Heatmap: Cluster_116 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	Light - ZT1	Light - ZT3	Light - ZT5	Light - ZT7	Light - ZT9	Light - ZT11	Light - ZT13	Light - ZT15	Dark - ZT17	Dark - ZT19	Dark - ZT21	Dark - ZT23	Light - ZT25	Nutrient stress - Low nitrogen - 10%	Nutrient stress - Low phosphate - 0%	Nutrient stress - Low sulfate - 2%	Nutrient stress - Low micronutrients - 0%	Nutrient stress - NaCl - 75 mM	Nutrient stress - Mannitol - 100 mM	Nutrient stress - Control	Environmental stress - Prolonged darkness - 72h	Environmental stress - Cold - 4C	Environmental stress - Heat - 37C	Environmental stress - Control	Environmental stress - High light - 150 uE	Environmental stress - Control high light - 40 uE
Cpa\|evm.model.tig00000037.45	0.48	0.19	0.19	0.16	0.16	0.1	0.15	0.26	0.17	0.27	0.39	0.42	0.55	0.2	0.27	0.3	0.16	0.38	0.24	0.14	0.09	0.06	1.0	0.55	0.4	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000042.218 (tig00000042_g15610.t1)	0.49	0.2	0.22	0.19	0.12	0.08	0.16	0.27	0.46	0.69	0.91	1.0	0.68	0.17	0.08	0.16	0.24	0.18	0.06	0.24	0.41	0.26	0.86	0.73	0.5	0.76
Cpa\|evm.model.tig00000076.20 (tig00000076_g2319.t1)	1.0	0.7	0.42	0.29	0.29	0.12	0.3	0.29	0.23	0.29	0.31	0.45	0.89	0.13	0.05	0.14	0.1	0.22	0.11	0.11	0.12	0.33	0.73	0.71	0.57	0.3
Cpa\|evm.model.tig00000076.22 (tig00000076_g2319.t1)	0.91	0.47	0.54	0.51	0.32	0.2	0.32	0.42	0.23	0.36	0.5	0.76	1.0	0.17	0.15	0.27	0.13	0.34	0.23	0.13	0.05	0.17	0.65	0.47	0.93	0.46
Cpa\|evm.model.tig00000076.29 (tig00000076_g2327.t1)	0.91	0.7	0.44	0.33	0.14	0.09	0.21	0.18	0.14	0.28	0.18	0.59	0.97	0.03	0.18	0.05	0.06	0.1	0.01	0.01	0.1	0.23	1.0	0.51	0.2	0.27
Cpa\|evm.model.tig00000101.4 (tig00000101_g4442.t1)	0.68	0.3	0.16	0.4	0.47	0.18	0.46	0.38	0.51	0.55	0.69	0.58	1.0	0.14	0.21	0.37	0.21	0.45	0.31	0.28	0.13	0.92	0.71	0.48	0.4	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000133.55 (tig00000133_g7719.t1)	0.41	0.0	0.22	1.0	0.49	0.18	0.16	0.27	0.4	0.2	0.61	0.35	0.25	0.0	0.0	0.0	0.04	0.06	0.06	0.06	0.0	0.09	0.54	0.1	0.63	0.07
Cpa\|evm.model.tig00000178.100 (tig00000178_g12823.t1)	0.84	0.35	0.35	0.41	0.33	0.15	0.26	0.29	0.32	0.62	0.84	1.0	0.73	0.55	0.3	0.3	0.27	0.21	0.3	0.3	0.22	0.27	0.65	0.68	0.61	0.52
Cpa\|evm.model.tig00000215.23 (tig00000215_g18553.t1)	0.75	0.17	0.07	0.04	0.03	0.04	0.14	0.28	0.4	0.6	0.89	1.0	0.79	0.36	0.08	0.17	0.11	0.24	0.14	0.17	0.06	0.17	0.7	0.49	0.36	0.42
Cpa\|evm.model.tig00000219.46 (tig00000219_g19485.t1)	0.79	0.51	0.35	0.38	0.35	0.24	0.39	0.46	0.54	0.45	0.58	0.69	0.6	0.14	0.24	0.13	0.16	0.41	0.23	0.19	0.04	0.5	1.0	0.54	0.54	0.32
Cpa\|evm.model.tig00000241.86 (tig00000241_g20949.t1)	1.0	0.37	0.31	0.25	0.13	0.11	0.18	0.28	0.05	0.09	0.16	0.21	0.88	0.22	0.15	0.12	0.11	0.14	0.16	0.18	0.08	0.15	0.59	0.27	0.65	0.7
Cpa\|evm.model.tig00000254.21 (tig00000254_g22470.t1)	0.85	0.34	0.37	0.39	0.26	0.18	0.39	0.64	0.6	0.86	0.96	0.91	0.9	0.47	0.27	0.83	0.44	0.35	0.34	0.41	0.32	0.32	1.0	0.73	0.73	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000254.22 (tig00000254_g22470.t1)	0.83	0.33	0.31	0.39	0.28	0.19	0.37	0.63	0.64	0.78	0.96	0.92	1.0	0.34	0.22	0.54	0.3	0.26	0.28	0.3	0.27	0.32	0.92	0.73	0.69	0.56
Cpa\|evm.model.tig00000254.65 (tig00021617_g22940.t1)	0.98	0.7	0.57	0.65	0.67	0.53	0.62	0.74	0.68	0.75	0.84	0.94	1.0	0.33	0.43	0.39	0.42	0.55	0.62	0.45	0.28	0.81	0.85	0.72	0.55	0.33
Cpa\|evm.model.tig00000269.77 (tig00000269_g23737.t1)	0.71	0.18	0.14	0.51	0.3	0.17	0.11	0.3	0.38	0.61	0.6	0.65	0.44	0.11	0.09	0.06	0.15	0.22	0.16	0.04	0.2	0.21	1.0	0.87	0.76	0.45
Cpa\|evm.model.tig00000383.75 (tig00021179_g19300.t1)	0.45	0.29	0.16	0.96	1.0	0.38	0.86	0.96	0.68	0.85	0.95	1.0	0.7	0.07	0.06	0.11	0.08	0.28	0.26	0.05	0.16	0.57	0.8	0.89	0.36	0.44
Cpa\|evm.model.tig00000402.60 (tig00000402_g233.t1)	0.34	0.09	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.16	0.25	0.24	0.59	0.18	0.34	0.0	0.08	0.0	0.0	0.11	0.41	0.0	0.17	0.4	1.0	0.29	0.54	0.23
Cpa\|evm.model.tig00000405.69 (tig00000405_g501.t1)	1.0	0.49	0.33	0.37	0.34	0.27	0.47	0.57	0.68	0.67	0.77	0.71	0.85	0.26	0.35	0.24	0.38	0.55	0.42	0.34	0.2	0.62	0.99	0.69	0.65	0.43
Cpa\|evm.model.tig00000411.71 (tig00000411_g577.t1)	0.96	0.37	0.38	0.41	0.32	0.3	0.42	0.49	0.35	0.44	0.54	0.68	1.0	0.1	0.19	0.09	0.2	0.29	0.3	0.4	0.21	0.13	0.45	0.62	0.44	0.5
Cpa\|evm.model.tig00000480.51 (tig00000480_g1319.t1)	1.0	0.45	0.29	0.17	0.12	0.12	0.22	0.32	0.42	0.5	0.65	0.76	0.77	0.25	0.3	0.25	0.25	0.23	0.21	0.18	0.18	0.31	0.63	0.53	0.45	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000489.19 (tig00000489_g1380.t1)	1.0	0.51	0.41	0.4	0.09	0.04	0.11	0.3	0.1	0.13	0.2	0.19	0.81	0.07	0.06	0.09	0.06	0.17	0.09	0.09	0.15	0.13	0.85	0.68	0.72	0.68
Cpa\|evm.model.tig00000551.21 (tig00000551_g2042.t1)	0.88	0.31	0.36	0.37	0.42	0.4	0.57	0.59	0.51	0.48	0.66	0.92	1.0	0.36	0.27	0.39	0.35	0.47	0.38	0.4	0.17	0.6	0.66	0.49	0.71	0.63
Cpa\|evm.model.tig00000615.71 (tig00000615_g2602.t1)	1.0	0.8	0.72	0.6	0.25	0.27	0.41	0.74	0.51	0.49	0.51	0.69	0.79	0.14	0.19	0.22	0.29	0.43	0.39	0.43	0.09	0.33	0.76	0.92	0.68	1.0
Cpa\|evm.model.tig00000655.38 (tig00000655_g2863.t1)	0.59	0.48	0.45	0.45	0.31	0.26	0.32	0.32	0.23	0.32	0.38	0.59	0.6	0.35	0.2	0.3	0.17	0.26	0.34	0.23	0.25	0.05	1.0	0.47	0.49	0.53
Cpa\|evm.model.tig00000658.5 (tig00000269_g23673.t1)	0.69	0.18	0.1	0.83	0.39	0.0	0.11	0.2	0.31	0.05	0.62	0.33	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.14	0.1	0.04	0.07	0.5	1.0	0.16	0.2	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000663.75 (tig00000734_g3757.t1)	0.65	0.37	0.23	0.29	0.24	0.18	0.23	0.23	0.5	0.43	0.52	0.51	1.0	0.16	0.23	0.22	0.25	0.35	0.34	0.27	0.13	0.41	0.59	0.54	0.53	0.34
Cpa\|evm.model.tig00000769.20 (tig00000769_g4015.t1)	0.67	0.47	0.24	0.33	0.47	0.51	0.63	0.6	0.42	0.58	0.63	0.59	0.72	0.24	0.13	0.14	0.19	0.22	0.24	0.21	0.1	0.38	1.0	0.41	0.63	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000792.26 (tig00000792_g4175.t1)	0.92	0.51	0.52	0.39	0.13	0.12	0.28	0.51	0.32	0.44	0.51	0.59	1.0	0.14	0.21	0.14	0.19	0.23	0.22	0.24	0.1	0.22	0.72	0.52	0.53	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000841.11 (tig00000841_g4736.t1)	1.0	0.65	0.52	0.52	0.43	0.3	0.42	0.48	0.45	0.59	0.69	0.72	0.88	0.29	0.28	0.25	0.64	0.5	0.38	0.4	0.11	0.78	0.96	0.75	0.74	0.62
Cpa\|evm.model.tig00000880.26 (tig00000880_g5186.t1)	0.8	0.32	0.33	0.37	0.35	0.31	0.39	0.47	0.34	0.39	0.51	0.65	1.0	0.29	0.25	0.28	0.23	0.31	0.3	0.25	0.15	0.17	0.79	0.44	0.64	0.49
Cpa\|evm.model.tig00000880.27 (tig00000880_g5187.t2)	0.74	0.5	0.36	0.36	0.24	0.18	0.3	0.34	0.27	0.29	0.39	0.39	0.78	0.16	0.84	0.2	0.17	0.19	0.16	0.16	0.23	0.38	1.0	0.31	0.75	0.35
Cpa\|evm.model.tig00000880.40 (tig00000880_g5198.t1)	1.0	0.46	0.2	0.41	0.4	0.2	0.28	0.41	0.26	0.28	0.44	0.33	0.8	0.11	0.11	0.09	0.1	0.24	0.21	0.1	0.04	0.11	0.93	0.41	0.51	0.4
Cpa\|evm.model.tig00000880.44 (tig00000880_g5208.t1)	1.0	0.6	0.44	0.72	0.43	0.32	0.39	0.45	0.5	0.43	0.73	0.55	0.66	0.13	0.21	0.24	0.27	0.45	0.36	0.31	0.31	0.72	0.98	0.73	0.52	0.36
Cpa\|evm.model.tig00000880.49 (tig00000880_g5208.t1)	0.79	0.34	0.31	0.43	0.21	0.13	0.2	0.33	0.36	0.32	0.48	0.37	0.38	0.07	0.17	0.07	0.13	0.19	0.2	0.16	0.42	0.77	1.0	0.97	0.32	0.3
Cpa\|evm.model.tig00001065.46 (tig00001065_g6745.t1)	1.0	0.33	0.28	0.3	0.15	0.09	0.17	0.23	0.26	0.42	0.69	0.78	0.89	0.16	0.18	0.16	0.2	0.34	0.31	0.22	0.07	0.05	0.83	0.65	0.67	0.35
Cpa\|evm.model.tig00001086.3 (tig00001086_g6836.t1)	1.0	0.54	0.38	0.32	0.23	0.18	0.36	0.48	0.4	0.48	0.65	0.66	0.95	0.19	0.18	0.23	0.24	0.41	0.3	0.28	0.28	0.57	0.94	0.6	0.71	0.51
Cpa\|evm.model.tig00001222.7 (tig00001222_g7599.t1)	0.68	0.22	0.0	0.17	0.25	0.26	0.34	0.42	0.25	0.17	0.24	0.33	0.63	0.07	0.04	0.16	0.0	0.27	0.25	0.08	0.14	0.18	1.0	0.1	0.85	0.29
Cpa\|evm.model.tig00001542.24	1.0	0.52	0.43	0.47	0.25	0.18	0.31	0.5	0.32	0.28	0.47	0.54	0.93	0.24	0.17	0.21	0.11	0.19	0.14	0.09	0.12	0.35	0.89	0.43	0.6	0.45
Cpa\|evm.model.tig00001576.5 (tig00001576_g9362.t1)	0.83	0.35	0.16	0.48	0.16	0.15	0.05	0.27	0.3	0.25	0.65	0.37	0.77	0.03	0.03	0.03	0.03	0.08	0.11	0.04	0.37	1.0	0.94	0.84	0.76	0.5
Cpa\|evm.model.tig00020528.11 (tig00020528_g9987.t1)	0.72	0.23	0.35	0.68	0.44	0.28	0.34	0.58	0.51	1.0	0.68	0.59	0.68	0.04	0.02	0.12	0.03	0.16	0.21	0.05	0.0	0.2	0.69	0.03	0.43	0.19
Cpa\|evm.model.tig00020553.125 (tig00020553_g10612.t1)	0.88	0.28	0.14	0.36	0.27	0.22	0.41	0.59	0.35	0.42	0.48	0.37	0.8	0.11	0.11	0.07	0.1	0.25	0.27	0.15	0.06	0.47	1.0	0.58	0.34	0.41
Cpa\|evm.model.tig00020560.17 (tig00020560_g11082.t1)	0.75	0.49	0.3	0.18	0.08	0.06	0.18	0.31	0.2	0.3	0.51	0.68	1.0	0.09	0.1	0.1	0.09	0.33	0.24	0.2	0.03	0.09	0.54	0.57	0.8	0.44
Cpa\|evm.model.tig00020563.165 (tig00020563_g11367.t1)	1.0	0.39	0.26	0.4	0.51	0.47	0.45	0.43	0.37	0.4	0.44	0.41	1.0	0.3	0.58	0.26	0.19	0.23	0.27	0.13	0.24	0.36	0.91	0.36	0.73	0.47
Cpa\|evm.model.tig00020616.34 (tig00020616_g12270.t1)	0.92	0.73	0.69	0.74	0.64	0.51	0.54	0.61	0.52	0.5	0.63	0.71	0.99	0.49	0.41	0.47	0.35	0.42	0.43	0.36	0.34	0.3	1.0	0.39	0.76	0.62
Cpa\|evm.model.tig00020685.36 (tig00020685_g12953.t1)	1.0	0.63	0.43	0.5	0.41	0.43	0.48	0.59	0.74	0.67	0.78	0.89	0.97	0.69	0.65	0.62	0.32	0.47	0.59	0.35	0.27	0.25	0.92	0.7	0.88	0.72
Cpa\|evm.model.tig00020816.57 (tig00020816_g14142.t1)	0.64	0.39	0.42	0.23	0.09	0.09	0.3	0.5	0.16	0.34	0.45	0.6	1.0	0.21	0.15	0.18	0.25	0.2	0.21	0.27	0.31	0.09	0.42	0.42	0.68	0.89
Cpa\|evm.model.tig00020830.60 (tig00020830_g14443.t1)	0.64	0.35	0.33	0.34	0.17	0.07	0.18	0.31	0.33	0.68	0.94	0.94	1.0	0.4	0.23	0.26	0.18	0.17	0.14	0.16	0.17	0.13	0.68	0.55	0.34	0.5
Cpa\|evm.model.tig00020961.129 (tig00020961_g16748.t1)	0.95	0.62	0.66	1.0	0.93	0.71	0.75	0.82	0.84	0.86	0.89	0.73	0.91	0.23	0.24	0.26	0.3	0.3	0.5	0.23	0.08	0.24	0.95	0.71	0.83	0.61
Cpa\|evm.model.tig00020961.24 (tig00020961_g16644.t1)	0.41	0.76	0.22	0.35	0.16	0.06	0.06	0.02	0.11	0.1	0.11	0.17	0.58	0.11	0.19	0.35	0.29	0.2	0.07	0.12	0.08	0.13	1.0	0.51	0.35	0.31
Cpa\|evm.model.tig00021012.5 (tig00021012_g16984.t1)	0.89	0.43	0.39	0.37	0.3	0.15	0.37	0.17	0.13	0.11	0.31	0.39	0.53	0.05	0.16	0.0	0.03	0.2	0.08	0.13	0.09	0.02	1.0	0.49	0.36	0.18
Cpa\|evm.model.tig00021073.49 (tig00021073_g18056.t1)	0.78	0.17	0.12	0.16	0.19	0.16	0.3	0.33	0.3	0.26	0.3	0.26	0.49	0.03	0.07	0.05	0.08	0.17	0.16	0.09	0.16	0.18	1.0	0.29	0.51	0.25
Cpa\|evm.model.tig00021108.7 (tig00000553_g2098.t1)	1.0	0.68	0.21	0.15	0.07	0.1	0.21	0.19	0.13	0.07	0.12	0.19	0.91	0.12	0.16	0.07	0.12	0.51	0.37	0.04	0.17	0.64	0.34	0.95	0.43	0.36
Cpa\|evm.model.tig00021127.197 (tig00021127_g18882.t1)	0.84	0.74	0.47	0.59	0.3	0.1	0.14	0.2	0.23	0.29	0.49	0.57	0.64	0.11	0.04	0.09	0.1	0.03	0.11	0.1	0.1	0.31	1.0	0.37	0.25	0.33
Cpa\|evm.model.tig00021234.36 (tig00021234_g19410.t1)	1.0	0.57	0.29	0.3	0.3	0.24	0.5	0.41	0.37	0.34	0.46	0.33	0.78	0.28	0.28	0.26	0.19	0.23	0.23	0.17	0.09	0.15	0.51	0.6	0.87	0.52
Cpa\|evm.model.tig00021234.5 (tig00021234_g19379.t1)	0.95	0.36	0.26	0.26	0.21	0.22	0.42	0.46	0.34	0.64	0.72	0.89	1.0	0.5	0.16	0.33	0.14	0.18	0.2	0.18	0.25	0.19	0.86	0.55	0.63	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021290.17 (tig00021290_g19981.t1)	1.0	0.7	0.61	0.48	0.29	0.23	0.28	0.41	0.46	0.58	0.78	0.73	0.92	0.21	0.23	0.24	0.34	0.63	0.38	0.46	0.14	0.51	0.9	0.56	0.86	0.5
Cpa\|evm.model.tig00021433.7	1.0	0.56	0.39	0.72	0.39	0.21	0.27	0.44	0.37	0.27	0.48	0.43	0.85	0.15	0.26	0.19	0.2	0.54	0.54	0.13	0.42	0.82	0.88	0.37	0.56	0.48
Cpa\|evm.model.tig00021535.7 (tig00021535_g22214.t1)	0.51	0.0	0.03	0.37	0.11	0.02	0.0	0.22	0.1	0.07	0.22	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.03	0.04	0.0	0.17	0.06	1.0	0.19	0.19	0.21

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)