Heatmap: Cluster_6 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10002 (10002)	0.6	1.0	0.5	0.52	0.51	0.43	0.47	0.81	0.41	0.28	0.4
Transcript_contig_10108 (10108)	0.51	0.12	0.6	0.85	0.35	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_10451 (10451)	0.23	0.0	0.89	0.83	0.76	1.0	0.55	0.0	0.0	0.28	0.85
Transcript_contig_10560 (10560)	0.0	0.0	0.79	0.45	0.0	0.91	1.0	0.0	0.0	0.44	0.0
Transcript_contig_10951 (10951)	0.65	0.8	0.0	0.0	0.58	0.0	0.32	1.0	0.0	0.28	0.0
Transcript_contig_11462 (11462)	0.07	0.0	0.0	0.0	0.16	0.23	0.08	0.0	0.0	0.03	1.0
Transcript_contig_11536 (11536)	0.25	0.1	0.71	0.1	0.17	0.14	0.53	0.0	0.19	0.0	1.0
Transcript_contig_11567 (11567)	0.0	0.0	0.44	0.4	0.51	0.42	0.26	0.0	0.0	0.24	1.0
Transcript_contig_1189 (1189)	0.13	0.21	0.0	0.11	0.18	1.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.42
Transcript_contig_12315 (12315)	0.66	0.09	0.0	0.0	0.0	0.39	0.14	0.0	0.0	1.0	0.98
Transcript_contig_12792 (12792)	0.5	1.0	0.2	0.0	0.0	0.0	0.3	0.81	0.0	0.44	0.33
Transcript_contig_13085 (13085)	0.21	0.55	0.0	0.0	0.0	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_13383 (13383)	0.25	1.0	0.0	0.0	0.36	0.5	0.1	0.93	0.62	0.99	0.79
Transcript_contig_13617 (13617)	0.87	1.0	0.08	0.27	0.52	0.21	0.11	0.94	0.0	0.58	0.43
Transcript_contig_14312 (14312)	0.34	0.46	0.47	0.23	0.11	0.55	0.06	0.0	0.64	1.0	0.88
Transcript_contig_14765 (14765)	0.0	0.0	0.27	0.0	0.31	0.46	1.0	0.0	0.0	0.44	0.29
Transcript_contig_15398 (15398)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59
Transcript_contig_15417 (15417)	0.24	0.13	0.36	0.52	0.7	0.1	0.0	0.0	0.0	0.4	1.0
Transcript_contig_16114 (16114)	0.09	0.26	0.85	0.46	0.0	0.22	0.5	1.0	0.0	0.11	0.81
Transcript_contig_1624 (1624)	0.77	0.56	1.0	0.8	0.21	0.44	0.61	0.67	0.22	0.96	0.78
Transcript_contig_16438 (16438)	0.07	0.0	0.0	1.0	0.0	0.26	0.15	0.0	0.32	0.63	0.13
Transcript_contig_17010 (17010)	0.2	0.0	0.23	0.38	0.21	0.27	1.0	0.0	0.66	0.29	0.2
Transcript_contig_17490 (17490)	0.43	0.91	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_18038 (18038)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_18197 (18197)	0.0	0.0	0.0	0.61	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_19086 (19086)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.27
Transcript_contig_19875 (19875)	0.19	0.0	0.43	0.0	0.0	1.0	0.58	0.0	0.0	0.48	0.0
Transcript_contig_22988 (22988)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_2375 (2375)	0.06	0.0	1.0	0.43	0.0	0.12	0.24	0.0	0.0	0.1	0.2
Transcript_contig_23909 (23909)	0.27	0.0	0.0	0.53	0.0	0.99	0.76	0.0	1.0	0.0	0.24
Transcript_contig_23996 (23996)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.0	0.0	0.68	1.0
Transcript_contig_2570 (2570)	0.16	0.15	0.69	0.9	0.7	0.58	1.0	0.14	0.0	0.27	0.57
Transcript_contig_26040 (26040)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.87
Transcript_contig_2742 (2742)	0.34	0.48	0.79	0.0	0.0	0.68	1.0	0.0	0.0	0.22	0.0
Transcript_contig_3202 (3202)	0.61	0.8	0.76	1.0	0.89	0.48	0.9	0.36	0.06	0.63	0.3
Transcript_contig_3292 (3292)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.4
Transcript_contig_3362 (3362)	0.0	0.0	0.0	0.3	0.49	0.0	1.0	0.84	0.0	0.69	0.23
Transcript_contig_33627 (33627)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_3365 (3365)	0.35	0.09	0.37	0.33	0.0	0.0	0.47	1.0	0.0	0.07	0.07
Transcript_contig_3424 (3424)	0.41	0.43	0.66	0.47	1.0	0.16	0.56	0.31	0.12	0.25	0.35
Transcript_contig_3448 (3448)	0.0	0.0	1.0	0.71	0.0	0.58	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_35670 (35670)	0.49	0.63	0.01	0.06	0.0	0.17	0.06	0.41	1.0	0.3	0.18
Transcript_contig_3675 (3675)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.32
Transcript_contig_3948 (3948)	0.18	0.0	1.0	0.07	0.29	0.71	0.78	0.0	0.0	0.34	0.25
Transcript_contig_3999 (3999)	0.44	1.0	0.13	0.45	0.15	0.07	0.36	0.0	0.0	0.27	0.07
Transcript_contig_4023 (4023)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_41123 (41123)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_43251 (43251)	0.14	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_4355 (4355)	0.58	0.47	0.17	0.33	0.31	0.43	1.0	0.08	0.01	0.92	0.3
Transcript_contig_4995 (4995)	0.0	0.0	0.49	0.0	0.0	0.7	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
Transcript_contig_5043 (5043)	0.01	0.0	0.31	0.59	1.0	0.15	0.24	0.0	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_5102 (5102)	0.99	0.88	0.14	0.4	0.23	0.45	1.0	0.4	0.4	0.91	0.45
Transcript_contig_54485 (54485)	0.55	0.58	0.1	0.96	1.0	0.53	0.83	0.38	0.03	0.37	0.27
Transcript_contig_5539 (5539)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.71	0.22	0.0	1.0	0.0	0.17
Transcript_contig_55597 (55597)	0.43	0.43	0.3	0.43	0.29	0.22	0.31	0.3	1.0	0.5	0.21
Transcript_contig_55711 (55711)	0.72	0.69	0.89	0.99	0.65	0.36	0.65	0.64	1.0	0.63	0.47
Transcript_contig_56439 (56439)	0.81	0.96	0.63	0.77	0.52	0.28	0.5	1.0	0.7	0.59	0.4
Transcript_contig_5740 (5740)	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_57600 (57600)	0.44	0.63	0.83	0.66	0.0	0.18	1.0	0.42	0.0	0.35	0.28
Transcript_contig_57818 (57818)	0.12	0.01	0.37	0.97	0.69	0.46	1.0	0.06	0.17	0.12	0.19
Transcript_contig_58624 (58624)	1.0	0.59	0.08	0.01	0.0	0.44	0.12	0.35	0.11	0.88	0.98
Transcript_contig_5888 (5888)	0.18	0.0	0.63	0.16	0.0	0.47	1.0	0.0	0.11	0.29	0.8
Transcript_contig_59652 (59652)	0.3	0.24	1.0	0.18	0.17	0.41	1.0	0.19	0.0	0.02	0.14
Transcript_contig_59739 (59739)	0.31	0.0	0.95	0.71	0.46	0.33	1.0	0.0	0.16	0.66	0.84
Transcript_contig_5978 (5978)	0.07	0.04	0.18	0.09	0.14	0.31	0.1	0.0	0.05	1.0	0.56
Transcript_contig_60053 (60053)	0.5	0.58	0.24	0.2	0.07	0.34	0.42	1.0	0.31	0.16	0.29
Transcript_contig_60205 (60205)	0.82	0.88	0.36	0.27	0.47	0.38	0.49	0.42	0.45	0.83	1.0
Transcript_contig_60220 (60220)	0.31	0.3	0.0	0.0	0.0	0.48	0.33	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_60343 (60343)	0.32	0.11	0.1	0.11	0.06	0.3	1.0	0.21	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_60524 (60524)	0.21	0.17	0.48	1.0	0.69	0.26	0.88	0.07	0.23	0.38	0.17
Transcript_contig_61338 (61338)	0.78	0.57	0.61	0.95	1.0	0.69	0.97	0.49	0.52	0.61	0.47
Transcript_contig_61640 (61640)	0.47	0.09	0.52	1.0	0.84	0.42	0.68	0.0	0.12	0.42	0.09
Transcript_contig_61645 (61645)	0.07	0.0	0.0	0.14	0.67	0.0	0.16	0.5	1.0	0.25	0.0
Transcript_contig_61689 (61689)	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.56	0.0	0.0	0.49	0.48
Transcript_contig_61692 (61692)	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	0.37	1.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_62080 (62080)	0.49	0.34	0.64	0.37	0.09	0.38	1.0	0.0	0.23	0.44	0.46
Transcript_contig_6226 (6226)	0.42	0.78	0.11	0.16	0.04	0.1	0.36	1.0	0.0	0.55	0.65
Transcript_contig_62300 (62300)	0.73	0.6	1.0	0.66	0.48	0.46	0.86	0.34	0.79	0.67	0.31
Transcript_contig_62549 (62549)	0.6	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.2	0.64	0.0	0.0	0.15
Transcript_contig_62656 (62656)	0.44	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.34
Transcript_contig_62718 (62718)	0.29	0.19	1.0	0.14	0.26	0.35	0.48	0.13	0.0	0.04	0.0
Transcript_contig_63135 (63135)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_63368 (63368)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.35	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_63576 (63576)	0.11	0.18	1.0	0.15	0.0	0.0	0.07	0.0	0.4	0.1	0.16
Transcript_contig_63727 (63727)	0.45	0.37	1.0	0.6	0.26	0.06	0.21	0.22	0.0	0.43	0.42
Transcript_contig_63918 (63918)	0.81	0.77	0.62	1.0	0.0	0.76	0.71	0.21	0.56	0.58	0.42
Transcript_contig_64977 (64977)	0.71	1.0	0.0	0.0	0.84	0.0	0.2	0.0	0.0	0.32	0.14
Transcript_contig_6510 (6510)	0.85	0.64	0.18	0.52	0.21	0.81	0.71	0.0	0.0	1.0	0.67
Transcript_contig_65363 (65363)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_66259 (66259)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_66452 (66452)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_66501 (66501)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_66889 (66889)	1.0	0.97	0.0	0.03	0.0	0.05	0.06	0.87	0.0	0.11	0.0
Transcript_contig_67673 (67673)	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.83	0.58
Transcript_contig_67780 (67780)	0.37	0.26	0.33	1.0	0.54	0.26	0.52	0.0	0.0	0.15	0.14
Transcript_contig_67888 (67888)	0.42	1.0	0.0	0.0	0.79	0.0	0.43	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67946 (67946)	0.35	0.84	0.49	0.34	0.4	0.36	0.5	1.0	0.09	0.33	0.19
Transcript_contig_67988 (67988)	0.92	1.0	0.11	0.61	0.75	0.83	0.61	0.94	0.46	0.61	0.25
Transcript_contig_68013 (68013)	0.32	0.2	0.22	0.16	0.42	0.63	1.0	0.0	0.0	0.37	0.25
Transcript_contig_68058 (68058)	0.37	0.46	0.05	0.49	0.37	0.3	0.66	1.0	0.07	0.06	0.17
Transcript_contig_68147 (68147)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.25	0.86	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68156 (68156)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_68172 (68172)	0.18	1.0	0.0	0.1	0.0	0.1	0.0	0.71	0.48	0.1	0.29
Transcript_contig_68323 (68323)	0.38	0.35	0.21	0.17	0.19	0.0	0.14	1.0	0.19	0.0	0.15
Transcript_contig_68399 (68399)	0.0	0.0	0.0	0.77	0.0	0.19	0.26	0.0	0.0	1.0	0.19
Transcript_contig_68481 (68481)	0.29	0.0	0.33	0.47	0.38	0.53	1.0	0.0	0.45	0.0	0.0
Transcript_contig_68551 (68551)	0.32	0.06	0.15	0.14	0.35	0.91	0.34	0.0	0.0	1.0	0.54
Transcript_contig_68672 (68672)	0.38	0.58	0.48	0.34	0.0	0.23	1.0	0.48	0.0	0.29	0.43
Transcript_contig_69593 (69593)	0.28	0.19	0.19	1.0	0.45	0.1	0.64	0.0	0.0	0.42	0.76
Transcript_contig_71235 (71235)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_71425 (71425)	0.27	0.0	0.62	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34
Transcript_contig_7161 (7161)	0.1	0.0	0.22	0.08	0.56	0.3	0.31	0.0	0.45	1.0	0.56
Transcript_contig_71763 (71763)	0.28	0.53	0.08	0.36	0.22	0.49	0.74	0.16	0.0	1.0	0.61
Transcript_contig_71779 (71779)	0.34	0.0	0.0	0.0	0.0	0.29	0.0	0.0	0.0	1.0	0.49
Transcript_contig_71871 (71871)	0.82	1.0	0.0	0.44	0.0	0.71	0.08	0.25	0.33	0.69	0.41
Transcript_contig_7252 (7252)	0.3	0.0	0.07	0.65	0.55	0.04	0.39	0.0	0.0	1.0	0.69
Transcript_contig_73151 (73151)	0.19	0.27	0.67	0.53	0.09	1.0	0.89	0.0	0.4	0.11	0.36
Transcript_contig_7453 (7453)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0
Transcript_contig_7688 (7688)	0.18	0.0	0.64	0.55	0.73	0.73	1.0	0.0	0.0	0.59	0.38
Transcript_contig_7801 (7801)	0.75	1.0	0.0	0.52	0.0	0.18	0.18	0.62	0.83	0.51	0.14
Transcript_contig_7849 (7849)	0.5	0.13	0.21	0.0	0.25	0.34	0.0	0.0	0.85	0.56	1.0
Transcript_contig_79470 (79470)	0.0	0.0	0.0	0.53	0.0	1.0	0.79	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_79498 (79498)	0.9	1.0	0.94	0.8	0.16	0.33	1.0	0.55	0.04	0.43	0.49
Transcript_contig_79711 (79711)	0.23	0.42	0.28	0.2	0.33	0.16	0.27	0.57	0.38	0.53	1.0
Transcript_contig_8003 (8003)	0.24	0.06	0.68	0.81	0.83	0.43	0.91	0.0	0.0	1.0	0.66
Transcript_contig_80397 (80397)	0.23	0.3	0.45	0.3	0.38	0.47	0.33	0.46	1.0	0.08	0.57
Transcript_contig_80499 (80499)	0.27	0.37	0.47	0.73	0.62	0.37	1.0	0.4	0.0	0.02	0.02
Transcript_contig_80652 (80652)	0.35	0.73	0.0	0.09	0.0	0.36	0.0	1.0	0.0	0.55	0.49
Transcript_contig_81064 (81064)	0.34	0.58	1.0	0.24	0.0	0.0	0.46	0.67	0.0	0.19	0.0
Transcript_contig_81171 (81171)	0.8	0.67	0.45	0.69	0.42	0.28	0.23	0.46	0.24	1.0	0.73
Transcript_contig_816 (816)	0.0	0.51	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_81609 (81609)	0.31	0.0	0.37	0.04	0.21	0.71	1.0	0.0	0.51	0.22	0.5
Transcript_contig_81766 (81766)	0.3	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.64	0.0	0.09	0.0
Transcript_contig_82263 (82263)	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.56	0.0
Transcript_contig_82308 (82308)	1.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_82450 (82450)	0.86	1.0	0.31	0.42	0.38	0.28	0.65	0.89	0.02	0.16	0.11
Transcript_contig_83146 (83146)	0.19	0.65	0.39	0.09	0.15	0.83	0.17	0.0	0.0	1.0	0.42
Transcript_contig_83477 (83477)	0.66	0.29	0.4	0.64	0.73	0.21	1.0	0.1	0.14	0.6	0.42
Transcript_contig_83562 (83562)	0.54	0.96	0.0	0.49	1.0	0.0	0.32	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_83573 (83573)	0.0	0.0	0.12	0.06	0.16	0.73	1.0	0.0	0.0	0.0	0.94
Transcript_contig_8424 (8424)	0.24	0.7	0.0	0.0	0.0	1.0	0.46	0.0	0.0	0.69	0.0
Transcript_contig_84645 (84645)	0.19	0.0	0.18	0.51	0.0	0.4	0.34	0.72	0.0	1.0	0.39
Transcript_contig_8998 (8998)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9002 (9002)	0.99	0.59	0.37	0.2	0.15	0.12	0.44	1.0	0.17	0.25	0.29
Transcript_contig_90037 (90037)	0.11	0.14	0.29	0.31	0.14	0.08	0.21	0.18	1.0	0.09	0.04
Transcript_contig_90076 (90076)	0.0	0.0	1.0	0.67	0.52	0.53	0.86	0.0	0.0	0.12	0.14
Transcript_contig_90447 (90447)	0.0	0.22	0.0	0.26	0.0	0.21	0.23	0.74	0.0	1.0	0.17
Transcript_contig_90985 (90985)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.52	0.0
Transcript_contig_9297 (9297)	0.76	1.0	0.0	0.11	0.0	0.07	0.2	0.46	0.2	0.13	0.04
Transcript_contig_9861 (9861)	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.61	0.0	0.0	0.0	0.95	0.15
Transcript_contig_9986 (9986)	0.16	0.33	0.55	0.31	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.91

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)