Heatmap: Cluster_136 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1197 (1197)	0.19	0.18	0.0	0.01	0.05	0.58	0.31	0.06	0.01	0.29	1.0
Transcript_contig_14276 (14276)	0.12	0.02	0.04	0.06	0.0	1.0	0.03	0.0	0.0	0.05	0.82
Transcript_contig_18223 (18223)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.45	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_19424 (19424)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.22	1.0
Transcript_contig_22151 (22151)	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_29676 (29676)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_3750 (3750)	0.42	0.01	0.0	0.0	0.0	0.76	0.03	0.0	0.16	0.76	1.0
Transcript_contig_4068 (4068)	0.38	0.28	0.51	0.3	0.04	0.45	0.59	0.49	0.13	0.03	1.0
Transcript_contig_42111 (42111)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.61	0.0	0.25	0.0	0.35
Transcript_contig_42121 (42121)	0.53	0.0	0.03	0.01	0.0	0.56	0.26	0.0	0.46	1.0	1.0
Transcript_contig_42923 (42923)	0.04	0.06	0.29	0.07	0.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.37	1.0
Transcript_contig_44048 (44048)	0.2	0.08	0.0	0.16	0.0	0.21	0.67	0.0	0.0	0.23	1.0
Transcript_contig_5060 (5060)	0.1	0.09	0.31	0.0	0.0	1.0	0.21	0.18	0.0	0.0	0.93
Transcript_contig_52967 (52967)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.96
Transcript_contig_53716 (53716)	0.07	0.01	0.28	0.15	0.03	0.43	0.06	0.0	0.13	0.23	1.0
Transcript_contig_55859 (55859)	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	1.0	0.03	0.05	0.09	0.05	0.34
Transcript_contig_57952 (57952)	0.01	0.02	0.2	0.09	0.05	0.53	0.08	0.0	0.18	0.2	1.0
Transcript_contig_58036 (58036)	0.47	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.0	0.0	1.0	0.75	0.68
Transcript_contig_58038 (58038)	0.0	0.0	0.05	0.0	0.0	1.0	0.15	0.0	0.27	0.09	0.61
Transcript_contig_58300 (58300)	0.03	0.03	0.07	0.03	0.02	0.61	0.04	0.0	0.0	0.01	1.0
Transcript_contig_58989 (58989)	0.06	0.07	0.19	0.12	0.11	1.0	0.41	0.21	0.26	0.29	0.81
Transcript_contig_59776 (59776)	0.01	0.0	0.2	0.19	0.08	0.48	0.07	0.0	0.0	0.24	1.0
Transcript_contig_60799 (60799)	0.03	0.1	0.16	0.04	0.02	0.85	0.4	0.13	0.04	0.12	1.0
Transcript_contig_61008 (61008)	0.18	0.33	0.12	0.0	0.0	0.7	0.2	0.34	0.4	0.08	1.0
Transcript_contig_61054 (61054)	0.0	0.0	0.3	0.0	0.12	0.44	0.29	0.0	0.0	0.22	1.0
Transcript_contig_61168 (61168)	0.07	0.01	0.03	0.01	0.0	0.76	0.16	0.0	0.04	0.58	1.0
Transcript_contig_61322 (61322)	0.44	0.0	0.13	0.04	0.0	0.65	0.03	0.0	0.0	0.37	1.0
Transcript_contig_65845 (65845)	0.79	0.67	0.51	0.89	0.3	0.74	0.15	0.52	0.0	1.0	0.91
Transcript_contig_66144 (66144)	0.03	0.0	0.0	0.05	0.0	0.45	0.08	0.0	0.2	0.44	1.0
Transcript_contig_66251 (66251)	0.09	0.0	0.16	0.11	0.14	1.0	0.23	0.0	0.98	0.39	0.44
Transcript_contig_67936 (67936)	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	1.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.98
Transcript_contig_68294 (68294)	0.27	0.34	0.04	0.0	0.0	1.0	0.05	0.37	0.0	0.0	0.67
Transcript_contig_68407 (68407)	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.42	0.2	0.0	0.0	0.45	1.0
Transcript_contig_68605 (68605)	0.0	0.0	0.19	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.21
Transcript_contig_7099 (7099)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_72663 (72663)	0.09	0.01	0.01	0.01	0.02	0.58	0.02	0.01	1.0	0.15	0.94
Transcript_contig_7450 (7450)	0.15	0.0	0.37	0.11	0.0	1.0	0.13	0.08	0.0	0.4	0.6
Transcript_contig_76456 (76456)	0.03	0.0	0.03	0.0	0.0	0.65	0.0	0.0	0.17	0.5	1.0
Transcript_contig_79731 (79731)	0.03	0.01	0.07	0.03	0.0	0.68	0.09	0.0	0.06	0.33	1.0
Transcript_contig_79742 (79742)	0.02	0.03	0.04	0.02	0.0	0.72	0.08	0.01	0.0	0.31	1.0
Transcript_contig_79767 (79767)	0.0	0.0	0.09	0.05	0.0	0.87	0.04	0.0	0.0	0.32	1.0
Transcript_contig_80667 (80667)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.58
Transcript_contig_80679 (80679)	0.28	0.32	0.37	0.27	0.03	0.89	0.15	0.39	0.44	0.42	1.0
Transcript_contig_81301 (81301)	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_81492 (81492)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.6
Transcript_contig_82284 (82284)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.47	0.0	0.0	0.0	0.19	1.0
Transcript_contig_83889 (83889)	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.1	0.08	0.0	0.0	0.04	1.0
Transcript_contig_84472 (84472)	0.02	0.0	0.24	0.14	0.0	0.32	0.06	0.0	0.0	0.34	1.0
Transcript_contig_85985 (85985)	0.58	0.0	1.0	0.0	0.0	0.48	0.59	0.0	0.0	0.83	0.0
Transcript_contig_87643 (87643)	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_90116 (90116)	0.34	0.52	0.21	0.37	0.58	0.85	0.57	0.0	0.0	0.35	1.0
Transcript_contig_91476 (91476)	0.0	0.0	0.12	0.11	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.27	1.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)