Heatmap: Cluster_225 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_10201 (10201)	0.13	0.0	0.11	0.89	1.0	0.08	0.16	0.0	0.0	0.15	0.25
Transcript_contig_1073 (1073)	0.1	0.0	0.31	0.78	1.0	0.25	0.79	0.0	0.0	0.02	0.13
Transcript_contig_10748 (10748)	0.07	0.0	0.0	1.0	0.75	0.19	0.68	0.0	0.0	0.0	0.1
Transcript_contig_10751 (10751)	0.11	0.0	1.0	0.43	0.27	0.1	0.46	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_11486 (11486)	0.15	0.04	0.65	0.14	0.97	0.19	1.0	0.0	0.0	0.3	0.12
Transcript_contig_11581 (11581)	0.13	0.08	0.21	0.45	1.0	0.18	0.62	0.03	0.06	0.08	0.11
Transcript_contig_12076 (12076)	0.22	0.0	0.25	0.41	1.0	0.18	0.9	0.0	0.0	0.09	0.05
Transcript_contig_12094 (12094)	0.13	0.09	0.64	1.0	0.78	0.2	0.54	0.05	0.0	0.01	0.05
Transcript_contig_13257 (13257)	0.22	0.0	0.67	0.49	1.0	0.11	0.83	0.19	0.0	0.31	0.15
Transcript_contig_13314 (13314)	0.13	0.0	0.0	0.44	0.99	0.35	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_1477 (1477)	0.25	0.06	0.85	1.0	0.81	0.22	0.76	0.0	0.26	0.0	0.0
Transcript_contig_1587 (1587)	0.19	0.06	0.04	0.22	1.0	0.2	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_17091 (17091)	0.12	0.0	0.64	1.0	0.96	0.03	0.68	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_19299 (19299)	0.17	0.0	0.13	0.72	1.0	0.11	0.86	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_21405 (21405)	0.14	0.04	0.07	1.0	0.34	0.13	0.14	0.29	0.0	0.0	0.04
Transcript_contig_2347 (2347)	0.1	0.01	0.49	0.71	1.0	0.41	0.49	0.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_26912 (26912)	0.15	0.0	0.17	0.16	1.0	0.19	0.64	0.0	0.0	0.05	0.0
Transcript_contig_27409 (27409)	0.0	0.0	0.15	0.8	1.0	0.0	0.22	0.0	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_3023 (3023)	0.19	0.0	1.0	0.61	0.84	0.17	0.37	0.0	0.0	0.08	0.0
Transcript_contig_3070 (3070)	0.23	0.1	0.38	1.0	0.66	0.26	0.82	0.28	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_4042 (4042)	0.2	0.08	0.63	0.68	0.82	0.42	1.0	0.21	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_4274 (4274)	0.23	0.04	0.43	1.0	0.84	0.18	0.53	0.05	0.0	0.04	0.02
Transcript_contig_5057 (5057)	0.19	0.0	0.36	0.76	1.0	0.35	0.84	0.0	0.0	0.04	0.12
Transcript_contig_5185 (5185)	0.14	0.04	1.0	0.86	0.43	0.16	0.51	0.0	0.08	0.0	0.0
Transcript_contig_5271 (5271)	0.07	0.02	0.33	0.53	1.0	0.24	0.33	0.03	0.01	0.1	0.09
Transcript_contig_54000 (54000)	0.11	0.07	0.26	0.46	1.0	0.17	0.23	0.11	0.28	0.15	0.11
Transcript_contig_56037 (56037)	0.13	0.11	0.34	0.78	1.0	0.24	0.45	0.19	0.05	0.18	0.16
Transcript_contig_56823 (56823)	0.39	0.43	0.71	1.0	0.65	0.22	0.59	0.53	0.0	0.05	0.06
Transcript_contig_59485 (59485)	0.17	0.0	0.53	0.73	0.99	0.57	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_60678 (60678)	0.16	0.0	0.55	0.31	1.0	0.32	0.79	0.37	0.25	0.0	0.0
Transcript_contig_60738 (60738)	0.15	0.01	0.27	0.39	1.0	0.18	0.59	0.0	0.0	0.07	0.03
Transcript_contig_6091 (6091)	0.36	0.21	0.59	1.0	0.87	0.3	0.8	0.27	0.03	0.1	0.14
Transcript_contig_60998 (60998)	0.22	0.0	0.0	0.29	1.0	0.21	0.94	0.0	0.0	0.08	0.05
Transcript_contig_61580 (61580)	0.0	0.07	0.11	0.33	1.0	0.06	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_62955 (62955)	0.09	0.05	0.0	0.47	1.0	0.27	0.52	0.07	0.0	0.04	0.0
Transcript_contig_63748 (63748)	0.1	0.02	0.07	0.78	1.0	0.17	0.36	0.0	0.1	0.31	0.23
Transcript_contig_65794 (65794)	0.11	0.0	0.26	0.29	1.0	0.15	0.97	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_66827 (66827)	0.0	0.0	0.32	0.18	1.0	0.4	0.49	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_67629 (67629)	0.0	0.26	0.12	0.93	0.73	0.43	0.57	1.0	0.0	0.48	0.27
Transcript_contig_67786 (67786)	0.21	0.08	0.33	0.55	1.0	0.13	0.49	0.44	0.15	0.08	0.02
Transcript_contig_67793 (67793)	0.24	0.32	1.0	0.96	0.36	0.29	0.44	0.23	0.09	0.0	0.13
Transcript_contig_67994 (67994)	0.24	0.16	0.19	0.57	1.0	0.21	0.61	0.04	0.08	0.01	0.13
Transcript_contig_68012 (68012)	0.11	0.07	0.26	0.95	1.0	0.15	0.58	0.04	0.06	0.08	0.09
Transcript_contig_69128 (69128)	0.1	0.08	0.89	1.0	0.64	0.12	0.29	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_69260 (69260)	0.15	0.0	0.85	1.0	0.68	0.52	0.71	0.0	0.0	0.1	0.0
Transcript_contig_71020 (71020)	0.16	0.0	0.37	1.0	0.49	0.02	0.45	0.0	0.0	0.05	0.0
Transcript_contig_7110 (7110)	0.09	0.04	0.07	1.0	0.75	0.16	0.26	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_74020 (74020)	0.25	0.0	0.85	0.94	1.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_7589 (7589)	0.37	0.1	0.0	0.67	1.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_78175 (78175)	0.1	0.02	0.23	0.63	1.0	0.18	0.33	0.04	0.0	0.11	0.08
Transcript_contig_78750 (78750)	0.12	0.07	0.24	0.4	1.0	0.32	0.38	0.04	0.02	0.21	0.17
Transcript_contig_7901 (7901)	0.15	0.0	0.19	0.58	1.0	0.11	0.95	0.0	0.0	0.16	0.09
Transcript_contig_79076 (79076)	0.16	0.07	0.43	0.72	1.0	0.31	0.52	0.14	0.37	0.32	0.26
Transcript_contig_79543 (79543)	0.0	0.0	0.0	0.18	1.0	0.05	0.48	0.0	0.0	0.04	0.0
Transcript_contig_79812 (79812)	0.09	0.0	0.43	1.0	0.88	0.31	0.55	0.0	0.0	0.0	0.14
Transcript_contig_79824 (79824)	0.12	0.0	0.31	0.8	0.83	0.48	1.0	0.0	0.0	0.16	0.29
Transcript_contig_82059 (82059)	0.16	0.0	0.88	0.79	1.0	0.56	0.92	0.0	0.0	0.08	0.0
Transcript_contig_83567 (83567)	0.07	0.0	0.32	0.69	1.0	0.28	0.65	0.0	0.0	0.26	0.09
Transcript_contig_83655 (83655)	0.13	0.0	0.13	0.61	0.91	0.18	1.0	0.0	0.0	0.07	0.14
Transcript_contig_85998 (85998)	0.06	0.0	0.2	1.0	0.61	0.13	0.31	0.0	0.0	0.07	0.02
Transcript_contig_90332 (90332)	0.08	0.0	0.18	0.27	1.0	0.0	0.78	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_90781 (90781)	0.09	0.0	0.44	0.74	1.0	0.11	0.41	0.0	0.0	0.0	0.0
Transcript_contig_9580 (9580)	0.25	0.0	0.41	0.97	1.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.28	0.22
Transcript_contig_9637 (9637)	0.11	0.0	0.24	0.89	1.0	0.21	0.63	0.0	0.17	0.0	0.08

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)