Heatmap: Cluster_140 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10591 (10591)	0.41	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_10877 (10877)	0.66	1.0	0.0	0.24	0.06	0.03	0.41	0.94	0.14	0.17	0.22
Transcript_contig_1100 (1100)	0.65	0.98	0.0	0.0	0.0	0.06	0.21	1.0	0.0	0.0	0.06
Transcript_contig_11156 (11156)	0.41	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	0.07	0.0
Transcript_contig_11363 (11363)	0.53	0.9	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_1226 (1226)	0.16	0.66	0.0	0.73	0.0	0.24	0.15	0.99	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_1241 (1241)	0.54	1.0	0.09	0.04	0.03	0.02	0.03	0.96	0.0	0.05	0.0
Transcript_contig_12606 (12606)	0.41	0.65	0.2	0.15	0.06	0.12	0.02	1.0	0.16	0.13	0.09
Transcript_contig_1420 (1420)	0.6	1.0	0.09	0.08	0.09	0.12	0.09	0.82	0.08	0.23	0.14
Transcript_contig_14907 (14907)	0.77	0.98	0.27	1.0	0.16	0.3	0.59	0.8	0.72	0.07	0.14
Transcript_contig_15277 (15277)	0.53	1.0	0.03	0.0	0.11	0.11	0.24	0.58	0.7	0.03	0.04
Transcript_contig_15353 (15353)	0.38	1.0	0.0	0.0	0.0	0.07	0.07	0.99	0.0	0.27	0.0
Transcript_contig_15605 (15605)	0.21	1.0	0.0	0.09	0.0	0.34	0.0	0.77	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_16537 (16537)	0.42	0.76	0.08	0.02	0.09	0.0	0.0	1.0	0.0	0.05	0.1
Transcript_contig_16758 (16758)	0.39	0.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.0	0.02	0.0
Transcript_contig_1803 (1803)	0.4	0.72	0.06	0.09	0.11	0.0	0.05	1.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_18447 (18447)	0.48	0.73	0.07	0.05	0.04	0.0	0.13	1.0	0.0	0.09	0.0
Transcript_contig_19804 (19804)	0.5	0.78	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.04	0.0
Transcript_contig_20732 (20732)	0.51	1.0	0.05	0.03	0.0	0.04	0.11	0.56	0.0	0.0	0.12
Transcript_contig_20845 (20845)	0.59	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.44	0.29	0.24	0.1
Transcript_contig_21089 (21089)	0.23	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_2205 (2205)	0.29	0.74	0.0	0.0	0.04	0.06	0.05	1.0	0.0	0.02	0.05
Transcript_contig_2468 (2468)	0.52	0.92	0.0	0.11	0.22	0.09	0.25	1.0	0.0	0.06	0.03
Transcript_contig_2605 (2605)	0.16	0.18	0.0	0.23	0.0	0.0	0.0	0.5	1.0	0.14	0.12
Transcript_contig_27514 (27514)	0.38	0.92	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	1.0	0.02	0.01	0.01
Transcript_contig_29 (29)	0.57	0.85	0.14	0.16	0.1	0.07	0.18	1.0	0.0	0.02	0.01
Transcript_contig_40419 (40419)	0.32	1.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.82	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5585 (5585)	0.62	1.0	0.11	0.06	0.02	0.1	0.07	1.0	0.02	0.04	0.0
Transcript_contig_57785 (57785)	0.24	0.84	0.23	0.05	0.0	0.14	0.08	1.0	0.0	0.08	0.17
Transcript_contig_5970 (5970)	0.45	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.78	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_60593 (60593)	0.49	1.0	0.06	0.09	0.0	0.0	0.05	0.97	0.12	0.02	0.0
Transcript_contig_60910 (60910)	0.42	0.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61132 (61132)	0.26	0.89	0.1	0.01	0.0	0.12	0.07	1.0	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_61177 (61177)	0.44	0.65	0.06	0.0	0.0	0.03	0.11	1.0	0.02	0.04	0.07
Transcript_contig_61591 (61591)	0.49	1.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.07	0.81	0.07	0.08	0.09
Transcript_contig_61700 (61700)	0.32	0.68	0.17	0.16	0.0	0.11	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61986 (61986)	0.56	0.98	0.02	0.06	0.13	0.04	0.07	1.0	0.0	0.12	0.09
Transcript_contig_62020 (62020)	0.65	0.82	0.12	0.06	0.0	0.0	0.05	1.0	0.0	0.07	0.0
Transcript_contig_62188 (62188)	0.45	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.13	1.0	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_62317 (62317)	0.28	0.93	0.04	0.02	0.05	0.05	0.11	1.0	0.0	0.02	0.07
Transcript_contig_62457 (62457)	0.46	0.69	0.14	0.08	0.05	0.02	0.06	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_63038 (63038)	0.52	0.82	0.15	0.08	0.03	0.0	0.04	1.0	0.03	0.07	0.1
Transcript_contig_63065 (63065)	0.39	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_63639 (63639)	0.38	0.71	0.04	0.0	0.0	0.0	0.01	1.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_64648 (64648)	0.37	0.83	0.0	0.02	0.0	0.01	0.01	1.0	0.01	0.05	0.0
Transcript_contig_65382 (65382)	0.25	0.77	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_6587 (6587)	0.3	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.05	0.0
Transcript_contig_67571 (67571)	0.55	1.0	0.01	0.04	0.01	0.02	0.05	0.99	0.01	0.09	0.05
Transcript_contig_67583 (67583)	0.51	1.0	0.06	0.03	0.11	0.05	0.19	0.72	0.0	0.01	0.09
Transcript_contig_67651 (67651)	0.36	0.76	0.16	0.22	0.09	0.06	0.14	1.0	0.02	0.06	0.04
Transcript_contig_67664 (67664)	0.54	1.0	0.19	0.07	0.0	0.17	0.39	0.94	0.54	0.04	0.04
Transcript_contig_68041 (68041)	0.31	0.87	0.0	0.0	0.0	0.05	0.0	1.0	0.0	0.18	0.03
Transcript_contig_68074 (68074)	0.4	0.89	0.31	0.17	0.09	0.17	0.29	1.0	0.11	0.02	0.01
Transcript_contig_68116 (68116)	0.16	1.0	0.0	0.23	0.0	0.62	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68117 (68117)	0.81	0.8	0.2	0.14	0.03	0.12	0.08	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68120 (68120)	0.41	0.86	0.19	0.12	0.0	0.07	0.23	1.0	0.07	0.0	0.03
Transcript_contig_68199 (68199)	0.52	0.81	0.0	0.08	0.0	0.01	0.0	1.0	0.0	0.05	0.0
Transcript_contig_68313 (68313)	0.58	0.96	0.0	0.12	0.0	0.0	0.11	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68636 (68636)	0.41	1.0	0.08	0.06	0.0	0.0	0.05	0.64	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68660 (68660)	0.24	1.0	0.15	0.03	0.0	0.0	0.0	0.62	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_68872 (68872)	0.38	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.18	0.61	0.0	0.17	0.0
Transcript_contig_69650 (69650)	0.38	0.71	0.12	0.09	0.0	0.07	0.0	1.0	0.0	0.07	0.12
Transcript_contig_7045 (7045)	0.44	1.0	0.0	0.08	0.0	0.19	0.0	0.93	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_71446 (71446)	0.54	1.0	0.06	0.05	0.02	0.02	0.06	0.64	0.01	0.0	0.01
Transcript_contig_7201 (7201)	0.49	0.9	0.06	0.05	0.04	0.13	0.14	1.0	0.02	0.16	0.04
Transcript_contig_73383 (73383)	0.45	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	1.0	0.04	0.0	0.0
Transcript_contig_80581 (80581)	0.54	1.0	0.04	0.02	0.0	0.15	0.03	0.97	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_81135 (81135)	0.48	1.0	0.0	0.0	0.0	0.06	0.04	0.81	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_82222 (82222)	0.47	1.0	0.06	0.02	0.04	0.0	0.16	0.87	0.0	0.02	0.03
Transcript_contig_83137 (83137)	0.4	0.91	0.17	0.03	0.0	0.11	0.11	1.0	0.06	0.02	0.12
Transcript_contig_83204 (83204)	0.3	0.62	0.23	0.04	0.0	0.03	0.08	1.0	0.0	0.02	0.02
Transcript_contig_86825 (86825)	0.41	1.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.14	0.61	0.14	0.0	0.0
Transcript_contig_8744 (8744)	0.7	0.91	0.16	0.32	0.1	0.14	0.22	1.0	0.05	0.02	0.03
Transcript_contig_90898 (90898)	0.47	0.71	0.02	0.07	0.05	0.0	0.01	1.0	0.02	0.0	0.0
Transcript_contig_91535 (91535)	0.32	0.54	0.0	0.0	0.0	0.02	0.02	1.0	0.04	0.0	0.0
Transcript_contig_9168 (9168)	0.46	1.0	0.09	0.04	0.13	0.05	0.03	0.66	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_9563 (9563)	0.36	0.88	0.0	0.05	0.18	0.13	0.16	1.0	0.0	0.04	0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)