.19	0.06	0.01	0.38	0.06	0.07	1.0	0.33	0.18
Transcript_contig_80908 (80908)	0.44	0.48	0.01	0.0	0.0	0.61	0.0	0.23	1.0	0.11	0.18
Transcript_contig_81587 (81587)	0.06	0.12	0.06	0.1	0.14	1.0	0.11	0.03	0.54	0.2	0.07
Transcript_contig_82319 (82319)	0.26	0.34	0.01	0.17	0.15	1.0	0.19	0.18	0.0	0.21	0.05
Transcript_contig_83749 (83749)	0.78	1.0	0.15	0.29	0.09	0.57	0.18	0.75	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_89195 (89195)	0.3	0.31	0.06	0.1	0.07	0.55	0.12	0.31	1.0	0.69	0.34
Transcript_contig_8964 (8964)	0.19	0.16	0.27	0.47	0.73	1.0	0.39	0.2	0.43	0.33	0.25
Transcript_contig_89976 (89976)	0.11	0.1	0.02	0.1	0.05	0.65	0.06	0.07	1.0	0.85	0.42
Transcript_contig_90329 (90329)	0.46	0.56	0.16	0.43	0.9	1.0	0.34	0.72	0.5	0.0	0.0
Transcript_contig_90788 (90788)	0.02	0.03	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.02	0.01	0.22	0.05
Transcript_contig_90795 (90795)	0.14	0.11	0.05	0.05	0.11	0.21	0.08	0.11	1.0	0.38	0.24
Transcript_contig_90810 (90810)	0.29	0.27	0.1	0.12	0.19	0.66	0.1	0.17	1.0	0.2	0.17
Transcript_contig_91005 (91005)	0.15	0.22	0.4	0.3	0.28	0.53	0.29	0.2	1.0	0.1	0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)