Heatmap: Cluster_128 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_13337 (13337)	0.08	0.0	1.0	0.13	0.21	0.75	0.66	0.47	0.31	0.55	0.38
Transcript_contig_13580 (13580)	0.05	0.01	0.79	0.34	0.19	1.0	0.91	0.01	0.21	0.66	0.42
Transcript_contig_13610 (13610)	0.21	0.11	0.23	0.22	0.51	1.0	0.92	0.1	0.11	0.58	0.4
Transcript_contig_1452 (1452)	0.29	0.29	0.33	0.17	0.32	0.38	1.0	0.25	0.23	0.15	0.15
Transcript_contig_18880 (18880)	0.08	0.0	0.36	0.39	0.21	1.0	0.99	0.0	0.0	0.86	0.34
Transcript_contig_2165 (2165)	0.44	0.51	0.4	0.36	0.62	0.51	1.0	0.42	0.31	0.4	0.23
Transcript_contig_54066 (54066)	0.64	0.62	0.66	0.7	0.62	0.9	1.0	0.42	0.6	0.85	0.57
Transcript_contig_54559 (54559)	0.5	0.56	0.31	0.43	0.55	0.69	1.0	0.81	0.09	0.79	0.36
Transcript_contig_54747 (54747)	0.34	0.3	0.52	0.42	0.39	0.94	1.0	0.25	0.16	0.78	0.7
Transcript_contig_55091 (55091)	0.53	0.34	0.39	0.36	0.41	0.65	1.0	0.16	0.4	0.62	0.39
Transcript_contig_55526 (55526)	0.42	0.53	0.26	0.37	0.54	0.47	1.0	0.69	0.04	0.4	0.22
Transcript_contig_55861 (55861)	0.14	0.11	0.85	0.45	0.35	0.87	0.8	0.11	0.3	1.0	0.95
Transcript_contig_56198 (56198)	0.3	0.3	0.28	0.33	0.37	0.43	1.0	0.23	0.02	0.45	0.29
Transcript_contig_56639 (56639)	0.24	0.08	0.22	0.25	0.24	1.0	1.0	0.08	0.0	0.57	0.34
Transcript_contig_56642 (56642)	0.4	0.46	0.3	0.65	1.0	0.49	0.89	0.54	0.04	0.41	0.31
Transcript_contig_56935 (56935)	0.57	0.5	0.19	0.28	0.31	0.58	1.0	0.53	0.36	0.61	0.37
Transcript_contig_57405 (57405)	0.18	0.05	0.36	0.22	0.31	0.62	1.0	0.05	0.14	0.24	0.22
Transcript_contig_57678 (57678)	0.33	0.36	0.25	0.22	0.33	0.4	1.0	0.25	0.02	0.12	0.13
Transcript_contig_57840 (57840)	0.15	0.1	0.38	0.51	0.25	0.69	1.0	0.2	0.35	0.74	0.56
Transcript_contig_57988 (57988)	0.15	0.03	0.39	0.19	0.29	0.63	1.0	0.02	0.01	0.22	0.21
Transcript_contig_58064 (58064)	0.48	0.4	0.3	0.29	0.29	0.5	1.0	0.49	0.57	0.72	0.38
Transcript_contig_58985 (58985)	0.4	0.35	0.46	0.3	0.39	0.76	1.0	0.33	0.09	0.65	0.54
Transcript_contig_59023 (59023)	0.35	0.45	0.45	0.53	0.56	0.64	1.0	0.47	0.21	0.41	0.39
Transcript_contig_59723 (59723)	0.19	0.02	0.63	0.31	0.18	1.0	0.74	0.04	0.53	0.74	0.49
Transcript_contig_59988 (59988)	0.05	0.1	0.31	0.14	0.1	1.0	0.51	0.11	0.06	0.36	0.16
Transcript_contig_60475 (60475)	0.09	0.01	0.42	0.24	0.11	1.0	0.74	0.02	0.34	0.95	0.89
Transcript_contig_61528 (61528)	0.03	0.14	0.46	0.27	0.51	0.99	1.0	0.0	0.0	0.37	0.14
Transcript_contig_61566 (61566)	0.22	0.0	0.9	0.67	0.75	0.9	0.25	0.0	0.16	0.96	1.0
Transcript_contig_61996 (61996)	0.33	0.25	0.29	0.37	0.34	0.61	1.0	0.3	0.11	0.42	0.31
Transcript_contig_63329 (63329)	0.05	0.0	0.11	0.18	0.17	1.0	0.59	0.0	0.1	0.31	0.57
Transcript_contig_64488 (64488)	0.18	0.08	0.39	0.27	0.45	0.77	1.0	0.15	0.16	0.37	0.45
Transcript_contig_65832 (65832)	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	1.0	0.57	0.0	0.0	0.45	0.0
Transcript_contig_6645 (6645)	0.49	0.48	0.5	0.43	0.7	0.52	1.0	0.5	0.01	0.53	0.25
Transcript_contig_67473 (67473)	0.03	0.0	0.55	0.21	0.03	1.0	0.57	0.0	0.14	0.25	0.28
Transcript_contig_6817 (6817)	0.19	0.16	0.17	0.4	1.0	0.24	0.63	0.32	0.29	0.45	0.37
Transcript_contig_68377 (68377)	0.29	0.07	0.36	0.37	0.24	0.82	1.0	0.03	0.19	0.75	0.36
Transcript_contig_69690 (69690)	0.14	0.11	0.59	0.53	0.27	1.0	0.87	0.13	0.01	0.42	0.46
Transcript_contig_70713 (70713)	0.35	0.35	0.45	0.41	0.46	0.53	1.0	0.38	0.18	0.45	0.31
Transcript_contig_72288 (72288)	0.24	0.02	0.24	0.3	0.27	0.89	0.71	0.01	0.1	1.0	0.61
Transcript_contig_72709 (72709)	0.2	0.01	0.43	0.42	0.59	0.68	1.0	0.0	0.0	0.27	0.33
Transcript_contig_750 (750)	0.19	0.12	0.08	0.66	0.73	0.69	0.08	0.06	0.44	1.0	0.62
Transcript_contig_78918 (78918)	0.14	0.05	0.29	0.27	0.41	0.62	1.0	0.04	0.1	0.31	0.28
Transcript_contig_79004 (79004)	0.51	0.59	0.47	0.43	0.57	0.57	1.0	0.54	0.45	0.46	0.28
Transcript_contig_79270 (79270)	0.7	0.55	0.31	0.7	1.0	0.75	0.93	0.23	0.55	0.97	0.74
Transcript_contig_79367 (79367)	0.12	0.0	0.54	0.48	0.44	1.0	0.81	0.0	0.29	0.52	0.32
Transcript_contig_79370 (79370)	0.32	0.21	0.38	0.43	0.57	0.8	1.0	0.18	0.05	0.59	0.34
Transcript_contig_79591 (79591)	0.23	0.0	0.31	0.45	0.57	0.73	1.0	0.0	0.05	0.36	0.42
Transcript_contig_80028 (80028)	0.31	0.29	0.38	0.32	0.45	0.42	1.0	0.16	0.02	0.22	0.2
Transcript_contig_80379 (80379)	0.28	0.33	0.59	0.79	1.0	0.54	0.89	0.61	0.2	0.41	0.28
Transcript_contig_89398 (89398)	0.26	0.31	0.34	0.4	0.37	0.62	1.0	0.21	0.03	0.52	0.26
Transcript_contig_89860 (89860)	0.23	0.0	0.35	0.62	0.42	0.49	1.0	0.0	0.0	0.34	0.44
Transcript_contig_89886 (89886)	0.4	0.5	0.54	0.61	0.57	0.67	1.0	0.35	0.29	0.52	0.38
Transcript_contig_91010 (91010)	0.39	0.22	0.26	0.73	0.75	0.84	0.62	0.13	0.84	0.96	1.0
Transcript_contig_945 (945)	0.18	0.12	0.32	0.44	0.67	0.46	1.0	0.11	0.07	0.52	0.31

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)