Heatmap: Cluster_53 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1013 (1013)	0.28	0.32	0.57	0.54	0.4	0.68	1.0	0.11	0.21	0.63	0.44
Transcript_contig_1373 (1373)	0.73	0.54	0.61	0.46	0.35	1.0	0.52	0.98	0.22	0.26	0.63
Transcript_contig_1381 (1381)	0.45	0.08	0.86	0.4	0.08	0.3	0.41	0.05	0.82	0.72	1.0
Transcript_contig_157 (157)	0.48	0.37	0.65	0.84	0.8	0.89	0.97	0.4	0.2	1.0	0.66
Transcript_contig_15706 (15706)	0.12	0.0	0.14	0.21	0.33	0.16	0.64	0.0	0.0	1.0	0.61
Transcript_contig_1577 (1577)	0.07	0.0	0.27	0.29	0.3	1.0	0.47	0.0	0.0	0.58	0.73
Transcript_contig_1615 (1615)	0.42	0.31	0.28	0.42	0.03	0.49	0.49	0.09	0.57	0.51	1.0
Transcript_contig_1677 (1677)	0.36	0.08	0.1	0.11	0.25	0.28	0.11	0.03	0.35	1.0	0.93
Transcript_contig_1838 (1838)	0.48	0.74	0.93	0.64	0.47	1.0	0.72	0.61	0.05	0.33	0.79
Transcript_contig_1881 (1881)	0.42	0.3	0.78	0.37	0.47	0.18	0.47	0.25	0.0	1.0	0.54
Transcript_contig_2202 (2202)	0.87	0.82	1.0	0.46	0.64	0.19	0.48	0.94	0.06	0.3	0.31
Transcript_contig_2366 (2366)	0.64	0.8	1.0	0.74	0.38	0.54	0.6	0.89	0.1	0.34	0.58
Transcript_contig_3242 (3242)	0.87	0.85	0.93	0.31	0.0	0.06	0.0	0.46	1.0	0.73	0.74
Transcript_contig_3994 (3994)	0.28	0.52	0.31	0.19	0.09	0.58	1.0	0.39	0.08	0.21	0.28
Transcript_contig_4154 (4154)	0.1	0.1	0.05	0.03	0.0	0.0	0.03	0.1	0.0	1.0	0.46
Transcript_contig_4640 (4640)	0.88	0.79	0.83	0.87	0.87	0.68	0.53	0.32	0.07	1.0	0.62
Transcript_contig_4651 (4651)	0.08	0.07	0.22	0.27	0.0	0.03	0.0	0.0	0.04	1.0	0.46
Transcript_contig_4683 (4683)	0.09	0.0	0.82	0.71	1.0	0.91	0.84	0.0	0.39	0.82	0.84
Transcript_contig_4734 (4734)	0.4	0.92	0.44	0.21	0.06	0.34	0.23	0.53	0.07	1.0	0.94
Transcript_contig_4912 (4912)	1.0	0.86	0.2	0.13	0.02	0.39	0.64	0.36	0.51	0.09	0.58
Transcript_contig_54646 (54646)	0.48	0.54	0.26	0.79	1.0	0.77	0.82	0.83	0.04	0.02	0.61
Transcript_contig_54812 (54812)	0.87	0.8	0.92	0.96	1.0	0.37	0.72	0.55	0.48	0.67	0.56
Transcript_contig_54940 (54940)	0.35	0.27	0.63	1.0	0.51	0.47	0.79	0.03	0.18	0.76	0.58
Transcript_contig_55540 (55540)	0.72	0.53	0.82	0.7	0.43	0.81	0.77	0.16	0.75	0.45	1.0
Transcript_contig_55882 (55882)	0.09	0.0	0.01	0.25	0.4	0.83	0.25	0.02	0.2	0.02	1.0
Transcript_contig_56968 (56968)	0.06	0.04	0.17	0.15	0.04	0.87	0.41	0.03	0.0	0.27	1.0
Transcript_contig_57088 (57088)	0.25	0.16	0.14	1.0	0.86	0.43	0.8	0.25	0.0	0.16	0.21
Transcript_contig_57142 (57142)	0.27	0.05	0.52	0.26	0.23	0.81	0.86	0.03	0.26	0.11	1.0
Transcript_contig_57304 (57304)	0.21	0.08	0.21	0.1	0.12	1.0	0.56	0.08	0.03	0.21	0.69
Transcript_contig_57343 (57343)	0.05	0.05	0.28	0.66	1.0	0.29	0.06	0.0	0.0	0.03	0.35
Transcript_contig_57491 (57491)	0.03	0.02	0.03	0.06	0.08	1.0	0.1	0.04	0.08	0.04	0.82
Transcript_contig_57507 (57507)	0.29	0.18	0.04	0.11	0.06	0.4	0.4	0.14	1.0	0.14	0.55
Transcript_contig_57578 (57578)	0.18	0.03	0.04	0.21	0.31	0.18	0.26	0.04	1.0	0.56	0.39
Transcript_contig_57984 (57984)	0.19	0.11	0.28	0.11	0.24	0.67	1.0	0.05	0.06	0.1	0.2
Transcript_contig_58190 (58190)	0.36	0.65	0.32	0.13	0.06	0.82	0.66	1.0	0.07	0.17	0.94
Transcript_contig_58282 (58282)	0.51	0.39	0.63	0.73	0.42	1.0	0.69	0.13	0.18	0.39	0.53
Transcript_contig_58376 (58376)	0.6	0.8	0.22	0.25	0.33	0.88	0.74	1.0	0.05	0.43	0.81
Transcript_contig_58432 (58432)	0.19	0.08	0.34	0.53	0.54	0.51	0.46	0.05	1.0	0.31	0.54
Transcript_contig_58446 (58446)	0.64	0.87	0.94	0.22	0.23	0.88	0.88	1.0	0.4	0.33	0.71
Transcript_contig_58470 (58470)	0.18	0.04	0.58	0.62	0.56	1.0	0.76	0.05	0.0	0.07	0.97
Transcript_contig_58895 (58895)	0.4	0.09	0.73	0.47	0.15	0.7	1.0	0.05	0.0	0.41	0.93
Transcript_contig_5896 (5896)	0.68	0.6	0.47	0.81	1.0	0.58	0.67	0.44	0.21	0.74	0.87
Transcript_contig_59178 (59178)	0.22	0.15	0.27	0.57	0.74	0.59	1.0	0.21	0.0	0.21	0.19
Transcript_contig_59262 (59262)	0.2	0.07	0.24	1.0	0.71	0.31	0.63	0.06	0.15	0.16	0.12
Transcript_contig_59614 (59614)	0.7	0.45	0.72	0.39	0.15	0.2	0.37	0.24	0.68	1.0	0.8
Transcript_contig_59625 (59625)	0.08	0.06	0.12	0.27	0.22	0.54	0.31	0.0	1.0	0.51	0.28
Transcript_contig_59764 (59764)	0.82	0.59	0.19	0.09	0.13	0.13	0.11	0.3	0.97	1.0	0.88
Transcript_contig_59960 (59960)	0.27	0.25	1.0	0.08	0.95	0.63	0.55	0.0	0.0	0.78	0.88
Transcript_contig_60066 (60066)	0.37	0.45	0.47	1.0	0.84	0.87	0.9	0.07	0.0	0.48	0.81
Transcript_contig_60132 (60132)	0.34	0.49	0.31	0.7	1.0	0.36	0.73	0.28	0.0	0.71	0.38
Transcript_contig_60742 (60742)	0.27	0.04	0.0	0.0	0.0	0.12	0.01	0.03	0.71	1.0	0.69
Transcript_contig_60760 (60760)	0.11	0.0	0.33	0.84	1.0	0.62	0.66	0.01	0.03	0.28	0.28
Transcript_contig_60762 (60762)	0.53	0.74	0.61	0.82	1.0	0.86	0.86	0.59	0.26	0.69	0.71
Transcript_contig_60893 (60893)	0.8	0.68	0.07	0.1	0.04	0.05	0.1	0.21	0.04	1.0	0.71
Transcript_contig_61352 (61352)	0.42	0.17	0.95	0.73	0.36	0.8	0.91	0.17	0.82	0.51	1.0
Transcript_contig_61521 (61521)	0.0	0.03	0.33	0.57	1.0	0.46	0.22	0.1	0.0	0.05	0.49
Transcript_contig_61555 (61555)	0.11	0.16	1.0	0.79	0.2	0.54	0.88	0.09	0.24	0.09	0.19
Transcript_contig_61739 (61739)	0.15	0.21	0.25	0.78	0.32	0.52	0.47	0.1	0.0	0.87	1.0
Transcript_contig_61783 (61783)	0.4	0.28	0.27	0.82	0.81	0.56	1.0	0.29	0.04	0.26	0.22
Transcript_contig_61906 (61906)	0.1	0.02	0.27	0.64	1.0	0.62	0.84	0.06	0.06	0.04	0.38
Transcript_contig_62246 (62246)	0.25	0.28	0.69	0.76	1.0	0.67	0.71	0.28	0.01	0.37	0.59
Transcript_contig_62301 (62301)	0.55	0.46	0.28	0.19	0.23	0.74	0.38	0.23	0.46	0.35	1.0
Transcript_contig_62543 (62543)	0.26	0.23	0.45	1.0	0.68	0.55	0.66	0.07	0.04	0.18	0.53
Transcript_contig_6608 (6608)	0.45	0.46	0.38	0.27	0.15	0.24	0.57	0.34	0.0	0.0	1.0
Transcript_contig_66236 (66236)	0.71	0.84	0.65	0.28	0.03	0.23	0.59	1.0	0.0	0.18	0.58
Transcript_contig_67518 (67518)	0.5	0.39	0.34	0.47	0.29	0.31	0.28	0.26	0.42	1.0	0.63
Transcript_contig_67649 (67649)	0.88	0.98	0.04	0.48	0.47	0.11	0.33	0.68	0.66	1.0	0.54
Transcript_contig_67678 (67678)	0.62	0.7	0.55	0.52	0.16	0.29	0.67	0.48	1.0	0.22	0.29
Transcript_contig_67761 (67761)	0.78	0.04	1.0	0.31	0.07	0.5	0.75	0.36	0.0	0.98	0.71
Transcript_contig_67824 (67824)	0.11	0.08	0.0	0.23	0.33	0.27	0.21	0.04	0.16	1.0	0.55
Transcript_contig_67918 (67918)	0.33	0.63	0.13	0.24	0.22	0.23	0.23	1.0	0.0	0.19	0.21
Transcript_contig_67926 (67926)	0.3	0.15	0.21	0.38	0.0	0.31	0.39	0.06	1.0	0.23	0.26
Transcript_contig_68079 (68079)	0.91	1.0	0.17	0.31	0.0	0.1	0.74	0.34	0.0	0.0	0.08
Transcript_contig_68214 (68214)	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.64
Transcript_contig_68383 (68383)	0.25	0.45	0.78	0.29	0.34	0.45	1.0	0.65	0.31	0.57	0.93
Transcript_contig_68521 (68521)	0.38	0.25	0.37	0.26	0.07	0.26	0.38	0.29	0.52	1.0	0.55
Transcript_contig_68565 (68565)	0.22	0.04	0.47	0.0	0.26	0.27	0.65	0.0	0.0	1.0	0.67
Transcript_contig_68923 (68923)	0.5	0.56	0.0	0.06	0.39	0.7	0.15	1.0	0.0	0.71	0.95
Transcript_contig_69026 (69026)	0.33	0.02	0.4	0.53	0.78	0.6	0.75	0.03	0.16	1.0	0.88
Transcript_contig_69045 (69045)	0.13	0.13	0.03	0.14	0.08	0.65	0.12	0.06	0.0	0.03	1.0
Transcript_contig_69297 (69297)	0.23	0.2	0.19	0.89	1.0	0.58	0.62	0.38	0.0	0.04	0.09
Transcript_contig_69723 (69723)	0.36	0.07	0.21	0.11	0.0	0.9	0.57	0.05	0.06	0.43	1.0
Transcript_contig_69748 (69748)	0.0	0.0	0.21	0.04	0.0	0.2	0.2	0.0	0.0	1.0	0.57
Transcript_contig_6993 (6993)	0.09	0.06	0.49	0.3	0.04	0.43	0.19	0.04	0.04	0.0	1.0
Transcript_contig_69973 (69973)	0.12	0.02	0.41	0.48	0.13	0.3	0.36	0.01	0.13	1.0	0.62
Transcript_contig_70376 (70376)	0.16	0.1	0.61	0.71	1.0	0.71	0.63	0.15	0.0	0.0	0.69
Transcript_contig_70437 (70437)	0.48	0.27	0.6	0.31	0.34	1.0	0.79	0.09	0.0	0.35	0.41
Transcript_contig_70446 (70446)	0.17	1.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.95	0.0	0.0	0.48	0.0
Transcript_contig_71116 (71116)	0.28	0.3	0.36	0.83	1.0	0.38	0.72	0.45	0.11	0.16	0.23
Transcript_contig_71819 (71819)	0.5	0.25	0.97	1.0	0.65	0.54	0.87	0.13	0.14	0.88	0.74
Transcript_contig_74826 (74826)	0.0	0.0	0.07	0.25	1.0	0.61	0.04	0.0	0.0	0.0	0.85
Transcript_contig_76322 (76322)	0.03	0.0	0.57	0.89	1.0	0.76	0.33	0.0	0.0	0.0	0.56
Transcript_contig_78695 (78695)	0.36	0.01	0.19	0.1	0.05	0.03	0.02	0.0	0.09	1.0	0.77
Transcript_contig_78769 (78769)	0.27	0.23	0.27	0.9	0.63	0.89	0.69	0.05	0.06	1.0	0.62
Transcript_contig_78790 (78790)	0.1	0.02	1.0	0.51	0.25	0.09	0.11	0.01	0.03	0.45	0.34
Transcript_contig_78825 (78825)	0.65	1.0	0.51	0.49	0.43	0.87	1.0	0.92	0.52	0.75	0.6
Transcript_contig_79306 (79306)	0.35	0.61	0.02	0.29	0.4	0.68	0.37	1.0	0.04	0.81	0.82
Transcript_contig_79502 (79502)	0.16	0.0	0.24	0.68	0.93	0.98	1.0	0.01	0.01	0.01	0.54
Transcript_contig_79532 (79532)	0.27	0.0	0.24	0.19	0.16	1.0	0.83	0.0	0.01	0.46	0.92
Transcript_contig_79608 (79608)	0.36	0.06	0.65	0.74	0.44	0.69	0.7	0.03	0.56	0.43	1.0
Transcript_contig_79664 (79664)	0.08	0.0	0.18	0.58	0.5	1.0	0.56	0.0	0.0	0.0	0.51
Transcript_contig_79840 (79840)	0.83	0.9	0.27	0.57	1.0	0.63	0.66	0.63	0.1	0.45	0.66
Transcript_contig_79887 (79887)	0.15	0.0	0.69	1.0	0.74	0.32	0.78	0.0	0.0	0.63	0.27
Transcript_contig_79942 (79942)	0.02	0.0	0.41	0.65	0.54	1.0	0.11	0.0	0.0	0.01	0.83
Transcript_contig_79978 (79978)	0.33	0.28	0.36	0.67	0.75	0.8	1.0	0.53	0.0	0.04	0.6
Transcript_contig_80182 (80182)	0.56	1.0	0.17	0.15	0.0	0.1	0.09	0.88	0.06	0.94	0.49
Transcript_contig_80212 (80212)	0.01	0.0	0.28	0.38	0.42	1.0	0.11	0.0	0.01	0.0	0.79
Transcript_contig_80242 (80242)	0.01	0.0	0.42	0.38	0.41	1.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.85
Transcript_contig_80244 (80244)	0.43	0.51	0.68	0.86	0.25	0.69	1.0	0.51	0.1	0.14	0.31
Transcript_contig_80287 (80287)	0.13	0.0	0.67	0.4	0.75	0.87	1.0	0.0	0.2	0.79	0.28
Transcript_contig_80445 (80445)	0.18	0.0	0.5	0.67	1.0	0.25	0.64	0.0	0.7	0.32	0.34
Transcript_contig_80492 (80492)	0.16	0.22	0.12	0.13	0.03	0.21	0.07	0.44	0.88	0.15	1.0
Transcript_contig_80580 (80580)	0.24	0.28	0.1	1.0	0.52	0.32	0.52	0.36	0.0	0.45	0.27
Transcript_contig_80792 (80792)	0.0	0.0	0.17	0.16	0.16	1.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.8
Transcript_contig_81335 (81335)	0.53	1.0	0.28	0.19	0.0	0.29	0.19	0.43	0.22	0.31	0.57
Transcript_contig_82010 (82010)	0.07	0.06	0.24	0.53	0.48	1.0	0.85	0.07	0.03	0.04	0.62
Transcript_contig_82404 (82404)	0.93	0.96	0.97	0.7	0.64	0.43	1.0	0.75	0.24	0.53	0.47
Transcript_contig_82511 (82511)	0.88	1.0	0.36	0.15	0.23	0.46	0.54	0.87	0.07	0.65	0.55
Transcript_contig_8547 (8547)	0.71	1.0	0.18	0.05	0.0	0.22	0.41	0.97	0.34	0.12	0.32
Transcript_contig_89305 (89305)	0.09	0.01	0.3	1.0	0.94	0.51	0.74	0.0	0.04	0.19	0.28
Transcript_contig_89383 (89383)	1.0	1.0	0.34	0.37	0.21	0.38	0.54	0.44	0.02	0.3	0.39
Transcript_contig_90213 (90213)	0.27	0.0	0.14	0.11	0.05	0.79	0.38	0.0	0.0	0.29	1.0
Transcript_contig_90386 (90386)	0.32	0.49	0.73	1.0	0.93	0.7	0.66	0.3	0.03	0.12	0.48
Transcript_contig_90394 (90394)	0.28	0.41	1.0	0.6	0.54	0.57	0.76	0.59	0.34	0.88	0.48
Transcript_contig_90769 (90769)	0.32	0.0	0.67	0.86	1.0	0.56	0.92	0.0	0.0	0.94	0.92
Transcript_contig_90805 (90805)	0.2	0.07	0.46	0.66	0.76	0.72	1.0	0.11	0.28	0.8	0.76

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)