Heatmap: Cluster_171 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	CCAP211/11P,High light	CCAP211/11P,Low light	CPCC90,BBM,72h,Autotrophy	CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy	CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy	NJ-7,20C	NJ-7,4C	UTEX259,20C	UTEX259,4C
Transcript_contig_1253 (1253)	0.28	0.23	0.65	0.32	0.27	0.45	0.91	0.21	1.0	0.87	0.56
Transcript_contig_12690 (12690)	0.26	0.41	0.48	0.23	0.19	0.77	0.85	0.38	0.36	1.0	0.73
Transcript_contig_15920 (15920)	0.02	0.05	0.0	0.06	0.19	0.58	1.0	0.16	0.0	0.98	0.22
Transcript_contig_18130 (18130)	0.07	0.36	0.6	0.06	0.23	0.59	0.91	0.27	0.18	1.0	0.22
Transcript_contig_21259 (21259)	0.01	0.0	0.37	0.24	0.2	0.46	1.0	0.0	0.0	0.5	0.45
Transcript_contig_2268 (2268)	0.44	0.42	0.74	0.62	0.44	0.71	1.0	0.43	0.65	0.65	0.7
Transcript_contig_3044 (3044)	0.28	0.31	1.0	0.59	0.27	0.32	0.47	0.34	0.6	0.35	0.39
Transcript_contig_3432 (3432)	0.09	0.16	0.31	0.15	0.09	0.24	1.0	0.15	0.46	0.93	0.57
Transcript_contig_3443 (3443)	0.12	0.05	0.41	0.19	0.11	0.77	1.0	0.06	0.12	0.53	0.32
Transcript_contig_3446 (3446)	0.1	0.03	0.55	0.59	0.91	0.88	1.0	0.0	0.61	0.45	0.42
Transcript_contig_4220 (4220)	0.3	0.08	0.89	0.66	0.26	0.37	1.0	0.07	0.0	0.0	0.02
Transcript_contig_4255 (4255)	0.37	0.34	0.48	0.95	0.92	0.79	0.93	0.9	0.28	1.0	0.82
Transcript_contig_4943 (4943)	0.48	0.56	0.13	0.16	0.02	0.17	0.32	0.15	0.08	1.0	0.55
Transcript_contig_496 (496)	0.32	0.25	0.7	0.3	0.17	0.56	1.0	0.29	0.67	0.36	0.33
Transcript_contig_5051 (5051)	0.48	0.66	0.42	0.22	0.25	0.51	1.0	0.75	0.0	0.46	0.37
Transcript_contig_54009 (54009)	0.14	0.19	0.26	0.34	0.38	0.59	1.0	0.27	0.51	0.47	0.46
Transcript_contig_54028 (54028)	0.4	0.43	0.52	0.4	0.37	0.57	1.0	0.46	0.45	0.48	0.48
Transcript_contig_54084 (54084)	0.16	0.68	0.22	0.25	0.11	0.44	0.73	1.0	0.11	0.5	0.54
Transcript_contig_54102 (54102)	0.33	0.23	0.48	0.47	0.55	0.27	0.67	0.18	1.0	0.42	0.32
Transcript_contig_54272 (54272)	0.23	0.21	0.62	0.49	0.14	0.26	0.53	0.19	1.0	0.14	0.23
Transcript_contig_54938 (54938)	0.31	0.15	0.71	0.49	0.45	0.5	1.0	0.12	0.91	0.41	0.36
Transcript_contig_5544 (5544)	0.59	0.33	0.42	0.53	0.48	0.68	1.0	0.26	0.57	0.63	0.47
Transcript_contig_55617 (55617)	0.34	0.2	0.92	0.5	0.33	0.45	1.0	0.23	0.92	0.43	0.36
Transcript_contig_56051 (56051)	0.37	0.41	0.57	0.33	0.77	0.62	0.97	0.65	1.0	0.74	0.62
Transcript_contig_56100 (56100)	0.22	0.1	0.46	0.33	0.26	0.48	1.0	0.07	0.56	0.43	0.32
Transcript_contig_56114 (56114)	0.33	0.34	0.72	0.54	0.68	0.84	1.0	0.33	0.73	0.67	0.85
Transcript_contig_56514 (56514)	0.22	0.25	0.17	0.08	0.07	0.27	0.46	0.55	1.0	0.57	0.52
Transcript_contig_56572 (56572)	0.38	0.36	0.38	0.22	0.2	0.71	1.0	0.39	0.33	0.57	0.71
Transcript_contig_56620 (56620)	0.17	0.1	0.99	0.56	0.25	0.48	1.0	0.11	0.04	0.11	0.13
Transcript_contig_56794 (56794)	0.16	0.15	0.52	0.27	0.28	0.58	1.0	0.12	0.16	0.23	0.21
Transcript_contig_57145 (57145)	0.41	0.31	0.95	0.49	0.4	0.66	1.0	0.29	0.78	0.87	0.56
Transcript_contig_57201 (57201)	0.11	0.06	0.48	0.27	0.18	0.59	1.0	0.06	0.4	0.38	0.37
Transcript_contig_57300 (57300)	0.22	0.3	0.34	0.4	0.83	0.8	1.0	0.45	0.0	0.89	0.58
Transcript_contig_57333 (57333)	0.16	0.08	0.92	0.58	0.24	0.42	1.0	0.1	0.04	0.09	0.08
Transcript_contig_57412 (57412)	0.23	0.09	0.32	0.37	0.41	0.58	1.0	0.13	0.28	0.41	0.41
Transcript_contig_57797 (57797)	0.21	0.0	1.0	0.32	0.7	0.7	0.97	0.0	0.0	0.19	0.7
Transcript_contig_57916 (57916)	0.1	0.02	0.13	0.21	0.13	0.35	0.63	0.02	1.0	0.28	0.27
Transcript_contig_58000 (58000)	0.04	0.13	0.32	0.23	0.21	0.81	1.0	0.11	0.0	0.57	0.2
Transcript_contig_58122 (58122)	0.34	0.93	0.08	0.04	0.09	0.35	0.51	1.0	0.04	0.25	0.18
Transcript_contig_58269 (58269)	0.64	0.5	0.3	0.18	0.3	0.29	0.57	0.58	1.0	0.79	0.71
Transcript_contig_58497 (58497)	0.22	0.06	0.35	0.29	0.35	0.38	1.0	0.1	0.2	0.61	0.42
Transcript_contig_58553 (58553)	0.52	0.64	0.59	0.21	0.25	0.54	1.0	0.82	0.3	0.62	0.4
Transcript_contig_59143 (59143)	0.49	0.5	0.54	0.39	0.32	0.85	1.0	0.88	0.83	0.97	0.81
Transcript_contig_59346 (59346)	0.45	0.48	0.46	0.29	0.34	0.62	1.0	0.6	0.49	0.48	0.39
Transcript_contig_60071 (60071)	0.14	0.12	0.91	0.51	0.28	0.36	1.0	0.22	0.31	0.13	0.09
Transcript_contig_60088 (60088)	0.1	0.0	0.35	0.55	0.35	0.39	1.0	0.0	0.0	0.39	0.16
Transcript_contig_60231 (60231)	0.46	0.3	0.86	0.66	0.57	0.35	0.8	0.15	1.0	0.17	0.2
Transcript_contig_60500 (60500)	0.14	0.14	0.46	0.37	0.17	0.48	1.0	0.05	0.21	0.42	0.32
Transcript_contig_60675 (60675)	0.71	1.0	0.69	0.59	0.48	0.39	0.78	0.69	0.09	0.56	0.3
Transcript_contig_61244 (61244)	0.14	0.12	0.07	0.23	0.35	0.54	1.0	0.07	0.75	0.46	0.19
Transcript_contig_61481 (61481)	0.5	0.59	0.29	0.24	0.28	0.32	1.0	0.38	0.85	0.55	0.26
Transcript_contig_62650 (62650)	0.18	0.0	0.77	0.64	0.53	0.58	1.0	0.0	0.01	0.18	0.23
Transcript_contig_62731 (62731)	0.32	0.09	0.71	0.52	0.59	0.22	1.0	0.2	0.0	0.21	0.02
Transcript_contig_63155 (63155)	0.11	0.0	0.65	0.45	0.19	0.25	1.0	0.05	0.0	0.04	0.09
Transcript_contig_68750 (68750)	0.29	0.17	0.33	0.72	0.36	0.58	1.0	0.0	0.0	0.63	0.38
Transcript_contig_68751 (68751)	0.61	0.6	0.69	0.29	0.3	0.39	1.0	0.47	0.65	0.42	0.36
Transcript_contig_68851 (68851)	0.52	0.11	0.15	0.14	0.57	0.6	1.0	0.31	0.0	0.94	0.71
Transcript_contig_69506 (69506)	0.32	0.23	0.26	0.19	0.2	0.45	1.0	0.16	0.22	0.26	0.28
Transcript_contig_69571 (69571)	0.08	0.06	0.71	0.33	0.38	0.41	1.0	0.07	0.02	0.3	0.3
Transcript_contig_71837 (71837)	0.18	0.08	1.0	0.59	0.1	0.29	0.7	0.03	0.45	0.16	0.14
Transcript_contig_7243 (7243)	0.26	0.25	0.72	0.55	0.59	0.49	1.0	0.33	0.43	0.48	0.37
Transcript_contig_73940 (73940)	0.32	0.46	0.51	0.39	0.12	0.52	1.0	0.0	0.0	0.62	0.28
Transcript_contig_78284 (78284)	0.28	0.32	0.16	0.27	0.38	0.69	1.0	0.32	0.27	0.74	0.52
Transcript_contig_78575 (78575)	0.35	0.48	0.96	0.44	0.32	0.74	1.0	0.75	0.22	0.31	0.42
Transcript_contig_78666 (78666)	0.25	0.39	0.45	0.35	0.39	0.83	1.0	0.69	0.73	0.63	0.57
Transcript_contig_78933 (78933)	0.26	0.38	0.27	0.37	0.43	0.53	1.0	0.74	0.13	1.0	0.56
Transcript_contig_78954 (78954)	0.18	0.13	1.0	0.52	0.26	0.41	0.96	0.15	0.17	0.17	0.19
Transcript_contig_78997 (78997)	0.25	0.45	0.18	0.16	0.55	0.55	0.73	0.77	1.0	0.58	0.48
Transcript_contig_79096 (79096)	0.3	0.13	0.57	0.54	0.54	0.35	0.81	0.07	1.0	0.49	0.35
Transcript_contig_79259 (79259)	0.23	0.05	1.0	0.5	0.65	0.38	0.6	0.11	0.72	0.21	0.36
Transcript_contig_79603 (79603)	0.31	0.12	0.67	0.39	0.53	0.42	1.0	0.3	0.44	0.62	0.43
Transcript_contig_79971 (79971)	0.55	0.71	0.28	0.22	0.25	0.68	0.8	0.53	0.34	1.0	0.56
Transcript_contig_80227 (80227)	0.47	0.45	0.5	0.44	1.0	0.39	0.89	0.66	0.91	0.64	0.5
Transcript_contig_80326 (80326)	0.31	0.1	0.66	0.63	0.57	0.35	0.7	0.01	1.0	0.55	0.37
Transcript_contig_81009 (81009)	0.23	0.14	1.0	0.85	0.22	0.21	0.45	0.31	0.58	0.12	0.24
Transcript_contig_81128 (81128)	0.1	0.04	0.63	0.61	0.58	0.34	1.0	0.17	0.17	0.53	0.57
Transcript_contig_82467 (82467)	0.17	0.19	1.0	0.33	0.21	0.45	0.96	0.36	0.36	0.29	0.27
Transcript_contig_83013 (83013)	0.35	0.09	0.42	0.28	0.08	0.7	0.77	0.14	0.47	1.0	0.84
Transcript_contig_83232 (83232)	0.36	0.52	0.98	0.62	0.28	0.77	1.0	0.48	0.25	0.48	0.58
Transcript_contig_83391 (83391)	0.62	0.49	0.39	0.19	0.2	0.49	0.72	0.55	0.55	1.0	0.82
Transcript_contig_8374 (8374)	0.18	0.4	0.75	0.49	0.61	0.61	1.0	0.65	0.06	0.56	0.65
Transcript_contig_84023 (84023)	0.58	1.0	0.27	0.43	0.36	0.5	0.85	0.3	0.0	0.52	0.44
Transcript_contig_89476 (89476)	0.49	0.46	0.61	0.37	0.42	0.45	1.0	0.46	0.6	0.41	0.46
Transcript_contig_89768 (89768)	0.32	0.17	1.0	0.72	0.25	0.46	0.82	0.24	0.47	0.34	0.3
Transcript_contig_90630 (90630)	0.23	0.06	0.61	0.51	0.61	0.53	0.71	0.03	1.0	0.36	0.43
Transcript_contig_90711 (90711)	0.3	0.17	0.75	0.36	0.1	0.24	0.66	0.11	1.0	0.22	0.17
Transcript_contig_938 (938)	0.14	0.03	0.43	0.37	0.08	0.73	1.0	0.0	0.34	0.48	0.49
Transcript_contig_9682 (9682)	0.08	0.02	0.38	0.41	0.22	0.35	0.92	0.0	1.0	0.52	0.18
Transcript_contig_9905 (9905)	0.18	0.21	0.89	0.54	0.66	0.34	1.0	0.05	0.0	0.01	0.13
Transcript_contig_9957 (9957)	0.18	0.1	0.76	0.74	0.63	0.81	1.0	0.0	0.06	0.66	0.65

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)