Heatmap: Cluster_25 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10040 (10040)	0.71	1.0	0.28	0.33	0.39	0.27	0.32	0.86	0.09	0.25	0.12
Transcript_contig_10569 (10569)	0.71	1.0	0.11	0.57	0.89	0.15	0.31	0.67	0.1	0.3	0.14
Transcript_contig_111 (111)	0.69	1.0	0.12	0.3	0.51	0.16	0.28	0.83	0.03	0.23	0.12
Transcript_contig_1309 (1309)	0.62	0.85	0.11	0.32	0.47	0.1	0.29	1.0	0.0	0.23	0.18
Transcript_contig_13532 (13532)	0.66	1.0	0.33	0.5	0.83	0.21	0.39	0.92	0.0	0.08	0.06
Transcript_contig_13784 (13784)	0.87	1.0	0.26	0.25	0.32	0.15	0.49	0.76	0.0	0.05	0.04
Transcript_contig_1539 (1539)	0.53	0.76	0.41	0.48	0.61	0.25	0.54	1.0	0.16	0.16	0.11
Transcript_contig_162 (162)	0.48	0.84	0.03	0.29	0.33	0.16	0.07	1.0	0.0	0.23	0.12
Transcript_contig_1693 (1693)	0.67	1.0	0.21	0.35	0.46	0.36	0.16	0.65	0.02	0.37	0.3
Transcript_contig_1828 (1828)	0.63	0.8	0.32	0.48	0.64	0.37	0.33	1.0	0.33	0.24	0.2
Transcript_contig_1996 (1996)	0.63	0.93	0.54	0.58	0.44	0.26	0.55	1.0	0.01	0.0	0.05
Transcript_contig_2058 (2058)	0.84	1.0	0.14	0.4	0.58	0.23	0.46	0.83	0.11	0.13	0.12
Transcript_contig_20748 (20748)	0.71	1.0	0.4	0.46	0.77	0.13	0.41	0.56	0.19	0.11	0.11
Transcript_contig_208 (208)	0.68	1.0	0.35	0.48	0.46	0.33	0.27	0.98	0.01	0.35	0.26
Transcript_contig_2453 (2453)	0.88	1.0	0.55	0.47	0.65	0.27	0.59	0.86	0.14	0.24	0.16
Transcript_contig_2903 (2903)	0.44	0.7	0.32	0.5	0.68	0.18	0.41	1.0	0.05	0.05	0.07
Transcript_contig_2972 (2972)	0.58	0.89	0.33	0.26	0.04	0.04	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_3167 (3167)	0.61	1.0	0.06	0.31	0.46	0.22	0.15	0.93	0.09	0.33	0.21
Transcript_contig_3256 (3256)	0.44	0.71	0.29	0.36	0.39	0.23	0.4	1.0	0.09	0.1	0.07
Transcript_contig_3368 (3368)	0.73	0.96	0.26	0.49	0.88	0.35	0.38	1.0	0.39	0.61	0.39
Transcript_contig_3520 (3520)	0.87	1.0	0.35	0.64	0.82	0.23	0.51	0.48	0.08	0.47	0.2
Transcript_contig_3567 (3567)	0.68	0.96	0.37	0.48	0.71	0.33	0.54	1.0	0.17	0.48	0.3
Transcript_contig_3766 (3766)	0.73	1.0	0.31	0.63	0.81	0.38	0.53	0.74	0.18	0.49	0.34
Transcript_contig_385 (385)	0.79	1.0	0.27	0.32	0.21	0.22	0.52	0.35	0.0	0.05	0.07
Transcript_contig_4226 (4226)	0.65	0.98	0.24	0.34	0.44	0.28	0.37	1.0	0.37	0.0	0.07
Transcript_contig_4377 (4377)	0.74	1.0	0.27	0.46	0.55	0.34	0.39	0.76	0.08	0.53	0.36
Transcript_contig_4402 (4402)	0.66	0.83	0.44	0.45	0.32	0.2	0.39	1.0	0.0	0.04	0.03
Transcript_contig_4471 (4471)	0.67	1.0	0.12	0.31	0.54	0.12	0.16	0.78	0.15	0.29	0.2
Transcript_contig_4539 (4539)	0.84	1.0	0.23	0.53	0.54	0.15	0.32	0.94	0.0	0.06	0.12
Transcript_contig_5384 (5384)	0.6	1.0	0.36	0.23	0.31	0.05	0.24	0.96	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_53871 (53871)	0.56	0.93	0.2	0.33	0.48	0.28	0.42	1.0	0.36	0.16	0.16
Transcript_contig_53998 (53998)	0.82	1.0	0.17	0.43	0.59	0.22	0.26	0.75	0.05	0.2	0.18
Transcript_contig_54266 (54266)	0.69	0.93	0.26	0.42	0.83	0.32	0.36	1.0	0.22	0.55	0.34
Transcript_contig_54467 (54467)	0.92	1.0	0.56	0.49	0.52	0.22	0.58	0.63	0.24	0.21	0.16
Transcript_contig_54506 (54506)	0.69	1.0	0.22	0.44	0.55	0.31	0.37	0.99	0.35	0.55	0.36
Transcript_contig_54547 (54547)	0.67	1.0	0.22	0.27	0.84	0.07	0.11	0.94	0.19	0.53	0.27
Transcript_contig_54644 (54644)	0.78	1.0	0.29	0.47	0.63	0.38	0.39	0.82	0.6	0.46	0.32
Transcript_contig_54697 (54697)	0.82	1.0	0.32	0.48	0.58	0.28	0.37	0.91	0.42	0.42	0.37
Transcript_contig_54745 (54745)	0.84	1.0	0.22	0.43	0.76	0.26	0.42	0.77	0.13	0.48	0.31
Transcript_contig_55006 (55006)	0.9	1.0	0.32	0.56	0.95	0.28	0.6	0.53	0.19	0.19	0.19
Transcript_contig_55287 (55287)	0.69	1.0	0.18	0.43	0.69	0.33	0.34	0.85	0.1	0.47	0.26
Transcript_contig_55315 (55315)	0.75	1.0	0.22	0.46	0.71	0.26	0.56	0.97	0.05	0.22	0.16
Transcript_contig_55358 (55358)	0.54	0.89	0.11	0.37	0.38	0.18	0.19	1.0	0.12	0.34	0.14
Transcript_contig_55397 (55397)	0.83	1.0	0.6	0.77	0.75	0.48	0.52	0.82	0.25	0.22	0.15
Transcript_contig_55515 (55515)	0.78	1.0	0.14	0.38	0.46	0.24	0.25	0.79	0.63	0.43	0.23
Transcript_contig_55567 (55567)	0.75	0.98	0.24	0.54	0.68	0.36	0.37	1.0	0.61	0.37	0.26
Transcript_contig_55574 (55574)	0.73	0.89	0.25	0.46	0.65	0.18	0.41	1.0	0.26	0.6	0.41
Transcript_contig_55748 (55748)	0.75	1.0	0.29	0.54	0.86	0.18	0.23	0.83	0.04	0.2	0.1
Transcript_contig_55800 (55800)	0.55	0.93	0.1	0.24	0.34	0.18	0.16	1.0	0.02	0.32	0.18
Transcript_contig_55813 (55813)	0.72	0.97	0.23	0.42	0.63	0.36	0.35	1.0	0.54	0.54	0.4
Transcript_contig_55872 (55872)	0.73	0.94	0.33	0.52	1.0	0.39	0.52	0.96	0.2	0.52	0.38
Transcript_contig_56122 (56122)	0.65	1.0	0.14	0.27	0.44	0.12	0.23	0.92	0.04	0.15	0.09
Transcript_contig_56159 (56159)	0.71	0.97	0.15	0.37	0.52	0.39	0.39	1.0	0.19	0.49	0.37
Transcript_contig_56193 (56193)	0.75	1.0	0.48	0.55	0.66	0.26	0.57	0.65	0.24	0.01	0.05
Transcript_contig_56248 (56248)	0.6	0.96	0.17	0.31	0.47	0.21	0.35	1.0	0.06	0.34	0.14
Transcript_contig_56472 (56472)	0.79	1.0	0.57	0.51	0.53	0.22	0.65	0.62	0.19	0.16	0.13
Transcript_contig_56682 (56682)	0.73	0.91	0.31	0.46	0.78	0.38	0.4	1.0	0.23	0.66	0.45
Transcript_contig_56910 (56910)	0.92	1.0	0.56	0.51	0.62	0.38	0.74	0.8	0.19	0.12	0.17
Transcript_contig_57272 (57272)	0.72	0.91	0.32	0.56	0.86	0.31	0.48	1.0	0.04	0.78	0.46
Transcript_contig_57344 (57344)	0.78	1.0	0.27	0.54	0.7	0.22	0.57	0.86	0.0	0.04	0.04
Transcript_contig_57352 (57352)	0.66	1.0	0.22	0.35	0.45	0.11	0.33	0.89	0.59	0.0	0.04
Transcript_contig_5741 (5741)	0.39	0.75	0.32	0.53	0.51	0.31	0.38	1.0	0.0	0.03	0.06
Transcript_contig_57613 (57613)	0.89	1.0	0.42	0.53	0.73	0.44	0.67	0.63	0.18	0.29	0.23
Transcript_contig_58018 (58018)	0.82	0.93	0.21	0.49	1.0	0.27	0.68	0.88	0.15	0.34	0.33
Transcript_contig_58053 (58053)	0.88	1.0	0.56	0.44	0.52	0.27	0.67	0.67	0.13	0.12	0.1
Transcript_contig_58157 (58157)	0.81	1.0	0.56	0.6	0.48	0.31	0.51	0.95	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_58167 (58167)	0.79	0.94	0.21	0.46	0.79	0.31	0.36	1.0	0.4	0.72	0.54
Transcript_contig_58227 (58227)	0.48	0.86	0.02	0.22	0.31	0.14	0.05	1.0	0.01	0.24	0.09
Transcript_contig_58457 (58457)	0.64	0.9	0.26	0.41	0.61	0.21	0.34	1.0	0.07	0.42	0.3
Transcript_contig_58785 (58785)	0.76	1.0	0.13	0.43	0.7	0.18	0.33	0.66	0.02	0.46	0.29
Transcript_contig_58864 (58864)	0.67	0.91	0.36	0.41	0.54	0.29	0.3	1.0	0.04	0.53	0.36
Transcript_contig_58967 (58967)	0.48	0.79	0.67	0.63	0.48	0.26	0.48	1.0	0.11	0.09	0.1
Transcript_contig_59217 (59217)	0.59	0.85	0.48	0.44	0.55	0.24	0.45	1.0	0.04	0.06	0.08
Transcript_contig_59540 (59540)	0.47	0.82	0.34	0.53	0.94	0.25	0.62	1.0	0.09	0.01	0.03
Transcript_contig_59581 (59581)	0.74	1.0	0.21	0.38	0.63	0.23	0.3	0.8	0.13	0.22	0.2
Transcript_contig_59670 (59670)	0.79	1.0	0.3	0.65	0.7	0.3	0.62	0.84	0.2	0.16	0.23
Transcript_contig_59674 (59674)	0.73	1.0	0.2	0.41	0.53	0.15	0.36	0.83	0.19	0.07	0.09
Transcript_contig_59762 (59762)	0.74	1.0	0.25	0.43	0.65	0.36	0.41	0.83	0.24	0.55	0.29
Transcript_contig_59830 (59830)	0.82	1.0	0.43	0.39	0.45	0.24	0.61	0.72	0.03	0.06	0.06
Transcript_contig_59969 (59969)	0.75	1.0	0.41	0.24	0.71	0.18	0.37	0.62	0.03	0.52	0.21
Transcript_contig_59971 (59971)	0.7	0.96	0.36	0.47	0.66	0.37	0.33	1.0	0.04	0.46	0.31
Transcript_contig_60103 (60103)	0.87	1.0	0.4	0.41	0.43	0.21	0.55	0.82	0.07	0.04	0.04
Transcript_contig_60251 (60251)	0.69	1.0	0.2	0.48	0.81	0.32	0.31	0.82	0.62	0.38	0.15
Transcript_contig_60280 (60280)	0.76	1.0	0.55	0.48	0.45	0.23	0.47	0.89	0.16	0.0	0.04
Transcript_contig_60408 (60408)	0.87	0.98	0.32	0.43	0.68	0.17	0.36	1.0	0.09	0.45	0.28
Transcript_contig_60590 (60590)	0.78	1.0	0.41	0.39	0.62	0.38	0.3	0.96	0.08	0.48	0.39
Transcript_contig_61361 (61361)	0.7	1.0	0.08	0.27	0.6	0.22	0.33	0.93	0.02	0.51	0.27
Transcript_contig_61424 (61424)	0.71	0.91	0.56	0.29	0.62	0.08	0.39	1.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_61505 (61505)	0.8	0.95	0.54	0.42	0.82	0.27	0.46	1.0	0.02	0.18	0.29
Transcript_contig_61817 (61817)	0.56	0.74	0.34	0.43	0.63	0.18	0.35	1.0	0.08	0.1	0.14
Transcript_contig_61818 (61818)	0.35	0.58	0.23	0.32	1.0	0.24	0.18	0.39	0.02	0.0	0.08
Transcript_contig_61835 (61835)	0.76	1.0	0.46	0.64	0.72	0.31	0.52	0.67	0.04	0.23	0.15
Transcript_contig_62156 (62156)	0.6	1.0	0.26	0.61	0.66	0.18	0.22	0.95	0.18	0.16	0.12
Transcript_contig_62224 (62224)	0.54	0.73	0.25	0.32	0.66	0.26	0.42	1.0	0.09	0.19	0.12
Transcript_contig_62318 (62318)	0.58	0.86	0.08	0.22	0.36	0.27	0.14	1.0	0.0	0.25	0.25
Transcript_contig_62835 (62835)	0.6	0.87	0.16	0.48	0.61	0.14	0.31	1.0	0.08	0.23	0.17
Transcript_contig_62979 (62979)	0.76	1.0	0.27	0.57	0.21	0.1	0.56	0.49	0.04	0.03	0.02
Transcript_contig_63341 (63341)	0.91	1.0	0.3	0.34	0.38	0.22	0.52	0.54	0.06	0.14	0.12
Transcript_contig_66168 (66168)	0.7	1.0	0.01	0.16	0.48	0.25	0.15	0.52	0.05	0.47	0.19
Transcript_contig_6646 (6646)	0.93	0.97	0.66	0.71	0.41	0.23	0.74	1.0	0.0	0.04	0.09
Transcript_contig_6734 (6734)	0.53	0.87	0.18	0.24	0.47	0.17	0.37	1.0	0.02	0.42	0.19
Transcript_contig_67528 (67528)	0.79	1.0	0.63	0.59	0.89	0.23	0.43	0.87	0.0	0.22	0.08
Transcript_contig_67835 (67835)	0.45	0.65	0.1	0.16	0.19	0.14	0.34	1.0	0.08	0.13	0.07
Transcript_contig_68197 (68197)	0.66	1.0	0.22	0.38	0.59	0.19	0.28	0.88	0.02	0.31	0.14
Transcript_contig_69146 (69146)	0.79	1.0	0.15	0.36	0.78	0.14	0.22	0.9	0.54	0.36	0.25
Transcript_contig_69317 (69317)	0.67	1.0	0.45	0.36	0.8	0.32	0.36	0.72	0.01	0.41	0.26
Transcript_contig_69958 (69958)	0.83	1.0	0.42	0.47	0.48	0.13	0.48	0.98	0.01	0.03	0.02
Transcript_contig_70046 (70046)	0.67	1.0	0.08	0.26	0.37	0.11	0.16	0.96	0.05	0.11	0.07
Transcript_contig_7255 (7255)	0.71	1.0	0.2	0.41	0.53	0.17	0.45	0.67	0.1	0.18	0.17
Transcript_contig_7364 (7364)	0.83	1.0	0.1	0.37	0.53	0.28	0.48	0.93	0.27	0.45	0.18
Transcript_contig_7782 (7782)	0.91	1.0	0.24	0.4	0.53	0.24	0.52	0.69	0.05	0.13	0.1
Transcript_contig_78071 (78071)	0.71	0.78	0.2	0.56	1.0	0.14	0.41	0.25	0.01	0.32	0.04
Transcript_contig_78101 (78101)	0.62	0.9	0.31	0.54	0.92	0.27	0.41	1.0	0.39	0.16	0.14
Transcript_contig_78307 (78307)	0.76	1.0	0.29	0.45	0.38	0.1	0.21	0.84	0.4	0.02	0.03
Transcript_contig_78410 (78410)	0.76	1.0	0.32	0.45	0.67	0.17	0.34	0.67	0.17	0.26	0.17
Transcript_contig_78560 (78560)	0.65	1.0	0.11	0.28	0.49	0.39	0.33	0.96	0.09	0.34	0.21
Transcript_contig_78724 (78724)	0.95	1.0	0.36	0.7	0.74	0.27	0.75	0.57	0.04	0.42	0.18
Transcript_contig_78932 (78932)	0.55	0.81	0.71	0.67	0.71	0.3	0.56	1.0	0.18	0.09	0.13
Transcript_contig_79008 (79008)	0.71	1.0	0.14	0.33	0.7	0.11	0.17	0.87	0.08	0.29	0.19
Transcript_contig_79113 (79113)	0.8	0.99	0.28	0.44	1.0	0.08	0.15	0.67	0.02	0.01	0.05
Transcript_contig_79726 (79726)	0.75	1.0	0.36	0.41	0.99	0.32	0.5	0.87	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_79779 (79779)	0.67	0.86	0.66	0.64	0.73	0.25	0.59	1.0	0.08	0.15	0.15
Transcript_contig_79809 (79809)	0.44	0.65	0.31	0.35	0.31	0.18	0.38	1.0	0.21	0.0	0.02
Transcript_contig_80179 (80179)	0.64	0.98	0.64	0.53	0.98	0.22	0.58	1.0	0.04	0.0	0.02
Transcript_contig_81893 (81893)	0.77	1.0	0.22	0.43	0.31	0.17	0.31	0.79	0.01	0.13	0.08
Transcript_contig_81894 (81894)	0.7	1.0	0.27	0.45	0.49	0.3	0.32	0.9	0.02	0.23	0.14
Transcript_contig_81913 (81913)	0.83	1.0	0.22	0.43	0.85	0.43	0.55	0.79	0.15	0.34	0.26
Transcript_contig_82064 (82064)	1.0	0.94	0.15	0.36	0.35	0.29	0.56	0.57	0.03	0.13	0.11
Transcript_contig_82076 (82076)	0.92	1.0	0.27	0.83	0.81	0.19	0.57	0.68	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_82092 (82092)	0.59	0.96	0.15	0.32	0.72	0.13	0.31	1.0	0.01	0.04	0.04
Transcript_contig_82944 (82944)	0.71	0.92	0.36	0.57	0.86	0.27	0.49	1.0	0.04	0.32	0.29
Transcript_contig_84685 (84685)	0.91	1.0	0.64	0.5	0.85	0.16	0.43	0.79	0.0	0.07	0.07
Transcript_contig_86 (86)	0.87	0.96	0.16	0.45	1.0	0.36	0.31	0.91	0.2	0.52	0.29
Transcript_contig_8840 (8840)	0.58	1.0	0.04	0.26	0.19	0.2	0.15	0.95	0.01	0.33	0.18
Transcript_contig_8862 (8862)	0.74	1.0	0.08	0.38	0.62	0.19	0.19	0.99	0.02	0.16	0.11
Transcript_contig_89351 (89351)	0.78	1.0	0.47	0.55	0.49	0.43	0.42	0.7	0.32	0.29	0.19
Transcript_contig_89369 (89369)	0.76	1.0	0.14	0.39	0.33	0.26	0.37	0.54	0.25	0.3	0.15
Transcript_contig_89459 (89459)	0.88	1.0	0.54	0.5	0.43	0.31	0.69	0.88	0.27	0.29	0.2
Transcript_contig_89483 (89483)	0.83	1.0	0.51	0.8	0.77	0.31	0.66	0.89	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_8950 (8950)	0.68	0.88	0.17	0.29	1.0	0.13	0.3	0.79	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_89517 (89517)	0.71	1.0	0.16	0.42	0.45	0.23	0.32	0.87	0.07	0.19	0.15
Transcript_contig_89571 (89571)	0.78	1.0	0.3	0.54	0.72	0.3	0.47	0.76	0.05	0.22	0.16
Transcript_contig_89649 (89649)	0.68	1.0	0.18	0.33	0.42	0.25	0.24	0.78	0.08	0.19	0.12
Transcript_contig_89688 (89688)	0.7	1.0	0.19	0.35	0.46	0.23	0.35	0.94	0.22	0.47	0.25
Transcript_contig_89791 (89791)	0.57	0.93	0.43	0.64	0.74	0.27	0.49	1.0	0.05	0.02	0.09
Transcript_contig_89823 (89823)	0.88	1.0	0.27	0.14	0.34	0.17	0.34	0.36	0.06	0.04	0.03
Transcript_contig_89931 (89931)	0.76	1.0	0.13	0.37	0.79	0.26	0.35	0.88	0.03	0.47	0.24
Transcript_contig_89982 (89982)	0.51	0.76	0.49	0.53	0.56	0.22	0.38	1.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_90050 (90050)	0.48	0.72	0.19	0.28	0.46	0.22	0.36	1.0	0.25	0.13	0.14
Transcript_contig_90086 (90086)	0.78	1.0	0.69	0.5	0.73	0.44	0.77	0.96	0.13	0.07	0.12
Transcript_contig_90094 (90094)	0.57	0.77	0.47	0.47	0.38	0.23	0.35	1.0	0.24	0.01	0.07
Transcript_contig_90109 (90109)	0.45	0.73	0.26	0.45	0.69	0.18	0.31	1.0	0.12	0.12	0.18
Transcript_contig_90184 (90184)	0.79	1.0	0.25	0.64	0.85	0.4	0.32	0.97	0.16	0.51	0.39
Transcript_contig_90205 (90205)	0.74	1.0	0.22	0.33	0.56	0.23	0.43	0.89	0.19	0.23	0.12
Transcript_contig_90218 (90218)	0.8	1.0	0.21	0.56	0.83	0.24	0.64	0.95	0.02	0.15	0.08
Transcript_contig_90288 (90288)	0.89	1.0	0.36	0.46	0.05	0.25	0.44	0.45	0.06	0.24	0.19
Transcript_contig_90310 (90310)	0.72	1.0	0.15	0.41	0.61	0.25	0.21	0.63	0.02	0.47	0.31
Transcript_contig_90496 (90496)	0.72	0.94	0.17	0.5	1.0	0.34	0.49	0.95	0.03	0.41	0.23
Transcript_contig_90764 (90764)	0.74	0.9	0.22	0.42	0.79	0.24	0.56	1.0	0.2	0.25	0.15
Transcript_contig_963 (963)	0.75	1.0	0.11	0.45	0.22	0.3	0.54	0.63	0.02	0.29	0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)