Heatmap: Cluster_51 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1142 (1142)	0.17	0.09	0.24	0.12	0.43	0.38	0.48	0.11	0.0	1.0	0.48
Transcript_contig_12423 (12423)	0.22	0.0	1.0	0.62	0.0	0.14	0.48	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_12588 (12588)	0.2	0.15	0.02	0.03	0.11	0.09	0.17	0.14	1.0	0.04	0.06
Transcript_contig_13094 (13094)	0.7	0.16	0.37	0.58	0.79	1.0	0.84	0.0	0.0	0.03	0.04
Transcript_contig_136 (136)	0.15	0.14	0.27	0.19	0.11	0.15	0.22	0.03	1.0	0.14	0.07
Transcript_contig_14370 (14370)	0.65	0.46	0.32	0.2	0.09	0.39	0.67	0.32	1.0	0.59	0.34
Transcript_contig_15619 (15619)	0.19	0.23	0.3	0.18	0.39	0.0	0.06	0.09	1.0	0.02	0.08
Transcript_contig_1618 (1618)	0.17	0.0	0.8	0.6	0.58	0.53	0.67	0.0	1.0	0.35	0.3
Transcript_contig_16764 (16764)	0.43	0.27	0.28	0.18	0.25	0.31	0.6	0.19	1.0	0.1	0.17
Transcript_contig_17029 (17029)	0.21	0.02	0.64	0.72	0.34	0.21	0.85	0.0	1.0	0.04	0.0
Transcript_contig_1749 (1749)	0.58	0.53	0.25	0.66	0.76	0.73	0.76	0.64	0.0	1.0	0.58
Transcript_contig_17920 (17920)	0.07	0.0	0.6	0.47	0.35	0.57	0.1	0.0	0.0	1.0	0.57
Transcript_contig_1839 (1839)	0.09	0.19	0.61	0.29	0.32	0.13	0.15	0.16	1.0	0.15	0.1
Transcript_contig_18394 (18394)	0.07	0.0	0.23	0.03	0.0	0.06	0.26	0.0	1.0	0.12	0.11
Transcript_contig_2303 (2303)	0.08	0.0	0.16	0.15	0.11	0.39	0.31	0.0	1.0	0.0	0.02
Transcript_contig_24547 (24547)	0.11	0.19	0.07	0.0	0.0	0.0	0.07	0.0	1.0	0.02	0.0
Transcript_contig_26231 (26231)	0.19	0.11	0.04	0.1	0.13	0.58	0.43	0.13	1.0	0.19	0.13
Transcript_contig_26327 (26327)	0.28	0.17	0.0	0.03	0.02	0.31	0.74	0.24	1.0	0.04	0.07
Transcript_contig_29874 (29874)	0.36	0.37	0.03	0.51	0.65	1.0	0.89	0.53	0.63	0.33	0.13
Transcript_contig_3553 (3553)	0.11	0.0	0.13	0.19	0.14	0.23	0.49	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_4052 (4052)	0.13	0.09	0.21	0.17	0.02	0.26	0.42	0.07	1.0	0.15	0.12
Transcript_contig_4157 (4157)	0.06	0.06	0.12	0.13	0.11	0.13	0.26	0.04	1.0	0.07	0.1
Transcript_contig_4272 (4272)	0.07	0.02	0.35	1.0	0.12	0.58	0.93	0.0	0.0	0.11	0.4
Transcript_contig_4707 (4707)	0.39	0.32	0.27	0.11	0.04	0.27	0.19	0.15	1.0	0.16	0.17
Transcript_contig_54700 (54700)	0.54	0.33	0.63	0.65	0.46	0.69	1.0	0.28	0.06	0.55	0.34
Transcript_contig_54875 (54875)	0.36	0.39	0.33	0.36	0.39	0.35	0.38	0.25	1.0	0.23	0.13
Transcript_contig_55158 (55158)	0.31	0.14	0.24	0.4	0.49	0.71	0.58	0.09	0.45	1.0	0.63
Transcript_contig_5530 (5530)	0.64	0.5	0.45	0.49	0.52	0.63	0.8	0.51	1.0	0.49	0.34
Transcript_contig_55776 (55776)	0.59	0.14	1.0	0.64	0.12	0.63	0.96	0.12	0.07	0.91	0.47
Transcript_contig_56516 (56516)	0.41	0.18	0.3	0.39	0.46	0.65	0.72	0.14	0.51	1.0	0.67
Transcript_contig_57685 (57685)	0.39	0.49	0.42	0.61	0.56	0.36	0.51	0.56	1.0	0.42	0.27
Transcript_contig_5783 (5783)	0.32	0.1	0.18	0.25	0.32	0.44	0.53	0.05	1.0	0.47	0.35
Transcript_contig_57839 (57839)	0.39	0.22	0.08	0.26	0.3	0.68	0.78	0.09	0.09	1.0	0.48
Transcript_contig_58323 (58323)	0.39	0.18	0.09	0.61	0.58	0.8	0.73	0.17	0.12	1.0	0.66
Transcript_contig_58426 (58426)	0.16	0.05	0.37	0.32	0.31	0.47	0.42	0.04	1.0	0.3	0.25
Transcript_contig_58598 (58598)	0.01	0.0	0.02	0.01	0.0	0.11	0.31	0.0	1.0	0.07	0.04
Transcript_contig_58612 (58612)	0.36	0.24	0.14	0.28	0.24	0.49	0.75	0.22	1.0	0.28	0.16
Transcript_contig_58802 (58802)	0.45	0.29	0.48	0.17	0.09	1.0	0.93	0.51	0.04	0.0	0.01
Transcript_contig_59074 (59074)	0.06	0.05	0.11	0.18	0.1	0.13	0.13	0.02	1.0	0.07	0.05
Transcript_contig_59925 (59925)	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_59981 (59981)	0.3	0.23	0.71	0.52	0.56	0.2	0.36	0.27	1.0	0.25	0.32
Transcript_contig_60335 (60335)	0.33	0.04	1.0	0.9	0.12	0.33	0.63	0.2	0.0	0.25	0.58
Transcript_contig_60425 (60425)	0.07	0.0	0.05	0.06	0.13	0.12	0.19	0.02	1.0	0.0	0.05
Transcript_contig_60658 (60658)	0.43	0.19	0.19	0.75	0.34	0.57	0.77	0.0	0.06	1.0	0.54
Transcript_contig_60903 (60903)	0.23	0.0	0.31	0.29	0.39	0.13	0.41	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_61139 (61139)	0.19	0.1	0.3	0.2	0.04	0.14	0.36	0.11	1.0	0.08	0.06
Transcript_contig_61358 (61358)	0.17	0.0	0.29	0.55	0.21	0.23	0.62	0.0	1.0	0.02	0.17
Transcript_contig_61772 (61772)	0.11	0.15	0.59	0.44	0.52	0.18	0.23	0.25	1.0	0.11	0.1
Transcript_contig_62066 (62066)	0.32	0.24	0.35	0.16	0.04	0.27	0.42	0.07	1.0	0.31	0.21
Transcript_contig_62417 (62417)	0.21	0.0	0.3	0.32	0.35	0.24	0.3	0.0	1.0	0.16	0.0
Transcript_contig_62888 (62888)	0.07	0.07	0.0	0.0	0.0	0.25	0.41	0.12	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_63107 (63107)	0.32	0.19	0.27	0.22	0.42	0.56	0.88	0.09	0.6	1.0	0.37
Transcript_contig_63943 (63943)	0.52	0.12	0.31	0.0	0.72	0.33	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_65250 (65250)	0.0	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_65306 (65306)	0.4	0.32	0.1	0.23	0.0	1.0	0.5	0.27	0.36	0.09	0.07
Transcript_contig_66154 (66154)	0.1	0.08	0.28	0.18	0.19	0.18	0.36	0.06	1.0	0.03	0.06
Transcript_contig_66218 (66218)	0.72	0.06	0.61	0.0	0.42	0.91	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67749 (67749)	0.17	0.0	0.33	0.97	0.19	0.67	1.0	0.0	0.83	0.25	0.52
Transcript_contig_68314 (68314)	0.26	0.0	0.45	0.26	0.04	0.45	0.91	0.0	1.0	0.27	0.31
Transcript_contig_68410 (68410)	0.09	0.55	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68451 (68451)	0.32	0.27	0.25	0.24	0.13	1.0	0.72	0.25	0.07	0.0	0.18
Transcript_contig_68741 (68741)	0.45	0.08	0.56	1.0	0.16	0.47	0.48	0.0	0.57	0.79	0.56
Transcript_contig_69138 (69138)	0.18	0.22	0.23	0.16	0.2	0.23	0.19	0.17	1.0	0.13	0.05
Transcript_contig_69352 (69352)	0.04	0.0	0.04	0.4	0.22	0.53	0.27	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_70977 (70977)	0.28	0.28	0.34	0.35	0.43	0.36	0.38	0.21	1.0	0.25	0.16
Transcript_contig_7138 (7138)	0.55	0.45	0.31	0.51	0.39	1.0	0.73	0.13	0.0	0.1	0.0
Transcript_contig_71500 (71500)	0.06	0.04	0.0	0.06	0.12	0.1	0.13	0.0	1.0	0.16	0.1
Transcript_contig_71657 (71657)	0.21	0.01	0.07	0.28	0.29	0.63	0.27	0.01	0.01	1.0	0.54
Transcript_contig_72923 (72923)	0.03	0.0	1.0	0.17	0.0	0.12	0.2	0.0	0.0	0.02	0.03
Transcript_contig_78537 (78537)	0.1	0.09	0.13	0.15	0.11	0.15	0.2	0.06	1.0	0.06	0.06
Transcript_contig_78731 (78731)	0.16	0.0	0.36	0.35	0.53	0.38	0.62	0.0	1.0	0.0	0.04
Transcript_contig_80081 (80081)	0.18	0.16	0.57	0.41	0.39	0.25	0.35	0.17	1.0	0.01	0.02
Transcript_contig_80090 (80090)	0.47	0.18	0.18	0.42	0.35	0.72	1.0	0.16	0.39	0.93	0.61
Transcript_contig_8023 (8023)	0.11	0.1	0.26	0.09	0.0	0.07	0.37	0.13	1.0	0.1	0.16
Transcript_contig_80962 (80962)	0.33	0.1	0.0	0.46	0.15	1.0	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_81259 (81259)	0.0	0.0	0.36	0.37	0.63	0.68	0.0	0.0	0.0	1.0	0.39
Transcript_contig_81661 (81661)	0.07	0.0	0.06	0.14	0.12	0.13	0.25	0.0	1.0	0.0	0.04
Transcript_contig_82301 (82301)	0.21	0.08	0.85	0.61	0.16	0.25	0.51	0.0	1.0	0.0	0.01
Transcript_contig_82315 (82315)	0.72	0.73	0.0	0.0	0.0	1.0	0.81	0.11	0.0	0.45	0.09
Transcript_contig_82423 (82423)	0.05	0.0	0.5	0.34	0.0	0.53	0.28	0.0	0.0	1.0	0.44
Transcript_contig_82705 (82705)	0.03	0.0	0.0	0.02	0.04	0.28	0.23	0.0	1.0	0.04	0.12
Transcript_contig_84508 (84508)	0.35	0.16	0.23	0.45	0.39	0.24	0.57	0.17	1.0	0.16	0.05
Transcript_contig_84748 (84748)	0.74	1.0	0.0	0.17	0.0	0.81	0.63	0.0	0.41	0.0	0.0
Transcript_contig_873 (873)	0.12	0.0	0.3	0.3	0.17	0.17	0.32	0.0	1.0	0.08	0.11
Transcript_contig_9075 (9075)	0.23	0.1	0.58	0.27	0.27	0.0	0.56	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_90800 (90800)	0.15	0.0	0.42	0.5	0.38	0.58	0.52	0.0	0.19	1.0	0.5
Transcript_contig_9182 (9182)	0.11	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.16	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9715 (9715)	0.18	0.0	0.11	0.35	0.62	0.84	0.39	0.0	0.03	1.0	0.72

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)