Heatmap: Cluster_119 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10347 (10347)	0.3	0.43	0.61	0.58	1.0	0.0	0.06	0.21	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_10402 (10402)	0.53	0.56	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0
Transcript_contig_1057 (1057)	0.46	0.77	0.25	0.61	0.93	0.14	0.65	1.0	0.0	0.23	0.13
Transcript_contig_10944 (10944)	0.35	0.96	0.0	0.46	0.35	0.23	0.4	1.0	0.0	0.17	0.18
Transcript_contig_11799 (11799)	0.11	0.43	0.17	1.0	0.39	0.1	0.12	0.68	0.0	0.0	0.22
Transcript_contig_11990 (11990)	0.45	0.57	0.25	0.66	0.72	0.03	0.54	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_12224 (12224)	0.53	0.31	0.0	1.0	0.0	0.4	0.0	0.0	0.0	0.23	0.23
Transcript_contig_12441 (12441)	0.87	0.59	0.83	0.87	0.9	0.27	0.53	1.0	0.0	0.18	0.35
Transcript_contig_12468 (12468)	0.31	0.62	0.0	0.41	0.0	0.0	0.07	1.0	0.0	0.07	0.07
Transcript_contig_12692 (12692)	1.0	0.78	0.0	0.0	0.8	0.0	0.0	0.0	0.93	0.0	0.37
Transcript_contig_13248 (13248)	0.3	0.87	0.0	0.44	0.49	0.03	0.04	1.0	0.0	0.12	0.11
Transcript_contig_13525 (13525)	0.58	1.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.25	0.26	0.0	0.35	0.29
Transcript_contig_13588 (13588)	0.31	0.52	0.12	1.0	0.33	0.0	0.23	0.98	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_1492 (1492)	0.36	0.48	0.13	0.35	0.21	0.09	0.42	1.0	0.0	0.02	0.04
Transcript_contig_15210 (15210)	0.33	0.65	0.4	1.0	0.39	0.4	0.6	0.8	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_15499 (15499)	0.62	0.27	0.81	1.0	0.0	0.16	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_16817 (16817)	0.35	0.45	0.15	0.18	0.43	0.0	0.13	1.0	0.0	0.3	0.12
Transcript_contig_17201 (17201)	0.59	0.66	0.0	1.0	0.46	0.28	0.5	0.39	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_17462 (17462)	0.54	0.58	0.0	0.63	1.0	0.2	0.59	0.37	0.25	0.13	0.09
Transcript_contig_17888 (17888)	0.35	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_18895 (18895)	0.27	0.99	0.22	1.0	0.0	0.63	0.98	0.44	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_21266 (21266)	0.13	0.44	0.02	0.6	0.51	0.03	0.07	1.0	0.0	0.02	0.03
Transcript_contig_2171 (2171)	0.26	0.47	0.26	1.0	0.79	0.2	0.12	0.51	0.0	0.17	0.1
Transcript_contig_22122 (22122)	0.89	1.0	0.0	0.36	0.93	0.69	0.23	0.8	0.54	0.0	0.0
Transcript_contig_22265 (22265)	0.34	0.56	0.54	1.0	0.81	0.13	0.22	0.68	0.0	0.47	0.33
Transcript_contig_22469 (22469)	0.4	0.76	0.17	0.43	0.0	0.05	0.68	1.0	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_25624 (25624)	1.0	0.64	0.0	0.7	0.5	0.25	0.25	0.86	0.0	0.0	0.28
Transcript_contig_272 (272)	0.48	0.69	0.1	0.98	1.0	0.54	0.64	0.66	0.02	0.45	0.22
Transcript_contig_2744 (2744)	0.37	0.53	0.04	0.54	0.24	0.16	0.32	1.0	0.0	0.27	0.15
Transcript_contig_3002 (3002)	0.42	0.73	0.28	0.81	1.0	0.12	0.4	0.43	0.0	0.04	0.04
Transcript_contig_4142 (4142)	0.53	0.37	0.36	1.0	0.6	0.0	0.55	0.36	0.0	0.0	0.12
Transcript_contig_4896 (4896)	0.44	0.66	0.24	1.0	0.71	0.0	0.2	0.32	0.86	0.09	0.0
Transcript_contig_5013 (5013)	0.33	0.76	0.12	1.0	0.43	0.14	0.38	0.37	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5075 (5075)	0.21	0.57	0.2	1.0	0.24	0.0	0.12	0.0	0.0	0.11	0.0
Transcript_contig_54157 (54157)	0.35	0.34	0.11	0.6	1.0	0.2	0.37	0.33	0.13	0.22	0.26
Transcript_contig_5497 (5497)	0.33	0.09	0.29	0.86	0.59	0.35	1.0	0.25	0.0	0.12	0.05
Transcript_contig_5654 (5654)	0.43	0.31	0.09	0.41	1.0	0.15	0.76	0.37	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5892 (5892)	0.4	0.41	0.39	0.84	0.06	0.06	0.21	1.0	0.07	0.06	0.07
Transcript_contig_60116 (60116)	0.5	0.74	0.2	0.6	0.66	0.0	0.85	1.0	0.0	0.1	0.0
Transcript_contig_60461 (60461)	0.36	0.25	0.22	1.0	0.59	0.0	0.32	0.88	0.0	0.12	0.0
Transcript_contig_60557 (60557)	0.42	0.72	0.5	0.73	1.0	0.39	0.64	0.25	0.22	0.0	0.0
Transcript_contig_60608 (60608)	0.63	0.94	0.48	1.0	0.9	0.72	0.3	0.84	0.16	0.92	0.64
Transcript_contig_60697 (60697)	0.43	1.0	0.0	0.89	0.0	0.0	0.72	0.54	0.0	0.14	0.0
Transcript_contig_61633 (61633)	0.26	0.54	0.0	0.23	0.25	0.05	0.07	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61671 (61671)	0.32	0.73	0.08	0.18	0.27	0.07	0.22	1.0	0.06	0.11	0.12
Transcript_contig_61967 (61967)	0.6	0.5	0.43	0.58	1.0	0.25	0.64	0.29	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_62112 (62112)	0.2	0.58	0.28	0.41	0.81	0.2	0.4	1.0	0.0	0.13	0.25
Transcript_contig_62562 (62562)	0.94	1.0	0.13	0.86	0.61	0.04	0.24	0.92	0.0	0.22	0.27
Transcript_contig_62643 (62643)	0.28	0.0	0.45	0.88	1.0	0.28	0.6	0.0	0.0	0.12	0.1
Transcript_contig_62919 (62919)	0.9	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.9	0.82
Transcript_contig_62936 (62936)	0.69	0.73	0.58	1.0	0.51	0.0	0.39	0.88	0.0	0.24	0.07
Transcript_contig_6388 (6388)	0.25	0.33	0.05	0.34	0.41	0.08	0.27	1.0	0.0	0.03	0.05
Transcript_contig_6398 (6398)	0.36	1.0	0.0	0.66	0.85	0.0	0.33	0.66	0.0	0.06	0.0
Transcript_contig_64483 (64483)	0.58	0.58	0.0	0.42	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_64533 (64533)	0.4	1.0	0.45	0.41	0.0	0.0	0.54	0.45	0.0	0.12	0.12
Transcript_contig_66648 (66648)	0.6	1.0	0.48	0.88	0.0	0.0	0.28	0.96	0.65	0.0	0.22
Transcript_contig_67697 (67697)	0.93	0.84	0.2	0.93	0.47	0.57	0.0	1.0	0.0	0.17	0.05
Transcript_contig_67931 (67931)	0.0	0.84	0.36	1.0	0.0	0.0	0.21	0.0	0.0	0.0	0.4
Transcript_contig_67982 (67982)	0.2	0.51	0.2	1.0	0.86	0.45	0.46	0.41	0.27	0.46	0.15
Transcript_contig_67985 (67985)	0.39	0.6	0.0	0.69	1.0	0.02	0.04	0.91	0.06	0.09	0.1
Transcript_contig_68054 (68054)	0.44	0.8	0.14	1.0	0.59	0.38	0.39	0.29	0.0	0.28	0.23
Transcript_contig_68076 (68076)	0.0	0.81	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68150 (68150)	0.5	0.49	0.25	0.06	0.48	0.25	0.12	1.0	0.25	0.0	0.06
Transcript_contig_68455 (68455)	0.51	0.45	0.15	0.67	0.6	0.45	0.39	1.0	0.27	0.08	0.33
Transcript_contig_6880 (6880)	1.0	0.55	0.5	0.37	0.29	0.29	0.49	0.5	0.0	0.41	0.12
Transcript_contig_69294 (69294)	0.22	0.39	0.1	0.34	0.31	0.07	0.14	1.0	0.03	0.1	0.08
Transcript_contig_69307 (69307)	0.49	0.74	0.18	1.0	0.35	0.14	0.17	0.36	0.0	0.24	0.0
Transcript_contig_69344 (69344)	0.78	0.92	0.35	1.0	0.0	0.68	0.77	0.82	0.55	0.81	0.3
Transcript_contig_69773 (69773)	0.67	0.48	0.48	1.0	0.86	0.21	0.49	0.0	0.0	0.07	0.18
Transcript_contig_69959 (69959)	0.7	0.99	0.32	1.0	0.53	0.28	0.66	0.64	0.0	0.2	0.07
Transcript_contig_7046 (7046)	0.17	0.98	0.0	0.94	0.0	0.1	0.0	1.0	0.0	0.09	0.27
Transcript_contig_71053 (71053)	0.48	0.66	0.15	0.94	1.0	0.21	0.52	0.65	0.0	0.06	0.1
Transcript_contig_7119 (7119)	0.5	1.0	0.73	0.93	0.0	0.42	0.5	0.74	0.0	0.2	0.0
Transcript_contig_71253 (71253)	0.21	0.95	0.0	1.0	0.0	0.32	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_71357 (71357)	0.21	0.48	0.2	0.83	1.0	0.19	0.07	0.71	0.14	0.0	0.03
Transcript_contig_71538 (71538)	0.19	0.39	0.06	0.37	0.47	0.02	0.08	1.0	0.0	0.02	0.0
Transcript_contig_72040 (72040)	0.9	0.88	0.35	1.0	0.41	0.27	0.89	0.7	0.0	0.81	0.25
Transcript_contig_7240 (7240)	0.41	0.51	0.0	1.0	0.89	0.48	0.15	0.46	0.0	0.0	0.15
Transcript_contig_72967 (72967)	0.61	0.43	0.64	1.0	0.0	0.19	0.6	0.0	0.0	0.0	0.15
Transcript_contig_7533 (7533)	0.4	0.68	0.0	0.23	0.0	0.21	0.0	1.0	0.0	0.08	0.04
Transcript_contig_7559 (7559)	0.21	0.42	0.16	0.61	1.0	0.22	0.27	0.75	0.0	0.13	0.1
Transcript_contig_7705 (7705)	0.53	0.73	0.0	1.0	0.89	0.17	0.19	0.29	0.07	0.22	0.29
Transcript_contig_77403 (77403)	0.48	1.0	0.49	0.67	0.61	0.16	0.0	0.99	0.0	0.0	0.09
Transcript_contig_7777 (7777)	0.53	1.0	0.88	0.54	0.34	0.17	0.35	0.59	0.0	0.0	0.19
Transcript_contig_79624 (79624)	0.22	0.41	0.46	1.0	0.47	0.07	0.27	0.65	0.03	0.05	0.04
Transcript_contig_79656 (79656)	0.3	0.73	0.19	1.0	0.0	0.21	0.67	0.76	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_82886 (82886)	0.68	0.94	0.14	0.77	1.0	0.22	0.56	0.78	0.05	0.25	0.25
Transcript_contig_83094 (83094)	0.54	0.91	0.59	1.0	0.74	0.55	0.62	0.3	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_8449 (8449)	0.13	0.31	0.2	0.24	0.23	0.05	0.13	1.0	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_85059 (85059)	0.55	1.0	0.0	0.74	0.72	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_8556 (8556)	0.3	0.27	0.25	1.0	0.66	0.06	0.51	0.29	0.0	0.02	0.0
Transcript_contig_8747 (8747)	0.39	0.41	0.53	0.87	1.0	0.48	0.89	0.65	0.0	0.23	0.05
Transcript_contig_9078 (9078)	0.26	1.0	0.14	0.96	0.16	0.08	0.19	0.84	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_91313 (91313)	0.15	0.53	0.04	1.0	0.95	0.06	0.09	0.48	0.0	0.22	0.2

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)