Heatmap: Cluster_194 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11232 (11232)	0.45	0.69	0.83	0.79	0.67	1.0	0.91	0.89	0.05	0.24	0.19
Transcript_contig_1205 (1205)	0.39	0.69	0.29	0.4	0.48	0.95	0.41	1.0	0.24	0.57	0.3
Transcript_contig_12186 (12186)	0.22	0.55	0.23	0.49	0.13	1.0	0.44	0.92	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_13118 (13118)	0.42	0.61	0.2	0.0	0.24	1.0	0.12	0.41	0.0	0.11	0.33
Transcript_contig_14496 (14496)	0.47	0.2	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	1.0	0.22	0.17	0.71
Transcript_contig_17593 (17593)	0.13	0.12	0.0	0.0	0.0	1.0	0.12	0.41	0.0	0.11	0.0
Transcript_contig_1965 (1965)	0.33	0.66	0.14	0.34	0.41	0.72	0.31	1.0	0.11	0.52	0.27
Transcript_contig_1969 (1969)	0.83	1.0	0.24	0.47	0.53	0.83	0.8	0.64	0.45	0.66	0.49
Transcript_contig_2089 (2089)	0.73	0.76	0.33	0.38	0.32	0.71	1.0	0.36	0.15	0.09	0.05
Transcript_contig_21784 (21784)	0.69	0.79	0.29	0.65	0.44	0.55	0.62	0.22	1.0	0.28	0.14
Transcript_contig_23458 (23458)	0.2	0.67	0.17	0.0	0.0	1.0	0.2	0.0	0.23	0.19	0.52
Transcript_contig_2440 (2440)	0.58	0.59	0.47	1.0	0.85	0.55	0.95	0.22	0.27	0.44	0.29
Transcript_contig_26091 (26091)	0.37	0.5	0.09	0.0	0.0	1.0	0.0	0.18	0.12	0.13	0.08
Transcript_contig_268 (268)	0.31	0.53	0.36	0.51	0.37	1.0	0.71	0.94	0.07	0.03	0.13
Transcript_contig_27643 (27643)	0.11	0.29	0.0	0.0	0.1	0.22	0.15	1.0	0.0	0.05	0.08
Transcript_contig_2889 (2889)	0.18	0.32	0.04	0.05	0.06	0.34	0.05	1.0	0.76	0.24	0.1
Transcript_contig_294 (294)	0.33	0.67	0.0	0.0	0.0	0.58	0.11	1.0	0.11	0.57	0.22
Transcript_contig_4680 (4680)	0.2	0.44	0.49	0.82	0.28	1.0	0.11	0.65	0.0	0.36	0.48
Transcript_contig_54160 (54160)	0.52	0.59	0.34	0.17	0.06	0.58	0.36	0.41	1.0	0.23	0.13
Transcript_contig_54302 (54302)	0.72	0.99	0.04	0.19	0.16	1.0	0.53	0.97	0.5	0.43	0.17
Transcript_contig_54737 (54737)	0.61	0.85	0.48	0.64	0.67	0.87	1.0	0.94	0.48	0.32	0.33
Transcript_contig_55490 (55490)	0.45	0.7	0.23	0.43	0.55	0.58	0.59	1.0	0.24	0.49	0.35
Transcript_contig_56205 (56205)	0.62	0.67	1.0	0.97	0.96	0.59	0.75	0.65	0.7	0.3	0.2
Transcript_contig_56262 (56262)	0.64	0.82	0.34	0.54	0.69	0.76	0.66	1.0	0.39	0.71	0.45
Transcript_contig_57066 (57066)	0.86	0.9	0.83	0.73	0.75	0.81	1.0	0.36	0.16	0.0	0.11
Transcript_contig_57147 (57147)	0.84	1.0	0.58	0.57	0.66	0.84	1.0	0.86	0.33	0.06	0.08
Transcript_contig_57168 (57168)	0.71	0.86	0.12	0.14	0.19	1.0	0.44	0.71	0.87	0.08	0.06
Transcript_contig_57694 (57694)	0.75	1.0	0.38	0.59	0.33	0.95	0.61	0.82	0.76	0.36	0.24
Transcript_contig_58888 (58888)	0.54	0.77	0.47	0.39	0.35	0.69	0.59	1.0	0.67	0.33	0.23
Transcript_contig_59248 (59248)	0.5	0.74	0.36	0.63	0.85	0.73	0.94	1.0	0.02	0.46	0.34
Transcript_contig_59350 (59350)	0.29	0.46	0.19	0.21	0.16	1.0	0.35	0.31	0.27	0.15	0.34
Transcript_contig_59648 (59648)	0.59	0.67	0.53	0.53	0.96	1.0	0.88	0.53	0.07	0.49	0.21
Transcript_contig_60535 (60535)	0.24	0.51	0.07	0.21	0.31	0.42	0.21	1.0	0.62	0.36	0.18
Transcript_contig_60638 (60638)	0.55	0.56	0.26	0.27	0.22	0.62	0.36	0.33	1.0	0.4	0.22
Transcript_contig_60822 (60822)	0.44	0.59	0.3	0.36	0.41	0.62	0.43	0.68	1.0	0.39	0.2
Transcript_contig_62773 (62773)	0.96	0.91	0.18	0.41	0.4	0.81	1.0	0.78	0.11	0.27	0.13
Transcript_contig_62827 (62827)	0.7	1.0	0.11	0.41	0.54	0.81	0.59	0.94	0.07	0.89	0.47
Transcript_contig_6378 (6378)	0.56	0.81	0.33	0.57	0.75	0.85	0.48	1.0	0.06	0.49	0.29
Transcript_contig_66194 (66194)	0.74	0.95	0.62	0.49	0.42	1.0	0.8	0.72	0.16	0.38	0.29
Transcript_contig_67485 (67485)	0.56	0.83	0.09	0.21	0.26	0.74	0.38	1.0	0.7	0.54	0.26
Transcript_contig_67858 (67858)	0.53	0.67	0.11	0.32	0.43	0.86	0.48	1.0	0.57	0.3	0.22
Transcript_contig_68046 (68046)	0.68	0.87	0.32	0.3	0.32	0.74	1.0	0.97	0.21	0.09	0.06
Transcript_contig_68725 (68725)	0.03	0.03	0.45	0.59	0.32	1.0	0.32	0.26	0.26	0.18	0.51
Transcript_contig_70213 (70213)	0.39	0.52	0.04	0.11	0.05	1.0	0.0	0.42	0.0	0.05	0.16
Transcript_contig_70219 (70219)	0.7	0.91	0.22	0.38	0.29	0.58	0.43	0.77	1.0	0.27	0.12
Transcript_contig_70256 (70256)	0.91	1.0	0.13	0.08	0.09	0.83	0.68	0.51	0.05	0.33	0.22
Transcript_contig_70608 (70608)	0.11	0.2	0.25	0.1	0.15	1.0	0.52	0.9	0.0	0.04	0.0
Transcript_contig_70673 (70673)	0.53	0.92	0.46	0.35	0.16	1.0	0.63	0.53	0.27	0.92	0.43
Transcript_contig_7220 (7220)	0.18	0.52	0.36	1.0	0.32	0.35	0.48	0.31	0.14	0.8	0.6
Transcript_contig_72457 (72457)	0.24	0.17	0.18	0.0	0.14	0.53	0.2	0.0	1.0	0.21	0.24
Transcript_contig_7395 (7395)	0.38	0.63	0.28	0.28	0.45	0.6	0.31	1.0	0.12	0.51	0.19
Transcript_contig_7719 (7719)	0.36	0.5	0.05	0.35	0.42	0.97	0.33	1.0	0.01	0.33	0.11
Transcript_contig_78035 (78035)	0.55	1.0	0.25	0.47	0.52	0.59	0.92	0.96	0.03	0.32	0.24
Transcript_contig_78155 (78155)	0.57	0.58	0.36	0.22	0.1	0.83	1.0	0.3	0.21	0.35	0.19
Transcript_contig_78392 (78392)	0.69	0.96	0.47	0.82	0.87	0.75	0.57	1.0	0.45	0.33	0.21
Transcript_contig_78592 (78592)	0.78	0.72	0.37	0.34	0.26	0.63	0.5	0.29	1.0	0.36	0.24
Transcript_contig_79009 (79009)	0.82	0.83	0.69	1.0	0.98	0.7	0.82	0.41	0.37	0.39	0.22
Transcript_contig_79683 (79683)	0.56	0.88	0.26	0.65	0.35	1.0	0.89	0.85	0.3	0.4	0.27
Transcript_contig_80298 (80298)	0.76	0.96	0.33	0.58	0.69	0.87	0.61	1.0	0.74	0.22	0.09
Transcript_contig_80526 (80526)	0.49	0.68	0.18	0.48	0.62	1.0	0.39	0.94	0.02	0.35	0.27
Transcript_contig_80602 (80602)	0.66	0.86	0.39	0.59	0.65	1.0	0.75	0.54	0.11	0.0	0.04
Transcript_contig_80857 (80857)	0.49	0.69	0.39	0.5	0.58	1.0	0.59	1.0	0.0	0.0	0.22
Transcript_contig_83116 (83116)	0.09	0.32	0.0	0.0	0.0	1.0	0.06	0.53	0.0	0.1	0.0
Transcript_contig_83640 (83640)	0.32	0.6	0.07	0.18	0.52	1.0	0.25	0.93	0.09	0.18	0.15
Transcript_contig_84330 (84330)	0.47	0.65	0.1	0.57	0.45	1.0	0.35	0.28	0.42	0.74	0.51
Transcript_contig_89824 (89824)	0.56	0.63	0.19	0.24	0.25	0.4	0.29	0.38	1.0	0.15	0.17
Transcript_contig_90303 (90303)	0.38	0.84	0.13	0.4	0.09	1.0	0.54	0.46	0.13	0.09	0.02
Transcript_contig_90508 (90508)	0.42	0.47	0.11	0.37	0.16	1.0	0.32	0.15	0.0	0.41	0.42
Transcript_contig_90566 (90566)	0.61	0.86	0.92	0.64	0.78	0.82	1.0	0.46	0.0	0.06	0.12
Transcript_contig_90774 (90774)	0.76	1.0	0.46	0.29	0.0	0.68	0.33	0.71	0.78	0.17	0.11

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)