Heatmap: Cluster_97 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10392 (10392)	0.03	0.05	0.0	1.0	0.4	0.08	0.02	0.0	0.0	0.12	0.15
Transcript_contig_1105 (1105)	0.24	0.33	0.19	1.0	0.98	0.29	0.4	0.09	0.02	0.2	0.21
Transcript_contig_11226 (11226)	0.02	0.0	0.22	0.54	1.0	0.06	0.11	0.0	0.0	0.0	0.06
Transcript_contig_12153 (12153)	0.0	0.01	0.03	1.0	0.52	0.24	0.5	0.04	0.0	0.06	0.06
Transcript_contig_13394 (13394)	0.04	0.0	0.0	0.56	1.0	0.27	0.12	0.0	0.0	0.26	0.33
Transcript_contig_14704 (14704)	0.16	0.08	0.2	1.0	0.23	0.0	0.38	0.0	0.0	0.33	0.0
Transcript_contig_14831 (14831)	0.16	0.0	0.38	0.71	1.0	0.33	0.52	0.0	0.23	0.38	0.2
Transcript_contig_15825 (15825)	0.0	0.0	0.0	0.52	1.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.12	0.06
Transcript_contig_15845 (15845)	0.01	0.0	0.0	0.41	1.0	0.16	0.15	0.0	0.0	0.03	0.03
Transcript_contig_16771 (16771)	0.01	0.0	0.13	0.82	1.0	0.07	0.08	0.01	0.0	0.07	0.06
Transcript_contig_16908 (16908)	0.08	0.32	0.31	1.0	0.61	0.08	0.24	0.0	0.0	0.03	0.0
Transcript_contig_17096 (17096)	0.07	0.23	0.13	0.36	1.0	0.05	0.08	0.17	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_24202 (24202)	0.01	0.0	0.15	0.6	1.0	0.04	0.14	0.0	0.0	0.12	0.06
Transcript_contig_2957 (2957)	0.05	0.02	0.1	0.36	1.0	0.1	0.08	0.04	0.04	0.23	0.16
Transcript_contig_3384 (3384)	0.12	0.09	0.87	0.85	1.0	0.61	0.22	0.07	0.0	0.09	0.06
Transcript_contig_404 (404)	0.16	0.27	0.39	1.0	0.53	0.28	0.1	0.45	0.0	0.14	0.16
Transcript_contig_4167 (4167)	0.18	0.31	0.2	1.0	0.74	0.16	0.35	0.51	0.15	0.0	0.13
Transcript_contig_5089 (5089)	0.0	0.0	0.11	1.0	0.53	0.06	0.24	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5167 (5167)	0.2	0.26	0.0	0.93	1.0	0.04	0.06	0.31	0.0	0.17	0.0
Transcript_contig_54271 (54271)	0.14	0.2	0.12	0.39	1.0	0.1	0.17	0.2	0.01	0.09	0.13
Transcript_contig_54308 (54308)	0.19	0.15	0.09	1.0	0.6	0.22	0.39	0.17	0.1	0.18	0.14
Transcript_contig_54478 (54478)	0.13	0.13	0.17	1.0	0.8	0.34	0.38	0.23	0.08	0.37	0.21
Transcript_contig_54708 (54708)	0.15	0.14	0.18	0.48	1.0	0.14	0.25	0.11	0.06	0.21	0.15
Transcript_contig_54934 (54934)	0.38	0.36	0.27	1.0	0.95	0.24	0.39	0.4	0.39	0.22	0.22
Transcript_contig_55060 (55060)	0.17	0.13	0.24	1.0	0.87	0.16	0.34	0.14	0.02	0.05	0.07
Transcript_contig_55329 (55329)	0.36	0.48	0.29	0.83	1.0	0.17	0.36	0.55	0.16	0.22	0.2
Transcript_contig_55354 (55354)	0.18	0.27	0.21	1.0	0.86	0.24	0.47	0.27	0.02	0.39	0.29
Transcript_contig_55496 (55496)	0.21	0.14	0.37	0.92	1.0	0.27	0.45	0.13	0.03	0.16	0.13
Transcript_contig_55807 (55807)	0.13	0.09	0.11	0.84	1.0	0.23	0.44	0.12	0.01	0.14	0.14
Transcript_contig_55841 (55841)	0.12	0.09	0.25	1.0	0.55	0.17	0.28	0.15	0.16	0.21	0.19
Transcript_contig_55936 (55936)	0.13	0.09	0.11	1.0	0.73	0.18	0.33	0.1	0.01	0.19	0.15
Transcript_contig_56222 (56222)	0.06	0.03	0.07	0.34	1.0	0.06	0.09	0.03	0.03	0.1	0.08
Transcript_contig_56737 (56737)	0.06	0.04	0.18	0.52	1.0	0.11	0.13	0.05	0.04	0.18	0.13
Transcript_contig_56819 (56819)	0.03	0.03	0.17	1.0	0.93	0.17	0.2	0.07	0.05	0.17	0.09
Transcript_contig_5702 (5702)	0.07	0.06	0.16	0.38	1.0	0.15	0.23	0.08	0.01	0.16	0.14
Transcript_contig_57156 (57156)	0.08	0.0	0.1	1.0	0.75	0.1	0.35	0.01	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_57621 (57621)	0.09	0.05	0.19	0.43	1.0	0.14	0.22	0.04	0.04	0.19	0.13
Transcript_contig_57777 (57777)	0.25	0.03	0.2	0.88	1.0	0.19	0.22	0.04	0.16	0.6	0.45
Transcript_contig_57791 (57791)	0.03	0.01	0.17	0.43	1.0	0.06	0.12	0.0	0.0	0.26	0.17
Transcript_contig_57904 (57904)	0.04	0.01	0.62	1.0	0.89	0.16	0.1	0.0	0.01	0.16	0.22
Transcript_contig_59207 (59207)	0.09	0.0	0.49	0.59	1.0	0.19	0.62	0.0	0.0	0.29	0.04
Transcript_contig_59251 (59251)	0.47	0.43	0.21	1.0	0.78	0.24	0.4	0.38	0.29	0.24	0.29
Transcript_contig_59356 (59356)	0.26	0.18	0.11	1.0	0.51	0.27	0.49	0.16	0.19	0.32	0.22
Transcript_contig_59757 (59757)	0.06	0.02	0.18	0.51	1.0	0.1	0.2	0.03	0.0	0.1	0.07
Transcript_contig_60095 (60095)	0.04	0.0	0.09	0.54	1.0	0.07	0.15	0.0	0.04	0.11	0.09
Transcript_contig_6056 (6056)	0.07	0.0	0.17	0.35	1.0	0.46	0.42	0.0	0.2	0.12	0.27
Transcript_contig_60916 (60916)	0.04	0.01	0.14	0.4	1.0	0.05	0.11	0.0	0.0	0.43	0.27
Transcript_contig_60923 (60923)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.28	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_60985 (60985)	0.07	0.06	0.0	1.0	0.81	0.71	0.83	0.26	0.24	0.27	0.34
Transcript_contig_6429 (6429)	0.12	0.15	0.3	1.0	0.7	0.09	0.36	0.21	0.0	0.08	0.05
Transcript_contig_64411 (64411)	0.07	0.21	0.5	0.53	1.0	0.05	0.17	0.25	0.0	0.05	0.0
Transcript_contig_66800 (66800)	0.08	0.1	0.21	0.54	1.0	0.0	0.13	0.43	0.1	0.08	0.08
Transcript_contig_66856 (66856)	0.12	0.0	0.24	1.0	0.99	0.2	0.36	0.0	0.0	0.02	0.09
Transcript_contig_6701 (6701)	0.11	0.07	0.13	0.66	1.0	0.18	0.24	0.04	0.0	0.18	0.13
Transcript_contig_67455 (67455)	0.02	0.01	0.07	0.55	1.0	0.11	0.08	0.01	0.01	0.06	0.05
Transcript_contig_67537 (67537)	0.14	0.0	0.08	1.0	0.59	0.11	0.31	0.0	0.15	0.03	0.02
Transcript_contig_67674 (67674)	0.08	0.11	0.56	1.0	0.41	0.0	0.54	0.0	0.42	0.14	0.1
Transcript_contig_67968 (67968)	0.36	0.03	0.53	0.94	1.0	0.16	0.52	0.14	0.08	0.1	0.06
Transcript_contig_68320 (68320)	0.06	0.08	0.0	0.65	1.0	0.09	0.17	0.17	0.0	0.14	0.09
Transcript_contig_68538 (68538)	0.12	0.11	0.09	0.73	1.0	0.14	0.15	0.0	0.0	0.01	0.05
Transcript_contig_69901 (69901)	0.15	0.05	0.25	0.57	1.0	0.03	0.16	0.06	0.0	0.18	0.07
Transcript_contig_69956 (69956)	0.03	0.0	0.0	0.84	1.0	0.12	0.13	0.0	0.0	0.01	0.0
Transcript_contig_70792 (70792)	0.0	0.02	0.03	0.68	1.0	0.02	0.18	0.07	0.04	0.03	0.05
Transcript_contig_71340 (71340)	0.04	0.02	0.13	0.7	1.0	0.13	0.19	0.0	0.01	0.11	0.11
Transcript_contig_7154 (7154)	0.02	0.0	0.18	1.0	0.59	0.03	0.11	0.0	0.0	0.03	0.03
Transcript_contig_71935 (71935)	0.08	0.22	0.11	1.0	0.49	0.01	0.04	0.22	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_73216 (73216)	0.09	0.0	0.3	0.82	1.0	0.15	0.36	0.0	0.02	0.0	0.01
Transcript_contig_73344 (73344)	0.02	0.0	0.18	0.64	1.0	0.07	0.13	0.0	0.07	0.06	0.03
Transcript_contig_73565 (73565)	0.18	0.2	0.11	0.33	1.0	0.12	0.37	0.07	0.0	0.12	0.13
Transcript_contig_74191 (74191)	0.12	0.1	0.03	0.68	1.0	0.08	0.26	0.17	0.0	0.16	0.11
Transcript_contig_78140 (78140)	0.08	0.03	0.15	0.56	1.0	0.15	0.31	0.04	0.03	0.13	0.09
Transcript_contig_78218 (78218)	0.19	0.18	0.1	1.0	0.62	0.22	0.4	0.21	0.04	0.24	0.22
Transcript_contig_78912 (78912)	0.09	0.0	0.21	0.57	1.0	0.12	0.42	0.0	0.0	0.25	0.2
Transcript_contig_79055 (79055)	0.11	0.08	0.08	0.71	1.0	0.15	0.26	0.1	0.04	0.11	0.1
Transcript_contig_7929 (7929)	0.13	0.16	0.09	0.34	1.0	0.14	0.12	0.09	0.14	0.07	0.07
Transcript_contig_79380 (79380)	0.09	0.05	0.09	0.51	1.0	0.12	0.25	0.08	0.08	0.07	0.05
Transcript_contig_79493 (79493)	0.16	0.0	0.31	0.37	1.0	0.23	0.58	0.0	0.0	0.34	0.35
Transcript_contig_79495 (79495)	0.04	0.03	0.08	0.47	1.0	0.07	0.16	0.03	0.0	0.08	0.05
Transcript_contig_79715 (79715)	0.11	0.03	0.18	0.72	1.0	0.2	0.4	0.04	0.01	0.09	0.09
Transcript_contig_79752 (79752)	0.01	0.0	0.23	1.0	0.79	0.04	0.03	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_79959 (79959)	0.13	0.22	0.29	1.0	0.78	0.26	0.36	0.29	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_80612 (80612)	0.04	0.0	0.37	0.88	0.65	1.0	0.29	0.0	0.12	0.05	0.09
Transcript_contig_81797 (81797)	0.08	0.0	0.13	0.9	1.0	0.22	0.47	0.0	0.01	0.0	0.07
Transcript_contig_82543 (82543)	0.02	0.0	0.16	0.85	1.0	0.16	0.22	0.0	0.0	0.18	0.15
Transcript_contig_82611 (82611)	0.0	0.0	0.17	1.0	0.94	0.32	0.56	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_82709 (82709)	0.13	0.12	0.09	1.0	0.44	0.17	0.3	0.15	0.0	0.08	0.13
Transcript_contig_8322 (8322)	0.06	0.0	0.16	0.57	1.0	0.14	0.33	0.0	0.07	0.12	0.11
Transcript_contig_83975 (83975)	0.07	0.0	0.0	0.79	1.0	0.02	0.05	0.16	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_84429 (84429)	0.14	0.0	0.21	1.0	0.83	0.73	0.19	0.0	0.14	0.26	0.22
Transcript_contig_85184 (85184)	0.15	0.0	0.0	1.0	0.39	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_86063 (86063)	0.02	0.0	0.07	0.84	1.0	0.04	0.11	0.0	0.0	0.08	0.01
Transcript_contig_8896 (8896)	0.02	0.0	0.17	1.0	0.71	0.56	0.24	0.0	0.0	0.22	0.16
Transcript_contig_89523 (89523)	0.23	0.14	0.22	0.85	1.0	0.19	0.36	0.15	0.08	0.35	0.29
Transcript_contig_90084 (90084)	0.18	0.11	0.18	1.0	0.76	0.2	0.47	0.19	0.62	0.33	0.24
Transcript_contig_90245 (90245)	0.06	0.03	0.19	0.79	1.0	0.12	0.33	0.02	0.0	0.03	0.05
Transcript_contig_90318 (90318)	0.01	0.01	0.19	1.0	0.75	0.03	0.02	0.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_90490 (90490)	0.1	0.07	0.2	0.52	1.0	0.17	0.22	0.07	0.05	0.13	0.1
Transcript_contig_9077 (9077)	0.06	0.04	0.27	1.0	0.92	0.18	0.11	0.0	0.0	0.22	0.32
Transcript_contig_90968 (90968)	0.26	0.34	0.64	1.0	0.66	0.21	0.32	0.16	0.02	0.23	0.06
Transcript_contig_9925 (9925)	0.08	0.04	0.05	0.5	1.0	0.07	0.22	0.04	0.0	0.07	0.04

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)