Heatmap: Cluster_126 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1532 (1532)	0.44	0.59	0.83	0.5	0.14	0.35	0.43	0.49	0.57	1.0	0.62
Transcript_contig_16649 (16649)	0.17	0.2	0.05	0.22	0.6	0.31	0.1	0.1	0.35	1.0	0.31
Transcript_contig_2175 (2175)	0.87	1.0	0.53	0.47	0.27	0.46	0.84	0.71	0.22	0.66	0.43
Transcript_contig_2304 (2304)	0.5	0.53	0.19	0.53	1.0	0.3	0.24	0.43	0.12	0.55	0.48
Transcript_contig_4010 (4010)	0.43	0.54	0.19	0.2	0.11	0.07	0.28	0.37	1.0	0.15	0.12
Transcript_contig_4288 (4288)	0.7	0.61	0.31	0.67	0.9	0.59	1.0	0.64	0.03	0.83	0.39
Transcript_contig_53724 (53724)	0.57	0.72	0.45	0.79	1.0	0.61	0.58	0.69	0.15	0.69	0.45
Transcript_contig_54099 (54099)	1.0	0.97	0.44	0.65	0.78	0.67	0.87	0.77	0.62	0.82	0.56
Transcript_contig_54124 (54124)	0.57	0.68	0.1	1.0	0.82	0.46	0.5	0.51	0.31	0.51	0.34
Transcript_contig_54176 (54176)	0.92	1.0	0.84	0.66	0.49	0.46	0.79	0.65	0.58	0.59	0.39
Transcript_contig_54241 (54241)	1.0	0.87	0.27	0.29	0.29	0.36	0.29	0.35	0.7	0.96	0.62
Transcript_contig_54647 (54647)	0.97	1.0	0.56	0.23	0.08	0.16	0.29	0.85	0.89	0.42	0.47
Transcript_contig_54790 (54790)	0.67	0.72	0.18	0.1	0.08	0.18	0.29	0.67	1.0	0.43	0.39
Transcript_contig_54813 (54813)	0.22	0.21	0.14	0.72	1.0	0.27	0.36	0.26	0.11	0.24	0.26
Transcript_contig_54847 (54847)	0.85	0.97	0.44	0.36	0.32	0.56	0.9	0.84	0.91	1.0	0.62
Transcript_contig_54874 (54874)	1.0	0.96	0.53	0.68	0.94	0.45	0.7	0.77	0.58	0.81	0.66
Transcript_contig_54946 (54946)	0.74	0.69	0.22	0.5	0.6	0.45	0.45	0.44	0.44	1.0	0.66
Transcript_contig_54957 (54957)	0.8	0.94	0.36	0.5	0.65	0.57	0.73	1.0	0.47	0.92	0.62
Transcript_contig_55014 (55014)	0.84	1.0	0.18	0.35	0.44	0.36	0.56	0.63	0.37	0.85	0.45
Transcript_contig_55130 (55130)	0.71	0.79	0.57	0.42	0.24	0.36	0.36	0.5	0.44	1.0	0.67
Transcript_contig_55233 (55233)	0.87	1.0	0.32	0.47	0.51	0.38	0.66	0.78	0.87	0.77	0.57
Transcript_contig_55263 (55263)	0.74	0.71	0.35	0.29	0.32	0.24	0.48	0.51	1.0	0.29	0.31
Transcript_contig_55535 (55535)	0.87	1.0	0.44	0.51	0.61	0.33	0.45	0.92	0.23	0.85	0.59
Transcript_contig_55625 (55625)	0.19	0.18	0.31	0.8	1.0	0.43	0.86	0.24	0.06	0.15	0.17
Transcript_contig_55703 (55703)	0.82	1.0	0.51	0.49	0.55	0.62	0.7	0.79	0.77	0.72	0.44
Transcript_contig_55771 (55771)	0.66	0.62	1.0	0.57	0.32	0.34	0.46	0.57	0.16	0.86	0.61
Transcript_contig_55894 (55894)	1.0	0.98	0.61	0.56	0.51	0.58	0.61	0.73	0.97	1.0	0.69
Transcript_contig_55940 (55940)	0.54	0.68	0.44	0.61	1.0	0.62	0.75	0.42	0.32	0.89	0.54
Transcript_contig_56121 (56121)	0.75	0.78	0.31	0.53	0.38	0.45	0.48	0.62	0.2	1.0	0.69
Transcript_contig_56218 (56218)	0.87	1.0	0.34	0.48	0.4	0.52	0.64	0.88	0.5	0.81	0.44
Transcript_contig_56410 (56410)	0.91	1.0	0.5	0.27	0.06	0.18	0.36	0.73	0.28	0.48	0.34
Transcript_contig_56416 (56416)	0.81	0.87	0.39	0.49	0.28	0.4	0.33	0.52	0.53	1.0	0.67
Transcript_contig_56445 (56445)	0.32	0.3	0.26	0.95	1.0	0.74	0.68	0.39	0.28	0.52	0.67
Transcript_contig_56541 (56541)	0.36	0.25	0.41	0.2	0.09	0.22	0.1	0.05	1.0	0.53	0.45
Transcript_contig_56567 (56567)	0.63	0.69	0.55	0.5	0.68	0.34	0.48	0.71	1.0	0.64	0.44
Transcript_contig_56630 (56630)	0.19	0.17	0.21	0.53	1.0	0.52	0.3	0.13	0.37	0.71	0.53
Transcript_contig_56942 (56942)	0.79	1.0	0.32	0.4	0.31	0.31	0.42	0.45	0.56	0.87	0.49
Transcript_contig_57330 (57330)	0.73	0.92	0.33	0.7	1.0	0.51	0.64	0.91	0.25	0.6	0.36
Transcript_contig_57646 (57646)	0.64	0.71	0.18	0.44	1.0	0.2	0.21	0.31	0.05	0.5	0.29
Transcript_contig_57905 (57905)	0.45	0.7	0.51	0.88	1.0	0.75	0.65	0.92	0.04	0.95	0.62
Transcript_contig_58189 (58189)	0.44	0.6	0.4	0.69	0.9	0.56	0.51	0.61	0.24	1.0	0.47
Transcript_contig_58252 (58252)	0.35	0.51	0.29	0.61	0.84	0.72	1.0	0.72	0.06	0.77	0.47
Transcript_contig_58293 (58293)	0.8	0.95	0.37	0.43	0.45	0.39	0.63	0.77	0.3	1.0	0.5
Transcript_contig_58306 (58306)	0.3	0.42	0.26	0.75	1.0	0.48	0.23	0.3	0.04	0.87	0.53
Transcript_contig_58573 (58573)	0.48	0.66	0.28	0.78	1.0	0.28	0.39	0.76	0.27	0.47	0.34
Transcript_contig_58683 (58683)	0.64	1.0	0.26	0.48	0.46	0.43	0.58	0.42	0.37	0.45	0.2
Transcript_contig_59390 (59390)	0.73	0.71	0.71	0.8	0.84	0.72	0.89	0.89	0.46	1.0	0.79
Transcript_contig_59411 (59411)	0.62	0.6	0.11	0.71	1.0	0.52	0.57	0.67	0.22	0.78	0.55
Transcript_contig_59807 (59807)	0.32	1.0	0.09	0.88	0.11	0.2	0.12	0.18	0.0	0.2	0.05
Transcript_contig_59916 (59916)	0.59	1.0	0.43	0.75	0.76	0.24	0.37	0.3	0.0	0.74	0.37
Transcript_contig_60020 (60020)	0.62	0.67	0.5	0.78	1.0	0.37	0.65	0.54	0.21	0.51	0.37
Transcript_contig_60755 (60755)	0.75	0.73	0.69	0.59	0.32	0.46	0.48	0.58	1.0	0.86	0.62
Transcript_contig_60937 (60937)	0.86	0.66	0.9	0.39	0.0	0.27	0.12	0.09	0.75	1.0	0.54
Transcript_contig_61259 (61259)	0.35	0.34	0.01	0.02	0.01	0.16	0.04	0.53	1.0	0.41	0.42
Transcript_contig_61262 (61262)	0.99	0.85	0.8	0.52	0.35	0.35	0.46	0.41	0.41	1.0	0.84
Transcript_contig_67520 (67520)	1.0	0.96	0.17	0.19	0.18	0.24	0.21	0.37	0.69	0.66	0.47
Transcript_contig_67860 (67860)	0.64	0.79	0.29	0.53	0.71	0.3	0.29	1.0	0.52	0.6	0.52
Transcript_contig_78061 (78061)	1.0	0.95	0.74	0.55	0.4	0.39	0.96	0.86	0.4	0.59	0.56
Transcript_contig_78094 (78094)	0.63	0.64	0.36	0.31	0.31	0.76	0.77	0.43	1.0	0.73	0.6
Transcript_contig_78118 (78118)	0.81	0.89	0.49	0.65	0.74	0.54	0.75	0.56	0.96	1.0	0.71
Transcript_contig_78165 (78165)	0.9	1.0	0.53	0.56	0.71	0.38	0.63	0.98	0.61	0.71	0.55
Transcript_contig_78292 (78292)	0.93	1.0	0.31	0.41	0.48	0.47	0.99	0.89	0.43	0.48	0.4
Transcript_contig_78776 (78776)	0.85	1.0	0.3	0.21	0.12	0.17	0.25	0.57	0.3	0.72	0.38
Transcript_contig_78816 (78816)	0.81	1.0	0.63	0.54	0.54	0.4	0.48	0.8	0.41	0.81	0.5
Transcript_contig_79450 (79450)	0.69	1.0	0.88	0.86	0.45	0.5	0.78	0.61	0.13	0.55	0.43
Transcript_contig_79482 (79482)	0.76	0.98	1.0	0.86	0.9	0.42	0.57	0.96	0.06	0.88	0.7
Transcript_contig_79522 (79522)	0.37	0.47	0.57	1.0	0.67	0.33	0.69	0.39	0.05	0.3	0.2
Transcript_contig_79774 (79774)	0.47	0.63	0.24	0.42	0.45	0.45	0.31	0.68	0.37	1.0	0.6
Transcript_contig_80043 (80043)	0.89	0.92	0.77	0.98	1.0	0.56	0.88	0.8	0.79	0.61	0.48
Transcript_contig_80066 (80066)	0.09	0.04	0.15	0.66	1.0	0.18	0.33	0.04	0.02	0.1	0.1
Transcript_contig_80123 (80123)	0.43	0.5	0.22	0.27	0.21	0.49	0.32	0.47	0.17	1.0	0.69
Transcript_contig_83524 (83524)	0.39	0.38	0.12	0.16	0.14	0.27	0.19	0.23	1.0	0.53	0.41
Transcript_contig_89159 (89159)	0.89	1.0	0.5	0.37	0.31	0.26	0.47	0.6	0.82	0.78	0.48
Transcript_contig_89174 (89174)	0.73	0.53	0.15	0.09	0.04	0.08	0.13	0.35	1.0	0.78	0.69
Transcript_contig_89245 (89245)	0.3	0.24	0.38	0.64	1.0	0.45	0.5	0.32	0.36	0.37	0.37
Transcript_contig_89368 (89368)	0.8	0.97	0.28	0.55	1.0	0.45	0.57	0.91	0.2	0.57	0.46
Transcript_contig_89834 (89834)	0.64	1.0	0.55	0.33	0.16	0.28	0.44	0.64	0.04	0.8	0.48
Transcript_contig_89900 (89900)	0.65	0.74	0.3	0.52	1.0	0.4	0.56	0.77	0.44	0.57	0.45
Transcript_contig_90176 (90176)	0.74	0.94	0.22	0.28	0.53	0.2	0.3	1.0	0.33	0.4	0.29
Transcript_contig_90224 (90224)	0.3	0.41	0.24	0.8	1.0	0.35	0.35	0.46	0.04	0.4	0.37
Transcript_contig_90469 (90469)	0.37	0.24	0.18	0.52	0.61	0.37	0.3	0.16	0.22	1.0	0.69
Transcript_contig_974 (974)	0.52	0.65	0.42	0.65	0.67	0.36	0.52	0.76	0.23	1.0	0.56
Transcript_contig_990 (990)	0.85	0.92	0.57	0.57	0.69	0.48	1.0	0.85	0.07	0.49	0.38

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)