Heatmap: Cluster_274 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10674 (10674)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_1091 (1091)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	3.42	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_10986 (10986)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_12109 (12109)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_12907 (12907)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	28.84	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_15536 (15536)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	2.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_16843 (16843)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.85	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_17035 (17035)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_18198 (18198)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	2.91	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_18444 (18444)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_18776 (18776)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_19762 (19762)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	4.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_2651 (2651)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.45	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_3828 (3828)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	3.3	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_4120 (4120)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5078 (5078)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	25.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5305 (5305)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	4.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5672 (5672)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.71	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_6116 (6116)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_63513 (63513)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_63519 (63519)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_64219 (64219)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	2.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_64521 (64521)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	5.24	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_64926 (64926)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	3.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_65595 (65595)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	4.26	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_66549 (66549)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	3.98	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67960 (67960)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	2.62	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68415 (68415)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	13.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68663 (68663)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.89	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_70525 (70525)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_71087 (71087)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	51.74	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_72900 (72900)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_74966 (74966)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_75388 (75388)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_80027 (80027)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	3.17	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_80257 (80257)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_81230 (81230)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	2.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_81948 (81948)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	2.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_83551 (83551)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	2.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_84104 (84104)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	2.65	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_85317 (85317)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	2.2	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_86155 (86155)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9566 (9566)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9600 (9600)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)