Heatmap: Cluster_160 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_101 (101)	0.65	0.89	0.31	0.28	0.61	0.19	0.45	1.0	0.04	0.49	0.21
Transcript_contig_1045 (1045)	0.64	0.98	0.34	0.39	0.78	0.26	0.42	1.0	0.04	0.29	0.17
Transcript_contig_1904 (1904)	0.5	0.81	0.28	0.48	0.69	0.31	0.45	1.0	0.3	0.3	0.22
Transcript_contig_1924 (1924)	0.57	0.72	0.3	0.26	0.33	0.12	0.17	1.0	0.23	0.39	0.29
Transcript_contig_2121 (2121)	0.73	1.0	0.25	0.33	0.46	0.24	0.52	0.91	0.11	0.19	0.09
Transcript_contig_2920 (2920)	0.56	1.0	0.23	0.17	0.21	0.18	0.36	0.7	0.01	0.23	0.14
Transcript_contig_3069 (3069)	0.74	1.0	0.35	0.31	0.48	0.24	0.49	0.97	0.11	0.58	0.26
Transcript_contig_3363 (3363)	0.77	1.0	0.32	0.57	0.59	0.47	0.59	0.96	0.35	0.59	0.4
Transcript_contig_3773 (3773)	0.71	1.0	0.3	0.25	0.34	0.21	0.18	0.86	0.01	0.41	0.21
Transcript_contig_3849 (3849)	0.69	0.96	0.29	0.19	0.29	0.2	0.28	1.0	0.24	0.29	0.27
Transcript_contig_3857 (3857)	0.68	1.0	0.28	0.2	0.29	0.16	0.29	0.82	0.0	0.25	0.21
Transcript_contig_4201 (4201)	0.72	0.94	0.21	0.28	0.43	0.34	0.62	1.0	0.31	0.45	0.31
Transcript_contig_5303 (5303)	0.81	1.0	0.42	0.49	0.44	0.4	0.58	0.88	0.49	0.36	0.28
Transcript_contig_53729 (53729)	0.71	0.92	0.29	0.42	0.4	0.24	0.42	1.0	0.12	0.18	0.16
Transcript_contig_53778 (53778)	0.65	0.82	0.41	0.54	0.82	0.29	0.54	1.0	0.12	0.34	0.26
Transcript_contig_53817 (53817)	0.57	0.78	0.26	0.24	0.53	0.17	0.23	1.0	0.42	0.38	0.23
Transcript_contig_53946 (53946)	0.79	1.0	0.13	0.26	0.32	0.22	0.55	0.69	0.0	0.13	0.05
Transcript_contig_54006 (54006)	0.66	0.92	0.23	0.26	0.55	0.31	0.37	1.0	0.3	0.44	0.34
Transcript_contig_54131 (54131)	0.55	0.86	0.33	0.42	0.51	0.28	0.4	1.0	0.2	0.37	0.23
Transcript_contig_54255 (54255)	0.63	1.0	0.2	0.2	0.28	0.2	0.4	0.98	0.2	0.22	0.17
Transcript_contig_54275 (54275)	0.63	0.99	0.33	0.43	0.78	0.21	0.38	1.0	0.02	0.52	0.22
Transcript_contig_54335 (54335)	0.65	0.9	0.34	0.42	0.73	0.31	0.48	1.0	0.09	0.48	0.31
Transcript_contig_54594 (54594)	0.69	0.91	0.29	0.39	0.4	0.3	0.43	1.0	0.44	0.31	0.26
Transcript_contig_55040 (55040)	0.6	0.92	0.37	0.57	0.76	0.51	0.57	1.0	0.13	0.41	0.34
Transcript_contig_55219 (55219)	0.7	1.0	0.22	0.28	0.38	0.32	0.56	0.99	0.25	0.37	0.26
Transcript_contig_55361 (55361)	0.67	1.0	0.14	0.21	0.43	0.17	0.35	0.91	0.35	0.32	0.18
Transcript_contig_55363 (55363)	0.71	0.92	0.42	0.49	0.54	0.47	0.57	1.0	0.3	0.38	0.35
Transcript_contig_55387 (55387)	0.77	1.0	0.35	0.47	0.57	0.44	0.69	0.98	0.23	0.34	0.2
Transcript_contig_55414 (55414)	0.62	0.89	0.28	0.4	0.52	0.32	0.56	1.0	0.18	0.38	0.24
Transcript_contig_55415 (55415)	0.73	0.95	0.39	0.4	0.56	0.27	0.53	1.0	0.3	0.28	0.2
Transcript_contig_55491 (55491)	0.66	0.96	0.17	0.39	0.7	0.18	0.33	1.0	0.16	0.43	0.31
Transcript_contig_55492 (55492)	0.57	0.8	0.35	0.47	0.77	0.31	0.45	1.0	0.17	0.4	0.27
Transcript_contig_55533 (55533)	0.63	0.9	0.26	0.36	0.53	0.34	0.34	1.0	0.15	0.29	0.29
Transcript_contig_55676 (55676)	0.78	0.98	0.48	0.51	0.76	0.31	0.6	1.0	0.31	0.57	0.3
Transcript_contig_55736 (55736)	0.69	0.9	0.25	0.3	0.35	0.25	0.42	1.0	0.24	0.29	0.22
Transcript_contig_55787 (55787)	0.6	0.83	0.33	0.42	0.62	0.23	0.45	1.0	0.18	0.23	0.14
Transcript_contig_55839 (55839)	0.67	1.0	0.18	0.42	0.69	0.24	0.32	0.96	0.05	0.53	0.25
Transcript_contig_55957 (55957)	0.68	0.92	0.23	0.29	0.45	0.21	0.31	1.0	0.61	0.37	0.26
Transcript_contig_55964 (55964)	0.73	0.92	0.23	0.28	0.37	0.19	0.43	1.0	0.33	0.21	0.17
Transcript_contig_56074 (56074)	0.72	0.99	0.18	0.4	0.56	0.38	0.49	1.0	0.05	0.46	0.36
Transcript_contig_56093 (56093)	0.66	0.93	0.31	0.43	0.47	0.26	0.45	1.0	0.25	0.32	0.16
Transcript_contig_56137 (56137)	0.57	0.79	0.25	0.26	0.41	0.15	0.35	1.0	0.3	0.32	0.19
Transcript_contig_56247 (56247)	0.71	1.0	0.35	0.5	0.66	0.38	0.66	0.91	0.33	0.75	0.41
Transcript_contig_56457 (56457)	0.7	1.0	0.29	0.35	0.47	0.34	0.5	0.85	0.11	0.43	0.22
Transcript_contig_56565 (56565)	0.63	0.88	0.2	0.29	0.32	0.16	0.36	1.0	0.16	0.2	0.17
Transcript_contig_56635 (56635)	0.77	1.0	0.33	0.39	0.51	0.37	0.69	0.84	0.33	0.35	0.23
Transcript_contig_56732 (56732)	0.72	1.0	0.3	0.31	0.31	0.2	0.37	0.98	0.34	0.58	0.24
Transcript_contig_56798 (56798)	0.74	1.0	0.4	0.41	0.5	0.29	0.38	0.92	0.38	0.35	0.22
Transcript_contig_56837 (56837)	0.58	0.89	0.32	0.36	0.48	0.26	0.44	1.0	0.26	0.45	0.4
Transcript_contig_57121 (57121)	0.72	0.88	0.38	0.5	0.7	0.32	0.52	1.0	0.37	0.41	0.35
Transcript_contig_57172 (57172)	0.71	0.91	0.24	0.28	0.33	0.22	0.31	1.0	0.12	0.29	0.27
Transcript_contig_57335 (57335)	0.54	0.85	0.23	0.35	0.38	0.19	0.26	1.0	0.15	0.42	0.26
Transcript_contig_57345 (57345)	0.75	1.0	0.39	0.43	0.53	0.32	0.64	0.95	0.32	0.67	0.44
Transcript_contig_57349 (57349)	0.64	0.84	0.2	0.4	0.48	0.23	0.51	1.0	0.07	0.62	0.21
Transcript_contig_57655 (57655)	0.89	1.0	0.18	0.38	0.71	0.18	0.46	0.87	0.17	0.36	0.31
Transcript_contig_57917 (57917)	0.67	1.0	0.27	0.31	0.37	0.19	0.45	0.84	0.02	0.15	0.12
Transcript_contig_58170 (58170)	0.81	1.0	0.22	0.32	0.5	0.26	0.4	1.0	0.21	0.49	0.36
Transcript_contig_58292 (58292)	0.71	1.0	0.29	0.3	0.49	0.18	0.46	0.79	0.13	0.23	0.08
Transcript_contig_58390 (58390)	0.62	0.93	0.36	0.51	0.59	0.24	0.5	1.0	0.16	0.78	0.35
Transcript_contig_58394 (58394)	0.65	0.9	0.22	0.38	0.6	0.22	0.62	1.0	0.17	0.4	0.24
Transcript_contig_58526 (58526)	0.8	0.92	0.29	0.4	0.62	0.22	0.51	1.0	0.26	0.25	0.25
Transcript_contig_58650 (58650)	0.63	0.89	0.28	0.49	0.71	0.35	0.55	1.0	0.51	0.29	0.22
Transcript_contig_58688 (58688)	0.75	0.93	0.21	0.31	0.38	0.17	0.35	1.0	0.3	0.27	0.21
Transcript_contig_58712 (58712)	0.74	0.96	0.12	0.42	0.64	0.22	0.35	1.0	0.39	0.38	0.3
Transcript_contig_58756 (58756)	0.65	0.88	0.28	0.42	0.48	0.3	0.36	1.0	0.28	0.43	0.36
Transcript_contig_58765 (58765)	0.69	0.9	0.33	0.43	0.52	0.26	0.48	1.0	0.41	0.46	0.36
Transcript_contig_58983 (58983)	0.73	0.92	0.25	0.41	0.54	0.3	0.58	1.0	0.31	0.33	0.25
Transcript_contig_59052 (59052)	0.65	0.94	0.29	0.33	0.45	0.22	0.37	1.0	0.13	0.23	0.17
Transcript_contig_59110 (59110)	0.47	0.71	0.2	0.37	0.55	0.29	0.4	1.0	0.17	0.23	0.17
Transcript_contig_59285 (59285)	0.84	0.99	0.37	0.46	0.58	0.35	0.67	1.0	0.43	0.4	0.29
Transcript_contig_59291 (59291)	0.57	0.89	0.18	0.35	0.54	0.32	0.34	1.0	0.14	0.32	0.24
Transcript_contig_59329 (59329)	0.68	0.92	0.12	0.24	0.32	0.32	0.36	1.0	0.7	0.36	0.22
Transcript_contig_59376 (59376)	0.61	0.89	0.16	0.28	0.57	0.28	0.34	1.0	0.27	0.31	0.21
Transcript_contig_59442 (59442)	0.65	0.89	0.21	0.26	0.34	0.33	0.39	1.0	0.41	0.23	0.19
Transcript_contig_59535 (59535)	0.52	0.81	0.17	0.45	0.74	0.25	0.35	1.0	0.02	0.24	0.14
Transcript_contig_59561 (59561)	0.67	0.96	0.24	0.28	0.46	0.25	0.47	1.0	0.31	0.4	0.24
Transcript_contig_59596 (59596)	0.63	1.0	0.3	0.38	0.4	0.23	0.47	0.65	0.26	0.25	0.11
Transcript_contig_59608 (59608)	0.65	0.89	0.25	0.3	0.51	0.26	0.36	1.0	0.11	0.23	0.18
Transcript_contig_59617 (59617)	0.67	0.92	0.21	0.29	0.48	0.21	0.36	1.0	0.34	0.4	0.23
Transcript_contig_59644 (59644)	0.63	0.97	0.25	0.34	0.74	0.25	0.47	1.0	0.04	0.33	0.17
Transcript_contig_59666 (59666)	0.64	0.93	0.26	0.29	0.43	0.2	0.45	1.0	0.02	0.2	0.11
Transcript_contig_59783 (59783)	0.74	1.0	0.3	0.46	0.52	0.35	0.5	0.94	0.25	0.36	0.21
Transcript_contig_59910 (59910)	0.72	0.89	0.28	0.41	0.67	0.18	0.33	1.0	0.32	0.23	0.32
Transcript_contig_59918 (59918)	0.69	0.93	0.33	0.33	0.52	0.21	0.56	1.0	0.09	0.18	0.16
Transcript_contig_60402 (60402)	0.5	0.75	0.22	0.36	0.53	0.26	0.48	1.0	0.19	0.27	0.23
Transcript_contig_60586 (60586)	0.77	1.0	0.44	0.63	0.74	0.36	0.49	1.0	0.45	0.56	0.3
Transcript_contig_61214 (61214)	0.6	0.85	0.32	0.31	0.25	0.14	0.34	1.0	0.02	0.07	0.09
Transcript_contig_61218 (61218)	0.7	1.0	0.25	0.28	0.33	0.26	0.42	0.8	0.06	0.32	0.19
Transcript_contig_61269 (61269)	0.58	0.87	0.14	0.3	0.56	0.23	0.42	1.0	0.08	0.27	0.16
Transcript_contig_61331 (61331)	0.69	0.94	0.26	0.33	0.44	0.43	0.35	1.0	0.31	0.4	0.44
Transcript_contig_62074 (62074)	0.6	0.81	0.21	0.27	0.19	0.35	0.34	1.0	0.3	0.41	0.25
Transcript_contig_66132 (66132)	0.75	1.0	0.38	0.5	0.53	0.42	0.59	1.0	0.51	0.58	0.32
Transcript_contig_66238 (66238)	0.58	0.81	0.18	0.24	0.36	0.22	0.28	1.0	0.43	0.29	0.2
Transcript_contig_672 (672)	0.8	0.97	0.26	0.53	0.86	0.29	0.56	1.0	0.47	0.25	0.25
Transcript_contig_67490 (67490)	0.69	1.0	0.19	0.23	0.41	0.27	0.5	0.73	0.31	0.14	0.09
Transcript_contig_67530 (67530)	0.69	0.98	0.31	0.33	0.4	0.18	0.45	1.0	0.19	0.26	0.19
Transcript_contig_68910 (68910)	0.77	1.0	0.17	0.34	0.43	0.27	0.62	0.92	0.06	0.3	0.16
Transcript_contig_69127 (69127)	0.73	1.0	0.23	0.33	0.41	0.27	0.47	0.94	0.04	0.31	0.2
Transcript_contig_69896 (69896)	0.69	0.95	0.24	0.29	0.34	0.31	0.37	1.0	0.27	0.34	0.27
Transcript_contig_78301 (78301)	0.7	1.0	0.36	0.56	0.83	0.32	0.64	0.86	0.08	0.51	0.24
Transcript_contig_78375 (78375)	0.72	1.0	0.3	0.41	0.52	0.3	0.65	0.9	0.2	0.41	0.26
Transcript_contig_78489 (78489)	0.64	1.0	0.25	0.44	0.4	0.38	0.43	0.7	0.08	0.39	0.31
Transcript_contig_78620 (78620)	0.66	1.0	0.24	0.3	0.35	0.27	0.33	0.69	0.26	0.36	0.23
Transcript_contig_78760 (78760)	0.6	0.85	0.39	0.54	0.41	0.27	0.4	1.0	0.22	0.44	0.3
Transcript_contig_78792 (78792)	0.57	0.9	0.32	0.36	0.59	0.45	0.58	1.0	0.05	0.52	0.29
Transcript_contig_78950 (78950)	0.51	0.84	0.22	0.3	0.32	0.15	0.32	1.0	0.14	0.17	0.1
Transcript_contig_79183 (79183)	0.55	1.0	0.15	0.31	0.6	0.2	0.25	0.87	0.19	0.41	0.29
Transcript_contig_79276 (79276)	0.73	1.0	0.32	0.4	0.45	0.3	0.47	0.95	0.25	0.36	0.26
Transcript_contig_79281 (79281)	0.65	0.88	0.28	0.34	0.52	0.3	0.42	1.0	0.39	0.42	0.36
Transcript_contig_79330 (79330)	0.72	1.0	0.37	0.26	0.48	0.19	0.35	0.94	0.04	0.29	0.19
Transcript_contig_79638 (79638)	0.72	1.0	0.3	0.34	0.35	0.19	0.48	0.92	0.13	0.23	0.19
Transcript_contig_80015 (80015)	0.71	1.0	0.19	0.39	0.38	0.3	0.45	0.83	0.41	0.22	0.15
Transcript_contig_80071 (80071)	0.67	1.0	0.26	0.3	0.3	0.25	0.5	0.71	0.03	0.2	0.13
Transcript_contig_80102 (80102)	0.55	0.8	0.28	0.32	0.35	0.32	0.39	1.0	0.04	0.26	0.31
Transcript_contig_80135 (80135)	0.69	0.91	0.38	0.42	0.36	0.21	0.31	1.0	0.55	0.34	0.29
Transcript_contig_80426 (80426)	0.72	0.98	0.24	0.37	0.42	0.3	0.42	1.0	0.21	0.36	0.24
Transcript_contig_80705 (80705)	0.67	0.79	0.36	0.49	0.72	0.2	0.46	1.0	0.0	0.44	0.25
Transcript_contig_81603 (81603)	0.87	1.0	0.18	0.65	0.8	0.14	0.72	0.74	0.0	0.89	0.36
Transcript_contig_82181 (82181)	0.61	1.0	0.3	0.37	0.53	0.43	0.66	0.84	0.16	0.66	0.33
Transcript_contig_82980 (82980)	0.61	0.93	0.33	0.5	0.8	0.22	0.4	1.0	0.05	0.3	0.17
Transcript_contig_868 (868)	0.51	0.73	0.19	0.26	0.36	0.03	0.07	1.0	0.07	0.28	0.18
Transcript_contig_89167 (89167)	0.58	0.8	0.32	0.65	0.45	0.25	0.33	1.0	0.18	0.41	0.26
Transcript_contig_89237 (89237)	0.74	1.0	0.31	0.36	0.61	0.28	0.5	0.96	0.28	0.3	0.23
Transcript_contig_89389 (89389)	0.68	0.92	0.4	0.43	0.6	0.32	0.5	1.0	0.35	0.57	0.32
Transcript_contig_89503 (89503)	0.79	1.0	0.31	0.54	0.47	0.33	0.43	0.97	0.33	0.5	0.31
Transcript_contig_89639 (89639)	0.61	0.92	0.18	0.26	0.28	0.27	0.43	1.0	0.18	0.41	0.21
Transcript_contig_89668 (89668)	0.57	0.98	0.27	0.44	0.64	0.23	0.2	1.0	0.01	0.44	0.24
Transcript_contig_89681 (89681)	0.82	0.97	0.41	0.47	0.66	0.48	0.69	1.0	0.34	0.41	0.39
Transcript_contig_89737 (89737)	0.64	0.9	0.31	0.52	0.77	0.39	0.45	1.0	0.13	0.44	0.29
Transcript_contig_90012 (90012)	0.69	0.84	0.42	0.57	0.78	0.34	0.56	1.0	0.21	0.43	0.35
Transcript_contig_90296 (90296)	0.63	0.92	0.31	0.39	0.22	0.17	0.39	1.0	0.05	0.42	0.29
Transcript_contig_90427 (90427)	0.62	0.98	0.3	0.42	0.33	0.16	0.31	1.0	0.12	0.22	0.13
Transcript_contig_90631 (90631)	0.64	0.86	0.28	0.44	0.45	0.31	0.41	1.0	0.33	0.34	0.24
Transcript_contig_90667 (90667)	0.61	0.83	0.3	0.45	0.51	0.29	0.25	1.0	0.45	0.38	0.34

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)