Heatmap: Cluster_169 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_11607 (11607)	0.54	0.77	0.26	0.22	0.1	0.21	0.17	1.0	0.64	0.08	0.08
Transcript_contig_1202 (1202)	0.59	0.79	0.36	0.37	0.44	0.23	0.54	1.0	0.16	0.2	0.12
Transcript_contig_12581 (12581)	0.62	1.0	0.33	0.21	0.13	0.09	0.25	0.65	0.04	0.12	0.14
Transcript_contig_13806 (13806)	0.45	0.63	0.1	0.19	0.0	0.22	0.26	1.0	0.0	0.18	0.05
Transcript_contig_14968 (14968)	0.6	1.0	0.24	0.21	0.2	0.2	0.19	0.98	0.04	0.21	0.06
Transcript_contig_1799 (1799)	0.68	0.88	0.19	0.17	0.23	0.22	0.53	1.0	0.09	0.08	0.1
Transcript_contig_1842 (1842)	0.68	1.0	0.24	0.21	0.14	0.19	0.11	0.77	0.11	0.49	0.2
Transcript_contig_2047 (2047)	0.59	1.0	0.19	0.12	0.33	0.12	0.19	0.49	0.06	0.28	0.12
Transcript_contig_2199 (2199)	0.67	1.0	0.51	0.28	0.21	0.26	0.44	0.41	0.24	0.33	0.17
Transcript_contig_2321 (2321)	0.59	0.89	0.4	0.23	0.08	0.17	0.34	1.0	0.03	0.13	0.08
Transcript_contig_3135 (3135)	0.76	1.0	0.3	0.13	0.09	0.18	0.61	0.95	0.02	0.08	0.02
Transcript_contig_3916 (3916)	0.7	1.0	0.32	0.32	0.27	0.2	0.36	0.82	0.01	0.2	0.16
Transcript_contig_4601 (4601)	0.62	0.77	0.36	0.31	0.37	0.2	0.47	1.0	0.21	0.18	0.16
Transcript_contig_4663 (4663)	0.89	1.0	0.02	0.15	0.03	0.07	0.08	0.94	0.03	0.47	0.13
Transcript_contig_53935 (53935)	0.85	1.0	0.39	0.34	0.26	0.24	0.6	0.79	0.18	0.34	0.22
Transcript_contig_53966 (53966)	0.84	1.0	0.72	0.47	0.27	0.18	0.43	0.83	0.19	0.14	0.11
Transcript_contig_54005 (54005)	0.76	1.0	0.53	0.49	0.47	0.33	0.6	0.97	0.72	0.39	0.27
Transcript_contig_54053 (54053)	0.77	1.0	0.28	0.25	0.24	0.27	0.59	0.9	0.24	0.37	0.29
Transcript_contig_54129 (54129)	0.76	1.0	0.52	0.42	0.37	0.26	0.53	0.9	0.2	0.41	0.26
Transcript_contig_54406 (54406)	0.82	1.0	0.61	0.38	0.35	0.33	0.67	0.81	0.91	0.27	0.19
Transcript_contig_54519 (54519)	0.57	0.78	0.35	0.34	0.43	0.2	0.45	1.0	0.16	0.2	0.13
Transcript_contig_5471 (5471)	0.7	1.0	0.47	0.23	0.23	0.16	0.44	0.88	0.07	0.26	0.22
Transcript_contig_55047 (55047)	0.79	1.0	0.72	0.4	0.23	0.21	0.45	0.91	0.18	0.27	0.17
Transcript_contig_55123 (55123)	0.74	1.0	0.33	0.22	0.16	0.2	0.49	0.92	0.0	0.06	0.09
Transcript_contig_55197 (55197)	0.72	1.0	0.38	0.21	0.13	0.17	0.44	0.82	0.11	0.14	0.09
Transcript_contig_55394 (55394)	0.71	1.0	0.36	0.45	0.46	0.27	0.55	0.97	0.53	0.12	0.11
Transcript_contig_55674 (55674)	0.71	1.0	0.32	0.18	0.14	0.12	0.29	0.81	0.07	0.16	0.09
Transcript_contig_55928 (55928)	0.7	0.87	0.38	0.34	0.34	0.27	0.42	1.0	0.31	0.19	0.19
Transcript_contig_56208 (56208)	0.58	0.88	0.23	0.2	0.25	0.18	0.36	1.0	0.87	0.11	0.1
Transcript_contig_56382 (56382)	0.8	0.99	0.15	0.17	0.15	0.2	0.47	1.0	0.07	0.37	0.21
Transcript_contig_56422 (56422)	0.82	1.0	0.45	0.43	0.34	0.32	0.54	0.75	0.14	0.37	0.31
Transcript_contig_56515 (56515)	0.74	0.96	0.26	0.21	0.19	0.21	0.5	1.0	0.16	0.29	0.2
Transcript_contig_57024 (57024)	0.51	0.84	0.14	0.08	0.08	0.15	0.3	1.0	0.11	0.18	0.13
Transcript_contig_57091 (57091)	0.79	1.0	0.53	0.34	0.24	0.33	0.68	0.74	0.41	0.3	0.18
Transcript_contig_57097 (57097)	0.56	0.74	0.19	0.33	0.39	0.34	0.38	1.0	0.16	0.18	0.21
Transcript_contig_57223 (57223)	0.54	0.9	0.24	0.11	0.2	0.27	0.18	1.0	0.03	0.09	0.09
Transcript_contig_57264 (57264)	0.67	0.9	0.37	0.42	0.46	0.28	0.58	1.0	0.3	0.12	0.12
Transcript_contig_57637 (57637)	0.7	0.98	0.51	0.36	0.29	0.28	0.42	1.0	0.41	0.22	0.2
Transcript_contig_57878 (57878)	0.7	1.0	0.35	0.29	0.49	0.32	0.33	0.94	0.05	0.27	0.13
Transcript_contig_58061 (58061)	0.69	1.0	0.39	0.23	0.05	0.19	0.24	0.8	0.17	0.26	0.16
Transcript_contig_58412 (58412)	0.78	1.0	0.5	0.39	0.44	0.29	0.53	0.79	0.4	0.27	0.25
Transcript_contig_58846 (58846)	0.74	0.96	0.34	0.33	0.42	0.26	0.43	1.0	0.31	0.41	0.25
Transcript_contig_59098 (59098)	0.71	0.87	0.44	0.37	0.16	0.2	0.55	1.0	0.68	0.27	0.14
Transcript_contig_59494 (59494)	0.67	1.0	0.07	0.09	0.06	0.16	0.1	0.69	0.13	0.37	0.2
Transcript_contig_59600 (59600)	0.64	1.0	0.64	0.23	0.07	0.14	0.3	0.88	0.49	0.12	0.12
Transcript_contig_60278 (60278)	0.58	1.0	0.17	0.04	0.06	0.16	0.11	0.43	0.32	0.45	0.34
Transcript_contig_61788 (61788)	0.71	0.98	0.39	0.15	0.11	0.26	0.59	1.0	0.05	0.18	0.16
Transcript_contig_66301 (66301)	0.83	1.0	0.15	0.14	0.42	0.08	0.14	0.68	0.0	0.27	0.1
Transcript_contig_67852 (67852)	0.62	0.83	0.38	0.44	0.73	0.36	0.54	1.0	0.18	0.24	0.27
Transcript_contig_67961 (67961)	0.42	0.7	0.06	0.04	0.07	0.07	0.06	1.0	0.08	0.05	0.1
Transcript_contig_68424 (68424)	0.67	1.0	0.67	0.3	0.47	0.13	0.38	0.95	0.18	0.45	0.35
Transcript_contig_68525 (68525)	0.79	1.0	0.55	0.34	0.27	0.23	0.65	0.85	0.19	0.26	0.19
Transcript_contig_69681 (69681)	0.66	0.78	0.1	0.08	0.11	0.02	0.12	1.0	0.0	0.15	0.06
Transcript_contig_69716 (69716)	0.82	1.0	0.2	0.03	0.11	0.12	0.23	0.87	0.03	0.27	0.17
Transcript_contig_69812 (69812)	0.76	1.0	0.44	0.3	0.27	0.31	0.6	0.77	0.08	0.24	0.2
Transcript_contig_722 (722)	0.85	1.0	0.57	0.42	0.3	0.3	0.54	0.99	0.22	0.28	0.19
Transcript_contig_78136 (78136)	0.9	1.0	0.74	0.47	0.29	0.3	0.69	0.88	0.29	0.21	0.19
Transcript_contig_78182 (78182)	0.49	0.77	0.43	0.37	0.17	0.19	0.22	1.0	0.66	0.16	0.15
Transcript_contig_78232 (78232)	0.71	0.86	0.42	0.38	0.35	0.35	0.57	1.0	0.57	0.22	0.22
Transcript_contig_78327 (78327)	0.83	1.0	0.42	0.35	0.34	0.21	0.43	0.84	0.23	0.39	0.29
Transcript_contig_78393 (78393)	0.69	1.0	0.27	0.2	0.13	0.22	0.39	0.78	0.16	0.44	0.28
Transcript_contig_7846 (7846)	0.55	0.8	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.04	0.04	0.07
Transcript_contig_78482 (78482)	0.76	1.0	0.26	0.24	0.26	0.28	0.51	0.68	0.17	0.46	0.24
Transcript_contig_78528 (78528)	0.68	1.0	0.47	0.31	0.14	0.17	0.36	0.77	0.11	0.25	0.13
Transcript_contig_78699 (78699)	0.75	1.0	0.38	0.17	0.05	0.25	0.52	0.83	0.02	0.09	0.09
Transcript_contig_78709 (78709)	0.8	1.0	0.62	0.43	0.38	0.23	0.55	0.88	0.07	0.44	0.31
Transcript_contig_78720 (78720)	0.85	1.0	0.41	0.36	0.28	0.26	0.49	0.84	0.21	0.32	0.28
Transcript_contig_78795 (78795)	0.79	1.0	0.56	0.34	0.2	0.2	0.49	0.9	0.07	0.09	0.12
Transcript_contig_78827 (78827)	0.91	1.0	0.45	0.39	0.3	0.29	0.53	0.88	0.38	0.3	0.26
Transcript_contig_78889 (78889)	0.94	1.0	0.41	0.28	0.27	0.35	0.64	0.87	0.16	0.34	0.26
Transcript_contig_79012 (79012)	0.7	1.0	0.52	0.23	0.12	0.27	0.59	0.5	0.21	0.26	0.17
Transcript_contig_79084 (79084)	0.63	0.98	0.19	0.23	0.28	0.23	0.32	1.0	0.03	0.22	0.21
Transcript_contig_79116 (79116)	0.61	1.0	0.28	0.25	0.17	0.26	0.52	0.82	0.02	0.06	0.06
Transcript_contig_79722 (79722)	0.46	0.7	0.3	0.19	0.35	0.17	0.19	1.0	0.11	0.18	0.19
Transcript_contig_80185 (80185)	0.7	0.9	0.54	0.37	0.38	0.28	0.56	1.0	0.11	0.18	0.17
Transcript_contig_80525 (80525)	0.62	1.0	0.05	0.08	0.04	0.16	0.11	0.62	0.07	0.1	0.17
Transcript_contig_80582 (80582)	0.74	1.0	0.07	0.15	0.07	0.22	0.09	0.88	0.07	0.11	0.07
Transcript_contig_81580 (81580)	0.71	1.0	0.73	0.32	0.13	0.29	0.49	0.98	0.18	0.16	0.15
Transcript_contig_82655 (82655)	0.53	0.89	0.28	0.33	0.26	0.26	0.26	1.0	0.58	0.24	0.2
Transcript_contig_82933 (82933)	0.87	1.0	0.05	0.06	0.11	0.06	0.04	0.55	0.07	0.22	0.13
Transcript_contig_89541 (89541)	0.7	0.87	0.35	0.31	0.33	0.27	0.52	1.0	0.18	0.23	0.22
Transcript_contig_89650 (89650)	0.72	1.0	0.41	0.29	0.16	0.15	0.33	0.78	0.06	0.37	0.19
Transcript_contig_89763 (89763)	0.74	1.0	0.3	0.35	0.3	0.24	0.47	0.64	0.32	0.34	0.2
Transcript_contig_90000 (90000)	0.85	1.0	0.67	0.46	0.2	0.17	0.37	0.94	0.05	0.25	0.18
Transcript_contig_90372 (90372)	0.71	1.0	0.19	0.15	0.2	0.15	0.15	0.65	0.18	0.17	0.15
Transcript_contig_90699 (90699)	0.61	0.88	0.24	0.25	0.18	0.23	0.34	1.0	0.01	0.07	0.14
Transcript_contig_90741 (90741)	0.53	0.74	0.33	0.36	0.36	0.18	0.41	1.0	0.1	0.15	0.13

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)