Heatmap: Cluster_203 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

XGMML0.04

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1349 (1349)	0.17	0.19	0.28	0.46	1.0	0.19	0.37	0.2	0.05	0.34	0.21
Transcript_contig_1527 (1527)	0.28	0.31	0.09	0.52	1.0	0.23	0.3	0.24	0.1	0.37	0.24
Transcript_contig_1694 (1694)	0.24	0.26	0.18	0.39	1.0	0.15	0.16	0.28	0.25	0.44	0.3
Transcript_contig_2298 (2298)	0.19	0.18	0.11	0.42	1.0	0.2	0.26	0.2	0.0	0.4	0.25
Transcript_contig_2925 (2925)	0.28	0.29	0.16	0.61	1.0	0.23	0.34	0.26	0.03	0.17	0.12
Transcript_contig_302 (302)	0.37	0.42	0.27	0.61	1.0	0.25	0.39	0.24	0.03	0.52	0.31
Transcript_contig_53692 (53692)	0.35	0.39	0.28	0.75	1.0	0.3	0.47	0.41	0.29	0.37	0.28
Transcript_contig_53953 (53953)	0.28	0.2	0.17	0.56	1.0	0.26	0.39	0.18	0.27	0.49	0.37
Transcript_contig_54041 (54041)	0.33	0.28	0.42	0.54	1.0	0.22	0.34	0.23	0.27	0.43	0.32
Transcript_contig_54149 (54149)	0.29	0.25	0.23	0.62	1.0	0.3	0.31	0.27	0.35	0.43	0.31
Transcript_contig_54189 (54189)	0.28	0.27	0.32	0.55	1.0	0.25	0.4	0.3	0.32	0.27	0.2
Transcript_contig_54367 (54367)	0.28	0.23	0.28	0.71	1.0	0.25	0.28	0.23	0.39	0.43	0.35
Transcript_contig_54606 (54606)	0.29	0.3	0.21	0.52	1.0	0.25	0.38	0.27	0.09	0.39	0.26
Transcript_contig_54749 (54749)	0.32	0.26	0.44	0.97	1.0	0.35	0.43	0.19	0.35	0.42	0.28
Transcript_contig_54990 (54990)	0.5	0.42	0.44	0.64	1.0	0.26	0.36	0.28	0.34	0.46	0.4
Transcript_contig_55074 (55074)	0.27	0.1	0.38	0.79	1.0	0.3	0.45	0.17	0.12	0.47	0.41
Transcript_contig_55151 (55151)	0.22	0.21	0.26	0.58	1.0	0.25	0.38	0.16	0.03	0.23	0.18
Transcript_contig_55232 (55232)	0.22	0.05	0.2	0.71	1.0	0.28	0.51	0.07	0.16	0.3	0.2
Transcript_contig_55734 (55734)	0.21	0.19	0.2	0.63	1.0	0.2	0.42	0.2	0.17	0.13	0.13
Transcript_contig_56089 (56089)	0.42	0.43	0.41	0.73	1.0	0.34	0.48	0.42	0.18	0.44	0.34
Transcript_contig_56146 (56146)	0.29	0.3	0.32	0.51	1.0	0.24	0.3	0.39	0.22	0.42	0.31
Transcript_contig_56441 (56441)	0.28	0.2	0.34	0.57	1.0	0.32	0.42	0.21	0.51	0.44	0.35
Transcript_contig_57050 (57050)	0.25	0.18	0.39	0.71	1.0	0.2	0.45	0.18	0.34	0.4	0.35
Transcript_contig_57179 (57179)	0.26	0.26	0.28	0.76	1.0	0.23	0.45	0.25	0.09	0.27	0.21
Transcript_contig_57297 (57297)	0.33	0.37	0.37	0.74	1.0	0.23	0.41	0.42	0.21	0.28	0.15
Transcript_contig_57336 (57336)	0.27	0.27	0.29	0.66	1.0	0.23	0.35	0.28	0.17	0.34	0.26
Transcript_contig_57403 (57403)	0.37	0.3	0.24	0.76	1.0	0.31	0.57	0.39	0.55	0.36	0.28
Transcript_contig_57476 (57476)	0.3	0.22	0.25	0.59	1.0	0.25	0.42	0.26	0.41	0.35	0.28
Transcript_contig_57692 (57692)	0.31	0.3	0.32	0.48	1.0	0.22	0.34	0.32	0.19	0.22	0.18
Transcript_contig_58098 (58098)	0.15	0.16	0.15	0.35	1.0	0.16	0.12	0.14	0.11	0.34	0.22
Transcript_contig_58139 (58139)	0.29	0.34	0.24	0.82	1.0	0.33	0.39	0.43	0.2	0.21	0.24
Transcript_contig_58241 (58241)	0.34	0.28	0.24	0.47	1.0	0.2	0.27	0.13	0.14	0.35	0.27
Transcript_contig_58330 (58330)	0.22	0.28	0.23	0.52	1.0	0.2	0.29	0.35	0.09	0.3	0.18
Transcript_contig_58706 (58706)	0.11	0.11	0.2	0.34	1.0	0.11	0.09	0.11	0.15	0.36	0.3
Transcript_contig_59029 (59029)	0.27	0.28	0.25	0.77	1.0	0.22	0.54	0.3	0.14	0.09	0.1
Transcript_contig_59835 (59835)	0.32	0.27	0.32	0.56	1.0	0.27	0.43	0.31	0.25	0.28	0.25
Transcript_contig_60048 (60048)	0.24	0.11	0.31	0.72	1.0	0.34	0.47	0.06	0.14	0.49	0.34
Transcript_contig_60183 (60183)	0.35	0.35	0.25	1.0	0.9	0.61	0.56	0.1	0.29	0.35	0.3
Transcript_contig_6046 (6046)	0.17	0.27	0.14	0.6	1.0	0.28	0.25	0.24	0.04	0.3	0.2
Transcript_contig_61964 (61964)	0.42	0.43	0.4	1.0	0.9	0.67	0.82	0.38	0.17	0.23	0.12
Transcript_contig_62165 (62165)	0.27	0.31	0.15	0.58	1.0	0.23	0.4	0.15	0.0	0.1	0.05
Transcript_contig_68781 (68781)	0.25	0.27	0.34	0.56	1.0	0.24	0.32	0.31	0.07	0.15	0.11
Transcript_contig_70183 (70183)	0.22	0.21	0.34	0.74	1.0	0.38	0.59	0.52	0.13	0.25	0.25
Transcript_contig_73072 (73072)	0.11	0.16	0.13	0.65	1.0	0.22	0.25	0.07	lass="value">0.97	0.28	0.17
Transcript_contig_78205 (78205)	0.44	0.4	0.13	0.67	1.0	0.43	0.53	0.31	0.17	0.37	0.33
Transcript_contig_78412 (78412)	0.21	0.2	0.15	0.48	1.0	0.19	0.25	0.26	0.23	0.42	0.29
Transcript_contig_78583 (78583)	0.12	0.18	0.04	0.5	1.0	0.24	0.16	0.25	0.01	0.21	0.16
Transcript_contig_78629 (78629)	0.35	0.23	0.17	0.81	1.0	0.27	0.5	0.22	0.39	0.51	0.37
Transcript_contig_78698 (78698)	0.27	0.27	0.47	0.73	1.0	0.29	0.4	0.34	0.21	0.35	0.3
Transcript_contig_78809 (78809)	0.35	0.27	0.41	0.66	1.0	0.35	0.37	0.25	0.51	0.47	0.34
Transcript_contig_78852 (78852)	0.34	0.26	0.4	0.94	1.0	0.39	0.44	0.21	0.15	0.51	0.35
Transcript_contig_78936 (78936)	0.32	0.43	0.11	0.48	1.0	0.25	0.31	0.39	0.11	0.33	0.25
Transcript_contig_79174 (79174)	0.26	0.12	0.22	0.83	1.0	0.4	0.54	0.18	0.48	0.58	0.4
Transcript_contig_80048 (80048)	0.23	0.15	0.41	0.74	1.0	0.34	0.43	0.19	0.33	0.4	0.29
Transcript_contig_89154 (89154)	0.44	0.35	0.5	0.91	1.0	0.39	0.55	0.24	0.09	0.54	0.42
Transcript_contig_89343 (89343)	0.26	0.13	0.44	0.78	1.0	0.36	0.46	0.1	0.55	0.37	0.34
Transcript_contig_89440 (89440)	0.35	0.33	0.4	0.73	1.0	0.31	0.39	0.45	0.28	0.48	0.34
Transcript_contig_89532 (89532)	0.28	0.2	0.27	0.8	1.0	0.22	0.52	0.24	0.21	0.1	0.11
Transcript_contig_89587 (89587)	0.21	0.16	0.45	0.68	1.0	0.23	0.41	0.13	0.12	0.44	0.27
Transcript_contig_90062 (90062)	0.2	0.14	0.32	0.61	1.0	0.23	0.4	0.12	0.2	0.33	0.22

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)