Heatmap: Cluster_217 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10060 (10060)	0.44	0.23	0.43	0.44	0.81	0.42	0.23	0.39	0.03	1.0	0.75
Transcript_contig_10170 (10170)	0.58	0.15	0.27	0.41	0.36	0.17	0.58	0.13	0.07	1.0	0.79
Transcript_contig_13424 (13424)	0.39	0.23	0.05	0.07	0.02	0.06	0.09	0.33	0.0	1.0	0.65
Transcript_contig_14641 (14641)	0.67	0.07	0.03	0.05	0.03	0.03	0.03	0.12	0.19	0.75	1.0
Transcript_contig_14955 (14955)	0.93	0.0	0.0	0.39	0.0	0.0	0.0	0.0	0.32	0.73	1.0
Transcript_contig_1575 (1575)	0.66	0.32	0.15	0.4	0.18	0.32	0.28	0.26	1.0	0.72	1.0
Transcript_contig_2101 (2101)	0.62	0.32	0.25	0.33	0.44	0.23	0.37	0.25	0.01	1.0	0.85
Transcript_contig_3464 (3464)	0.51	0.0	0.0	0.0	0.03	0.01	0.0	0.0	0.25	1.0	0.94
Transcript_contig_4927 (4927)	0.48	0.09	0.14	0.09	0.43	0.46	0.4	0.07	0.58	1.0	0.78
Transcript_contig_5246 (5246)	0.99	0.31	0.4	0.19	0.01	0.21	0.44	0.16	0.03	1.0	0.94
Transcript_contig_54521 (54521)	0.56	0.16	0.22	0.22	0.3	0.3	0.4	0.17	0.38	0.66	1.0
Transcript_contig_55032 (55032)	0.65	0.32	0.24	0.58	0.87	0.33	0.28	0.3	0.9	1.0	0.97
Transcript_contig_55059 (55059)	0.57	0.1	0.06	0.38	0.58	0.25	0.16	0.1	0.11	0.85	1.0
Transcript_contig_57610 (57610)	0.5	0.25	0.24	0.32	0.45	0.28	0.25	0.24	0.24	1.0	0.83
Transcript_contig_57719 (57719)	0.7	0.11	0.02	0.02	0.0	0.28	0.58	0.07	0.5	0.88	1.0
Transcript_contig_58540 (58540)	0.57	0.29	0.22	0.23	0.21	0.24	0.29	0.1	0.81	0.59	1.0
Transcript_contig_58702 (58702)	0.88	0.63	0.23	0.3	0.35	0.16	0.25	0.45	0.01	0.93	1.0
Transcript_contig_58970 (58970)	0.8	0.48	0.62	0.48	0.52	0.24	0.44	0.47	0.86	1.0	0.96
Transcript_contig_59136 (59136)	0.73	0.29	0.08	0.07	0.01	0.08	0.18	0.44	0.11	0.78	1.0
Transcript_contig_5925 (5925)	0.72	0.54	0.17	0.08	0.13	0.2	0.15	0.46	0.2	1.0	0.69
Transcript_contig_59263 (59263)	0.78	0.4	1.0	0.57	0.62	0.3	0.47	0.46	0.54	0.96	0.93
Transcript_contig_59541 (59541)	0.52	0.2	0.38	0.34	0.48	0.37	0.41	0.31	0.74	1.0	0.93
Transcript_contig_59620 (59620)	1.0	0.88	0.3	0.33	0.51	0.34	0.51	0.93	0.77	0.92	0.91
Transcript_contig_59863 (59863)	0.34	0.03	0.1	0.33	0.34	0.32	0.15	0.04	0.18	1.0	0.68
Transcript_contig_60142 (60142)	0.63	0.21	0.48	0.31	0.08	0.56	0.49	0.15	0.23	1.0	0.92
Transcript_contig_60821 (60821)	0.73	0.32	0.34	0.19	0.18	0.28	0.24	0.46	0.25	0.96	1.0
Transcript_contig_61255 (61255)	0.89	0.46	0.8	0.66	0.67	0.32	0.52	0.31	0.28	0.99	1.0
Transcript_contig_61306 (61306)	0.44	0.18	0.08	0.2	0.1	0.28	0.13	0.16	0.04	1.0	0.88
Transcript_contig_61452 (61452)	0.82	0.09	0.27	0.38	0.42	0.18	0.28	0.02	0.59	0.85	1.0
Transcript_contig_62380 (62380)	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	1.0
Transcript_contig_62615 (62615)	0.52	0.05	0.02	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.13	1.0	0.85
Transcript_contig_63130 (63130)	0.69	0.29	0.18	0.35	0.22	0.09	0.14	0.35	0.09	1.0	0.81
Transcript_contig_63633 (63633)	0.36	0.0	0.05	0.36	0.11	0.13	0.24	0.0	0.0	0.4	1.0
Transcript_contig_67580 (67580)	0.41	0.06	0.01	0.03	0.02	0.09	0.03	0.06	0.58	1.0	0.66
Transcript_contig_67841 (67841)	1.0	0.35	0.08	0.02	0.0	0.04	0.05	0.37	0.36	0.68	0.81
Transcript_contig_68511 (68511)	0.41	0.1	0.0	0.09	0.0	0.0	0.39	0.0	0.87	1.0	0.96
Transcript_contig_69474 (69474)	0.38	0.05	0.18	0.25	0.36	0.13	0.26	0.13	0.02	0.91	1.0
Transcript_contig_70063 (70063)	0.53	0.28	0.26	0.26	0.41	0.21	0.38	0.33	0.37	1.0	0.83
Transcript_contig_70794 (70794)	0.21	0.04	0.14	0.05	0.0	0.14	0.0	0.0	0.28	0.64	1.0
Transcript_contig_7345 (7345)	0.53	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.76
Transcript_contig_74406 (74406)	0.3	0.02	0.04	0.02	0.05	0.08	0.09	0.08	0.0	0.83	1.0
Transcript_contig_78128 (78128)	0.65	0.31	0.62	0.41	0.37	0.21	0.33	0.24	0.31	1.0	0.78
Transcript_contig_78269 (78269)	0.56	0.21	0.2	0.27	0.25	0.21	0.37	0.19	0.13	0.89	1.0
Transcript_contig_78458 (78458)	0.56	0.25	0.32	0.3	0.35	0.26	0.4	0.2	0.3	1.0	0.87
Transcript_contig_79027 (79027)	0.58	0.25	0.04	0.02	0.18	0.19	0.28	0.34	1.0	0.77	0.7
Transcript_contig_79525 (79525)	0.52	0.0	0.24	0.53	0.82	0.22	0.72	0.0	0.0	1.0	0.7
Transcript_contig_80370 (80370)	0.36	0.0	0.07	0.15	0.29	0.09	0.13	0.0	0.04	1.0	0.83
Transcript_contig_80661 (80661)	1.0	0.58	0.15	0.25	0.21	0.23	0.24	0.44	0.41	0.9	0.95
Transcript_contig_80719 (80719)	0.61	0.11	0.34	0.54	0.38	0.25	0.37	0.05	0.27	1.0	0.97
Transcript_contig_81757 (81757)	0.4	0.17	0.15	0.17	0.26	0.25	0.19	0.23	1.0	0.9	0.76
Transcript_contig_82759 (82759)	0.65	0.31	0.0	0.02	0.04	0.03	0.04	0.32	0.03	0.86	1.0
Transcript_contig_848 (848)	0.79	0.41	0.35	0.5	0.69	0.28	0.34	0.22	0.27	0.94	1.0
Transcript_contig_854 (854)	0.57	0.22	0.24	0.2	0.11	0.26	0.21	0.32	0.08	0.98	1.0
Transcript_contig_8605 (8605)	0.21	0.03	0.04	0.03	0.04	0.0	0.15	0.0	0.0	1.0	0.38
Transcript_contig_89529 (89529)	0.67	0.3	0.54	0.33	0.32	0.25	0.32	0.26	0.43	1.0	0.97
Transcript_contig_89869 (89869)	0.99	0.81	0.36	0.54	0.51	0.32	0.51	1.0	0.31	0.96	0.93
Transcript_contig_90693 (90693)	0.84	0.66	0.39	0.43	0.77	0.22	0.38	1.0	0.47	0.7	0.85
Transcript_contig_90721 (90721)	0.53	0.12	0.13	0.22	0.33	0.13	0.1	0.18	0.58	0.77	1.0
Transcript_contig_90996 (90996)	0.51	0.29	0.18	0.36	0.51	0.19	0.22	0.13	1.0	0.88	0.7
Transcript_contig_91053 (91053)	0.27	0.12	0.0	0.3	0.19	0.23	0.38	0.22	0.97	1.0	0.73

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)