Heatmap: Cluster_237 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1114 (1114)	0.6	1.0	0.44	0.47	0.87	0.34	0.35	0.9	0.27	0.53	0.34
Transcript_contig_1149 (1149)	0.7	1.0	0.06	0.16	0.22	0.09	0.29	0.96	0.0	0.04	0.03
Transcript_contig_1440 (1440)	0.6	0.88	0.4	0.32	0.57	0.18	0.69	1.0	0.06	0.23	0.17
Transcript_contig_1491 (1491)	0.64	0.84	0.23	0.35	0.35	0.18	0.36	1.0	0.01	0.15	0.07
Transcript_contig_187 (187)	0.69	0.86	0.4	0.37	0.5	0.31	0.66	1.0	0.03	0.22	0.15
Transcript_contig_2759 (2759)	0.61	0.9	0.26	0.37	0.49	0.32	0.4	1.0	0.06	0.23	0.18
Transcript_contig_3127 (3127)	0.61	0.79	0.5	0.48	0.73	0.26	0.49	1.0	0.04	0.14	0.15
Transcript_contig_4293 (4293)	0.48	0.82	0.46	0.27	0.22	0.12	0.44	1.0	0.06	0.13	0.06
Transcript_contig_473 (473)	0.81	1.0	0.41	0.6	0.76	0.58	0.84	0.75	0.1	0.34	0.19
Transcript_contig_5168 (5168)	0.68	1.0	0.4	0.44	0.55	0.17	0.63	0.77	0.01	0.2	0.12
Transcript_contig_54334 (54334)	0.6	0.78	0.37	0.57	0.49	0.19	0.5	1.0	0.13	0.09	0.1
Transcript_contig_54384 (54384)	0.67	0.92	0.56	0.61	0.74	0.21	0.38	1.0	0.22	0.37	0.23
Transcript_contig_57210 (57210)	0.6	0.74	0.36	0.27	0.28	0.17	0.48	1.0	0.0	0.0	0.05
Transcript_contig_58125 (58125)	0.64	0.87	0.38	0.36	0.33	0.37	0.52	1.0	0.05	0.27	0.23
Transcript_contig_58626 (58626)	0.7	0.93	0.17	0.25	0.27	0.18	0.45	1.0	0.0	0.03	0.01
Transcript_contig_58711 (58711)	0.71	0.96	0.47	0.36	0.22	0.25	0.51	1.0	0.0	0.0	0.13
Transcript_contig_59256 (59256)	0.7	1.0	0.37	0.37	0.45	0.21	0.43	0.93	0.1	0.27	0.17
Transcript_contig_59664 (59664)	0.7	1.0	0.2	0.15	0.29	0.33	0.43	0.85	0.19	0.42	0.18
Transcript_contig_59667 (59667)	0.49	0.7	0.23	0.2	0.3	0.22	0.33	1.0	0.12	0.25	0.15
Transcript_contig_59929 (59929)	0.66	0.96	0.46	0.44	0.71	0.34	0.58	1.0	0.07	0.26	0.18
Transcript_contig_60423 (60423)	0.69	1.0	0.06	0.26	0.17	0.06	0.33	0.81	0.03	0.0	0.03
Transcript_contig_62189 (62189)	0.73	1.0	0.52	0.41	0.5	0.33	0.74	0.72	0.22	0.48	0.18
Transcript_contig_6240 (6240)	0.76	1.0	0.46	0.52	0.41	0.3	0.93	0.8	0.0	0.36	0.2
Transcript_contig_6249 (6249)	0.9	1.0	0.1	0.15	0.32	0.09	0.32	0.87	0.02	0.0	0.06
Transcript_contig_63089 (63089)	0.65	0.93	0.21	0.34	0.62	0.2	0.48	1.0	0.02	0.04	0.04
Transcript_contig_69071 (69071)	0.52	0.82	0.32	0.31	0.85	0.14	0.34	1.0	0.05	0.27	0.16
Transcript_contig_69360 (69360)	0.72	0.85	0.44	0.49	0.56	0.38	0.73	1.0	0.13	0.3	0.18
Transcript_contig_69572 (69572)	0.71	0.89	0.48	0.54	0.52	0.26	0.41	1.0	0.06	0.27	0.22
Transcript_contig_73471 (73471)	0.64	1.0	0.22	0.32	0.26	0.14	0.35	1.0	0.0	0.0	0.01
Transcript_contig_78968 (78968)	0.79	1.0	0.52	0.64	0.43	0.28	0.65	0.63	0.33	0.51	0.32
Transcript_contig_78999 (78999)	0.6	0.79	0.33	0.26	0.25	0.21	0.6	1.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_79117 (79117)	0.65	1.0	0.33	0.4	0.21	0.33	0.62	0.98	0.03	0.0	0.12
Transcript_contig_79165 (79165)	0.54	0.8	0.27	0.39	0.78	0.3	0.33	1.0	0.15	0.41	0.28
Transcript_contig_79397 (79397)	0.66	0.85	0.52	0.51	0.76	0.4	0.57	1.0	0.16	0.4	0.36
Transcript_contig_79539 (79539)	0.75	0.99	0.29	0.3	0.3	0.25	0.4	1.0	0.06	0.37	0.18
Transcript_contig_79613 (79613)	0.64	0.88	0.57	0.37	0.25	0.29	0.7	1.0	0.04	0.03	0.04
Transcript_contig_79822 (79822)	0.73	1.0	0.37	0.51	0.38	0.27	0.63	1.0	0.31	0.48	0.38
Transcript_contig_79957 (79957)	0.82	1.0	0.37	0.58	0.64	0.42	0.8	0.87	0.0	0.14	0.1
Transcript_contig_80125 (80125)	0.51	0.76	0.2	0.48	0.84	0.29	0.31	1.0	0.19	0.33	0.31
Transcript_contig_80361 (80361)	0.43	0.71	0.47	0.38	0.45	0.13	0.4	1.0	0.0	0.13	0.1
Transcript_contig_82 (82)	0.71	0.91	0.25	0.33	0.4	0.31	0.44	1.0	0.05	0.33	0.21
Transcript_contig_82228 (82228)	0.71	1.0	0.18	0.31	0.29	0.2	0.55	1.0	0.02	0.13	0.13
Transcript_contig_82431 (82431)	0.74	0.93	0.5	0.42	0.42	0.22	0.71	1.0	0.3	0.09	0.17
Transcript_contig_89146 (89146)	0.75	1.0	0.18	0.39	0.69	0.29	0.69	0.85	0.05	0.37	0.16
Transcript_contig_89225 (89225)	0.73	0.96	0.51	0.47	0.55	0.19	0.41	1.0	0.1	0.27	0.21
Transcript_contig_89283 (89283)	0.61	0.84	0.58	0.49	0.5	0.4	0.52	1.0	0.32	0.15	0.19
Transcript_contig_90070 (90070)	0.68	0.87	0.33	0.42	0.51	0.36	0.56	1.0	0.13	0.01	0.03
Transcript_contig_90073 (90073)	0.6	0.9	0.22	0.21	0.35	0.15	0.4	1.0	0.0	0.0	0.03
Transcript_contig_90222 (90222)	0.78	1.0	0.37	0.62	0.69	0.51	0.95	0.71	0.11	0.32	0.16

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)