Heatmap: Cluster_114 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10283 (10283)	0.77	1.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_10488 (10488)	0.65	1.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.06	0.9	0.49	0.1	0.0
Transcript_contig_10504 (10504)	0.65	1.0	0.06	0.0	0.0	0.03	0.13	0.98	0.08	0.0	0.04
Transcript_contig_12046 (12046)	0.55	1.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.0	0.31	0.21	0.17	0.17
Transcript_contig_12905 (12905)	0.47	0.65	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_14169 (14169)	1.0	0.96	0.0	0.04	0.21	0.08	0.06	0.61	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_14770 (14770)	0.8	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.57	0.0	0.16	0.0
Transcript_contig_15108 (15108)	0.85	1.0	0.04	0.21	0.0	0.11	0.24	0.88	0.0	0.2	0.22
Transcript_contig_15343 (15343)	0.8	1.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.51	0.0	0.05	0.0
Transcript_contig_15402 (15402)	0.74	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_15566 (15566)	0.66	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_15878 (15878)	0.46	0.68	0.0	0.0	0.0	0.09	0.12	1.0	0.0	0.14	0.0
Transcript_contig_15926 (15926)	0.57	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.51	0.0	0.07	0.08
Transcript_contig_16238 (16238)	0.95	1.0	0.34	0.26	0.01	0.07	0.01	0.03	0.11	0.25	0.17
Transcript_contig_16485 (16485)	0.43	0.92	0.0	0.39	0.0	0.09	0.2	1.0	0.0	0.09	0.0
Transcript_contig_16589 (16589)	0.85	1.0	0.04	0.03	0.04	0.07	0.08	0.33	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_17083 (17083)	0.66	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.22
Transcript_contig_171 (171)	0.6	1.0	0.08	0.47	0.0	0.0	0.25	0.94	0.0	0.04	0.2
Transcript_contig_19240 (19240)	1.0	0.96	0.0	0.11	0.14	0.0	0.0	0.85	0.0	0.03	0.2
Transcript_contig_19353 (19353)	0.53	0.87	0.0	0.27	0.39	0.0	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_19968 (19968)	0.49	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_1998 (1998)	0.85	1.0	0.0	0.0	0.0	0.26	0.09	0.82	0.0	0.0	0.17
Transcript_contig_2053 (2053)	1.0	1.0	0.32	0.09	0.01	0.0	0.0	0.04	0.0	0.05	0.05
Transcript_contig_2054 (2054)	0.77	1.0	0.26	0.31	0.21	0.14	0.25	0.46	0.0	0.04	0.07
Transcript_contig_22495 (22495)	0.94	1.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.03	0.15	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_2252 (2252)	0.85	1.0	0.11	0.12	0.08	0.08	0.17	0.23	0.0	0.03	0.07
Transcript_contig_23174 (23174)	0.54	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.26	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_23842 (23842)	0.59	1.0	0.3	0.18	0.0	0.04	0.05	0.45	0.0	0.08	0.15
Transcript_contig_24688 (24688)	0.7	1.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.19	0.2	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_3111 (3111)	0.95	1.0	0.22	0.05	0.0	0.0	0.09	0.15	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_3754 (3754)	0.68	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.21	0.0
Transcript_contig_4144 (4144)	0.67	1.0	0.17	0.44	0.23	0.14	0.17	0.87	0.0	0.05	0.27
Transcript_contig_4200 (4200)	1.0	0.98	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_4337 (4337)	0.67	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.77	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_4621 (4621)	0.96	1.0	0.21	0.07	0.1	0.05	0.11	0.59	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_4844 (4844)	0.68	1.0	0.07	0.07	0.11	0.17	0.19	0.65	0.01	0.08	0.14
Transcript_contig_5040 (5040)	0.57	1.0	0.0	0.28	0.06	0.03	0.1	0.2	0.27	0.03	0.0
Transcript_contig_54125 (54125)	0.92	1.0	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.27	0.02	0.01	0.0
Transcript_contig_5706 (5706)	0.46	1.0	0.05	0.09	0.06	0.03	0.15	0.83	0.0	0.03	0.01
Transcript_contig_5923 (5923)	0.71	1.0	0.28	0.2	0.22	0.05	0.23	0.37	0.0	0.31	0.0
Transcript_contig_5957 (5957)	0.73	1.0	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.86	0.0	0.0	0.27
Transcript_contig_59861 (59861)	0.59	1.0	0.1	0.07	0.12	0.0	0.06	0.4	0.0	0.06	0.06
Transcript_contig_60657 (60657)	0.66	0.79	0.02	0.02	0.05	0.03	0.1	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_60767 (60767)	0.55	0.94	0.0	0.18	0.35	0.19	0.28	1.0	0.0	0.0	0.17
Transcript_contig_60838 (60838)	0.76	1.0	0.03	0.01	0.0	0.07	0.08	0.34	0.05	0.0	0.03
Transcript_contig_60987 (60987)	0.92	0.63	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	1.0	0.0	0.55	0.23
Transcript_contig_61124 (61124)	0.45	1.0	0.08	0.02	0.0	0.0	0.0	0.7	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61313 (61313)	0.55	1.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.24	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61543 (61543)	0.88	0.94	0.25	0.11	0.0	0.22	0.32	1.0	0.07	0.1	0.1
Transcript_contig_61561 (61561)	0.78	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61858 (61858)	0.48	0.58	0.0	0.03	0.0	0.09	0.02	1.0	0.02	0.01	0.0
Transcript_contig_62023 (62023)	0.7	1.0	0.07	0.07	0.04	0.01	0.03	0.57	0.0	0.11	0.04
Transcript_contig_62501 (62501)	0.75	0.98	0.12	0.16	0.0	0.0	0.09	1.0	0.0	0.21	0.0
Transcript_contig_6296 (6296)	0.81	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.69	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_63298 (63298)	0.47	0.85	0.0	0.33	0.0	0.0	0.12	1.0	0.0	0.08	0.0
Transcript_contig_63770 (63770)	0.85	1.0	0.05	0.03	0.06	0.04	0.02	0.02	0.0	0.31	0.07
Transcript_contig_63822 (63822)	0.35	0.53	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_64818 (64818)	0.74	1.0	0.51	0.15	0.11	0.0	0.18	0.46	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_64931 (64931)	0.62	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.44	0.0	0.37	0.0
Transcript_contig_66241 (66241)	0.7	1.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	0.06	0.0
Transcript_contig_66375 (66375)	1.0	0.91	0.0	0.0	0.0	0.59	0.66	0.89	0.0	0.12	0.0
Transcript_contig_6699 (6699)	0.84	1.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.0	0.41	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67573 (67573)	0.57	1.0	0.01	0.07	0.05	0.1	0.14	0.96	0.59	0.09	0.08
Transcript_contig_67606 (67606)	0.83	1.0	0.08	0.03	0.05	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_67683 (67683)	0.83	1.0	0.25	0.15	0.02	0.06	0.12	0.45	0.0	0.02	0.0
Transcript_contig_67711 (67711)	0.53	0.79	0.11	0.01	0.01	0.01	0.03	1.0	0.02	0.01	0.0
Transcript_contig_67768 (67768)	0.87	0.44	0.1	0.06	0.5	0.17	0.48	1.0	0.0	0.49	0.0
Transcript_contig_68144 (68144)	0.55	1.0	0.02	0.17	0.08	0.17	0.12	0.85	0.16	0.05	0.14
Transcript_contig_68387 (68387)	0.69	0.72	0.04	0.03	0.03	0.09	0.2	1.0	0.04	0.04	0.05
Transcript_contig_68829 (68829)	0.63	1.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.01	0.77	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_69448 (69448)	0.62	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_72670 (72670)	0.96	1.0	0.19	0.04	0.07	0.05	0.09	0.93	0.0	0.02	0.03
Transcript_contig_72804 (72804)	0.83	1.0	0.0	0.0	0.25	0.53	0.0	0.0	0.87	0.11	0.23
Transcript_contig_75383 (75383)	0.67	1.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_80600 (80600)	0.59	0.98	0.0	0.0	0.03	0.13	0.0	1.0	0.0	0.11	0.04
Transcript_contig_81199 (81199)	0.57	0.49	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.2	0.0
Transcript_contig_81835 (81835)	0.64	1.0	0.11	0.0	0.0	0.05	0.11	0.23	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_82326 (82326)	0.65	1.0	0.03	0.03	0.05	0.14	0.15	0.78	0.0	0.16	0.1
Transcript_contig_83710 (83710)	0.46	1.0	0.11	0.03	0.03	0.02	0.0	0.72	0.3	0.04	0.01
Transcript_contig_84251 (84251)	0.69	1.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.06	0.37	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_8640 (8640)	0.66	1.0	0.23	0.16	0.0	0.97	0.59	0.46	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_8642 (8642)	0.44	1.0	0.06	0.04	0.02	0.01	0.01	0.83	0.05	0.11	0.06
Transcript_contig_8709 (8709)	0.46	1.0	0.0	0.0	0.05	0.0	0.03	0.52	0.0	0.0	0.11
Transcript_contig_90373 (90373)	1.0	0.94	0.23	0.25	0.04	0.11	0.24	0.13	0.04	0.0	0.05
Transcript_contig_90410 (90410)	0.91	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.17
Transcript_contig_99 (99)	0.95	1.0	0.06	0.02	0.1	0.1	0.04	0.04	0.0	0.02	0.05

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)