Heatmap: Cluster_233 (HCCA)

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View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_24 (24)	0.65	0.57	0.63	0.63	1.0	0.45	0.8	0.4	0.46	0.75	0.53
Transcript_contig_2705 (2705)	0.45	0.48	0.27	0.6	0.62	0.46	0.5	0.51	0.38	1.0	0.45
Transcript_contig_4341 (4341)	0.72	0.88	0.35	0.53	0.62	0.46	0.5	0.7	0.13	1.0	0.57
Transcript_contig_4924 (4924)	0.26	0.27	0.4	0.41	1.0	0.28	0.26	0.32	0.33	0.58	0.47
Transcript_contig_5270 (5270)	0.62	0.72	0.42	0.52	1.0	0.31	0.7	0.6	0.33	0.4	0.31
Transcript_contig_5285 (5285)	0.57	0.59	0.39	0.8	1.0	0.56	0.51	0.34	0.24	0.67	0.55
Transcript_contig_5289 (5289)	0.37	0.51	0.22	0.53	1.0	0.39	0.28	0.24	0.06	0.41	0.17
Transcript_contig_53893 (53893)	0.82	0.78	0.22	0.68	0.81	0.32	0.85	0.67	0.14	1.0	0.55
Transcript_contig_54297 (54297)	0.75	0.72	0.55	0.81	1.0	0.43	0.46	0.55	0.68	0.68	0.5
Transcript_contig_54492 (54492)	0.95	1.0	0.46	0.69	0.88	0.65	0.85	0.71	0.62	1.0	0.74
Transcript_contig_54507 (54507)	0.48	0.54	0.59	0.72	0.77	0.51	0.7	0.5	0.59	1.0	0.62
Transcript_contig_54710 (54710)	0.68	0.7	0.55	0.69	1.0	0.41	0.66	0.74	0.52	0.63	0.54
Transcript_contig_54740 (54740)	0.9	0.93	0.75	0.89	1.0	0.4	0.7	0.86	0.39	0.65	0.49
Transcript_contig_54800 (54800)	1.0	1.0	0.72	0.77	0.99	0.34	0.76	0.76	0.61	0.9	0.71
Transcript_contig_54829 (54829)	0.8	0.96	0.63	0.44	0.51	0.49	0.54	0.99	0.29	1.0	0.58
Transcript_contig_54837 (54837)	0.83	0.68	0.77	0.88	1.0	0.54	0.9	0.47	0.55	0.82	0.52
Transcript_contig_54983 (54983)	0.96	0.83	0.49	0.68	0.91	0.61	1.0	0.54	0.23	0.72	0.62
Transcript_contig_55016 (55016)	0.83	0.88	0.72	0.76	1.0	0.53	0.73	0.74	0.18	0.54	0.42
Transcript_contig_55054 (55054)	0.67	0.79	0.64	1.0	0.99	0.53	0.58	0.78	0.87	0.69	0.5
Transcript_contig_55118 (55118)	0.4	0.38	0.56	0.64	0.71	0.45	0.59	0.44	0.43	1.0	0.6
Transcript_contig_55133 (55133)	0.43	0.45	0.1	0.55	1.0	0.34	0.36	0.3	0.14	0.52	0.35
Transcript_contig_55242 (55242)	0.85	0.8	0.49	0.75	0.88	0.48	0.81	0.42	1.0	0.73	0.49
Transcript_contig_55299 (55299)	0.53	0.62	0.44	0.7	0.93	0.31	0.67	1.0	0.7	0.58	0.4
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Transcript_contig_55712 (55712)	0.94	1.0	0.52	0.77	0.95	0.31	0.69	0.94	0.52	0.66	0.47
Transcript_contig_55838 (55838)	0.95	0.92	0.58	0.81	1.0	0.7	0.94	0.81	0.59	0.95	0.71
Transcript_contig_55891 (55891)	0.98	0.98	0.79	1.0	0.94	0.54	0.65	0.7	0.88	0.9	0.6
Transcript_contig_55950 (55950)	0.51	0.5	0.7	0.85	1.0	0.44	0.58	0.51	0.4	0.8	0.6
Transcript_contig_56034 (56034)	0.57	0.62	0.55	0.66	1.0	0.44	0.52	0.56	0.63	0.51	0.37
Transcript_contig_56082 (56082)	0.79	0.92	0.71	0.78	0.83	0.67	0.67	1.0	0.15	0.88	0.68
Transcript_contig_56157 (56157)	0.55	0.46	0.62	0.85	1.0	0.37	0.62	0.42	0.49	0.43	0.41
Transcript_contig_56442 (56442)	0.69	0.8	0.58	0.62	1.0	0.59	0.76	0.69	0.66	0.67	0.53
Transcript_contig_56460 (56460)	0.78	0.85	0.48	0.68	1.0	0.55	0.67	0.69	0.4	0.71	0.52
Transcript_contig_56582 (56582)	0.7	0.75	0.41	0.7	1.0	0.29	0.69	0.7	0.82	0.45	0.23
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Transcript_contig_57340 (57340)	0.91	1.0	0.52	0.75	0.8	0.6	0.89	0.93	0.86	0.87	0.5
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Transcript_contig_60105 (60105)	0.73	0.78	0.47	0.59	1.0	0.43	0.73	0.78	0.48	0.8	0.6
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Transcript_contig_78066 (78066)	0.82	0.84	0.67	0.72	0.85	0.26	0.64	1.0	0.38	0.88	0.52
Transcript_contig_78169 (78169)	0.69	0.68	0.61	0.64	1.0	0.31	0.67	0.76	0.66	0.47	0.42
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Transcript_contig_78261 (78261)	0.45	0.35	0.36	0.56	1.0	0.43	0.44	0.44	0.44	0.67	0.49
Transcript_contig_78603 (78603)	0.75	0.78	0.5	0.62	1.0	0.27	0.55	0.57	0.35	0.5	0.38
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Transcript_contig_82440 (82440)	0.7	0.81	0.56	0.61	0.96	0.54	0.83	1.0	0.82	0.73	0.44
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Transcript_contig_89341 (89341)	0.67	0.62	0.57	0.69	1.0	0.24	0.53	0.4	0.27	0.51	0.38
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Transcript_contig_89543 (89543)	0.93	0.83	0.48	0.72	0.71	0.57	1.0	0.47	0.59	0.72	0.46
Transcript_contig_89734 (89734)	0.8	0.86	0.68	0.91	1.0	0.42	0.63	0.43	0.88	0.66	0.51
Transcript_contig_89885 (89885)	0.47	0.56	0.64	0.71	1.0	0.31	0.44	0.75	0.23	0.46	0.33
Transcript_contig_90349 (90349)	0.95	0.94	0.69	0.69	1.0	0.75	0.69	0.6	0.51	0.99	0.72
Transcript_contig_90624 (90624)	0.87	0.94	0.7	0.83	1.0	0.63	0.83	0.52	0.25	0.98	0.66

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)