View as: (view raw or zlog-transformed)
View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)
(Values are normalized against highest expression of the row)
Gene | CCAP211/11P,High light | CCAP211/11P,Low light | CPCC90,BBM,72h,Autotrophy | CPCC90,BBM,97h,Mixotrophy | CPCC90,BBM,98h,Mixotrophy | CPCC90,BBM,120h,Mixotrophy | CPCC90,BBM,144h,Heterotrophy | NJ-7,20C | NJ-7,4C | UTEX259,20C | UTEX259,4C |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Transcript_contig_10115 (10115) | 0.64 | 1.0 | 0.4 | 0.25 | 0.04 | 0.17 | 0.3 | 0.73 | 0.22 | 0.06 | 0.09 |
Transcript_contig_1056 (1056) | 0.71 | 1.0 | 0.25 | 0.12 | 0.09 | 0.18 | 0.3 | 0.72 | 0.21 | 0.29 | 0.16 |
Transcript_contig_1118 (1118) | 0.74 | 1.0 | 0.3 | 0.25 | 0.26 | 0.25 | 0.3 | 0.54 | 0.0 | 0.04 | 0.07 |
Transcript_contig_1337 (1337) | 0.6 | 0.78 | 0.2 | 0.21 | 0.29 | 0.18 | 0.36 | 1.0 | 0.0 | 0.19 | 0.12 |
Transcript_contig_1663 (1663) | 0.73 | 1.0 | 0.16 | 0.2 | 0.12 | 0.18 | 0.23 | 0.83 | 0.07 | 0.15 | 0.09 |
Transcript_contig_2156 (2156) | 0.78 | 1.0 | 0.15 | 0.24 | 0.35 | 0.14 | 0.21 | 0.88 | 0.06 | 0.31 | 0.22 |
Transcript_contig_2359 (2359) | 0.86 | 1.0 | 0.31 | 0.35 | 0.36 | 0.21 | 0.52 | 0.81 | 0.07 | 0.35 | 0.29 |
Transcript_contig_2430 (2430) | 0.54 | 0.81 | 0.12 | 0.23 | 0.32 | 0.13 | 0.29 | 1.0 | 0.0 | 0.14 | 0.1 |
Transcript_contig_3848 (3848) | 0.71 | 1.0 | 0.13 | 0.28 | 0.12 | 0.17 | 0.35 | 0.65 | 0.11 | 0.16 | 0.12 |
Transcript_contig_4232 (4232) | 0.64 | 1.0 | 0.04 | 0.06 | 0.07 | 0.11 | 0.1 | 0.87 | 0.01 | 0.07 | 0.15 |
Transcript_contig_527 (527) | 0.57 | 1.0 | 0.13 | 0.11 | 0.11 | 0.06 | 0.14 | 0.82 | 0.02 | 0.23 | 0.09 |
Transcript_contig_5273 (5273) | 0.68 | 1.0 | 0.11 | 0.17 | 0.11 | 0.13 | 0.13 | 0.72 | 0.13 | 0.19 | 0.16 |
Transcript_contig_53801 (53801) | 0.73 | 1.0 | 0.27 | 0.46 | 0.5 | 0.32 | 0.47 | 0.95 | 0.08 | 0.38 | 0.21 |
Transcript_contig_53874 (53874) | 0.72 | 1.0 | 0.27 | 0.21 | 0.17 | 0.19 | 0.28 | 0.76 | 0.04 | 0.32 | 0.16 |
Transcript_contig_53973 (53973) | 0.82 | 0.99 | 0.32 | 0.25 | 0.43 | 0.25 | 0.48 | 1.0 | 0.2 | 0.23 | 0.15 |
Transcript_contig_53992 (53992) | 0.61 | 0.88 | 0.19 | 0.23 | 0.26 | 0.24 | 0.38 | 1.0 | 0.01 | 0.15 | 0.1 |
Transcript_contig_54061 (54061) | 0.77 | 1.0 | 0.17 | 0.18 | 0.22 | 0.17 | 0.31 | 0.67 | 0.07 | 0.16 | 0.12 |
Transcript_contig_54420 (54420) | 0.72 | 1.0 | 0.1 | 0.12 | 0.16 | 0.08 | 0.11 | 0.9 | 0.13 | 0.21 | 0.14 |
Transcript_contig_54535 (54535) | 0.69 | 1.0 | 0.2 | 0.17 | 0.16 | 0.12 | 0.21 | 0.55 | 0.26 | 0.28 | 0.13 |
Transcript_contig_54614 (54614) | 0.73 | 1.0 | 0.17 | 0.17 | 0.17 | 0.24 | 0.26 | 0.95 | 0.11 | 0.38 | 0.2 |
Transcript_contig_54715 (54715) | 0.51 | 0.77 | 0.17 | 0.19 | 0.28 | 0.21 | 0.3 | 1.0 | 0.18 | 0.21 | 0.16 |
Transcript_contig_54725 (54725) | 0.75 | 1.0 | 0.22 | 0.22 | 0.38 | 0.19 | 0.35 | 0.89 | 0.34 | 0.27 | 0.2 |
Transcript_contig_55110 (55110) | 0.77 | 1.0 | 0.22 | 0.33 | 0.35 | 0.27 | 0.39 | 0.83 | 0.11 | 0.19 | 0.13 |
Transcript_contig_55293 (55293) | 0.55 | 0.85 | 0.37 | 0.3 | 0.38 | 0.24 | 0.45 | 1.0 | 0.05 | 0.14 | 0.14 |
Transcript_contig_55769 (55769) | 0.76 | 1.0 | 0.13 | 0.18 | 0.19 | 0.22 | 0.3 | 0.83 | 0.01 | 0.28 | 0.12 |
Transcript_contig_55905 (55905) | 0.77 | 1.0 | 0.24 | 0.21 | 0.24 | 0.21 | 0.26 | 0.97 | 0.43 | 0.32 | 0.2 |
Transcript_contig_56014 (56014) | 0.75 | 1.0 | 0.2 | 0.23 | 0.3 | 0.21 | 0.54 | 0.87 | 0.08 | 0.28 | 0.13 |
Transcript_contig_56111 (56111) | 0.68 | 1.0 | 0.11 | 0.17 | 0.2 | 0.19 | 0.32 | 0.77 | 0.13 | 0.22 | 0.15 |
Transcript_contig_56133 (56133) | 0.81 | 1.0 | 0.24 | 0.28 | 0.23 | 0.14 | 0.27 | 0.91 | 0.08 | 0.29 | 0.19 |
Transcript_contig_56326 (56326) | 0.68 | 1.0 | 0.1 | 0.13 | 0.14 | 0.12 | 0.22 | 0.77 | 0.08 | 0.13 | 0.08 |
Transcript_contig_56433 (56433) | 0.72 | 1.0 | 0.07 | 0.13 | 0.11 | 0.13 | 0.19 | 0.59 | 0.01 | 0.2 | 0.07 |
Transcript_contig_56512 (56512) | 0.76 | 1.0 | 0.34 | 0.19 | 0.19 | 0.2 | 0.3 | 0.84 | 0.08 | 0.3 | 0.22 |
Transcript_contig_56564 (56564) | 0.77 | 1.0 | 0.35 | 0.32 | 0.32 | 0.25 | 0.42 | 1.0 | 0.18 | 0.2 | 0.15 |
Transcript_contig_56717 (56717) | 0.65 | 1.0 | 0.36 | 0.46 | 0.52 | 0.19 | 0.49 | 0.99 | 0.03 | 0.16 | 0.09 |
Transcript_contig_56777 (56777) | 0.74 | 0.98 | 0.32 | 0.36 | 0.33 | 0.28 | 0.51 | 1.0 | 0.25 | 0.36 | 0.21 |
Transcript_contig_56989 (56989) | 0.66 | 0.89 | 0.29 | 0.33 | 0.44 | 0.27 | 0.5 | 1.0 | 0.09 | 0.25 | 0.16 |
Transcript_contig_57093 (57093) | 0.74 | 0.91 | 0.44 | 0.27 | 0.27 | 0.33 | 0.34 | 1.0 | 0.41 | 0.17 | 0.13 |
Transcript_contig_57257 (57257) | 0.78 | 1.0 | 0.32 | 0.28 | 0.27 | 0.24 | 0.41 | 0.75 | 0.39 | 0.35 | 0.18 |
Transcript_contig_57263 (57263) | 0.67 | 1.0 | 0.09 | 0.1 | 0.09 | 0.08 | 0.16 | 0.77 | 0.03 | 0.18 | 0.09 |
Transcript_contig_57339 (57339) | 0.72 | 1.0 | 0.06 | 0.05 | 0.19 | 0.13 | 0.39 | 0.49 | 0.14 | 0.01 | 0.06 |
Transcript_contig_57633 (57633) | 0.72 | 1.0 | 0.32 | 0.24 | 0.21 | 0.27 | 0.34 | 0.84 | 0.23 | 0.43 | 0.22 |
Transcript_contig_58109 (58109) | 0.79 | 1.0 | 0.07 | 0.15 | 0.16 | 0.2 | 0.21 | 0.99 | 0.35 | 0.33 | 0.21 |
Transcript_contig_58159 (58159) | 0.72 | 0.98 | 0.19 | 0.22 | 0.31 | 0.31 | 0.4 | 1.0 | 0.13 | 0.32 | 0.19 |
Transcript_contig_58324 (58324) | 0.74 | 1.0 | 0.23 | 0.24 | 0.18 | 0.15 | 0.22 | 0.79 | 0.02 | 0.14 | 0.09 |
Transcript_contig_58753 (58753) | 0.59 | 0.86 | 0.22 | 0.3 | 0.38 | 0.28 | 0.32 | 1.0 | 0.11 | 0.26 | 0.16 |
Transcript_contig_58783 (58783) | 0.65 | 1.0 | 0.21 | 0.23 | 0.21 | 0.18 | 0.34 | 0.94 | 0.15 | 0.21 | 0.17 |
Transcript_contig_58799 (58799) | 0.69 | 0.94 | 0.14 | 0.17 | 0.23 | 0.35 | 0.34 | 1.0 | 0.14 | 0.41 | 0.24 |
Transcript_contig_58805 (58805) | 0.72 | 0.94 | 0.3 | 0.28 | 0.25 | 0.27 | 0.34 | 1.0 | 0.51 | 0.31 | 0.26 |
Transcript_contig_59061 (59061) | 0.53 | 0.79 | 0.25 | 0.25 | 0.36 | 0.25 | 0.39 | 1.0 | 0.15 | 0.26 | 0.17 |
Transcript_contig_59220 (59220) | 0.73 | 1.0 | 0.2 | 0.22 | 0.27 | 0.2 | 0.3 | 0.95 | 0.2 | 0.23 | 0.18 |
Transcript_contig_59264 (59264) | 0.74 | 0.99 | 0.21 | 0.29 | 0.42 | 0.32 | 0.39 | 1.0 | 0.23 | 0.14 | 0.13 |
Transcript_contig_59310 (59310) | 0.71 | 1.0 | 0.27 | 0.42 | 0.48 | 0.31 | 0.38 | 0.99 | 0.02 | 0.33 | 0.23 |
Transcript_contig_59537 (59537) | 0.71 | 0.93 | 0.36 | 0.34 | 0.36 | 0.31 | 0.4 | 1.0 | 0.35 | 0.22 | 0.21 |
Transcript_contig_59798 (59798) | 0.75 | 1.0 | 0.12 | 0.12 | 0.17 | 0.3 | 0.39 | 0.89 | 0.37 | 0.38 | 0.26 |
Transcript_contig_59948 (59948) | 0.65 | 0.97 | 0.2 | 0.5 | 0.43 | 0.27 | 0.38 | 1.0 | 0.12 | 0.37 | 0.22 |
Transcript_contig_59972 (59972) | 0.68 | 1.0 | 0.08 | 0.12 | 0.08 | 0.1 | 0.12 | 0.64 | 0.0 | 0.17 | 0.07 |
Transcript_contig_60234 (60234) | 0.73 | 1.0 | 0.17 | 0.29 | 0.31 | 0.25 | 0.07 | 0.93 | 0.07 | 0.19 | 0.14 |
Transcript_contig_61248 (61248) | 0.8 | 1.0 | 0.17 | 0.16 | 0.18 | 0.17 | 0.24 | 0.69 | 0.03 | 0.16 | 0.12 |
Transcript_contig_61512 (61512) | 0.59 | 1.0 | 0.04 | 0.07 | 0.16 | 0.04 | 0.08 | 0.2 | 0.02 | 0.29 | 0.16 |
Transcript_contig_61518 (61518) | 0.63 | 0.96 | 0.16 | 0.19 | 0.34 | 0.25 | 0.34 | 1.0 | 0.17 | 0.24 | 0.15 |
Transcript_contig_62535 (62535) | 0.73 | 1.0 | 0.18 | 0.17 | 0.17 | 0.16 | 0.2 | 0.83 | 0.1 | 0.25 | 0.13 |
Transcript_contig_63544 (63544) | 0.64 | 1.0 | 0.25 | 0.22 | 0.27 | 0.26 | 0.31 | 0.71 | 0.46 | 0.28 | 0.09 |
Transcript_contig_66200 (66200) | 0.64 | 1.0 | 0.1 | 0.13 | 0.18 | 0.07 | 0.15 | 1.0 | 0.0 | 0.11 | 0.08 |
Transcript_contig_67647 (67647) | 0.72 | 1.0 | 0.18 | 0.11 | 0.02 | 0.12 | 0.24 | 0.76 | 0.03 | 0.17 | 0.08 |
Transcript_contig_67887 (67887) | 0.43 | 1.0 | 0.04 | 0.07 | 0.26 | 0.0 | 0.39 | 0.64 | 0.0 | 0.27 | 0.04 |
Transcript_contig_67933 (67933) | 0.65 | 1.0 | 0.13 | 0.12 | 0.09 | 0.11 | 0.19 | 0.74 | 0.11 | 0.21 | 0.08 |
Transcript_contig_69641 (69641) | 0.59 | 1.0 | 0.2 | 0.14 | 0.19 | 0.2 | 0.43 | 0.37 | 0.08 | 0.11 | 0.03 |
Transcript_contig_70453 (70453) | 0.7 | 1.0 | 0.15 | 0.12 | 0.13 | 0.18 | 0.21 | 0.92 | 0.0 | 0.12 | 0.1 |
Transcript_contig_70631 (70631) | 0.69 | 1.0 | 0.1 | 0.17 | 0.19 | 0.15 | 0.28 | 0.76 | 0.03 | 0.19 | 0.1 |
Transcript_contig_7384 (7384) | 0.79 | 1.0 | 0.26 | 0.27 | 0.24 | 0.22 | 0.25 | 0.89 | 0.07 | 0.29 | 0.13 |
Transcript_contig_78127 (78127) | 0.64 | 0.95 | 0.18 | 0.28 | 0.28 | 0.24 | 0.35 | 1.0 | 0.16 | 0.38 | 0.21 |
Transcript_contig_78168 (78168) | 0.75 | 1.0 | 0.13 | 0.25 | 0.29 | 0.19 | 0.23 | 0.84 | 0.13 | 0.43 | 0.23 |
Transcript_contig_78597 (78597) | 0.51 | 0.78 | 0.2 | 0.32 | 0.28 | 0.21 | 0.31 | 1.0 | 0.05 | 0.19 | 0.17 |
Transcript_contig_78679 (78679) | 0.67 | 1.0 | 0.23 | 0.3 | 0.41 | 0.29 | 0.35 | 0.71 | 0.11 | 0.3 | 0.2 |
Transcript_contig_78828 (78828) | 0.76 | 1.0 | 0.18 | 0.18 | 0.21 | 0.25 | 0.3 | 0.98 | 0.41 | 0.28 | 0.22 |
Transcript_contig_78902 (78902) | 0.62 | 1.0 | 0.26 | 0.21 | 0.18 | 0.14 | 0.25 | 0.57 | 0.09 | 0.21 | 0.09 |
Transcript_contig_78974 (78974) | 0.77 | 1.0 | 0.21 | 0.2 | 0.15 | 0.25 | 0.18 | 0.95 | 0.1 | 0.34 | 0.15 |
Transcript_contig_78988 (78988) | 0.75 | 1.0 | 0.15 | 0.22 | 0.19 | 0.1 | 0.32 | 0.84 | 0.0 | 0.13 | 0.06 |
Transcript_contig_79134 (79134) | 0.64 | 1.0 | 0.09 | 0.07 | 0.16 | 0.11 | 0.13 | 0.84 | 0.01 | 0.14 | 0.06 |
Transcript_contig_7962 (7962) | 0.86 | 1.0 | 0.14 | 0.08 | 0.11 | 0.17 | 0.09 | 0.78 | 0.0 | 0.0 | 0.04 |
Transcript_contig_8029 (8029) | 0.7 | 1.0 | 0.13 | 0.14 | 0.08 | 0.16 | 0.3 | 0.32 | 0.02 | 0.12 | 0.16 |
Transcript_contig_80447 (80447) | 0.68 | 1.0 | 0.15 | 0.18 | 0.18 | 0.2 | 0.2 | 0.97 | 0.01 | 0.11 | 0.13 |
Transcript_contig_81935 (81935) | 0.75 | 1.0 | 0.22 | 0.19 | 0.18 | 0.28 | 0.36 | 0.82 | 0.54 | 0.26 | 0.19 |
Transcript_contig_8213 (8213) | 0.71 | 1.0 | 0.12 | 0.25 | 0.15 | 0.13 | 0.22 | 0.99 | 0.0 | 0.2 | 0.21 |
Transcript_contig_82309 (82309) | 0.58 | 0.97 | 0.22 | 0.12 | 0.29 | 0.2 | 0.27 | 1.0 | 0.01 | 0.25 | 0.14 |
Transcript_contig_83106 (83106) | 0.76 | 1.0 | 0.33 | 0.26 | 0.19 | 0.4 | 0.34 | 0.42 | 0.11 | 0.32 | 0.32 |
Transcript_contig_8321 (8321) | 0.8 | 1.0 | 0.27 | 0.29 | 0.28 | 0.24 | 0.32 | 0.73 | 0.34 | 0.28 | 0.13 |
Transcript_contig_83615 (83615) | 0.79 | 1.0 | 0.27 | 0.2 | 0.17 | 0.09 | 0.12 | 0.72 | 0.1 | 0.18 | 0.16 |
Transcript_contig_84081 (84081) | 0.8 | 1.0 | 0.17 | 0.33 | 0.16 | 0.06 | 0.34 | 0.61 | 0.0 | 0.2 | 0.13 |
Transcript_contig_89130 (89130) | 0.72 | 1.0 | 0.2 | 0.16 | 0.14 | 0.16 | 0.26 | 0.88 | 0.27 | 0.22 | 0.13 |
Transcript_contig_89231 (89231) | 0.66 | 0.95 | 0.24 | 0.26 | 0.34 | 0.23 | 0.36 | 1.0 | 0.2 | 0.25 | 0.18 |
Transcript_contig_89313 (89313) | 0.76 | 1.0 | 0.22 | 0.21 | 0.21 | 0.25 | 0.31 | 0.93 | 0.35 | 0.21 | 0.18 |
Transcript_contig_89592 (89592) | 0.75 | 1.0 | 0.27 | 0.38 | 0.47 | 0.25 | 0.4 | 0.9 | 0.17 | 0.32 | 0.19 |
Transcript_contig_90520 (90520) | 0.76 | 1.0 | 0.1 | 0.15 | 0.11 | 0.16 | 0.25 | 0.83 | 0.06 | 0.21 | 0.18 |
Transcript_contig_90570 (90570) | 0.74 | 1.0 | 0.13 | 0.12 | 0.09 | 0.12 | 0.16 | 0.54 | 0.07 | 0.21 | 0.11 |
Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)