Heatmap: Cluster_86 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1229 (1229)	0.79	1.0	0.18	0.13	0.07	0.15	0.37	0.89	0.0	0.12	0.06
Transcript_contig_13519 (13519)	0.83	1.0	0.2	0.2	0.24	0.33	0.31	0.9	0.04	0.17	0.15
Transcript_contig_14511 (14511)	0.55	1.0	0.17	0.07	0.05	0.3	0.7	0.87	0.0	0.05	0.06
Transcript_contig_18108 (18108)	0.94	1.0	0.13	0.08	0.24	0.29	0.44	0.98	0.0	0.1	0.06
Transcript_contig_1852 (1852)	0.79	1.0	0.38	0.19	0.26	0.25	0.59	0.63	0.12	0.29	0.21
Transcript_contig_19576 (19576)	0.5	0.91	0.25	0.34	0.2	0.47	0.43	1.0	0.11	0.09	0.18
Transcript_contig_231 (231)	0.77	1.0	0.3	0.13	0.16	0.4	0.64	0.93	0.03	0.23	0.16
Transcript_contig_2655 (2655)	0.46	0.68	0.07	0.05	0.08	0.05	0.24	1.0	0.14	0.08	0.07
Transcript_contig_3251 (3251)	0.52	0.66	0.16	0.18	0.18	0.07	0.24	1.0	0.01	0.06	0.02
Transcript_contig_3283 (3283)	0.6	0.77	0.0	0.03	0.0	0.19	0.37	1.0	0.0	0.05	0.01
Transcript_contig_332 (332)	0.63	0.93	0.23	0.19	0.31	0.28	0.52	1.0	0.63	0.18	0.16
Transcript_contig_3422 (3422)	0.73	1.0	0.25	0.13	0.26	0.43	0.74	1.0	0.01	0.25	0.14
Transcript_contig_3607 (3607)	0.69	1.0	0.24	0.08	0.05	0.42	0.81	0.88	0.21	0.17	0.18
Transcript_contig_5219 (5219)	0.75	1.0	0.14	0.24	0.27	0.19	0.43	0.62	0.0	0.06	0.04
Transcript_contig_54034 (54034)	0.7	1.0	0.1	0.13	0.14	0.28	0.67	0.81	0.07	0.18	0.08
Transcript_contig_54175 (54175)	0.83	1.0	0.11	0.15	0.14	0.31	0.7	0.49	0.06	0.39	0.18
Transcript_contig_55163 (55163)	1.0	0.87	0.17	0.1	0.06	0.25	0.57	0.3	0.0	0.18	0.22
Transcript_contig_55241 (55241)	0.67	0.91	0.12	0.13	0.12	0.21	0.44	1.0	0.01	0.23	0.12
Transcript_contig_55406 (55406)	0.73	0.95	0.23	0.12	0.1	0.19	0.5	1.0	0.03	0.09	0.06
Transcript_contig_55488 (55488)	0.7	1.0	0.09	0.13	0.13	0.24	0.57	0.76	0.01	0.2	0.1
Transcript_contig_55649 (55649)	0.65	0.86	0.3	0.28	0.42	0.31	0.66	1.0	0.21	0.2	0.2
Transcript_contig_55941 (55941)	0.49	0.82	0.08	0.09	0.08	0.12	0.34	1.0	0.02	0.07	0.03
Transcript_contig_56346 (56346)	0.78	1.0	0.03	0.1	0.14	0.13	0.39	0.75	0.01	0.01	0.03
Transcript_contig_5694 (5694)	0.55	0.77	0.14	0.18	0.23	0.16	0.38	1.0	0.03	0.32	0.15
Transcript_contig_57071 (57071)	0.75	1.0	0.07	0.07	0.06	0.38	0.5	0.75	0.11	0.22	0.15
Transcript_contig_57226 (57226)	0.66	1.0	0.2	0.17	0.25	0.12	0.38	0.88	0.0	0.07	0.03
Transcript_contig_57371 (57371)	1.0	0.95	0.26	0.12	0.09	0.46	0.72	0.21	0.01	0.2	0.23
Transcript_contig_57460 (57460)	0.66	0.93	0.26	0.23	0.27	0.35	0.71	1.0	0.09	0.14	0.11
Transcript_contig_58156 (58156)	0.65	1.0	0.15	0.09	0.1	0.2	0.34	0.86	0.04	0.25	0.13
Transcript_contig_58442 (58442)	0.61	0.92	0.52	0.31	0.14	0.49	0.68	1.0	0.01	0.05	0.29
Transcript_contig_58602 (58602)	0.76	1.0	0.16	0.11	0.06	0.38	0.5	0.62	0.94	0.3	0.27
Transcript_contig_58622 (58622)	0.8	1.0	0.18	0.12	0.12	0.41	0.62	0.55	0.16	0.23	0.2
Transcript_contig_58809 (58809)	0.79	1.0	0.35	0.27	0.27	0.44	0.84	0.91	0.3	0.25	0.26
Transcript_contig_58900 (58900)	0.69	1.0	0.16	0.12	0.09	0.39	0.76	0.7	0.01	0.07	0.09
Transcript_contig_58903 (58903)	0.74	1.0	0.37	0.2	0.26	0.31	0.63	0.94	0.43	0.2	0.19
Transcript_contig_5907 (5907)	0.45	0.67	0.17	0.19	0.0	0.31	0.33	1.0	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_59247 (59247)	0.65	1.0	0.17	0.08	0.1	0.26	0.39	0.96	0.09	0.27	0.13
Transcript_contig_59440 (59440)	0.76	0.97	0.03	0.09	0.15	0.31	0.56	1.0	0.04	0.24	0.15
Transcript_contig_59555 (59555)	0.62	0.97	0.63	0.28	0.21	0.54	0.57	1.0	0.33	0.0	0.25
Transcript_contig_59645 (59645)	0.74	1.0	0.06	0.1	0.07	0.21	0.46	0.96	0.11	0.28	0.1
Transcript_contig_59671 (59671)	0.85	1.0	0.27	0.21	0.23	0.3	0.59	0.64	0.53	0.25	0.24
Transcript_contig_59761 (59761)	0.79	1.0	0.0	0.06	0.05	0.56	0.5	0.44	0.0	0.11	0.15
Transcript_contig_5987 (5987)	0.79	1.0	0.2	0.12	0.02	0.41	0.63	0.69	0.16	0.19	0.23
Transcript_contig_60050 (60050)	0.79	1.0	0.0	0.0	0.0	0.15	0.44	0.43	0.0	0.04	0.0
Transcript_contig_60329 (60329)	0.7	1.0	0.08	0.17	0.21	0.3	0.52	0.87	0.02	0.22	0.12
Transcript_contig_60466 (60466)	0.74	1.0	0.22	0.25	0.33	0.34	0.43	1.0	0.08	0.15	0.11
Transcript_contig_61498 (61498)	0.83	1.0	0.21	0.16	0.07	0.38	0.61	0.46	0.14	0.19	0.21
Transcript_contig_61619 (61619)	1.0	0.83	0.67	0.28	0.0	0.33	0.69	0.2	0.0	0.36	0.09
Transcript_contig_61897 (61897)	0.62	0.95	0.15	0.14	0.16	0.14	0.3	1.0	0.07	0.23	0.13
Transcript_contig_62474 (62474)	0.78	1.0	0.0	0.14	0.0	0.33	0.64	0.6	0.81	0.23	0.07
Transcript_contig_6284 (6284)	0.74	1.0	0.1	0.1	0.15	0.32	0.6	0.94	0.04	0.16	0.08
Transcript_contig_63269 (63269)	0.63	1.0	0.13	0.07	0.08	0.6	0.66	0.79	0.46	0.13	0.3
Transcript_contig_6753 (6753)	0.76	1.0	0.17	0.11	0.16	0.51	0.65	0.6	0.01	0.19	0.22
Transcript_contig_67639 (67639)	0.82	1.0	0.65	0.3	0.15	0.33	0.53	0.45	0.14	0.36	0.27
Transcript_contig_67810 (67810)	1.0	0.92	0.32	0.26	0.03	0.49	0.85	0.59	0.04	0.23	0.13
Transcript_contig_68529 (68529)	0.44	0.65	0.11	0.23	0.04	0.06	0.29	1.0	0.05	0.02	0.0
Transcript_contig_6896 (6896)	0.46	0.79	0.05	0.06	0.27	0.11	0.31	1.0	0.08	0.09	0.06
Transcript_contig_70303 (70303)	0.99	1.0	0.4	0.13	0.01	0.18	0.54	0.55	0.0	0.03	0.05
Transcript_contig_70598 (70598)	0.5	0.76	0.28	0.12	0.39	0.07	0.28	1.0	0.02	0.13	0.17
Transcript_contig_70724 (70724)	0.43	0.51	0.12	0.04	0.07	0.21	0.28	1.0	0.08	0.07	0.0
Transcript_contig_7583 (7583)	0.42	0.71	0.17	0.11	0.19	0.18	0.4	1.0	0.05	0.19	0.08
Transcript_contig_78087 (78087)	0.55	0.79	0.11	0.1	0.12	0.22	0.6	1.0	0.01	0.04	0.03
Transcript_contig_78227 (78227)	0.79	1.0	0.16	0.11	0.19	0.23	0.41	0.67	0.08	0.23	0.18
Transcript_contig_78427 (78427)	0.68	1.0	0.1	0.19	0.27	0.34	0.48	0.65	0.07	0.29	0.16
Transcript_contig_78434 (78434)	0.81	1.0	0.03	0.07	0.05	0.18	0.44	0.61	0.02	0.32	0.08
Transcript_contig_78478 (78478)	0.68	1.0	0.11	0.2	0.25	0.33	0.56	0.73	0.01	0.18	0.09
Transcript_contig_78692 (78692)	0.84	1.0	0.34	0.22	0.23	0.42	0.6	0.27	0.13	0.19	0.18
Transcript_contig_78862 (78862)	0.59	0.89	0.24	0.21	0.21	0.23	0.56	1.0	0.15	0.18	0.12
Transcript_contig_78994 (78994)	0.75	1.0	0.05	0.09	0.09	0.22	0.54	0.51	0.02	0.11	0.06
Transcript_contig_79348 (79348)	0.72	1.0	0.15	0.1	0.09	0.26	0.48	0.8	0.02	0.14	0.11
Transcript_contig_79485 (79485)	0.66	0.9	0.0	0.05	0.08	0.21	0.49	1.0	0.0	0.3	0.08
Transcript_contig_79643 (79643)	0.68	1.0	0.13	0.04	0.08	0.08	0.27	0.69	0.0	0.05	0.08
Transcript_contig_80477 (80477)	0.64	1.0	0.41	0.25	0.16	0.35	0.78	0.8	0.41	0.31	0.2
Transcript_contig_862 (862)	0.79	1.0	0.01	0.02	0.01	0.23	0.21	0.55	0.06	0.1	0.04
Transcript_contig_8811 (8811)	0.82	1.0	0.18	0.14	0.04	0.41	0.6	0.74	0.91	0.45	0.41
Transcript_contig_89293 (89293)	0.57	0.83	0.02	0.03	0.05	0.16	0.45	1.0	0.01	0.02	0.01
Transcript_contig_89439 (89439)	0.82	1.0	0.11	0.12	0.16	0.21	0.33	0.67	0.01	0.2	0.13
Transcript_contig_89686 (89686)	0.76	1.0	0.07	0.05	0.03	0.23	0.31	0.57	0.08	0.1	0.1
Transcript_contig_89792 (89792)	0.83	1.0	0.1	0.16	0.15	0.39	0.55	0.51	0.09	0.29	0.25
Transcript_contig_89868 (89868)	0.81	1.0	0.11	0.07	0.06	0.22	0.47	0.78	0.04	0.11	0.07
Transcript_contig_90010 (90010)	0.68	1.0	0.14	0.13	0.1	0.43	0.63	0.88	0.07	0.22	0.27
Transcript_contig_90140 (90140)	0.74	0.92	0.17	0.12	0.12	0.37	0.85	1.0	0.0	0.17	0.14
Transcript_contig_90214 (90214)	0.65	0.89	0.31	0.33	0.51	0.37	0.66	1.0	0.12	0.17	0.15
Transcript_contig_90330 (90330)	0.42	0.64	0.14	0.14	0.22	0.17	0.23	1.0	0.12	0.13	0.07
Transcript_contig_90494 (90494)	0.83	1.0	0.25	0.18	0.23	0.31	0.64	0.84	0.38	0.25	0.27
Transcript_contig_9454 (9454)	0.46	0.61	0.0	0.42	0.0	0.0	0.26	1.0	0.0	0.05	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)